Superfamily : 50203 [ Bacterial enterotoxins ]
Class : All beta proteins
Fold : OB-fold
# of Members : 20
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1an8a1  (   4 )                    kdisnvksdllyay---ti--t-pydykdCrVnf
d1c48a-  ( 101 )                                           tpdÇvtgkVey
d1enfa1  (   2 )              dlhdkseltdlalanaygqy------nh-pFikenikS-d
d1esfa1  (   1 )    sekseeinekdlrkkselqgtalgnlkqiy---y-yne-kAktenkes-h
d1et9a1  (   1 )                   nsynttnrhnlesly---khdsn-lIeadsiknsp
d1eu3a1  (   2A)                    glevdnnsllrniy---st--i-vYeysdivIdf
d1ty0a1  (   4 )                   senikdvklqlnyay---ei--i-pVdytnCnIdy
d2rdha1  (   6 )                      rsqatqdlseyy---nr--p-yfdlrnlsGyr
d2z8la1  (  13 )                         difdlrdyy---sg--a-skelknvtGyr
d3ea6a1  (   3 )                       digidnlrnfy---tkkd--fvdlkdvkDnd
d3r2ta1  (  38 )                     nrlydtnklhqyy---sg--p-syeLtnvsgqS
d3seba1  (   1 )     esqpdpkpdelhksskftgl-menmkvly---d-dn--hVsainvkS-i
d4fo2a-  (   1 )                       gAsqffkdnÇnri----t-Aslve-gveLtk
d4ohja1  (  42 )                      tndnikdlldwy---ss--g-sdtftnSeVld
d5elba-  (   1 )                       tp-qnitdlÇaey----hnTqihtLndkIfs
d5i4da1  ( 165 )                      tpk-yedlrayy---tk--p-sfefekqfGfM
d6lwta1  (  40 )                        hdkealyryy---tg--k-tmeMknisAlk
d6ro0b2  (  90 )                                 ttrntgqpatdhyysnVtAtr
d6ro0d-  (   1 )                                      dvp-yvlvktnMvVts
d6ro0f-  (   2 )                                        lpthlyk-nFtVqe
                                           aaaaaa           bbbbbbbb b

                             60        70        80        90        100 
d1an8a1  (  32 )    st---------thtLnIdT---qkyrg----kdyyIsSem----------
d1c48a-  ( 112 )    Tkynd------ddtftVkVg-------------dkeLfTnrw--------
d1enfa1  (  34 )    eis-----g--ekdLIFrn---qGd----sg--nDLrVkFa---------
d1esfa1  (  45 )    dqf-----l--qhTIlFkg---fft----yn---dLLVdfd---------
d1et9a1  (  32 )    div-----t--shmLkYsv--------------knLsVfFe---------
d1eu3a1  (  28 )    kt---------shnLvTk-----kLdvr-dardFfInSem----------
d1ty0a1  (  33 )    lt---------thdFyIdI---ssykk----knfsVdSev----------
d2rdha1  (  32 )    eg----------ntVtFin---h---------yqqTdVkLe---------
d2z8la1  (  36 )    ysk-----g-g-hyLiFdk---h---------qkftrIqIf---------
d3ea6a1  (  29 )    tp------i--anqLqFsn----------es--ydLiSesk---------
d3r2ta1  (  65 )    qgy-----y-dsnVLlfnq---q---------nqkFQVfLl---------
d3seba1  (  42 )    dqf-----l--yfDLIYsi---kdtklg-ny--dnVrVeFk---------
d4fo2a-  (  26 )    yisdinn---ntdgmyVvS--st--------ggvwrIsrak---d--ypd
d4ohja1  (  68 )    Ns---------lgsMrIkN---td--------gSiSlIiFp---------
d5elba-  (  27 )    yteslag---kremAiItF--kn--------gatFqVevpgsqHi--dsq
d5i4da1  ( 190 )    lkp-----wttvrFMNViP---n---------rfiYkIALv---------
d6lwta1  (  64 )    hg---------knnLrfkf---r---------gikIqVlLp---------
d6ro0b2  ( 111 )    llsst------nsRlÇAVFvrsg--------qpvIGAÇtSpy----dgky
d6ro0d-  (  16 )    vamkpyevtptrmLVÇGiAaklgaaasspdah-VpFÇFgkdlkrpgss--
d6ro0f-  (  15 )    lalklkg---knqeFçLTAfmsg--------rslvrAçLsdaghe--h--
                    b            bbbbb                bbbbb           

                             110       120       130       140       150 
d1an8a1  (  56 )    ---syeasqkfk------rddhVdVfglfyilnsh-----tGeyIyggIt
