Superfamily : 48163 [ An anticodon-binding domain of class I aminoacyl-tRNA synthetases ]
Class : All alpha proteins
Fold : An anticodon-binding domain of class I aminoacyl-tRNA synthetases
# of Members : 9
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1irxa1  ( 320 )    glgilnlydefEkveriyfgvegeelrrtYelsmpkkperlvAQApFrFL
d1j09a1  ( 306 )          dleklrwmnGkyIr-evlsleeVaerVkpfLreagLswe-----
d2cfoa2  ( 312 )          dwdklnwlnrqyIq--qlepeeFLaeLiplWqgagyaFd--e--
d2o5ra2  ( 313 )          dp-klkw-nGyylr-n--pieklaelAkpfFekagIkIi-----
d3afha2  ( 316 )          dyqklewvnGkhMr--ridledLKreFiewAkyagkeIp--s--
d4g6za2  ( 305 )          dhnklnwlnnhyIk--eaddarLaglAkpfFaalgId----a--
d4gria2  ( 315 )          dyhkldffnsyyir--ekkdedLfnlLlpfFqk-gyVskpst--
d6b1pa2  ( 300 )            swlnwlnahylqs--------------------------aLl
d7k86a2  ( 299 )          dm-algwvnqhfLk--tedvaaIvphLvyqLqklgldva--a--
                               aaaaaaaa      aaaaaaaaaaaa             

                             60        70        80        90        100 
d1irxa1  ( 375 )    avLVqLphlteedIInvLikqghIprdlskedverVklRInlArnWvkky
d1j09a1  ( 344 )    ---------seayLrrAVeLMrp--------rFdtlkeFPekArYLFte-
d2cfoa2  ( 350 )    -------erdrpWLfdLAqlLqp--------gLntlreAidqGavFFip-
d2o5ra2  ( 350 )    ---------deeyFkkVLeiTke--------rVevlseFPeeSrFFfe--
d3afha2  ( 354 )    --------vderyFseTLrICre--------kvntlsqLydiMyPFMnd-
d4g6za2  ( 341 )    -------gaigpdLvsVMglmk---------dAstvkeIAenSAmFYra-
d4gria2  ( 355 )    -------leenqkLklLIplIks--------rI-klsdAlnmTkfFye--
d6b1pa2  ( 322 )    elLpfSf-sdlpalldalk------------eSqtlkeLAlkIdeVliap
d7k86a2  ( 337 )    -------gpa---pedVVvALre--------rVqtlkeMAekAvvWYqp-
                                 aaaaaaaa                aaaaa        

                             110       120       130       140       150 
d1irxa1  ( 425 )    ApedvkFsilekppeveVsedVreAMneVAewLenheefsveeFnniLfe
d1j09a1  ( 376 )    ----dYpvsekAqrklee---glplLkeLyprLraqeewteaaLealLrg
d2cfoa2  ( 384 )    ----svtfdseAma-qLgqpqSatILayLlehLpaepaLtvamGqqlIqq
d2o5ra2  ( 381 )    ----dpapv-------eIpee-keVfsqL-eeLqnv-rwt-eeItpvFkk
d3afha2  ( 387 )    ----dYeYekdYvekfLkreeAerVLeeAkkaFkdlnswnmeeIekTLrd
d4g6za2  ( 377 )    ----patps-----------------------------------------
d4gria2  ( 388 )    ------dIwnefe----------cilelkp----------------grse
d6b1pa2  ( 371 )    yeefn-------------------almplLefa---------------ee
d7k86a2  ( 368 )    ----lteydeaAvakhF-kagaevaLgkArelLaalp-wtaesVgvALhd
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1irxa1  ( 475 )    VakrrgIssreWfstLyrLFIgkergprLAsFLASLd--------rsfVi
d1j09a1  ( 419 )    FAaekgvklgqVaqPLrAALTGsleTpgLfeILalLgk-erALrRLeral
d2cfoa2  ( 429 )    AAkaAgvkkgaTmrTLrAALTGaVhgpdLmaAWqILHqrgwDepRLaaAl
d2o5ra2  ( 419 )    VLkqhgvkpkeFy-tLrrVLTgreeGpelvnIiplLgk-eiFlrRierSl
d3afha2  ( 433 )    LsekglaskkvVfqLIrGAVTGklvTPgLfeTIevLgk-erTlkRLerTL
d4g6za2  ( 449 )    -----------------------------davlllfgvvsra        
d4gria2  ( 429 )    nda---------glpiriAALGs-vsPpLfdSlklIg------skvferi
d6b1pa2  ( 419 )    ia-------gsfmqpLrlALlgg--ggigleAlfILg--------kesRi
d7k86a2  ( 413 )    AaaaleigmgkVaqPLrVAITGtqvspdishTVyLAgr-eqAl-RIdvAi
                             aaa   aaaaa        aaaaaaa          aaaa 

                           
d1irxa1  ( 517 )    kRLrleg
d1j09a1  ( 468 )    a      
d2cfoa2  ( 479 )    kqAqtts
d2o5ra2  ( 468 )    g      
d3afha2  ( 482 )    qflkk  
d4g6za2                    
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d6b1pa2  ( 459 )    nFl    
d7k86a2  ( 462 )    tkVa   
                           

