PASS2.8 - Home

solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x

beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x

hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x

                             10        20        30        40        50  
d1ddga1  ( 226 )                                ihtspysk-daplvAsLsvnqk
d1ep3b1  (   2 )                                                      
d1f20a1  ( 963 )             sWkrnkFrLtyvaeapdltqGLSnVhk-krVSaArLlsrqn
d1i8da2  (  94 )                                                      
d1krha1  ( 106 )                                                      
d1kzla1  (   1 )                                                      
d1kzla2  (  93 )                                                      
d1qfja1  (   1 )                                                      
d1tvca1  (   2 )                                                      
d2piaa1  (   1 )                                                      
d2qdxa1  (   2 )                                                      
d2rc5a1  (   7 )                           Ptr--epqinlfk-snpykAkVisNvl
d2xnja1  (   2 )                                                      
d3lo8a1  (   8 )                  skvsvaplhlesakepplntykpkePftAtivsves
d3ozua2  ( 151 )                                                      
d3qfta1  ( 246 )    rqYelvvhtdidaakvymGEmgrlksyenqkppFda-knPflAaVttNrk
d3w5ha1  (1001 )                                                      
d4dqla1  ( 661 )                                          gafstnVvaSke
d4gqna1  (   1 )                                                      
d4gqnb2  (  97 )                                                      
d5gxub1  ( 304 )                                  ytvfda-qhpykAnVAvkre
d5ylya1  ( 596 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1ddga1  ( 247 )    itg-------rnsekdvrhIeIdLgd-sgLrYqpgDaLGVwYqNdpalVk
d1ep3b1  (   2 )                                                      
d1f20a1  (1003 )    lqs-------pkssrstIfVrLhtngnqeLqYqpgdhLGVFPGNhedlVn
d1i8da2  (  94 )                                                      
d1krha1  ( 106 )                                                      
d1kzla1  (   1 )                                                      
d1kzla2  (  93 )                                                      
d1qfja1  (   1 )                                                      
d1tvca1  (   2 )                                                      
d2piaa1  (   1 )                                                      
d2qdxa1  (   2 )                                                      
d2rc5a1  (  32 )    ltpetgtgkrpeGealvhrIvLaIdHsa-YPYvigQsGGViPpgedpekk
d2xnja1  (   2 )                                                      
d3lo8a1  (  44 )    lvgp----kap---getÇhividHgg-n-vpYwegqsYGviPpgenpkkp
d3ozua2  ( 151 )                                                      
d3qfta1  ( 295 )    lnq-------gte-rhlMhLeLdIsd-SkirYesgdhVAVyPaNdsalVn
d3w5ha1  (1001 )                                                      
d4dqla1  ( 673 )    lqq-------pgsarstrhLeIeLp---easYqegDhLGViPrNyegIvn
d4gqna1  (   1 )                                                      
d4gqnb2  (  97 )                                                      
d5gxub1  ( 323 )    lht-------pes-dscIhLeFdIag-sgltYetgDhVGVlCdNls-tVd
d5ylya1  ( 596 )                                                      
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1ddga1  ( 289 )    eLVelL--wlkgdepVtve--------------------gktlpLneALq
d1ep3b1  (   2 )                                                      
d1f20a1  (1046 )    aLierLedappanhvVkvemleerntalgvisnwkdesrLppctIfqAFk
d1i8da2  (  94 )                                                      
d1krha1  ( 106 )                                                      
d1kzla1  (   1 )                                                      
d1kzla2  (  93 )                                                      
d1qfja1  (   1 )                                                      
d1tvca1  (   2 )                                                      
d2piaa1  (   1 )                                                      
d2qdxa1  (   2 )                                                      
d2rc5a1  (  83 )    ak------------------------------------------------
d2xnja1  (   2 )                                                      
d3lo8a1  (  85 )    --------------------------------------------------
d3ozua2  ( 151 )                                                      
d3qfta1  ( 336 )    qLGkiL--gadLdvvMsLnNlde--------esnkkhpFpCpTsYrtALt
d3w5ha1  (1001 )                                                      
d4dqla1  ( 714 )    rVtarF--gldasqqirla----------------------tvsVeelLq
d4gqna1  (   1 )                                                      
d4gqnb2  (  97 )                                                      
d5gxub1  ( 365 )    eAlrlL--dmspdtflh-------------------ppfp-pcnLrtALt
d5ylya1  ( 596 )                                                      
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1ddga1  ( 317 )    whfeLtv-NtanIVenYAtltrsetLlplvgdk--------akLqhyAa-
d1ep3b1  (   2 )                                                      
d1f20a1  (1096 )    yYLdIttpPtplqLqqFAsLAtnekekqrLlvLSk----glqeyeeWkwg
d1i8da2  (  94 )                                                      
d1krha1  ( 106 )                                                      
d1kzla1  (   1 )                                                      
d1kzla2  (  93 )                                                      
d1qfja1  (   1 )                                                      
d1tvca1  (   2 )                                                      
d2piaa1  (   1 )                                                      
d2qdxa1  (   2 )                                                      
d2rc5a1  (  85 )    --------------------------------------------------
d2xnja1  (   2 )                                                      
d3lo8a1  (  85 )    --------------------------------------------------
d3ozua2  ( 151 )                                                      
d3qfta1  ( 376 )    yYLdItnpPrtnVLyeLAqyAsepseqelLrkMAsssgeGkelylswVve
d3w5ha1  (1001 )                                                      
d4dqla1  ( 753 )    -yvELqdpVtrtQLraMAakTv-pphkveLealle-----kqaykeqVla
d4gqna1  (   1 )                                                      
d4gqnb2  (  97 )                                                      
d5gxub1  ( 410 )    -yAcLlssPkksALvaLAahAsdpteaerLkhLAsp----agdyskwVve
d5ylya1  ( 596 )                                                      
                                                                      

