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Superfamily : 55874 [ ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
# of Members : 18
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1b63a2  (   1 )       mpiqvlp---------pqlaNqiaAg---------------------
d1bxda-  ( 290 )        tgqempmemadl-navlgeviaaesg-------yereietalypg-
d1h7sa2  (  29 )                                                      
d1i58a-  ( 352 )             gshmvpI-sfVFnrFprmVrdlakkm---nkeVnfimrg--
d1id0a-  ( 335 )              relhpV-aplLdnltsalnkvyqrk---gVnIsldIsp--
d1q1da1  (   7 )    sasdkyqkis---------qlehIlkrpdtyIgsvetqeqlqw---iyde
d1r62a-  ( 194 )              rvtesI-hkVAerVvtlVsmelpd-----nVLirdydp--
d1s14a-  (1027 )                                                      
d1th8a1  (   1 )         mrnemhlqfsArsenesfArvtVaafVaqldpt------------
d1ysra-  ( 299 )            ddhvpVdI-tdLLdrAAhdaariyp-----dLdVslvpSp--
d2c2aa2  ( 321 )           qinrekvdL-ÇdlVesAvnaikefAssh--nV-nVlfesnv--
d2e0aa2  ( 188 )       pshigsidpnCdV-vavVqdAFecSrmlCdqyylsSPelkltqvNgk
d2hkja3  (  10 )            ls---------paefFkrnpelaGFpn---------------
d3cwva1  (   8 )            gg---------iVenVrkrpgmyCg-----------------
d3t0ha-  (  16 )        evetfa---------FqaeiaqlMsliintfys-------------
d4e01a2  ( 186 )        dfvgiictrLSP-kkiIekwvdfArrlcehkygnAPrVrInghv--
d4k4oa1  (  18 )                       gleaVrkrpgmyIg-----------------
d6m37a-  (   5 )          adyiemkvpAqpeyvgiIrltLsgvAsrmgYt------------
                                       aaaaaaa  a                     

                             60        70        80        90        100 
d1b63a2  (  18 )    ----evVe-------rPasVVkeLVenSLda---------------gAtr
d1bxda-  ( 327 )    ----sievkM--hplsikrAvanMvvnAaryGn--------------gwi
d1h7sa2  (  29 )         gqvv----l-sLsTAvkeLVenSlda---------------gAtn
d1i58a-  ( 387 )    ----edteLdrtfVeeIgePLlhLLrnAIdhgIEpkeeRiakgkppiGtL
d1id0a-  ( 369 )    ----eIsFvG--eqndFveVMgNVLDnACkyCl--------------efV
d1q1da1  (  47 )    dcmienvtI----VpGLfkIFdeILvnAadnkvrd----------psMkr
d1r62a-  ( 227 )    ---sLpeLaH--dpdqIeqVLLnIVrnAlqaLgpe-----------GgeI
d1s14a-  (1027 )           td----ttrPnhLGqeVIdnSVdeAla-----------ghAkr
d1th8a1  (  34 )    ----------mdelteIktVVseAVtnAIihgynn---------dpngiV
d1ysra-  ( 333 )    ----tciIvG--lpagLrlAVdnAIaNavkhggA-------------tlV
d2c2aa2  ( 358 )    --pçpVeAyI--dptrIrqVLlnLLnnGVkysk---kdap------dkyV
d2e0aa2  ( 234 )    fpdqpIhIvY--vpshLhhMLfeLFknAMraTvehQenqp-----sltpI
d2hkja3  (  28 )    -----p-------arALyQTVrELIenSLdaTdvh----------gilPn
d3cwva1  (  24 )    ------dvg----eyGLHhLVyfLLdVAyeeArr-----------geCrd
d3t0ha-  (  40 )    --------n----keiFlrelisnSsdaldkiryeSltdpskldsgkelh
d4e01a2  ( 229 )    ----aarfpF--ipmpLdyILpeLLknAMraTMeshldtpy----nVpdV
d4k4oa1  (  32 )    ------sts----geGLHhLVweIVdnSideala-----------gfAks
d6m37a-  (  37 )    ----------ydeiedLkiAVseACtnavqhayke---------dkngeV
                                  aaaaaaaaaaaaaaaa                   b

                             110       120       130       140       150 
d1b63a2  (  42 )    IdIdIe------rGGa-----klIrIrDnGcGikkd-------------e
d1bxda-  ( 357 )    kvsSgte-----------pnrAwFqveDdgpGiapeqrkhlfqp----fv
d1h7sa2  (  54 )    IdLklk------dyGv-----dlIeVsdnGcGveee-------------n
d1i58a-  ( 433 )    iLsArheg-----------nnVVIeVeDdGrGidkekIirkAiekglide
d1id0a-  ( 399 )    eIsArqtd-----------ehLyIvVeDdGpgip----------------
