Superfamily : 81301 [ Nucleotidyltransferase ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : Nucleotidyltransferase
# of Members : 11
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1px5a2  (   1 )      melrhTp----------ardldkfiedh----llpn-tFrtqvkeAid
d1vj7a2  ( 197 )                             etefykIshmm--nekrrerealvd
d2bcqa3  ( 386 )                                       rMp---reeAteIeq
d2fmpa3  ( 149 )                                       rIp---reeMlqMqd
d2hhpa2  (   4 )    qkvfgitgpvstvgataaenklndsliqelkkegsfEteqetanRvqVlk
d2m2ua-  (   1 )                                       mlt---liqGkkivn
d2nrka1  (   4 )                                      iV--teyqpaWveqfe
d4xq7a1  (   5 )      qelystp----------asrldsFvaqw----lqphrewkeevldAvr
d5deca-  (   3 )                                    ddkw--erfLvpYrqAVe
d6ewza-  (  29 )                             deaf-dtllgF--veLdhIYssALk
d6ipna3  ( 290 )                                        vl---rsDVdaLqq
                                                             aaaaaaaaa

                             60        70        80        90        100 
d1px5a2  (  35 )    iV-rFLke-rCfqg----------------pvrVskVvkGgss-------
d1vj7a2  ( 220 )    dIvtkIksyT--teq-----------gl----fgdVygrpkhiysIyrkm
d2bcqa3  ( 398 )    tVqkaAqa-fns----------------------gLlCvACgsyrrg--k
d2fmpa3  ( 161 )    iVlneVkk-vds----------------------eYiAtVCgsfrrg--a
d2hhpa2  (  54 )    iLqeLAqrFV--yeVSkkknmsdgmArd--AgG--kIftyg-syrlgvhg
d2m2ua-  (  13 )    hlRsr-----la------Feyn-----gqlikilsknivavgslrre--e
d2nrka1  (  18 )    eeaqaLkqiL--k-------------en----ClkVehI--gsTSVp---
d4xq7a1  (  39 )    tveeflrqehFqgq----------------dvrvlkvvkvg-sFgngtvl
d5deca-  (  19 )    eLkvkLkgIr--tlyed-------dhSP----IefVtgrVkpvasIlekA
d6ewza-  (  51 )    eIstkLsild--dnfnhi-----ykhnP----IhhmerrvkemrsLiekL
d6ipna3  ( 301 )    vVeeAVg--Alp----------------------gAtVtlTggFrrg--k
                    aaaaaaaa                            bbbb  aaa     

                             110       120       130       140       150 
d1px5a2  (  72 )    -------r------sd---AdLVVFLtkLtsFeDQlrrrgeFIqeIrrqL
d1vj7a2  ( 253 )    rdk-----kkrfdq-ifdLIAIrCVMe-----------tqsdVyaMvgyI
d2bcqa3  ( 423 )    a-----tC------gd---VdVLIThpdgshr--------gIFsrLLdsL
d2fmpa3  ( 186 )    e-----sS------gd---MdVLLTHpsftse---stkqpkLLhqVVeqL
d2hhpa2  (  97 )    p-----g-------sd---IdTLVVVPk----hVt---redFftvFdsLL
d2m2ua-  (  45 )    k-----ml------nd---vdlliivpe---------------kkllkhv
d2nrka1  (  44 )    ------------nLAAkpiIdFLViVe-----------eiekVdllqweF
d4xq7a1  (  77 )    r-----st------re---velvAFlscFhsfqeaakhhkdvlrliwktM
d5deca-  (  58 )    rrksip--lheiet-mqdIAgLrIMCq-----------fvdDiqiVkemL
d6ewza-  (  90 )    nrkglqisaetAkehIldIAgIrVVCn-----------yldDIylIeemL
d6ipna3  ( 326 )    l-----qg------hd---VdFLIthpegqea--------gLLprVMcrL
                                       bbbbbbb               aaaaaaaaa

