PASS2.8 - Home

solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x

beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x

hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x

                             10        20        30        40        50  
d1j0la-  (  -2 )                                                 gshmd
d1miwa2  (   2 )                                                      
d1no5a-  (   6 )                                                   qld
d1ou5a2  (   1 )                                              mklqspeF
d1px5a2  (   1 )                         melrhTpardldkfiedhllpn-----tF
d1r89a2  (   1 )                             mkveeilekalel-vipd----eee
d1v4aa2  (   3 )    plssplqqywqtvvlpeplaeslsaqaksVLTfsdfVqdSviahpeWteL
d1vfga2  (   1 )                                                      
d1vj7a2  ( 197 )                                    etefykIshmmnekrrer
d1ylqa1  (   1 )                                                      
d2b4va2  (  31 )                         pspdhyavwgkaiaennrrvgp--ehfrt
d2bcqa3  ( 386 )                                                     r
d2fcla1  (   2 )                                                      
d2fmpa3  ( 149 )                                                     r
d2hhpa2  (   4 )         qkvfgitgpvstvgataaenklndsliqelkkegsfEteqetanR
d2id1a1  (   2 )                                                    ei
d2m2ua-  (   1 )                                                     m
d2nrka1  (   4 )                                                iVteyq
d2pbea2  (   2 )                                                     r
d3upsa-  (  14 )                                                   fd-
d4k8va1  ( 147 )                             pdklkkvldklrlkrkdi----sea
d4xq7a1  (   5 )                         qelystpasrldsFvaqwlqph----rew
d5deca-  (   3 )                                           ddkwerfLvpY
d6ewza-  (  29 )                                    deaf-dtllgFveLdhIY
d6ipna3  ( 290 )                                                      
d6sj5a-  (   1 )                                                   mnS
d6un8a1  (   2 )                                              nGpiimtr
d7bl46-  (   2 )                                                   qg-
d7of0u-  (  91 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1j0la-  (   3 )    --letlraRReaVlslCarhg-------------------AvrVrvf--g
d1miwa2  (   2 )      kppfqe-AlgIIqqLkqhg--------------------ydAyfV--g
d1no5a-  (   9 )    --IkselaiVktiLqqlVp---------------------dytVwAf--g
d1ou5a2  (   9 )    --qsLfteGLksLtelFvken--------------------heLRIA--g
d1px5a2  (  26 )    --rtqvkeAidiV-rFLke----rCfq------g---pvrVskVvkGgs-
d1r89a2  (  21 )    --vrkGreAeeeLrrrLdel--------------------gveyvFVg--
d1v4aa2  (  57 )    --epPqadewqhYaawLqaLv-------------------sdeagLr--e
d1vfga2  (   1 )               mvGqIAkemg--------------------lrAYiV--G
d1vj7a2  ( 215 )    --ealvddIvtkIksyTteq------------gl------fgdVygrp-k
d1ylqa1  (   1 )          mkeIkeiTkkdVq---------------------dAeIyly--G
d2b4va2  (  60 )    --airAqqqlqgLAdkwtp---------------------dAkVyccg--
d2bcqa3  ( 387 )    MpreeAteIeqtVqkaAqafn---s---------------gLlCvACg--
d2fcla1  (   2 )      ipeylrVLrIydrLn-----------------------evnwvVtg--
d2fmpa3  ( 150 )    IpreeMlqMqdiVlneVkkvd---s---------------eYiAtVCg--
d2hhpa2  (  49 )    --vqVlkiLqeLAqrFVyeV-SkkknmsdgmArd---A--gGkIftyg--
d2id1a1  (   4 )    --qeiSklAieALedi-----------------k------Gkdiield-T
d2m2ua-  (   2 )    ltliqGkkivnhlRsr----l---aFeyng----qlikilsknivavg--
d2nrka1  (  10 )    --paWveqfeeeaqaLkqiL-k----------en------ClkVehIg--
d2pbea2  (   3 )    --seqedifldfAlnde----------------r------IrLVtle---
d3upsa-  (  16 )    --pellklVtdsLddd-----------------q------aleiatip-l
d4k8va1  ( 168 )    --aetvnkVVerLlrrMqk---re---------s---eFkgVeqlntgs-
d4xq7a1  (  30 )    --keevldAvrtveeflrq---ehFqg------q---dvrvlkvvkvg--
d5deca-  (  14 )    --rqAVeeLkvkLkgIrtly-ed-------dhSP------IefVtgrV-k
d6ewza-  (  46 )    --ssALkeIstkLsilddnf-nh-----iykhnP------Ihhmerrv-k
d6ipna3  ( 290 )    vlrsDVdaLqqvVeeAVg-Al---p---------------gAtVtlTg--
d6sj5a-  (   4 )    --qeLlaiAvdAIdnk-----------------k------GedTiSLe-M
d6un8a1  (  10 )    --eeRmkiVheikerIldky-g----------dd------VkAIGVyg--
d7bl46-  (   4 )    --kalqdfVidkIddl-----------------k------Gqdiiald-v
d7of0u-  (  91 )      kFdidmMvslLrqe-----------------n------Ardicviq-V
                        aaaaaaaaaaaaa                         bbbb    

