BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 53697 [ SIS domain ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : SIS domain
# of Members : 17
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1j5xa-  (   2 )                                                      
d1m3sa1  (   1 )                                                      
d1moqa-  ( 243 )                                                      
d1nria-  (   9 )                                                      
d1tzba-  (   2 )                                                      
d1vima1  (   2 )                                                      
d1wiwa-  (   2 )                                                      
d2cxna-  (   1 )    mAaLtrnpqFqkLlewhransanlkLrelfeadpeRfnnfSlnlnTnhgh
d2e5fa-  (   1 )                                                      
d2i2wa-  (   1 )                                                      
d2yvaa-  (   1 )                                                      
d3ff1a1  (   2 )                                                    th
d3g68a1  (   2 )                                                      
d3knza1  (   2 )                                                      
d4s1wa-  ( 248 )                                                      
d5lu5a-  (   3 )                                                      
d7kqaa1  (   9 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1j5xa-  (   2 )                                                      
d1m3sa1  (   1 )                                                      
d1moqa-  ( 243 )                                                      
d1nria-  (   9 )                                                      
d1tzba-  (   2 )                                                      
d1vima1  (   2 )                                                      
d1wiwa-  (   2 )                                                      
d2cxna-  (  51 )    IlVdYSkNL--VskeVmqmLveLAksrgVeaardnMfsGskiNytedrAV
d2e5fa-  (   1 )                                                      
d2i2wa-  (   1 )                                                      
d2yvaa-  (   1 )                                                      
d3ff1a1  (   4 )    IqLdfskTlefFgehelkqqqeiVk-----sihktIhegtgagsdflgWV
d3g68a1  (   2 )                                                      
d3knza1  (   2 )                                                      
d4s1wa-  ( 248 )                                                      
d5lu5a-  (   3 )                                                      
d7kqaa1  (   9 )                                                      
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1j5xa-  (   2 )                          skTlkEItDQknelkkfFenf--Vl---
d1m3sa1  (   1 )                                                      
d1moqa-  ( 243 )                  gdkg-iyrhyMqkEIyeQPnAIknTltgRis-h---
d1nria-  (   9 )                                                      
d1tzba-  (   2 )                             sqLlqdYlnWenyIlrrVdFptsyv
d1vima1  (   2 )                                                      
d1wiwa-  (   2 )                                                      
d2cxna-  (  99 )    LHVALRnrsntpikvdgkdvMp-eVnrVldkMksFCqrVrs-----gdwk
d2e5fa-  (   1 )                          mkTliEIkqTpdGIikAdkvF--nk---
d2i2wa-  (   1 )                                                      
d2yvaa-  (   1 )                                                      
d3ff1a1  (  49 )    dlpvdyd------------------keefsrIveAskrIke---------
d3g68a1  (   2 )                           tIqdy-letPvrre-Iis---------
d3knza1  (   2 )                                 netplrLl-elt---------
d4s1wa-  ( 248 )                        vyahylkEIheQpaV-rrIiqeyqdae---
d5lu5a-  (   3 )                                                      
d7kqaa1  (   9 )                  mslsdptsTlMfaEAaeAAdVVarQfsrN-------
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1j5xa-  (  25 )    --n-le-------------kit---eVLFVGcgssynLAlTIsyyFervl
d1m3sa1  (   1 )                                      mtteyvaeilnelhnS
d1moqa-  ( 274 )    --g-qVdLseLgpnAdelLs--kVeHIQILAcgtsyNSGmVSryWFeslA
d1nria-  (   9 )          lstliTeqrNpnSvdidrq------stleivrlneedklVplai
d1tzba-  (  27 )    vegevvrI-------------eamprLyISGmgGSGVVAdLIrDFSlTw-
d1vima1  (   2 )                                        lrflevvseHiknl
d1wiwa-  (   2 )                                   rdLdreetylvDrtgLale
d2cxna-  ( 143 )    Gytg-----------------ksItDIINIGiggsdlGPlMVTeALkpys
d2e5fa-  (  24 )    --v-kd-------------kIsLpnrILYLGcgsshfLSkLLamVTnmh-
d2i2wa-  (   1 )                            m------yqdlirnelneaaeTlanF
d2yvaa-  (   1 )                                   mqerikacftesiqtqiaA
d3ff1a1  (  72 )    ----------------------nSdVLVVIGiggsylGArAAieltss--
d3g68a1  (  20 )    ------nAdslFneVkrtn-----LkIIITGsgtsyhSGVQvqpyLqnlL
d3knza1  (  14 )    ------qtredLwrAAqaLtergVtrIILTGsgtSyhGAlTartf-qrwc
d4s1wa-  ( 276 )    --g-nlkId---qdIIndVk--eAdrIYVIAagtsyhAGlVGkeFLekWA
d5lu5a-  (   3 )                           nr------eltyitnsiaeaqrVmaaM
d7kqaa1  (  38 )    --------hatMetLAasLraapPpfVVTCArgssdhAAtYGkyLLetql
                                                     aaaaaaaaaaaaaaa  