                             210       220       230       240       250 
d1ddga1  ( 357 )    -tTpIVDMVrfsp-aqldaeaLin-lLrpLtPrlys--------Iassqa
d1ep3b1  (   2 )                           sqlqemMtVvsQrevaynifeMvLkgt
d1f20a1  (1142 )    knPtMveVLeeFpsIqMpAtLLLT-qLslLqpryys--------Issspd
d1i8da2  (  94 )                   i-gghlmsghimttAeVAkiltse-nnrqIwFkVq
d1krha1  ( 106 )                           ih-hFeGtLarvenlsdstItFdIqLd
d1kzla1  (   1 )                        mftglveaiGvVkdvqgtidngfaMkIeAp
d1kzla2  (  93 )                   rmggHfvqghvdtvAeIvekkqdg-eaidFtFrPr
d1qfja1  (   1 )                            t-tlsCkVtsveaitdtvyrVrIvPd
d1tvca1  (   2 )                     crisfgevgsfeAevvglnwvssntvqFllqkr
d2piaa1  (   1 )                       ttpqedgflrLkIaskekiardiwsFeLtdp
d2qdxa1  (   2 )                           sn-lyterVlsvhhwndtlFsFkTtrn
d2rc5a1  (  85 )    -----------------------gladvgytvrlys--------IaSpsy
d2xnja1  (   2 )                           ad-wvtGkVtkvqnwtdalFSLtVhA-
d3lo8a1  (  85 )    -------------------------g-apqnvrlys--------iaStrY
d3ozua2  ( 151 )                       wk----gwrtFvIrekrpesdvitSFiLePa
d3qfta1  ( 426 )    arrhILAILqdCpsLrPpidHLCe-lLprLqahyys--------Iasssk
d3w5ha1  (1001 )                  stpaiTLenpdikypLrLidkevvnhdtRrFrFaLp
d4dqla1  ( 797 )    krlTMLeLLekYpaCeMkfseFIa-lLpsirpryys--------IsssPr
d4gqna1  (   1 )                        mftgiitdiGkVdrvkpln-eGvlLrIeTa
d4gqnb2  (  97 )                   emgghlvfghvdgqAeIverkdeg-daVrFtLrAp
d5gxub1  ( 457 )    sqrSLleVMaefpsAkPplgvFFagVAprlqprfys--------Issspk
d5ylya1  ( 596 )                     apFL-npkkqkaAeLkekikishdvTlFrFgLe
                                                    bbbb              

                             260       270       280       290       300 
d1ddga1  ( 396 )    ----------------------------------------eveneVhVtV
d1ep3b1  (  29 )    L---VdeMd--lpgqfLhLaVpngaml--lrrpisIsswdkraktCtIlY
d1f20a1  (1183 )    ----------------------------------------mypdeVHLtV
d1i8da2  ( 127 )    d---sqlmkyIlykgfIGId--------gisltVgevt----ptrFCVhL
d1krha1  ( 132 )    d---gqpdIhFlagqyVnVtlp----gttetrsysFssqpgn-rlTgFvV
d1kzla1  (  31 )    -----qILddChtgdsIAVn--------gtcltVtdfd----ryhFtVgI
d1kzla2  ( 127 )    d---pfVlkyIvykgyIALd--------gtsltIthvd----dstFsImM
d1qfja1  (  26 )    ------aafsFragqyLmVvMde-----rdkrpfsMaStpdekgfIeLhI
d1tvca1  (  35 )    pdecgnRGvkfepgqfmdltipgtd----vsrsysPanlpnpeGrleFli
d2piaa1  (  32 )    q---gapLppfeagAnLtVaVpn-----gsrrtysLcndsqernrYvIaV
d2qdxa1  (  28 )    ------pgLrFktgqfVmIGlevd--grplmraysIaSpnye-ehLeFfS
d2rc5a1  ( 104 )    S---fg----------------------------------mkednIEFiI
d2xnja1  (  27 )    ------pvlpFtagqfTkLGleId--gervqraysYvnspdn-pdLeFyL
d3lo8a1  ( 101 )    G---dn----------------------------------fdGrtGSlcv
d3ozua2  ( 178 )    d---ggpVvnFepgqyTsVAidVpalglqqirqysLsdmpn-grsYrIsV
d3qfta1  ( 467 )    ----------------------------------------vhpnsVHIca
d3w5ha1  (1037 )    s---pehiLglpvgqhIyLSarid--gnlVirpytPvssdddkgfVdLvI
d4dqla1  ( 838 )    ----------------------------------------vdekqASItV
d4gqna1  (  30 )    -----ydpetIelgasIaCs--------gvcltVvalPekgsarwFeVeA
d4gqnb2  ( 132 )    -----elapfIaqkgsVALd--------gtsltVngvn----aneFdVlL
d5gxub1  ( 499 )    ----------------------------------------iaetrIhVtC
d5ylya1  ( 628 )    h---deQlLgLptgkhMlIrkkvt---evVmraytPttanetrGhFdLvV
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Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

									10										20										30										40										50										60										70										80										90										100										110										120										130										140										150										160										170										180										190										200										210										220										230										240										250										260										270										280										290										300										310										320										330										340										350										360
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