BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 63748 [ Tudor/PWWP/MBT ]
Class : All beta proteins
Fold : SH3-like barrel
# of Members : 19
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1h3za-  ( 118 )                                  servnYkpgmrvltkms---
d1khca-  ( 223 )                                  eYd-efgigdLVWGkik---
d1mhna-  (  89 )                                    lqqwkvgdkCSAiws---
d1oz2a1  ( 204 )    ecwswesyleeqkaitapvslfqdsqavthnkN-gfklgmkLEGidp---
d1oz2a2  ( 314 )      fswsqylrstraqaapkhlfv--sqshsppPlgfqvgmklEAvdr---
d1wjra1  (   8 )                                   pidlitvgSliElqds---
d2g3ra1  (1485 )                                       sfvglrVvAkws---
d2hqxa1  (   8 )                  tqfqklMenMrndiasp---gyarg-fCIAkf-vd-
d2jnga1  (   5 )                      rsefasgntyAlyvrdtlqpgmrvrMlddyee
d2l89a-  (  45 )                                  saddrlnfGdrilvkap---
d2l8da1  (   5 )                                  mpnrkYadgevvmGrwp---
d3fdra-  (   6 )                   qld-lv-nMtqhYensvpetvhvgdiVAAplptn-
d4rxja-  ( 958 )                                       lhykqiVwVlg----
d6iipa1  (   8 )                                      eYkagdlVFAkmk---
                                                            bbbbb     

                             60        70        80        90        100 
d1h3za-  ( 135 )    g--fpwwPSMvvteskMtsvArkskpkr-----agtfypviFFpnke---
d1khca-  ( 242 )    g---swWPAmVvswaTskrqAmp------------gmRwVqWfgdgk---
d1mhna-  ( 104 )    ed-gciypAtIasIdfk-----------------retCvVvYtgygn---
d1oz2a1  ( 250 )    qhpsmyfiLtVaevc-------------------gyrLrLhFdgy--sec
d1oz2a2  ( 357 )    mnpslVcvAsVtdvv-------------------dsrFlVhFdnw--ddt
d1wjra1  (  24 )    qnpfqYWivsvienv-------------------gGrlrlryvgledtes
d2g3ra1  (1497 )    sn-gyfysGkItrdvga------------------gkykLlFd-dgy---
d2hqxa1  (  46 )    ---gewyRArvekvesp------------------akihVfYIDygn---
d2jnga1  (  37 )    isagdeGeFrqsn------------------ngv-ppvqvfWestgr---
d2l89a-  (  62 )    g--ypwwPAlllrr-ket------kdslntnssfnvlYkvlfFpdfn---
d2l8da1  (  22 )    gs-vlyyevqvtsYdda-----------------shlYtvkYk-dgt---
d3fdra-  (  42 )    ---gswyRArVlgtlen------------------gnldLyfVDfg----
d4rxja-  ( 970 )    --nyrwwpAeIcnpsVp----------niqglhdlgDfPVfffgshd---
d6iipa1  (  21 )    g--yphwPArIdelpegavkppa------------nkypIfFFGthe---
                         bbbbbbb                        bbbbbb        

                             110       120       130       140       150 
d1h3za-  ( 175 )    -YlWtgsd--sltpl-tseaisqfle-----kpkpktaslikAYkmAqst
d1khca-  ( 276 )    -fseisad--kLva--LG-lFsqhFn-----latfnlvsYrkAMyhTLek
d1mhna-  ( 133 )    -reeqnLs--dLlsp-ice                               
d1oz2a1  ( 279 )    hdfwvnAnspdIhp---agwfektghklqppk-gy------keee     
d1oz2a2  ( 386 )    ydywCdpsspyIhp---vgwCqkqgkpltppq-dyp-----dpdn     
d1wjra1  (  55 )    ydqwlfYldyrlrp---vgwCqenkyrmdPpseiyplkmaseWkctleks
d2g3ra1  (1524 )    -ecdVlgk--dIllc-dp                                
d2hqxa1  (  72 )    -revLpst--rLGtLs---pafstvlpaqa                    
d2jnga1  (  65 )    -tywvhWh--mleilG--fee                             
d2l89a-  ( 100 )    -fawvkrn--svkpl-ldseiakflg-----sskrkskelieAYeaSktp
d2l8da1  (  50 )    -elalkes--dirlq-ssfk------------------------------
d3fdra-  (  68 )    -ngdCpl---dLraLr---sdfl-slpfqaie                  
d4rxja-  (1008 )    --ywVhqg--rVfpyvegfaegqtsintfale------------------
d6iipa1  (  54 )    -taflgpk--dLfp--Ykeykdkfgk-------snkrkgFneGlweIenn
                     bbbb       b                                     