                             210       220       230       240       250 
d1j5xa-  (  67 )    k-------irTkAIpAgeVAfqkIp-------dLglAFLFSrtGntteVL
d1m3sa1  (  18 )    aa-------------------yis----------------------nead
d1moqa-  ( 319 )    g-------IpCdVeiAseFryr--kSavr---rnSLMITLSqsGetadTl
d1nria-  (  48 )    es--------------------Cl----------------------pqis
d1tzba-  (  63 )    ---nwe--VeViavkdyfLk--ar---------dGLLIAVSysGntieTl
d1vima1  (  16 )    rn-------------------hid----------------------letv
d1wiwa-  (  21 )    Lrd-----------------LvgtgpvPgeaYpgphAAlGy-----gEGq
d2cxna-  ( 176 )    k-----gGprVwfVsni-dgthiakTlasLspetSLFIIASktFttqeTi
d2e5fa-  (  57 )    g-------GlGiALpCseFLysketypig---eveLAVGISrsGetteIl
d2i2wa-  (  21 )    lkd-----------------dani----------------------haIq
d2yvaa-  (  20 )    ae-------------------alp----------------------dais
d3ff1a1  (  99 )    -frnsneyPeIvFVGnhlsstytkelvdyLadkdFSVNVIsksgtttePa
d3g68a1  (  60 )    d-------idVvk-yPfit---edtFk-----nntLVVgvSqgGssysTy
d3knza1  (  58 )    a-------lpVdVcwPfLd---detLars---gkALVVgIsqggGslsTl
d4s1wa-  ( 318 )    g-------vpTeVhvAsefvy---nplls---ekPLFVYISqsGetadSr
d5lu5a-  (  24 )    lad-----------------erll----------------------atvr
d7kqaa1  (  80 )    g-------lvVasaSpsvgsvy-aaplqL---rgALFIVIsqsGkspdLl
                                                                  aaaa

                             260       270       280       290       300 
d1j5xa-  ( 106 )    lANdvLkkr----------nh-rTIGITIeeeSrLAkeSd-------lpl
d1m3sa1  (  28 )    qLAdhIlsSh-------------qIFTAGag-------------------
d1moqa-  ( 357 )    aGLrlSkel----------gYlgSLAICNvpgSsLvreSd-------laL
d1nria-  (  56 )    lAveqIvqafqq---------gGrLIYIGag-------------------
d1tzba-  (  97 )    yTVeyAkrr-------------rIPAVAITtggrLaqm-------gVPtV
d1vima1  (  25 )    geMilIdsar-------------SIFViGag-------------------
d1wiwa-  (  49 )    fAAlLSglpdwgee-------gTLFlLEGGydlg--eaAgaaetgrArvV
d2cxna-  ( 220 )    tNAetAkewFleaAkdpsavakHFVALStn---takVkefgIdpqnMFeF
d2e5fa-  (  97 )    lALeki-------------nv-kkLGITTre-SsLtrmCd-------ySL
d2i2wa-  (  32 )    rAAvlLAdsFka---------ggkVLSCGng-------------------
d2yvaa-  (  29 )    rAamtLvqsLln---------gnkILCCGng-------------------
d3ff1a1  ( 148 )    vafrlFkqlVeeryg-keeAqkrIFATTDkekgaLkqlAtn---egYetF
d3g68a1  (  99 )    nA--lAedk----------gC-kiAS-AGc-nAlIdeiSd-------yiL
d3knza1  (  96 )    aA-erArnv----------gH-ItAS-AgvapAtIdraAd-------yiL
d4s1wa-  ( 356 )    aVLveTnkl----------gh-kSLTITnvagStLsreAd-------htL
d5lu5a-  (  35 )    kVAdaCiaSiaq---------ggkVLLAGng-------------------
d7kqaa1  ( 119 )    rnAeaAkaa----------gA-rVIALVNvedSpLAqlAd-------tvI
                    aaaaaaaa                bbbb                      