                             160       170       180       190       200 
d1px5a2  ( 106 )    eaCqreq---kFkVtFeVqs--------paLsFvLssp---qlq--qeve
d1vj7a2  ( 286 )    hel-----wrpmpgrfkdyiaapkangyqSIhTTVyGp---------kgp
d2bcqa3  ( 452 )    rq-----e----gFLtddlvSqeengqQqkYlGvCrLpgp----grrhrr
d2fmpa3  ( 219 )    qk-----v----hFItdtlskg-----etkFmGvCqLpskndekeyphrr
d2hhpa2  ( 125 )    rerk---------eldeiapv--pdafvPiIkIkFs-----------gis
d2m2ua-  (  66 )    lp-----nirikglsfsvkvcg-----erkCvlfiewe-------kktyq
d2nrka1  (  71 )    eri----gYeYgef-----------glsgrryLrkgpi---------krt
d4xq7a1  ( 113 )    wqsqdll---d-lgledlrme---qrvpdAlvFtiqtr---gta--epit
d5deca-  (  94 )    fark---dFtvv--dqrdyia-----gyrSYhLVVlYpLqtvs-gekhVl
d6ewza-  ( 129 )    lkqe---dVqli--krkdyiqhpkengyrSLhIVVsIpVflae-rvevLp
d6ipna3  ( 355 )    qd-----q----glIlyhqhqh----aferSfCiFrLpqpg---swkaVr
                    a             bbbb            bbbbb             bb

                             210       220       230       240       250 
d1px5a2  ( 146 )    FdVlPAfDALgqwtpgykp-npeiyvqlikeCks---------------r
d1vj7a2  ( 322 )    IeIqIRT---kemhqvAeygv-----------------------------
d2bcqa3  ( 489 )    LdIiVvpysefACAlLyfTgsahFnrsMralAktkgmsLsehaLstaVvr
d2fmpa3  ( 255 )    IdIrLIPkdqyyCGVLyfTgsdiFnknMrahAlekgftIneytIrplgv-
d2hhpa2  ( 153 )    IdLICArLdqpqVplsltLsdknllrnLd---------------------
d2m2ua-  (  99 )    ldlftalaeekPYaiFhftGpvsyliriraalkkknyklnqyGlfkn---
d2nrka1  (  98 )    hhVhIYqfdntqeilrhlAfrnyLrenp-aiattYG----tl----Kkql
d4xq7a1  ( 151 )    vtivPAyrAlgpslpnsqp-ppevyvslikAc------------------
d5deca-  ( 138 )    VeIqIRT---laMnfwAtiehslnykysgnipekvk----lr----lqra
d6ewza-  ( 173 )    VeIqIRT---igmdmWaslehkirykn-naetekyr----dl----lkec
d6ipna3  ( 417 )    VdLVVApvsqfPFAlLGwTgs-lfqreLrrfSrekglwLnshgLfdpq--
                    bbbbbb    aaaaaaaaa  aaaaa   aa                   

                             260       270       280   
d1px5a2  ( 180 )    gkegeF----stCfTelqrdflrnr          
d1vj7a2  ( 340 )    -----------------aanwikelv-el      
d2bcqa3  ( 539 )    nthgkgpgrvlpTptEkdVFrlLglpyrepaeRdw
d2fmpa3  ( 304 )    ---tgvageplpvdsekdIFdyIqwkyrepkdRse
d2hhpa2  ( 182 )    --ekDl----rALngTrvTdeilelv         
d2m2ua-  ( 146 )    -----qtlvplkittekelikelgftyripkkrl 
d2nrka1  ( 139 )    aqahpdsidkykdafikkIekeAlkkywe      
d4xq7a1  ( 187 )    ----------fpsfSelqrnfvkhr          
d5deca-  ( 177 )    Se--------aasrlDeemseirgevqea      
d6ewza-  ( 211 )    At--------eitevedklqqihseite       
d6ipna3  ( 468 )    --------tffqAasEedIFrhLgleylppeqRna
                                   aaaaaaaa            