d1q1da1  (  84 )    IdVnIh--ae-----------htIeVkndgkGipIeihn-----keniyi
d1r62a-  ( 261 )    iLrTrtafqltLh-geryrlAArIDVeDnGpgi-----------------
d1s14a-  (1055 )    VdViLh--a------d-----qSLeViDdGrGmpvdihp-----eegvpa
d1th8a1  (  65 )    sIsViIed-----------gvVhLtVrDegvGipdieearqpl-------
d1ysra-  ( 364 )    qLsAvssr-----------agVeIAIdDngsgVp----------------
d2c2aa2  ( 395 )    kViLdekd-----------gGVlIiVednGiGipdhAkdrifeqfyrvt-
d2e0aa2  ( 277 )    eViVvLgk-----------edLtIkIsdrGgGvplriidrlfsytystap
d2hkja3  (  56 )    IkItId--liddarqi-----YkVnVvDnGiGippq-------------e
d3cwva1  (  53 )    VVLeVg--g------d-----gSIALFCTSrtVt-------------aen
d3t0ha-  (  78 )    inliPn--kq-----d-----rtltivDtGiGmtkadli-----nnlgti
d4e01a2  ( 269 )    vItIannd-----------vdLiIrIsDrGgGiahkdldrvmdyhftta-
d4k4oa1  (  61 )    IqVIIe--p------d-----dSItViDdGrGipvgiqa-----ktgrpa
d6m37a-  (  68 )    sIrFGvfe-----------drLeViVadegg-------------------
                    bbbbbb                bbbbbb                      

                             160       170       180       190       200 
d1b63a2  (  68 )    LalaLarhatskiaslddleaiislgfr--gEalASISSVS------rLt
d1bxda-  ( 392 )    rgdsarti-------------------sgtglglaivqrivdnH-ngmle
d1h7sa2  (  80 )    FeglTl----------adltqvetFGfr--gealSSLCaLS------dVt
d1i58a-  ( 472 )    skAatLsdqeiLnflfvpgFstkevsevsggvgmdvVknvVesl-nGsIs
d1id0a-  ( 422 )    --------lskreviFdrgqrvdtlr-pgqgvglavAreiTeqy-egkIv
d1q1da1  ( 117 )    PemifGhlltssnydd--dekkvtggrn--gygaKLCNIF----St-eFi
d1r62a-  ( 313 )    ------------------------------glglsiArnlIdqh-sGkIe
d1s14a-  (1087 )    VeliLc---------------------------isvvnal----Sk-rVe
d1th8a1  ( 104 )    ---------------------------ersgmgftiMenfMd-----eVi
d1ysra-  ( 387 )    --------egerqvVfer-----------fslGLalVaqqAqlH-ggtAs
d2c2aa2  ( 443 )    ------------------------------glglaiTkeIVelH-gGrIw
d2e0aa2  ( 316 )    tpn---------------------apLaGfgyglPiSrlyAkyf-qgdLn
d2hkja3  (  86 )    VpnaFGrVl----yss--yvnrqtrgmy--glgvkAAVLYSQmhqdkpIe
d3cwva1  (  77 )    LvrVAtGaGFlgrppgd-------gWGw--dsmLVVSLAL----Ss-rYq
d3t0ha-  ( 111 )    AksgtkaFmealqa--------gadism--igqfgvGFYSAYlvAe-kvt
d4e01a2  ( 335 )    ----------------------------gfgfglPtSrayAeyl-ggsLq
d4k4oa1  (  93 )    VetvFtv------------------------lgsSvVNAL----St-sLd
d6m37a-  ( 115 )    -------------------------------lglylMetlMd-----eVr
                                                     aaaaaaa       bbb

                             210       220       230       240       250 
d1b63a2  ( 110 )    LtSrtaeqqeAwqAyAe--grdm--nv-tvkpaah---pvGttleVldLF
d1bxda-  ( 422 )    lgtse-------------------------------rGglsirAwlpvpv
d1h7sa2  ( 122 )    IsTchasakvGtrLFd----hnG--kiiqktpypr---prGttvsVqqLF
d1i58a-  ( 523 )    IeSek-------------------------------dkGtkvtIrLplt 
d1id0a-  ( 462 )    AgeSm-------------------------------lgGarmeViFGrQh
d1q1da1  ( 158 )    LeTAdlnvgqkYvQkWen----nMsichppkitsykkgpsytkvtFkPdl
d1r62a-  ( 332 )    ftswp-------------------------------g-htEfSVYLpirk
d1s14a-  (1128 )    VnVrrd--gqvynIAFengekvqdlqvvgt-cgkr---ntGtsvhFwPde
d1th8a1  ( 122 )    VeSev-------------------------------nkgttvyLkk    
d1ysra-  ( 428 )    LenSp-------------------------------lgGarLVLrLpgps
d2c2aa2  ( 462 )    VeSev-------------------------------gkGSrffVwIpkd 
d2e0aa2  ( 350 )    lySls-------------------------------gyGtdaiIyLkAls
d2hkja3  ( 129 )    IeTSpvnskriytFkLkIdinknepiivergsveNtrgfhGtsvaISIp-