                             110       120       130       140       150 
d1j0la-  (  30 )    svArgeare------------------------------------d-sd-
d1miwa2  (  27 )    gAVrDlllg-------------------r----------------pIgd-
d1no5a-  (  35 )    sRVkgkAkk------------------------------------y-sd-
d1ou5a2  (  35 )    gAVrdLlng-------------------v----------------kPqd-
d1px5a2  (  63 )    s----------rsdAdLVVFLtkLt--sFeDQlr----------------
d1r89a2  (  47 )    syarntWl-kgsLeIdVfLlfpe---------------------------
d1v4aa2  (  90 )    LRlFrrrIV-------------------rIaWAqtlalvt----------
d1vfga2  (  18 )    gVVrdillg-------------------k----------------evwd-
d1vj7a2  ( 244 )    hiysIyrkmr------------------------dk-----kkrfd-qif
d1ylqa1  (  22 )    svvEgdysi------------------------------------glsd-
d2b4va2  (  85 )    svtygqer---gsdldLACfdp----------------------------
d2bcqa3  ( 417 )    syrr---gkatCgdVdVLIThpdgshr-----------------------
d2fcla1  (  29 )    sLSfaLqgVpvVhdIdIqTd------------------------------
d2fmpa3  ( 180 )    sfrr---gaesSgdMdVLLTHpsftse-----------------------
d2hhpa2  (  89 )    syrlgvhg-pg-sdIdTLVVVPk---------------------------
d2id1a1  (  28 )    sklts--------------------------------------------l
d2m2ua-  (  39 )    slrr---eekmlndvdlliivpe---------------------------
d2nrka1  (  39 )    -----sTSVp-----------------------------------nLAAk
d2pbea2  (  40 )    -------------------------------------------------f
d3upsa-  (  41 )    agkss--------------------------------------------i
d4k8va1  ( 200 )    yyeHvkisapnefdvmFkLeVprIelqeyyetGafYLVkfkriprgnpls
d4xq7a1  (  69 )    sFgngtvl-rstrevelvAFlscFh--sfqeaak----------------
d5deca-  (  49 )    pvasIlekAr------------------------rksip--lheie-tmq
d6ewza-  (  81 )    emrsLiekLn------------------------rkglqisaetAkehIl
d6ipna3  ( 320 )    gFrr---gklqghdVdFLIthpegqea-----------------------
d6sj5a-  (  28 )    kgisd--------------------------------------------m
d6un8a1  (  39 )    -----sLGrq-----------------------------------tDgpy
d7bl46-  (  28 )    qgkss--------------------------------------------i
d7of0u-  ( 115 )    ppemr--------------------------------------------y
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1j0la-  (  42 )    --ldL-LVaFeegrtlldharLklaLegl-------------L-------
d1miwa2  (  41 )    --VdI-ATsA---l-PedV-aiFp----k------------tidvG----
d1no5a-  (  47 )    --LdL-AIis-epLdflardrLkeaFses------------dL-------
d1ou5a2  (  49 )    --idF-ATtA---t-ptqMkeMFqsagir------------minnr----
d1px5a2  (  93 )    ----------r---rgeFIqeIrrqLeaCqreqkF---kV-tFeVqs---
d1r89a2  (  69 )    ------ef--s---keelrerGleIGka----------VL-dsyeiry-a
d1v4aa2  ( 112 )    ----------eesIlqQlSyLAetLIvAArdwLydaccrewgpCna----
d1vfga2  (  32 )    --vdf-VVeg---nAieLAkeLArrhgvn------------vhpfp----
d1vj7a2  ( 264 )    dLIAI-rCVMe---tqsdVyaMvgyIhel-----------wrpmpgrfkd
d1ylqa1  (  35 )    --idV-AIVSdvFedrnrkleFfgkItkk------------ff-------
d2b4va2  ( 108 )    ------yp--s---hevqakrTdkLrtvIkryVPh---yLrnnLlGltea
d2bcqa3  ( 442 )    ----------------gIFsrLLdsLrq-------------e--------
d2fcla1  (  50 )    -----e----------egAyeIeriFsef-----------vsVrfs----
d2fmpa3  ( 204 )    -stkqp----------kLLhqVVeqLqk-------------v--------
d2hhpa2  ( 110 )    ------hV--t---redFftvFdsLLrerk--------el-deiapvpda
d2id1a1  (  34 )    fqr-I-vAtGd---snrqVkaLAnsVqvkLkeag------vdiv--gseg
d2m2ua-  (  59 )    -------------------kkllkhvlp-------------nirik----
d2nrka1  (  49 )    piIdF-LViVe---eiekVdllqweFerigYeYge---f-----------
d2pbea2  (  41 )    qdydI-sYFVt---dvesFkendqwLeiFgkri-------------qkpe
d3upsa-  (  47 )    ady-V-iAsgr---ssrqVta-AqkLadrIkaatg------yvS--kieg
d4k8va1  ( 250 )    hFlegevL--S---AtkMlskFrkIIkeeVkeIk----di-dVsVekekp
d4xq7a1  ( 100 )    ----------h---hkdvlrliwktMwqsqdlld----lg-ledlrmeqr
d5deca-  (  72 )    dIAgL-rIMCq---fvdDiqiVkemLfar---------kdFtvv--dqrd
d6ewza-  ( 107 )    dIAgI-rVVCn---yldDIylIeemLlkq---------edVqli--krkd
d6ipna3  ( 345 )    ----------------gLLprVMcrLqd-------------q--------
d6sj5a-  (  34 )    TdYfV-VThGn---nerqVqAIArAVkevAneqn------ievk--rmeg
d6un8a1  (  49 )    sdIeM-MCVMs---te----------------------------------
d7bl46-  (  34 )    TdcmI-ICtGt---ssrhVmsIAdhVvqesraag------llPl--gveg
d7of0u-  ( 121 )    tdyFV-IVSGt---strhLhaMAfyVvkmykhlkc---krdphv--kieg
                                   aaaaaaaaaaaa                       

