BASE   PART 1   PART 2   PART 3  
Superfamily : 56399 [ ADP-ribosylation ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : ADP-ribosylation
# of Members : 6
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1ikpa2  ( 395 )                                                      
d4dv8a1  ( 265 )    lsryekwekIkqhYqhWsdslseeGrglLkkLqipiepkkddiihsLsqe
d4gv2a2  ( 322 )                                   lkCqlqllds---------
d4k6lg-  (  19 )                                                      
d6ro0a-  (   2 )                                                      
d7aaca2  ( 797 )                                   lkTdikvVdr---------
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1ikpa2  ( 395 )                         ptGaeFlgdgg------------------
d4dv8a1  ( 315 )    ekelLkrIqIdsSdfLsteekefLkkLqidIrdslseeekellnriqvds
d4gv2a2  ( 332 )    ------------gapeykvIqtYLeqTGsn--------------------
d4k6lg-  (  19 )                                                      
d6ro0a-  (   2 )                                                      
d7aaca2  ( 807 )    ------------d-seAeiIrkYvknThAtthn-----------------
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1ikpa2  ( 406 )    dVsFstrgtqnWt-verLlqAhrqLeergyvFVGYhGtfleaAqsiVfgg
d4dv8a1  ( 365 )    snpLs----------ekekefLkkLkldIqpy-----dInqrLqdtggl-
d4gv2a2  ( 350 )    -hcptLqhIwkVnq-egEedrFqahs-lgnRkLLWhGtnmavvaaILtsG
d4k6lg-  (  19 )         vdfVyRVDstp--pdVIfrd----GFsllgynrnFQqFISGrSÇs
d6ro0a-  (   2 )       dppatVyKYDsrp--pedVfqn----GFtAwgnndnVleHlTGrSÇq
d7aaca2  ( 828 )    aydLevidIfkIer-egEcqrYkpfkqlhnrrLLWhGsrttnFagiLsqG
                                      aaaaa                   aa      

                             160       170       180       190       200 
d1ikpa2  ( 455 )    Vrar----sqdldaiwrGFyIAgdpalAyg---------yAqdqepdarg
d4dv8a1  ( 399 )    --idspsin---------------ldvrkqYkrDIqnIdalLhqsIgstL
d4gv2a2  ( 399 )    Lrim-phsg---grVGkGIyFASENskSag---------yviG-mkcga-
d4k6lg-  (  58 )    gg----ss------dSrYIATTssvnqTyaIAraYysrs-----------
d6ro0a-  (  43 )    vg----ss------nSAFVsTSssrryTevYLehrmqeaveaer---agr
d7aaca2  ( 877 )    LriappeapvtgymFGkGIyFADMVSkSAn---------yChT-sq--g-
                                      bbb   aaaaa                     

                             210       220       230       240       250 
d1ikpa2  ( 492 )    rirNGaLLRVYVprsslpgFyrts-ltlaapeAageVerLIghpLpLr--
d4dv8a1  ( 432 )    yn--kIyLyeNmnInnlt-------atlGadLvdstdntkInrgifneFk
d4gv2a2  ( 434 )    -hhvGyMFLGEVA---Lgrehhintdnpslksppp-----------gf--
d4k6lg-  (  87 )    -tFkgnLyrYqIRAdn--nFYs---llpSItyLetqgg--hFnayEktMm
d6ro0a-  (  80 )    gtGhfiGyIYeVRAdn--nFyg---AasSYfeYvdtygdnaGrilAGaLA
d7aaca2  ( 914 )    -dpiGlILLGeVA---LGnmyelkhash-isklpk-----------gk--
                          bbbbbbb      bbb                            

                             260       270       280       290       300 
d1ikpa2  ( 539 )    --------ldAITGpeee--------------------------------
d4dv8a1  ( 473 )    knfkysissnYmiVdInerpAldneRLKWrIqLsp-dTrAGyLenGkLIL
d4gv2a2  ( 467 )    --------dSVIArGhtePd-ptqdteleld---gqqVvVPqgq--pvpc
d4k6lg-  ( 129 )    r-------lQrEyVStlsIl-penIqkAvaLvydsatglVkdgv--stmN
d6ro0a-  ( 125 )    t-------yqsgyLAhrrIp-PeNIrrVTrvyhnGitgett-tt--eysN
d7aaca2  ( 946 )    --------hSVkGlGkttPd-psanisld-------gVdVPLGt--giss
                               bb b           bb           b      bbb 

                             310       320       330       340       350 
d1ikpa2  ( 549 )    -------ggrleTILGwpLAerTVVIPSaIpTdprnvggdLdpssipdkE
d4dv8a1  ( 522 )    qrnIgLeIkdVqiikqs---ekeyIrIdAkVv                  
d4gv2a2  ( 503 )    pefssStFsqSeYLIYqesQ-CRLRYLLevh                   
d4k6lg-  ( 169 )    asylgls----ttSnp-----gvIpfLpepqty-tqqrIDAFgplISSÇF
d6ro0a-  ( 164 )    aryvsqq----trAnp-----npyt-srrSvas-ivGTlVrmapvVgAÇm
d7aaca2  ( 978 )    g-vndTsllyNeYIVYdiaQ-VnLkYlLkLkFnfkt              
                                                                      