d3cwva1  ( 113 )    VDIWad--grQwrVmGehGhpqgegaavtpmepmpvsaerGVrVhFvPDa
d3t0ha-  ( 150 )    vitkhndd-eqyaWeSsAg------gsFtvrtdtgepmgRGtkvilhlk-
d4e01a2  ( 356 )    lqSlq-------------------------------giGtdvyLrLrhid
d4k4oa1  ( 134 )    VrVykd--gkVyyQeYrrGavvddLkviee-t--d---rhGttVhFiPDp
d6m37a-  ( 129 )    vqn---------------------------------hsgvtvaMtkyln 
                    bbbb                                    bbbbbbb   

                             260       270       280       290       300 
d1b63a2  ( 152 )    yntparrk-flrtektEfnhIdeiIrriAlarfdVTInLshng-----ki
d1bxda-  ( 441 )    traq----------------------------------------------
d1h7sa2  ( 164 )    stlpvrhkeFqrnikkeyakv-qvlhayCiisagirVsCtnqlgqgkrqp
d1i58a-                                                               
d1id0a-                                                               
d1q1da1  ( 204 )    trFgmeLd------ndILgVMrrrVydINgsvrdInVyln---g-----k
d1r62a-                                                               
d1s14a-  (1172 )    tfF-d-------sprFsvsrLthvLkakAvlCpgVeItFkDei--nn--t
d1th8a1                                                               
d1ysra-                                                               
d2c2aa2                                                               
d2e0aa2  ( 369 )    sesi----------------------------------------------
d2hkja3  ( 178 )    -----GdW------pkaksrIyeyIkrtyiiTpYAeFiFkDPeg-----n
d3cwva1  ( 161 )    tiF-e-------vlaFdrarLsrrCneLAalapgLrVsFAdlqrg----e
d3t0ha-  ( 192 )    ----edqteYle-----errikeivkkhSqf-igypitlfve        
d4e01a2  ( 375 )    g                                                 
d4k4oa1  ( 176 )    eiFte-------ttvYdfdkLAtrVrelAflnrgLhIsIeDrregqe--d
d6m37a-                                                               
                                                                      

                             310       320 
d1b63a2  ( 196 )    vrqyravpeggqkerRlgaIc
d1bxda-  ( 445 )    -------g--------ttkeg
d1h7sa2  ( 214 )    vVcTgGsp---sikeNigsVf
d1i58a-                                  
d1id0a-                                  
d1q1da1  ( 241 )    sLkir                
d1r62a-                                  
d1s14a-  (1210 )    eqrwcyqd             
d1th8a1                                  
d1ysra-                                  
d2c2aa2                                  
d2e0aa2  ( 373 )    -------eklpvfnksafkhy
d2hkja3  ( 212 )    vtyyprltnkipkppqe    
d3cwva1  ( 199 )    rtlwhlpg             
d3t0ha-                                  
d4e01a2                                  
d4k4oa1  ( 217 )    kkeyhyeg             
d6m37a-
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
DNA mismatch repair protein MutLDNA gyrase/MutL, N-terminal domainEscherichia coli [TaxId: 562]view
Histidine kinase domain of the osmosensor EnvZHistidine kinaseEscherichia coli [TaxId: 562]view
DNA mismatch repair protein PMS2DNA gyrase/MutL, N-terminal domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Histidine kinase CheAHistidine kinaseThermotoga maritima [TaxId: 2336]view
Histidine kinase PhoQ domainHistidine kinaseEscherichia coli [TaxId: 562]view
DNA topoisomerase IIDNA gyrase/MutL, N-terminal domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Nitrogen regulation protein NtrB, C-terminal domainHistidine kinaseEscherichia coli [TaxId: 562]view