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
C-terminal domain of class I lysyl-tRNA synthetaseC-terminal domain of class I lysyl-tRNA synthetasePyrococcus horikoshii [TaxId: 53953]view
C-terminal domain of glutamyl-tRNA synthetase (GluRS)C-terminal domain of glutamyl-tRNA synthetase (GluRS)Thermus thermophilus [TaxId: 274]view
automated matchesautomated matchesSynechococcus elongatus [TaxId: 32046]view
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No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200
G L G I L N L Y D E F E K V E R I Y F G V E G E E L R R T Y E L S M P K K P E R L V A Q A P F R F L A V L V Q L P H L T E E D I I N V L I K Q G H I P R D L S K E D V E R V K L R I N L A R N W V K K Y A P E D V K F S I L E K P P E V E V S E D V R E A M N E V A E W L E N H E E F S V E E F N N I L F E V A K R R G I S S R E W F S T L Y R L F I G K E R G P R L A S F L A S L D - - - - - - - - R S F V I K R L R L E G
- - - - - - D L E K L R W M N G K Y I R - E V L S L E E V A E R V K P F L R E A G L S W E - - - - - - - - - - - - - - S E A Y L R R A V E L M R P - - - - - - - - R F D T L K E F P E K A R Y L F T E - - - - - D Y P V S E K A Q R K L E E - - - G L P L L K E L Y P R L R A Q E E W T E A A L E A L L R G F A A E K G V K L G Q V A Q P L R A A L T G S L E T P G L F E I L A L L G K - E R A L R R L E R A L A - - - - - -
- - - - - - D W D K L N W L N R Q Y I Q - - Q L E P E E F L A E L I P L W Q G A G Y A F D - - E - - - - - - - - - E R D R P W L F D L A Q L L Q P - - - - - - - - G L N T L R E A I D Q G A V F F I P - - - - - S V T F D S E A M A - Q L G Q P Q S A T I L A Y L L E H L P A E P A L T V A M G Q Q L I Q Q A A K A A G V K K G A T M R T L R A A L T G A V H G P D L M A A W Q I L H Q R G W D E P R L A A A L K Q A Q T T S
- - - - - - D P - K L K W - N G Y Y L R - N - - P I E K L A E L A K P F F E K A G I K I I - - - - - - - - - - - - - - D E E Y F K K V L E I T K E - - - - - - - - R V E V L S E F P E E S R F F F E - - - - - - D P A P V - - - - - - - E I P E E - K E V F S Q L - E E L Q N V - R W T - E E I T P V F K K V L K Q H G V K P K E F Y - T L R R V L T G R E E G P E L V N I I P L L G K - E I F L R R I E R S L G - - - - - -
- - - - - - D Y Q K L E W V N G K H M R - - R I D L E D L K R E F I E W A K Y A G K E I P - - S - - - - - - - - - - V D E R Y F S E T L R I C R E - - - - - - - - K V N T L S Q L Y D I M Y P F M N D - - - - - D Y E Y E K D Y V E K F L K R E E A E R V L E E A K K A F K D L N S W N M E E I E K T L R D L S E K G L A S K K V V F Q L I R G A V T G K L V T P G L F E T I E V L G K - E R T L K R L E R T L Q F L K K - -
- - - - - - D H N K L N W L N N H Y I K - - E A D D A R L A G L A K P F F A A L G I D - - - - A - - - - - - - - - G A I G P D L V S V M G L M K - - - - - - - - - D A S T V K E I A E N S A M F Y R A - - - - - P A T P S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D A V L L L F G V V S R A - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - D Y H K L D F F N S Y Y I R - - E K K D E D L F N L L L P F F Q K - G Y V S K P S T - - - - - - - - - L E E N Q K L K L L I P L I K S - - - - - - - - R I - K L S D A L N M T K F F Y E - - - - - - - - D I W N E F E - - - - - - - - - - C I L E L K P - - - - - - - - - - - - - - - - G R S E N D A - - - - - - - - - G L P I R I A A L G S - V S P P L F D S L K L I G - - - - - - S K V F E R I A Q F R N - -
- - - - - - - - S W L N W L N A H Y L Q S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L L E L L P F S F - S D L P A L L D A L K - - - - - - - - - - - - E S Q T L K E L A L K I D E V L I A P Y E E F N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L M P L L E F A - - - - - - - - - - - - - - - E E I A - - - - - - - G S F M Q P L R L A L L G G - - G G I G L E A L F I L G - - - - - - - - K E S R I N F L - - - -
- - - - - - D M - A L G W V N Q H F L K - - T E D V A A I V P H L V Y Q L Q K L G L D V A - - A - - - - - - - - - G P A - - - P E D V V V A L R E - - - - - - - - R V Q T L K E M A E K A V V W Y Q P - - - - - L T E Y D E A A V A K H F - K A G A E V A L G K A R E L L A A L P - W T A E S V G V A L H D A A A A L E I G M G K V A Q P L R V A I T G T Q V S P D I S H T V Y L A G R - E Q A L - R I D V A I T K V A - - -

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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