                             360       370       380  
d1ikpa2  ( 592 )    qaisalpdyasqpg                    
d4dv8a1                                               
d4gv2a2                                               
d4k6lg-  ( 209 )    SIgSVchshrgqradvynMsfydArpvIelilsk
d6ro0a-  ( 203 )    ArqAessee--------aMvlvyyesiay---sf
d7aaca2
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Exotoxin A, C-terminal domainADP-ribosylating toxinsPseudomonas aeruginosa [TaxId: 287]view
automated matchesADP-ribosylating toxinsAnthrax bacillus (Bacillus anthracis) [TaxId: 1392]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesSalmonella enterica [TaxId: 90370]view
automated matchesADP-ribosylating toxinsBordetella pertussis [TaxId: 520]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P T G A E F L G D G G - - - - - - - - - - - - - - - - - - D V S F S T R G T Q N W T - V E R L L Q A H R Q L E E R G Y V F V G Y H G T F L E A A Q S I V F G G V R A R - - - - S Q D L D A I W R G F Y I A G D P A L A Y G - - - - - - - - - Y A Q D Q E P D A R G R I R N G A L L R V Y V P R S S L P G F Y R T S - L T L A A P E A A G E V E R L I G H P L P L R - - - - - - - - - - L D A I T G P E E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G R L E T I L G W P L A E R T V V I P S A I P T D P R N V G G D L D P S S I P D K E Q A I S A L P D Y A S Q P G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
L S R Y E K W E K I K Q H Y Q H W S D S L S E E G R G L L K K L Q I P I E P K K D D I I H S L S Q E E K E L L K R I Q I D S S D F L S T E E K E F L K K L Q I D I R D S L S E E E K E L L N R I Q V D S S N P L S - - - - - - - - - - E K E K E F L K K L K L D I Q P Y - - - - - D I N Q R L Q D T G G L - - - I D S P S I N - - - - - - - - - - - - - - - L D V R K Q Y K R D I Q N I D A L L H Q S I G S T L Y N - - K I Y L Y E N M N I N N L T - - - - - - - A T L G A D L V D S T D N T K I N R G I F N E F K K N F K Y S I S S N Y M I V D I N E R P A L D N E R L K W R I Q L S P - D T R A G Y L E N G K L I L Q R N I G L E I K D V Q I I K Q S - - - E K E Y I R I D A K V V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L K C Q L Q L L D S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G A P E Y K V I Q T Y L E Q T G S N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H C P T L Q H I W K V N Q - E G E E D R F Q A H S - L G N R K L L W H G T N M A V V A A I L T S G L R I M - P H S G - - - G R V G K G I Y F A S E N S K S A G - - - - - - - - - Y V I G - M K C G A - - H H V G Y M F L G E V A - - - L G R E H H I N T D N P S L K S P P P - - - - - - - - - - - G F - - - - - - - - - - D S V I A R G H T E P D - P T Q D T E L E L D - - - G Q Q V V V P Q G Q - - P V P C P E F S S S T F S Q S E Y L I Y Q E S Q - C R L R Y L L E V H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V D F V Y R V D S T P - - P D V I F R D - - - - G F S L L G Y N R N F Q Q F I S G R S C S G G - - - - S S - - - - - - D S R Y I A T T S S V N Q T Y A I A R A Y Y S R S - - - - - - - - - - - - T F K G N L Y R Y Q I R A D N - - N F Y S - - - L L P S I T Y L E T Q G G - - H F N A Y E K T M M R - - - - - - - L Q R E Y V S T L S I L - P E N I Q K A V A L V Y D S A T G L V K D G V - - S T M N A S Y L G L S - - - - T T S N P - - - - - G V I P F L P E P Q T Y - T Q Q R I D A F G P L I S S C F S I G S V C H S H R G Q R A D V Y N M S F Y D A R P V I E L I L S K
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P P A T V Y K Y D S R P - - P E D V F Q N - - - - G F T A W G N N D N V L E H L T G R S C Q V G - - - - S S - - - - - - N S A F V S T S S S R R Y T E V Y L E H R M Q E A V E A E R - - - A G R G T G H F I G Y I Y E V R A D N - - N F Y G - - - A A S S Y F E Y V D T Y G D N A G R I L A G A L A T - - - - - - - Y Q S G Y L A H R R I P - P E N I R R V T R V Y H N G I T G E T T - T T - - E Y S N A R Y V S Q Q - - - - T R A N P - - - - - N P Y T - S R R S V A S - I V G T L V R M A P V V G A C M A R Q A E S S E E - - - - - - - - A M V L V Y Y E S I A Y - - - S F
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L K T D I K V V D R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D - S E A E I I R K Y V K N T H A T T H N - - - - - - - - - - - - - - - - - A Y D L E V I D I F K I E R - E G E C Q R Y K P F K Q L H N R R L L W H G S R T T N F A G I L S Q G L R I A P P E A P V T G Y M F G K G I Y F A D M V S K S A N - - - - - - - - - Y C H T - S Q - - G - - D P I G L I L L G E V A - - - L G N M Y E L K H A S H - I S K L P K - - - - - - - - - - - G K - - - - - - - - - - H S V K G L G K T T P D - P S A N I S L D - - - - - - - G V D V P L G T - - G I S S G - V N D T S L L Y N E Y I V Y D I A Q - V N L K Y L L K L K F N F K T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
d1ikpa2 A P11439 GO:0016757
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in