Topoisomerase IV subunit BDNA gyrase/MutL, N-terminal domainEscherichia coli [TaxId: 562]view
Anti-sigma factor spoIIabHistidine kinaseBacillus stearothermophilus [TaxId: 1422]view
automated matchesHistidine kinaseMycobacterium tuberculosis [TaxId: 1773]view
Sensor histidine kinase TM0853Histidine kinaseThermotoga maritima [TaxId: 2336]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Topoisomerase VI-B subunitDNA gyrase/MutL, N-terminal domainSulfolobus shibatae [TaxId: 2286]view
automated matchesautomated matchesMyxococcus xanthus [TaxId: 246197]view
automated matchesHeat shock protein 90, HSP90, N-terminal domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase kinase (BCK)alpha-ketoacid dehydrogenase kinase, C-terminal domainNorway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
automated matchesautomated matchesEnterococcus faecalis [TaxId: 226185]view
automated matchesautomated matchesBacillus subtilis [TaxId: 224308]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320
- - - M P I Q V L P - - - - - - - - - P Q L A N Q I A A G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E V V E - - - - - - - R P A S V V K E L V E N S L D A - - - - - - - - - - - - - - - G A T R I D I D I E - - - - - - R G G A - - - - - K L I R I R D N G C G I K K D - - - - - - - - - - - - - E L A L A L A R H A T S K I A S L D D L E A I I S L G F R - - G E A L A S I S S V S - - - - - - R L T L T S R T A E Q Q E A W Q A Y A E - - G R D M - - N V - T V K P A A H - - - P V G T T L E V L D L F Y N T P A R R K - F L R T E K T E F N H I D E I I R R I A L A R F D V T I N L S H N G - - - - - K I V R Q Y R A V P E G G Q K E R R L G A I C
- - - - T G Q E M P M E M A D L - N A V L G E V I A A E S G - - - - - - - Y E R E I E T A L Y P G - - - - - S I E V K M - - H P L S I K R A V A N M V V N A A R Y G N - - - - - - - - - - - - - - G W I K V S S G T E - - - - - - - - - - - P N R A W F Q V E D D G P G I A P E Q R K H L F Q P - - - - F V R G D S A R T I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S G T G L G L A I V Q R I V D N H - N G M L E L G T S E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R G G L S I R A W L P V P V T R A Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - - - - - - - - T T K E G
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Q V V - - - - L - S L S T A V K E L V E N S L D A - - - - - - - - - - - - - - - G A T N I D L K L K - - - - - - D Y G V - - - - - D L I E V S D N G C G V E E E - - - - - - - - - - - - - N F E G L T L - - - - - - - - - - A D L T Q V E T F G F R - - G E A L S S L C A L S - - - - - - D V T I S T C H A S A K V G T R L F D - - - - H N G - - K I I Q K T P Y P R - - - P R G T T V S V Q Q L F S T L P V R H K E F Q R N I K K E Y A K V - Q V L H A Y C I I S A G I R V S C T N Q L G Q G K R Q P V V C T G G S P - - - S I K E N I G S V F
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S A S D K Y Q K I S - - - - - - - - - Q L E H I L K R P D T Y I G S V E T Q E Q L Q W - - - I Y D E D C M I E N V T I - - - - V P G L F K I F D E I L V N A A D N K V R D - - - - - - - - - - P S M K R I D V N I H - - A E - - - - - - - - - - - H T I E V K N D G K G I P I E I H N - - - - - K E N I Y I P E M I F G H L L T S S N Y D D - - D E K K V T G G R N - - G Y G A K L C N I F - - - - S T - E F I L E T A D L N V G Q K Y V Q K W E N - - - - N M S I C H P P K I T S Y K K G P S Y T K V T F K P D L T R F G M E L D - - - - - - N D I L G V M R R R V Y D I N G S