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, OAS1, N-terminal domain2'-5'-oligoadenylate synthetase 1, OAS1, N-terminal domainPig (Sus scrofa) [TaxId: 9823]view
Stringent response-like protein RelA domain 2RelA/SpoT domainStreptococcus equisimilis [TaxId: 119602]view
DNA polymerase lambdaDNA polymerase beta-likeHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
DNA polymerase beta, catalytic (31 kD) fragmentDNA polymerase beta-likeHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Poly(A) polymerase, PAP, N-terminal domainPoly(A) polymerase, PAP, N-terminal domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
DNA polymerase XDNA polymerase beta-likeAfrican swine fever virus [TaxId: 10497]view
Hypothetical protein GrpBGrpB-likeEnterococcus faecalis [TaxId: 1351]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesRelA/SpoT domainBacillus subtilis [TaxId: 224308]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280
- - M E L R H T P - - - - - - - - - - A R D L D K F I E D H - - - - L L P N - T F R T Q V K E A I D I V - R F L K E - R C F Q G - - - - - - - - - - - - - - - - P V R V S K V V K G G S S - - - - - - - - - - - - - - R - - - - - - S D - - - A D L V V F L T K L T S F E D Q L R R R G E F I Q E I R R Q L E A C Q R E Q - - - K F K V T F E V Q S - - - - - - - - P A L S F V L S S P - - - Q L Q - - Q E V E F D V L P A F D A L G Q W T P G Y K P - N P E I Y V Q L I K E C K S - - - - - - - - - - - - - - - R G K E G E F - - - - S T C F T E L Q R D F L R N R - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E T E F Y K I S H M M - - N E K R R E R E A L V D D I V T K I K S Y T - - T E Q - - - - - - - - - - - G L - - - - F G D V Y G R P K H I Y S I Y R K M R D K - - - - - K K R F D Q - I F D L I A I R C V M E - - - - - - - - - - - T Q S D V Y A M V G Y I H E L - - - - - W R P M P G R F K D Y I A A P K A N G Y Q S I H T T V Y G P - - - - - - - - - K G P I E I Q I R T - - - K E M H Q V A E Y G V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A A N W I K E L V - E L - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R M P - - - R E E A T E I E Q T V Q K A A Q A - F N S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L L C V A C G S Y R R G - - K A - - - - - T C - - - - - - G D - - - V D V L I T H P D G S H R - - - - - - - - G I F S R L L D S L R Q - - - - - E - - - - G F L T D D L V S Q E E N G Q Q Q K Y L G V C R L P G P - - - - G R R H R R L D I I V V P Y S E F A C A L L Y F T G S A H F N R S M R A L A K T K G M S L S E H A L S T A V V R N T H G K G P G R V L P T P T E K D V F R L L G L P Y R E P A E R D W
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R I P - - - R E E M L Q M Q D I V L N E V K K - V D S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E Y I A T V C G S F R R G - - A E - - - - - S S - - - - - - G D - - - M D V L L T H P S F T S E - - - S T K Q P K L L H Q V V E Q L Q K - - - - - V - - - - H F I T D T L S K G - - - - - E T K F M G V C Q L P S K N D E K E Y P H R R I D I R L I P K D Q Y Y C G V L Y F T G S D I F N K N M R A H A L E K G F T I N E Y T I R P L G V - - - - T G V A G E P L P V D S E K D I F D Y I Q W K Y R E P K D R S E
