Superfamily : 89095 [ GatB/YqeY motif ]
Class : All alpha proteins
Fold : GatB/YqeY motif
# of Members : 4
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1ng6a-  (   1 )    msllerLnqdmklymknr-ekdkltVVrmVkasLqneaiklkkdsLtede
d1zq1c1  ( 457 )    elpqakVerYvkey---kldrslAqtlVd----ddlfeg-----------
d2d6fc1  ( 445 )    elpsekkerImrdy---gLsedlAsqLvkrn-lVdeFd-----------t
d2f2ab1  ( 294 )    elpderkakYvnel---gLpayDAhvLTltkemSdfFesTiehg---Adv
                      aaaaaaaaaa        aaaaaaaaa                     

                             60        70        80        90        100 
d1ng6a-  (  50 )    eltVLsreLkqrkdslqefsnanrldlvdkVqkeldiLevYLpeqlseee
d1zq1c1  ( 499 )    -paalv--------------------------------------------
d2d6fc1  ( 488 )    tviAsllAytlrelrr                                  
d2f2ab1  ( 338 )    klTSnwLmggVneylnkn-------------qveLldtk------Ltpen
                    aaaaa    aaaaa                                    

                             110       120       130       140       
d1ng6a-  ( 100 )    LrtiVneTiaevgAsskadmgkVmgaImpkVkGkadgslInkLVssqLs
d1zq1c1  ( 512 )    ------------------------------------------------g
d2d6fc1                                                              
d2f2ab1  ( 369 )    LAgMIklied------gtMsskiAkkVFpeLAakggnAkqiMednglvq
                                                                     

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Hypothetical protein YqeYGatB/YqeY domainBacillus subtilis [TaxId: 1423]view
Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E, GatE, C-terminal domainGatB/GatE C-terminal domain-likePyrococcus abyssi [TaxId: 29292]view
Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E, GatE, C-terminal domainGatB/GatE C-terminal domain-likeMethanobacterium thermoautotrophicum [TaxId: 145262]view
Aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B, GatB, C-terminal domainGatB/GatE C-terminal domain-likeStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140
M S L L E R L N Q D M K L Y M K N R - E K D K L T V V R M V K A S L Q N E A I K L K K D S L T E D E E L T V L S R E L K Q R K D S L Q E F S N A N R L D L V D K V Q K E L D I L E V Y L P E Q L S E E E L R T I V N E T I A E V G A S S K A D M G K V M G A I M P K V K G K A D G S L I N K L V S S Q L S
E L P Q A K V E R Y V K E Y - - - K L D R S L A Q T L V D - - - - D D L F E G - - - - - - - - - - - - P A A L V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G
E L P S E K K E R I M R D Y - - - G L S E D L A S Q L V K R N - L V D E F D - - - - - - - - - - - T T V I A S L L A Y T L R E L R R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
E L P D E R K A K Y V N E L - - - G L P A Y D A H V L T L T K E M S D F F E S T I E H G - - - A D V K L T S N W L M G G V N E Y L N K N - - - - - - - - - - - - - Q V E L L D T K - - - - - - L T P E N L A G M I K L I E D - - - - - - G T M S S K I A K K V F P E L A A K G G N A K Q I M E D N G L V Q

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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