d1c48a-  ( 135 )    -----nlqslLlsAqit--gmtVTIktnaçhn----------gGtFseVi
d1enfa1  (  59 )    ---tadlAqkfk-------nknVdIygasfyykÇeisen-isEÇLyggTt
d1esfa1  (  73 )    ---skdiVdkyk-------gkkVdLygayygyqÇaGgtpnkTAçMyggVt
d1et9a1  (  54 )    ---kdwiSqefk-------dkeVdIyalSaqe---------ryeAfggIt
d1eu3a1  (  53 )    ---deyaAndfk------tgdkIaVfsvPfdwnylsk-gkVtAyTyggIt
d1ty0a1  (  57 )    ---esyiTtkft------knqkVnIfglPyiftry-----dvyyIyggVt
d2rdha1  (  51 )    ---g-kdkdkIkd----gnnenldVfVvre-----------dnnSiggIt
d2z8la1  (  59 )    ---g-kdierlkt----rknpgLdIfVvkeaenr-----ngtvfSyggVt
d3ea6a1  (  50 )    ---dfnkFsnfk-------gkkLdVfgisyngq------cntkyIyggVt
d3r2ta1  (  88 )    ---g-kdenkyke-----kthgLdVfAvpelvdl-----dgrIfSvsgVt
d3seba1  (  70 )    ---nkdlAdkyk-------dkyVdVfgaNyyyqÇyFs--drkTÇMyggVt
d4fo2a-  (  58 )    nvmtaemrkiAmaAvls--gmrV-NMÇASpas----s-----pnvIwaIe
d4ohja1  (  89 )    ---spyyspaft------kgekVdLnTkrtkkSqhtsegtyiHfQisgVt
d5elba-  (  62 )    kkaiermkdtLriAylt--eakVekLÇVwnnk----t-----phAIaais
d5i4da1  ( 214 )    ---g-kdekkYkd----gpydnidVfIvlednky-----qlkkySvggIt
d6lwta1  (  84 )    ---g-ndkskFqq----rsYegLdVfFvqekrdk-----hdifyTvggVi
d6ro0b2  ( 143 )    wsmysrLrkmLylIyva--gisVrVhVSkeeqYyDYedatFeTYALtgIs
d6ro0d-  (  63 )    -----pmEvmLraVfmq--qrpLrMfLG-pkqltfe---gkpAleLirMv
d6ro0f-  (  50 )    dtwfdtmlgfAisAyal--ksrIaLtvedspy----pgt---pgdLleLq
                          aaaa           bbbbbb               bbbb  bb

                             160 
d1an8a1  (  92 )    pAqn      
d1c48a-  ( 168 )    fr        
d1enfa1  (  99 )    lns       
d1esfa1  ( 113 )    lhdnnrl--t
d1et9a1  (  92 )    ltn------s
d1eu3a1  (  93 )    pyqk      
d1ty0a1  (  93 )    pSvnsns   
d2rdha1  (  88 )    ktn-rtq   
d2z8la1  (  96 )    kkn-qg    
d3ea6a1  (  84 )    atn       
d3r2ta1  ( 124 )    kkn-vk    
d3seba1  ( 120 )    eh        
d4fo2a-  (  96 )    lea       
d4ohja1  ( 130 )    ntek      
d5elba-  ( 101 )    man       
d5i4da1  ( 251 )    ktn-s-k   
d6lwta1  ( 121 )    qnn-kt    
d6ro0b2  ( 191 )    içnpgsslç 
d6ro0d-  ( 102 )    eÇsgk-qdÇp
d6ro0f-  (  91 )    iÇplng-yÇe
                    b
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Streptococcal superantigen Spe-CSuperantigen toxins, N-terminal domainStreptococcus pyogenes [TaxId: 1314]view
Verotoxin-1/shiga-toxin, B-pentamerBacterial AB5 toxins, B-subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
Staphylococcal enterotoxin H, SEHSuperantigen toxins, N-terminal domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
Staphylococcal enterotoxin A, SEASuperantigen toxins, N-terminal domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
Streptococcal superantigen Spe-HSuperantigen toxins, N-terminal domainStreptococcus pyogenes [TaxId: 1314]view
Streptococcal superantigen Smez-2Superantigen toxins, N-terminal domainStreptococcus pyogenes [TaxId: 1314]view
Streptococcal pyrogenic exotoxin Spe-JSuperantigen toxins, N-terminal domainStreptococcus pyogenes [TaxId: 1314]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
Superantigen-like protein SET3Superantigen toxins, N-terminal domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 93061]view
Staphylococcal enterotoxin B, SEBSuperantigen toxins, N-terminal domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
automated matchesBacterial AB5 toxins, B-subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