                             210       220       230       240       250 
d1j0la-  (  69 )    -------------------gvrVdIvSe-------rgla-----------
d1miwa2  (  64 )    s-khGtVvVvhk-------gkaYeVtTFkt-----dgsv------tfvr-
d1no5a-  (  75 )    -------------------pWrVdlldw-------Atts-----------
d1ou5a2  (  76 )    gekhgtitArlh-------eenFeItTLri---------------fttd-
d1px5a2  ( 123 )    ----paLsFvLsspqlqqeveFdVlPA-fDALgqwtpgykpn--------
d1r89a2  (  96 )    eh--pyVhGvVk------gVeVdVvPC-ykLk-------------e----
d1v4aa2  ( 149 )    qgapllIlggkLGggeLnfssdIdLiF-Aw-----Pe-r------ednaq
d1vfga2  (  60 )    --efgtAhLkig-------klkleFatArr-----et--------vepA-
d1vj7a2  ( 299 )    yi--a-------apkangyqSIhTTVy-Gp--------------------
d1ylqa1  (  63 )    -------------------dspfeFhI----------lt-----------
d2b4va2  ( 144 )    rt--PvVkLrfA------n-dvaaryt-plseedrkArTalL---dVrnq
d2bcqa3  ( 455 )    -g--FLtddlvSqeengqQqkYlGvCr-Lpgp------------------
d2fcla1  (  72 )    -s--teiCShfgeLiidgiVeImGdir-rled------------------
d2fmpa3  ( 222 )    -h--FItdtlskg-----etkFmGvCq-Lpsk------------------
d2hhpa2  ( 140 )    fv--PiIkIkFs------gisIdLICA-rLdqpqVplsltLs---d----
d2id1a1  (  72 )    he---------------sGewVlVdAg-----------------------
d2m2ua-  (  73 )    -g--lsfsvkvcg-----erkCvlfie-we--------------------
d2nrka1  (  82 )    ---------------glsgr-ryLrkg-pi--------------------
d2pbea2  (  76 )    de--l-------fppelg-nwFsYiIl-Fed-------------------
d3upsa-  (  85 )    lp---------------aAdwVlLdAg-----------------------
d4k8va1  ( 290 )    gs--pAVtLlIr-npeeIsVdIiLALE-Skg--------sWpistkeglp
d4xq7a1  ( 132 )    vp--dAlvFtiqtrgtaepitvtivPA-yrAlgpslpnsqpp--------
d5deca-  ( 107 )    yi--a------------gyrSYhLVVl-YpLq-----tv-----------
d6ewza-  ( 142 )    yi--q-------hpkengyrSLhIVVs-IpVf-----la-----------
d6ipna3  ( 358 )    -g--lIlyhqhqh----aferSfCiFr-Lpqp------------------
d6sj5a-  (  72 )    yn---------------eArwIlIdLa-----------------------
d6un8a1  (  61 )    ------------------eaefshewt-tg--------------------
d7bl46-  (  72 )    en---------------sAdwIvVdLg-----------------------
d7of0u-  ( 162 )    kd---------------tddwLcVdFg-----------------------
                                         bbbbb                        

