solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
10 20 30 40 50
d1k8kd1 ( 1 ) millevnnriIeetLalkFenaaag--------------nkpe-------
d1k8kd2 ( 121 ) fasvFekYFqfqeegke-----------------------
d1k8kf- ( 2 ) tatlrpylsaVratLqaaLcLenfsSqvverhnkpEVevrssk
aaaaaaaaaaaaa
60 70 80 90 100
d1k8kd1 ( 30 ) ---avevtfadfdgVlYhIsNpngdktkVmVSIsLk----fYkelqahga
d1k8kd2 ( 138 ) --genravihyrddEtMyVeSk---kdrVtVvFSTvFkddddvviGkvfM
d1k8kf- ( 45 ) elllqpvtisrnekekVlIeGS---iNSVrVSIaVkqadeiekilChkfM
bbbb bbbbb bbbbbb aaaaa a
110 120 130 140 150
d1k8kd1 ( 73 ) delLk--rvYgsy--lvn-pes---------------gynVSLlYdLenL
d1k8kd2 ( 183 ) qefkegrrashtapqVlfshrePpleLkdtdAavgdniGYItfvLfprhT
d1k8kf- ( 92 ) rfmmmrAe---nffILrrkpve---------------gydISFlItNfht
aaaa bbbbb
160 170 180 190 200
d1k8kd1 ( 103 ) pa-skdsivhqAGmLkrNC
d1k8kd2 ( 233 ) nasardntinlIhtFrdyLhyhIkcskayihtrmraktsdflkvlnrarp
d1k8kf- ( 124 ) eqmykhkLvdfVIhFMeeIdkeIsemklsvnararivaeeflkn
aaaaaaaa aaaa
d1k8kd1
d1k8kd2 ( 283 ) d
d1k8kf-
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | 60 | 70 | 80 | 90 | 100 | 110 | 120 | 130 | 140 | 150 | 160 | 170 | 180 | 190 | 200 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| M | I | L | L | E | V | N | N | R | I | I | E | E | T | L | A | L | K | F | E | N | A | A | A | G | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | N | K | P | E | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | V | E | V | T | F | A | D | F | D | G | V | L | Y | H | I | S | N | P | N | G | D | K | T | K | V | M | V | S | I | S | L | K | - | - | - | - | F | Y | K | E | L | Q | A | H | G | A | D | E | L | L | K | - | - | R | V | Y | G | S | Y | - | - | L | V | N | - | P | E | S | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | Y | N | V | S | L | L | Y | D | L | E | N | L | P | A | - | S | K | D | S | I | V | H | Q | A | G | M | L | K | R | N | C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | F | A | S | V | F | E | K | Y | F | Q | F | Q | E | E | G | K | E | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | E | N | R | A | V | I | H | Y | R | D | D | E | T | M | Y | V | E | S | K | - | - | - | K | D | R | V | T | V | V | F | S | T | V | F | K | D | D | D | D | V | V | I | G | K | V | F | M | Q | E | F | K | E | G | R | R | A | S | H | T | A | P | Q | V | L | F | S | H | R | E | P | P | L | E | L | K | D | T | D | A | A | V | G | D | N | I | G | Y | I | T | F | V | L | F | P | R | H | T | N | A | S | A | R | D | N | T | I | N | L | I | H | T | F | R | D | Y | L | H | Y | H | I | K | C | S | K | A | Y | I | H | T | R | M | R | A | K | T | S | D | F | L | K | V | L | N | R | A | R | P | D |
| - | - | - | - | - | - | - | T | A | T | L | R | P | Y | L | S | A | V | R | A | T | L | Q | A | A | L | C | L | E | N | F | S | S | Q | V | V | E | R | H | N | K | P | E | V | E | V | R | S | S | K | E | L | L | L | Q | P | V | T | I | S | R | N | E | K | E | K | V | L | I | E | G | S | - | - | - | I | N | S | V | R | V | S | I | A | V | K | Q | A | D | E | I | E | K | I | L | C | H | K | F | M | R | F | M | M | M | R | A | E | - | - | - | N | F | F | I | L | R | R | K | P | V | E | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | G | Y | D | I | S | F | L | I | T | N | F | H | T | E | Q | M | Y | K | H | K | L | V | D | F | V | I | H | F | M | E | E | I | D | K | E | I | S | E | M | K | L | S | V | N | A | R | A | R | I | V | A | E | E | F | L | K | N | - | - | - | - | - | - | - |