automated matchesSuperantigen toxins, N-terminal domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
Cholera toxinBacterial AB5 toxins, B-subunitsVibrio cholerae [TaxId: 666]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
automated matchesautomated matchesStaphylococcus aureus [TaxId: 46170]view
automated matchesBacterial AB5 toxins, B-subunitsBordetella pertussis [TaxId: 520]view
automated matchesBacterial AB5 toxins, B-subunitsBordetella pertussis [TaxId: 520]view
automated matchesBacterial AB5 toxins, B-subunitsBordetella pertussis [TaxId: 520]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160
- - - - - - - - - - - - - - - - K D I S N V K S D L L Y A Y - - - T I - - T - P Y D Y K D C R V N F S T - - - - - - - - - T H T L N I D T - - - Q K Y R G - - - - K D Y Y I S S E M - - - - - - - - - - - - - S Y E A S Q K F K - - - - - - R D D H V D V F G L F Y I L N S H - - - - - T G E Y I Y G G I T P A Q N - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T P D C V T G K V E Y T K Y N D - - - - - - D D T F T V K V G - - - - - - - - - - - - - D K E L F T N R W - - - - - - - - - - - - - N L Q S L L L S A Q I T - - G M T V T I K T N A C H N - - - - - - - - - - G G T F S E V I F R - - - - - - - -
- - - - - - - - - - D L H D K S E L T D L A L A N A Y G Q Y - - - - - - N H - P F I K E N I K S - D E I S - - - - - G - - E K D L I F R N - - - Q G D - - - - S G - - N D L R V K F A - - - - - - - - - - - - T A D L A Q K F K - - - - - - - N K N V D I Y G A S F Y Y K C E I S E N - I S E C L Y G G T T L N S - - - - - - -
S E K S E E I N E K D L R K K S E L Q G T A L G N L K Q I Y - - - Y - Y N E - K A K T E N K E S - H D Q F - - - - - L - - Q H T I L F K G - - - F F T - - - - Y N - - - D L L V D F D - - - - - - - - - - - - S K D I V D K Y K - - - - - - - G K K V D L Y G A Y Y G Y Q C A G G T P N K T A C M Y G G V T L H D N N R L - - T
- - - - - - - - - - - - - - - N S Y N T T N R H N L E S L Y - - - K H D S N - L I E A D S I K N S P D I V - - - - - T - - S H M L K Y S V - - - - - - - - - - - - - - K N L S V F F E - - - - - - - - - - - - K D W I S Q E F K - - - - - - - D K E V D I Y A L S A Q E - - - - - - - - - R Y E A F G G I T L T N - - - - - - S
- - - - - - - - - - - - - - - - G L E V D N N S L L R N I Y - - - S T - - I - V Y E Y S D I V I D F K T - - - - - - - - - S H N L V T K - - - - - K L D V R - D A R D F F I N S E M - - - - - - - - - - - - - D E Y A A N D F K - - - - - - T G D K I A V F S V P F D W N Y L S K - G K V T A Y T Y G G I T P Y Q K - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - S E N I K D V K L Q L N Y A Y - - - E I - - I - P V D Y T N C N I D Y L T - - - - - - - - - T H D F Y I D I - - - S S Y K K - - - - K N F S V D S E V - - - - - - - - - - - - - E S Y I T T K F T - - - - - - K N Q K V N I F G L P Y I F T R Y - - - - - D V Y Y I Y G G V T P S V N S N S - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - R S Q A T Q D L S E Y Y - - - N R - - P - Y F D L R N L S G Y R E G - - - - - - - - - - N T V T F I N - - - H - - - - - - - - - Y Q Q T D V K L E - - - - - - - - - - - - G - K D K D K I K D - - - - G N N E N L D V F V V R E - - - - - - - - - - - D N N S I G G I T K T N - R T Q - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D I F D L R D Y Y - - - S G - - A - S K E L K N V T G Y R Y S K - - - - - G - G - H Y L I F D K - - - H - - - - - - - - - Q K F T R I Q I F - - - - - - - - - - - - G - K D I E R L K T - - - - R K N P G L D I F V V K E A E N R - - - - - N G T V F S Y G G V T K K N - Q G - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - D I G I D N L R N F Y - - - T K K D - - F V D L K D V K D N D T P - - - - - - I - - A N Q L Q F S N - - - - - - - - - - E S - - Y D L I S E S K - - - - - - - - - - - - D F N K F S N F K - - - - - - - G K K L D V F G I S Y N G Q - - - - - - C N T K Y I Y G G V T A T N - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - N R L Y D T N K L H Q Y Y - - - S G - - P - S Y E L T N V S G Q S Q G Y - - - - - Y - D S N V L L F N Q - - - Q - - - - - - - - - N Q K F Q V F L L - - - - - - - - - - - - G - K D E N K Y K E - - - - - K T H G L D V F A V P E L V D L - - - - - D G R I F S V S G V T K K N - V K - - - -
- E S Q P D P K P D E L H K S S K F T G L - M E N M K V L Y - - - D - D N - - H V S A I N V K S - I D Q F - - - - - L - - Y F D L I Y S I - - - K D T K L G - N Y - - D N V R V E F K - - - - - - - - - - - - N K D L A D K Y K - - - - - - - D K Y V D V F G A N Y Y Y Q C Y F S - - D R K T C M Y G G V T E H - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - G A S Q F F K D N C N R I - - - - T - A S L V E - G V E L T K Y I S D I N N - - - N T D G M Y V V S - - S T - - - - - - - - G G V W R I S R A K - - - D - - Y P D N V M T A E M R K I A M A A V L S - - G M R V - N M C A S P A S - - - - S - - - - - P N V I W A I E L E A - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - T N D N I K D L L D W Y - - - S S - - G - S D T F T N S E V L D N S - - - - - - - - - L G S M R I K N - - - T D - - - - - - - - G S I S L I I F P - - - - - - - - - - - - S P Y Y S P A F T - - - - - - K G E K V D L N T K R T K K S Q H T S E G T Y I H F Q I S G V T N T E K - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - T P - Q N I T D L C A E Y - - - - H N T Q I H T L N D K I F S Y T E S L A G - - - K R E M A I I T F - - K N - - - - - - - - G A T F Q V E V P G S Q H I - - D S Q K K A I E R M K D T L R I A Y L T - - E A K V E K L C V W N N K - - - - T - - - - - P H A I A A I S M A N - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - T P K - Y E D L R A Y Y - - - T K - - P - S F E F E K Q F G F M L K P - - - - - W T T V R F M N V I P - - - N - - - - - - - - - R F I Y K I A L V - - - - - - - - - - - - G - K D E K K Y K D - - - - G P Y D N I D V F I V L E D N K Y - - - - - Q L K K Y S V G G I T K T N - S - K - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H D K E A L Y R Y Y - - - T G - - K - T M E M K N I S A L K H G - - - - - - - - - K N N L R F K F - - - R - - - - - - - - - G I K I Q V L L P - - - - - - - - - - - - G - N D K S K F Q Q - - - - R S Y E G L D V F F V Q E K R D K - - - - - H D I F Y T V G G V I Q N N - K T - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T T R N T G Q P A T D H Y Y S N V T A T R L L S S T - - - - - - N S R L C A V F V R S G - - - - - - - - Q P V I G A C T S P Y - - - - D G K Y W S M Y S R L R K M L Y L I Y V A - - G I S V R V H V S K E E Q Y Y D Y E D A T F E T Y A L T G I S I C N P G S S L C -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D V P - Y V L V K T N M V V T S V A M K P Y E V T P T R M L V C G I A A K L G A A A S S P D A H - V P F C F G K D L K R P G S S - - - - - - - P M E V M L R A V F M Q - - Q R P L R M F L G - P K Q L T F E - - - G K P A L E L I R M V E C S G K - Q D C P