Q K V F G I T G P V S T V G A T A A E N K L N D S L I Q E L K K E G S F E T E Q E T A N R V Q V L K I L Q E L A Q R F V - - Y E V S K K K N M S D G M A R D - - A G G - - K I F T Y G - S Y R L G V H G P - - - - - G - - - - - - - S D - - - I D T L V V V P K - - - - H V T - - - R E D F F T V F D S L L R E R K - - - - - - - - - E L D E I A P V - - P D A F V P I I K I K F S - - - - - - - - - - - G I S I D L I C A R L D Q P Q V P L S L T L S D K N L L R N L D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E K D L - - - - R A L N G T R V T D E I L E L V - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M L T - - - L I Q G K K I V N H L R S R - - - - - L A - - - - - - F E Y N - - - - - G Q L I K I L S K N I V A V G S L R R E - - E K - - - - - M L - - - - - - N D - - - V D L L I I V P E - - - - - - - - - - - - - - - K K L L K H V L P - - - - - N I R I K G L S F S V K V C G - - - - - E R K C V L F I E W E - - - - - - - K K T Y Q L D L F T A L A E E K P Y A I F H F T G P V S Y L I R I R A A L K K K N Y K L N Q Y G L F K N - - - - - - - - Q T L V P L K I T T E K E L I K E L G F T Y R I P K K R L -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I V - - T E Y Q P A W V E Q F E E E A Q A L K Q I L - - K - - - - - - - - - - - - - E N - - - - C L K V E H I - - G S T S V P - - - - - - - - - - - - - - - N L A A K P I I D F L V I V E - - - - - - - - - - - E I E K V D L L Q W E F E R I - - - - G Y E Y G E F - - - - - - - - - - - G L S G R R Y L R K G P I - - - - - - - - - K R T H H V H I Y Q F D N T Q E I L R H L A F R N Y L R E N P - A I A T T Y G - - - - T L - - - - K K Q L A Q A H P D S I D K Y K D A F I K K I E K E A L K K Y W E - - - - - -
- - Q E L Y S T P - - - - - - - - - - A S R L D S F V A Q W - - - - L Q P H R E W K E E V L D A V R T V E E F L R Q E H F Q G Q - - - - - - - - - - - - - - - - D V R V L K V V K V G - S F G N G T V L R - - - - - S T - - - - - - R E - - - V E L V A F L S C F H S F Q E A A K H H K D V L R L I W K T M W Q S Q D L L - - - D - L G L E D L R M E - - - Q R V P D A L V F T I Q T R - - - G T A - - E P I T V T I V P A Y R A L G P S L P N S Q P - P P E V Y V S L I K A C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F P S F S E L Q R N F V K H R - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D D K W - - E R F L V P Y R Q A V E E L K V K L K G I R - - T L Y E D - - - - - - - D H S P - - - - I E F V T G R V K P V A S I L E K A R R K S I P - - L H E I E T - M Q D I A G L R I M C Q - - - - - - - - - - - F V D D I Q I V K E M L F A R K - - - D F T V V - - D Q R D Y I A - - - - - G Y R S Y H L V V L Y P L Q T V S - G E K H V L V E I Q I R T - - - L A M N F W A T I E H S L N Y K Y S G N I P E K V K - - - - L R - - - - L Q R A S E - - - - - - - - A A S R L D E E M S E I R G E V Q E A - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D E A F - D T L L G F - - V E L D H I Y S S A L K E I S T K L S I L D - - D N F N H I - - - - - Y K H N P - - - - I H H M E R R V K E M R S L I E K L N R K G L Q I S A E T A K E H I L D I A G I R V V C N - - - - - - - - - - - Y L D D I Y L I E E M L L K Q E - - - D V Q L I - - K R K D Y I Q H P K E N G Y R S L H I V V S I P V F L A E - R V E V L P V E I Q I R T - - - I G M D M W A S L E H K I R Y K N - N A E T E K Y R - - - - D L - - - - L K E C A T - - - - - - - - E I T E V E D K L Q Q I H S E I T E - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V L - - - R S D V D A L Q Q V V E E A V G - - A L P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G A T V T L T G G F R R G - - K L - - - - - Q G - - - - - - H D - - - V D F L I T H P E G Q E A - - - - - - - - G L L P R V M C R L Q D - - - - - Q - - - - G L I L Y H Q H Q H - - - - A F E R S F C I F R L P Q P G - - - S W K A V R V D L V V A P V S Q F P F A L L G W T G S - L F Q R E L R R F S R E K G L W L N S H G L F D P Q - - - - - - - - - - T F F Q A A S E E D I F R H L G L E Y L P P E Q R N A

 

 

 

 

 

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