Superfamily : 53244 [ MurD-like peptide ligases, peptide-binding domain ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : MurD-like peptide ligases, peptide-binding domain
# of Members : 7
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
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d1j6ua2  ( 296 )    gvhrrfsiafhd--petnIyVIdd-yAhtpdeIrnLLqtAkevFenekIV
d1o5za1  ( 294 )       grfeilekn-----gkmYILd-GahnphgAesLvrsLklyfngepLS
d1p3da2  ( 322 )    gagrrfdqlgefirpngkVrLVDd-yghhPteVgvtIkaAregwgdkrIV
d2gc6a1  ( 297 )     wparlekIsd------tplIVId-Gah-pdgIngLitaLkqlfs-qpIT
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d4cvka3  ( 320 )      vgrava-qlta---sgLrVIddSynAnpasMlaAIdiLsg--fsgrTV
                          bbbbb        bbbb      aaaaaaaaaaaaa      bb

                             60        70        80        90        100 
d1e8ca2  ( 381 )    CVFGcgGdrdk-gkRpl-gaiAeefAdvavVTddNPrt--eepraIIndI
d1j6ua2  ( 343 )    VIFQPhr--------gnfAkaLq-lAdeVVVTevyd---------sGk-i
d1o5za1  ( 335 )    LVIGILddk----nRedILrkYtgiFerVIVTrVpsprMk-----dMnsL
d1p3da2  ( 372 )    -IFQPhrysrTrdlfddFvqvLS-qvdalI-LdVyaageapivgAdSksL
d2gc6a1  ( 338 )    VIaGl----------aamad-LtaafstVylVpVpgtpra----------
d2wjpa3  ( 341 )    LLLGGdGk--s-adFsp-LaryLngdnvrLYCFG----------rdGaqL
d4cvka3  ( 363 )    LVLGdMg---aeqaHreVGayAagkVsALyAvgp-----------lMahA
                    bbb                        bbbb               aaaa

                             110       120       130       140       150 
d1e8ca2  ( 428 )    lagldag---hakv-egRaeaVtcAVq-AkendVVLVAGKGhedyqivgn
d1j6ua2  ( 392 )    wdsLkslgk-eAyfveklpeLEkvI--svsenTVFLFVGa----------
d1o5za1  ( 376 )    vdmAkkff--nVeviedPleAIesTe------rATVVTGS----------
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d2gc6a1  ( 374 )    -----------lrlkdsWqeAlaaSlnd-vpdqPIVITgs----------
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                    a                aaaaaaaa        bbbbb            

                             160       170     
d1e8ca2  ( 476 )    qrldy-sDrvtVarlLgvia       
d1j6ua2  ( 429 )    -----gdIiySSrrFverYqssk    
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                           aaaaaaaaaa          

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurEMurCDEF C-terminal domainEscherichia coli [TaxId: 562]view
UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase MurCMurCDEF C-terminal domainThermotoga maritima [TaxId: 2336]view
Folylpolyglutamate synthetase, C-terminal domainFolylpolyglutamate synthetase, C-terminal domainThermotoga maritima [TaxId: 2336]view
UDP-N-acetylmuramate-alanine ligase MurCMurCDEF C-terminal domainHaemophilus influenzae [TaxId: 727]view
Folylpolyglutamate synthetase, C-terminal domainFolylpolyglutamate synthetase, C-terminal domainLactobacillus casei [TaxId: 1582]view
automated matchesautomated matchesEscherichia coli [TaxId: 668369]view
automated matchesautomated matchesPseudomonas aeruginosa, PA01 [TaxId: 208964]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170
- V C G R - E V F T A P - - - - G K P T V V V D - Y A H T P D A L E K A L Q A A R L H C - A G K L W C V F G C G G D R D K - G K R P L - G A I A E E F A D V A V V T D D N P R T - - E E P R A I I N D I L A G L D A G - - - H A K V - E G R A E A V T C A V Q - A K E N D V V L V A G K G H E D Y Q I V G N Q R L D Y - S D R V T V A R L L G V I A - - - - - - -
G V H R R F S I A F H D - - P E T N I Y V I D D - Y A H T P D E I R N L L Q T A K E V F E N E K I V V I F Q P H R - - - - - - - - G N F A K A L Q - L A D E V V V T E V Y D - - - - - - - - - S G K - I W D S L K S L G K - E A Y F V E K L P E L E K V I - - S V S E N T V F L F V G A - - - - - - - - - - - - - - - G D I I Y S S R R F V E R Y Q S S K - - - -
- - - G R F E I L E K N - - - - - G K M Y I L D - G A H N P H G A E S L V R S L K L Y F N G E P L S L V I G I L D D K - - - - N R E D I L R K Y T G I F E R V I V T R V P S P R M K - - - - - D M N S L V D M A K K F F - - N V E V I E D P L E A I E S T E - - - - - - R A T V V T G S - - - - - - - - - - - - - - - L F L V G Y V R E F L T T G K I N E E W K L
G A G R R F D Q L G E F I R P N G K V R L V D D - Y G H H P T E V G V T I K A A R E G W G D K R I V - I F Q P H R Y S R T R D L F D D F V Q V L S - Q V D A L I - L D V Y A A G E A P I V G A D S K S L C R S I R N L G K V D P I L V S D T S Q L G D V L D Q I I Q D G D L I L A Q G A - - - - - - - - - - - - - - - G S V S K I S R G L A E S W - - - - - - - -
- W P A R L E K I S D - - - - - - T P L I V I D - G A H - P D G I N G L I T A L K Q L F S - Q P I T V I A G L - - - - - - - - - - A A M A D - L T A A F S T V Y L V P V P G T P R A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L R L K D S W Q E A L A A S L N D - V P D Q P I V I T G S - - - - - - - - - - - - - - - L Y L A S A V R Q T L L G - - - - - - - - -
G L P H R F E V V L E H - - - - N G V R W I N D S K A T N V G S T E A A L N G - - L H V - D G T L H L L L G G D G K - - S - A D F S P - L A R Y L N G D N V R L Y C F G - - - - - - - - - - R D G A Q L A A - L R P E - - - V A E Q T E T M E Q A M R L L A P R V Q P G D M V L L S P A C A S L D Q F K - - - - - N F E Q R G N E F A R L A K E L G - - - - - - -
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