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L P T H L Y K - N F T V Q E L A L K L K G - - - K N Q E F C L T A F M S G - - - - - - - - R S L V R A C L S D A G H E - - H - - D T W F D T M L G F A I S A Y A L - - K S R I A L T V E D S P Y - - - - P G T - - - P G D L L E L Q I C P L N G - Y C E

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
d1an8a1 A Q8NKX2 GO:0005576
d1an8a1 A Q8NKX2 GO:0035821
d1an8a1 A Q8NKX2 GO:0090729
d1c48a_ A P69178 GO:0005576
d1c48a_ A P69178 GO:0019836
d1c48a_ A P69178 GO:0090729
d1c48a_ A P69178 GO:0098676
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0005576
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0035821
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0042289
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0042608
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0046872
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0090729
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0005576
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0035821
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0042289
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0042608
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0046872
d1enfa1 A P0A0M0 GO:0090729
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0005515
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0005576
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0035821
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0042289
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0046872
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0090729
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0005515
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0005576
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0035821
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0042289
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0046872
d1esfa1 A P0A0L2 GO:0090729
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0005576
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0035821
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0090729
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0005576
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0035821
d1et9a1 A P0C0I6 GO:0090729
d1eu3a1 A Q9RQQ5 GO:0005576
d1eu3a1 A Q9RQQ5 GO:0035821
d1eu3a1 A Q9RQQ5 GO:0046872
d1eu3a1 A Q9RQQ5 GO:0090729
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0005576
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0035821
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0046872
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0090729
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0005576
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0035821
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0046872
d1ty0a1 A Q7BAE3 GO:0090729
d2z8la1 A Q9ZFS6 GO:0005515
d2z8la1 A Q9ZFS6 GO:0005576
d3seba1 A P01552 GO:0005515
d3seba1 A P01552 GO:0005576
d3seba1 A P01552 GO:0035821
d3seba1 A P01552 GO:0046872
d3seba1 A P01552 GO:0090729
d3seba1 A P01552 GO:0005515
d3seba1 A P01552 GO:0005576
d3seba1 A P01552 GO:0035821
d3seba1 A P01552 GO:0046872
d3seba1 A P01552 GO:0090729
 
Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in