                             260       270       280       290       300 
d1j0la-  (  82 )    ----prlreqVl-r----eAipl                           
d1miwa2  ( 103 )    --sleeDLkrrdft--nAIA-de----yg-----------tiiDpfgGre
d1no5a-  (  88 )    ----edfreiIr-k----vyvvIqek                        
d1ou5a2  ( 115 )    --wq-kdAerrdlt-inSMFLgf----dG-----------tlfdyfnGye
d1px5a2  ( 166 )    ------peiyvqlikeCksrgke-------------------geF--stC
d1r89a2  ( 120 )    ------pk---------------------------------niks--avD
d1v4aa2  ( 198 )    fFtrGrLikvLdqptqdgfVyrVdrlrPfgesg-------plVlsFaaLe
d1vfga2  (  96 )    --sLkeDLirrdft-inaMAiSvNledyg-----------tlidyfgGlr
d1vj7a2  ( 319 )    -----------------------------------kgpIeIqIRTke---
d1ylqa1  (  73 )    ----kkeWkmsk-r-fIrkyrrl                           
d2b4va2  ( 185 )    cVgdndvyIaekgrdn-------v---egIv-drttgCrIaIqCt--ske
d2bcqa3  ( 483 )    --------------------------------grrhrrLdIiVvpysefA
d2fcla1  ( 103 )    -----------------gtwedpv---dlny-rfvethgMIpVLsleyEy
d2fmpa3  ( 245 )    ---------------------------ndek-eyphrrIdIrLIPkdqyy
d2hhpa2  ( 174 )    ------knllr------------------------------nLd---ekD
d2id1a1  (  84 )    -------------------------------------dVvVhV-lpa---
d2m2ua-  (  94 )    ---------------------------------kktyqldlftalaeekP
d2nrka1  (  95 )    -----------------------------------krthhVhIYqfdntq
d2pbea2  (  97 )    -----------------------------------gnkLdLtLIpir---
d3upsa-  (  97 )    -------------------------------------dIiIhLfrpe---
d4k8va1  ( 328 )    IqgwLgtkvrtnLrre--pFYLVP---knak-dgnsfqgeTWrlS-----
d4xq7a1  ( 171 )    ------pevyvslikAc------------------------------fps
d5deca-  ( 131 )    ------------------------------s-gekhVlVeIqIRTla---
d6ewza-  ( 166 )    ------------------------------e-rvevLpVeIqIRTig---
d6ipna3  ( 410 )    ---------------------------g----swkaVrVdLVVApvsqfP
d6sj5a-  (  84 )    -------------------------------------dVvVHVFhkd---
d6un8a1  (  72 )    -----------------------------------ewkVeVnFdSee---
d7bl46-  (  84 )    -------------------------------------dviVhVMqee---
d7of0u-  ( 174 )    -------------------------------------sMVIhLMlpe---
                                                                      

                             310       320       330       340       350 
d1j0la-                                                               
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