                             310       320       330       340       350 
d1j5xa-  ( 138 )    vFpv-rEeaiv-TksF-SILLS-LFlADkiag-------------ns--T
d1m3sa1  (  46 )    --------------rsglmAksFAmrLmhMg------fnAhivge-----
d1moqa-  ( 390 )    mTnAgtEiGvAsTKAFTTQLTVLLMLVAKLSrlkg-ld----asiEhdIV
d1nria-  (  78 )    --------------tsGrlGvldaseCpptfgvs-tevkGiIAgg-----
d1tzba-  ( 127 )    iVp----kasapRAALPQLLTAALHVVakvygidVkiP----egLeppn-
d1vima1  (  44 )    --------------rsgyiAkaFamrLmHLg------ytVyvvge-----
d1wiwa-  (  93 )    rVGfrpgVevhIppspLApYrYlrFLLlATgreevlrs----Vde-----
d2cxna-  ( 267 )    w------dWVggRYS---LWSAIGLSIALHVgFdhFeq----LLsGAhwM
d2e5fa-  ( 125 )    vVpA-iEeSVVMTHSFTSFYFAYLQLLrysyg-------------lp--p
d2i2wa-  (  54 )    --------------gShcDAmhFAeeLtgryrenrpgyPAiaIsd-----
d2yvaa-  (  51 )    --------------tSaaNAqhFaaSMinrfeteRpslpAiALNt-----
d3ff1a1  ( 194 )    ivp----ddVggRYS---VltAVGlLPIATAgI---ni----eaiGaakA
d3g68a1  ( 131 )    tvnCgeEkSgAktKGYYCtKln-LLLGLQIArekgiis----sekyneei
d3knza1  ( 128 )    tvpcg-------tkgYHcTVln-lllaLAVAgqqqrLd----geqrrsLl
d4s1wa-  ( 388 )    lLhAgpeiavastKAYtAQIaVLSILSQiVAkeh---------eadidLl
d5lu5a-  (  57 )    --------------gSaadAqhIagqFvsrfafdRpgLpAvALTt-----
d7kqaa1  ( 151 )    pLhAgaEkSvAaTKSYLASLAALLQLAAYWk-------------qdssLr
                                  aaaaaaaaaaaaaaaa                    

                             360       370       380       390       400 
d1j5xa-  ( 172 )    erFseLVgySpeFfdiSwkvIekidLk---ehdhFVFLGs-EF--fGVSl
d1m3sa1  (  71 )    -i----------------------ltp-plaegDLVIIGsgsGetkslih
d1moqa-  ( 435 )    hGLqaLpsrIeqMLs-qdkrIealAed-FsdkhhALFLGrgdQ--yPIAl
d1nria-  ( 109 )    -ecAirhp--vegaedntkaVlndLqsihFsknDVLVGIaasgrtpYVia
d1tzba-  ( 168 )    --------------ealIhkLveeFqk------rPTIIAAeSM--rGVAy
d1vima1  (  69 )    -t----------------------vtp-ritdqDVLVGISgsGettsVvn
d1wiwa-  ( 134 )    -ALleErrrLgpevpveeNpAKflAytLl---erlPLFYSPl--frpLEg
d2cxna-  ( 304 )    DqhFlktpLekNAPVLLALLgIWYINCygCe-thALLPYdqyM--hrFaa
d2e5fa-  ( 159 )    lnageIskATekSle-yeryIreIVesf--dFqNIIFLGsgll--yPVAl
d2i2wa-  (  85 )    -vshiscv--g-ndfGfndiFsryVea-vGregDVLLGIStsGnsaNVik
d2yvaa-  (  82 )    -dnvvlta--iandrlhdevYAkqVra-lGhagDVLLAIstrGnsrdIvk
d3ff1a1  ( 232 )    reeLssdkLeeNiAyqYATiRnILya-kgy--ttELInYep-s--qyfNe
d3g68a1  ( 177 )    nkIldAinrfeaVy-lSkqWIernkek-LvnskeIrIIGhsdI--yGDTl
d3knza1  ( 174 )    lr-ekTFnhLpaLvtasqaWAqtNala-L--sadIrLtGpatL--fGTVq
d4s1wa-  ( 431 )    reLakVttAIeaIvd-dapi-eqiAtdfLetTrnAFFIGrtID--ynVSl
d5lu5a-  (  88 )    -dtsilta--IgndygyekLFsrqVqa-lGnegDVLIGYstsGkspNIla
d7kqaa1  ( 188 )    aALdlLpdaLreAwq-c--dWsaVteg-LveatnLFVLGrglg--lGAAq
                                       aaaaaaa        bbbbb      aaaaa

                             410       420       430       440       450 
d1j5xa-  ( 217 )    ESAlKCie-SlT----------------SeAys-tleYrh---gpkalVk
d1m3sa1  (  97 )    tAakAksl---------------hGiVAALTinpeSsIGk---------q
d1moqa-  ( 481 )    EGAlKLkeISyI---------------hAeAya-AgeLkh---gPlalId
d1nria-  ( 156 )    GLqyAksl---------------gAlTIsIASNpkse-ae---------i
d1tzba-  ( 196 )    RVknEFneNAkI---------------ePsVeIL-peAhh---nwiegse
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d7kqaa1
 

 

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Hypothetical protein YckFmono-SIS domainBacillus subtilis [TaxId: 1423]view
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in