Superfamily : 47396 [ Transcription factor IIA (TFIIA), alpha-helical domain ]
Class : All alpha proteins
Fold : Transcription factor IIA (TFIIA), alpha-helical domain
# of Members : 3
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1nh2b-  (   3 )    naeasrvyeiiVesvVnevredfenagideqtLqdlkniwqkklte    
d1nh2d1  (   5 )    gyyelyrrstiGnslvdaldtlisdgrieaslamrvletfDkvvaetlkd
d1nvpb-  (   9 )      tvp-lyrsvIedvIndvrdiflddgvdeqvLmelktlwenklm     
                             aaaaaaaaa aaaaa     aaaaaaaaaaaaaaa      

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Large chain TOA1, N-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), alpha-helical domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Small chain TOA2, N-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), alpha-helical domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Large chain TOA1, N-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), alpha-helical domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50
N A E A S R V Y E I I V E S V V N E V R E D F E N A G I D E Q T L Q D L K N I W Q K K L T E - - - -
G Y Y E L Y R R S T I G N S L V D A L D T L I S D G R I E A S L A M R V L E T F D K V V A E T L K D
- - T V P - L Y R S V I E D V I N D V R D I F L D D G V D E Q V L M E L K T L W E N K L M - - - - -

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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