                             160       170       180       
d1h3za-  ( 216 )    pdldslsvps                             
d1khca-  ( 316 )    ArvrAgktfssspgesedqLkpMlewAhggFkptgigLp
d1mhna-                                                    
d1oz2a1                                                    
d1oz2a2                                                    
d1wjra1  ( 102 )    lidAakfplpmevfkdhadl                   
d2g3ra1                                                    
d2hqxa1                                                    
d2jnga1                                                    
d2l89a-  ( 141 )    pdlkeesstdle                           
d2l8da1  (  66 )    --------------------------------------q
d3fdra-                                                    
d4rxja-  (1043 )    -------------------eaakrfqelkaqresealei
d6iipa1  (  92 )    pgv
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Hypothetical protein SPBC215.07cPWWP domainFission yeast (Schizosaccharomyces pombe) [TaxId: 4896]view
DNA methyltransferase DNMT3BPWWP domainMouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]view
Survival motor neuron protein 1, smnTudor domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Lethal(3)malignant brain tumor-like proteinMBT repeatHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Lethal(3)malignant brain tumor-like proteinMBT repeatHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Scm-like with four MBT domains protein 2, SFMBT2 (KIAA1617)MBT repeatHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
p53-binding protein 1, 53BP1, N-terminal domainTudor domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
P100 co-activator, SND1Tudor domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Cullin-7CPH domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesFission yeast (Schizosaccharomyces pombe) [TaxId: 4896]view
Lamin-b receptorTudor domainChicken (Gallus gallus) [TaxId: 9031]view
Tudor and KH domain-containing protein TDRKHTudor domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
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automated matchesPWWP domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Domain ID Name
d2qqra12qqr A:897-955
d2qqra22qqr A:956-1011
d2g3ra22g3r A:1538-1603
d3s6wa-3s6w A:
d2r58a22r58 A:282-385
FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S E R V N Y K P G M R V L T K M S - - - G - - F P W W P S M V V T E S K M T S V A R K S K P K R - - - - - A G T F Y P V I F F P N K E - - - - Y L W T G S D - - S L T P L - T S E A I S Q F L E - - - - - K P K P K T A S L I K A Y K M A Q S T P D L D S L S V P S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E Y D - E F G I G D L V W G K I K - - - G - - - S W W P A M V V S W A T S K R Q A M P - - - - - - - - - - - - G M R W V Q W F G D G K - - - - F S E I S A D - - K L V A - - L G - L F S Q H F N - - - - - L A T F N L V S Y R K A M Y H T L E K A R V R A G K T F S S S P G E S E D Q L K P M L E W A H G G F K P T G I G L P
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L Q Q W K V G D K C S A I W S - - - E D - G C I Y P A T I A S I D F K - - - - - - - - - - - - - - - - - R E T C V V V Y T G Y G N - - - - R E E Q N L S - - D L L S P - I C E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
E C W S W E S Y L E E Q K A I T A P V S L F Q D S Q A V T H N K N - G F K L G M K L E G I D P - - - Q H P S M Y F I L T V A E V C - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Y R L R L H F D G Y - - S E C H D F W V N A N S P D I H P - - - A G W F E K T G H K L Q P P K - G Y - - - - - - K E E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - F S W S Q Y L R S T R A Q A A P K H L F V - - S Q S H S P P P L G F Q V G M K L E A V D R - - - M N P S L V C V A S V T D V V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D S R F L V H F D N W - - D D T Y D Y W C D P S S P Y I H P - - - V G W C Q K Q G K P L T P P Q - D Y P - - - - - D P D N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P I D L I T V G S L I E L Q D S - - - Q N P F Q Y W I V S V I E N V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G R L R L R Y V G L E D T E S Y D Q W L F Y L D Y R L R P - - - V G W C Q E N K Y R M D P P S E I Y P L K M A S E W K C T L E K S L I D A A K F P L P M E V F K D H A D L - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S F V G L R V V A K W S - - - S N - G Y F Y S G K I T R D V G A - - - - - - - - - - - - - - - - - - G K Y K L L F D - D G Y - - - - E C D V L G K - - D I L L C - D P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - T Q F Q K L M E N M R N D I A S P - - - G Y A R G - F C I A K F - V D - - - - G E W Y R A R V E K V E S P - - - - - - - - - - - - - - - - - - A K I H V F Y I D Y G N - - - - R E V L P S T - - R L G T L S - - - P A F S T V L P A Q A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - R S E F A S G N T Y A L Y V R D T L Q P G M R V R M L D D Y E E I S A G D E G E F R Q S N - - - - - - - - - - - - - - - - - - N G V - P P V Q V F W E S T G R - - - - T Y W V H W H - - M L E I L G - - F E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S A D D R L N F G D R I L V K A P - - - G - - Y P W W P A L L L R R - K E T - - - - - - K D S L N T N S S F N V L Y K V L F F P D F N - - - - F A W V K R N - - S V K P L - L D S E I A K F L G - - - - - S S K R K S K E L I E A Y E A S K T P P D L K E E S S T D L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M P N R K Y A D G E V V M G R W P - - - G S - V L Y Y E V Q V T S Y D D A - - - - - - - - - - - - - - - - - S H L Y T V K Y K - D G T - - - - E L A L K E S - - D I R L Q - S S F K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q
- - - - - - - - - - - - - - - Q L D - L V - N M T Q H Y E N S V P E T V H V G D I V A A P L P T N - - - - G S W Y R A R V L G T L E N - - - - - - - - - - - - - - - - - - G N L D L Y F V D F G - - - - - N G D C P L - - - D L R A L R - - - S D F L - S L P F Q A I E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L H Y K Q I V W V L G - - - - - - N Y R W W P A E I C N P S V P - - - - - - - - - - N I Q G L H D L G D F P V F F F G S H D - - - - - Y W V H Q G - - R V F P Y V E G F A E G Q T S I N T F A L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E A A K R F Q E L K A Q R E S E A L E I
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E Y K A G D L V F A K M K - - - G - - Y P H W P A R I D E L P E G A V K P P A - - - - - - - - - - - - N K Y P I F F F G T H E - - - - T A F L G P K - - D L F P - - Y K E Y K D K F G K - - - - - - - S N K R K G F N E G L W E I E N N P G V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in