V R D I N V Y L N - - - G - - - - - K S L K I R - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - P S H I G S I D P N C D V - V A V V Q D A F E C S R M L C D Q Y Y L S S P E L K L T Q V N G K F P D Q P I H I V Y - - V P S H L H H M L F E L F K N A M R A T V E H Q E N Q P - - - - - S L T P I E V I V V L G K - - - - - - - - - - - E D L T I K I S D R G G G V P L R I I D R L F S Y T Y S T A P T P N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A P L A G F G Y G L P I S R L Y A K Y F - Q G D L N L Y S L S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Y G T D A I I Y L K A L S S E S I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E K L P V F N K S A F K H Y
- - - - - - - - L S - - - - - - - - - P A E F F K R N P E L A G F P N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P - - - - - - - A R A L Y Q T V R E L I E N S L D A T D V H - - - - - - - - - - G I L P N I K I T I D - - L I D D A R Q I - - - - - Y K V N V V D N G I G I P P Q - - - - - - - - - - - - - E V P N A F G R V L - - - - Y S S - - Y V N R Q T R G M Y - - G L G V K A A V L Y S Q M H Q D K P I E I E T S P V N S K R I Y T F K L K I D I N K N E P I I V E R G S V E N T R G F H G T S V A I S I P - - - - - - G D W - - - - - - P K A K S R I Y E Y I K R T Y I I T P Y A E F I F K D P E G - - - - - N V T Y Y P R L T N K I P K P P Q E - - - -
- - - - - - - - G G - - - - - - - - - I V E N V R K R P G M Y C G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D V G - - - - E Y G L H H L V Y F L L D V A Y E E A R R - - - - - - - - - - - G E C R D V V L E V G - - G - - - - - - D - - - - - G S I A L F C T S R T V T - - - - - - - - - - - - - A E N L V R V A T G A G F L G R P P G D - - - - - - - G W G W - - D S M L V V S L A L - - - - S S - R Y Q V D I W A D - - G R Q W R V M G E H G H P Q G E G A A V T P M E P M P V S A E R G V R V H F V P D A T I F - E - - - - - - - V L A F D R A R L S R R C N E L A A L A P G L R V S F A D L Q R G - - - - E R T L W H L P G - - - - - - - - - - - - -
- - - - E V E T F A - - - - - - - - - F Q A E I A Q L M S L I I N T F Y S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N - - - - K E I F L R E L I S N S S D A L D K I R Y E S L T D P S K L D S G K E L H I N L I P N - - K Q - - - - - D - - - - - R T L T I V D T G I G M T K A D L I - - - - - N N L G T I A K S G T K A F M E A L Q A - - - - - - - - G A D I S M - - I G Q F G V G F Y S A Y L V A E - K V T V I T K H N D D - E Q Y A W E S S A G - - - - - - G S F T V R T D T G E P M G R G T K V I L H L K - - - - - E D Q T E Y L E - - - - - E R R I K E I V K K H S Q F - I G Y P I T L F V E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - D F V G I I C T R L S P - K K I I E K W V D F A R R L C E H K Y G N A P R V R I N G H V - - - - - - A A R F P F - - I P M P L D Y I L P E L L K N A M R A T M E S H L D T P Y - - - - N V P D V V I T I A N N D - - - - - - - - - - - V D L I I R I S D R G G G I A H K D L D R V M D Y H F T T A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G F G F G L P T S R A Y A E Y L - G G S L Q L Q S L Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G I G T D V Y L R L R H I D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L E A V R K R P G M Y I G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S T S - - - - G E G L H H L V W E I V D N S I D E A L A - - - - - - - - - - - G F A K S I Q V I I E - - P - - - - - - D - - - - - D S I T V I D D G R G I P V G I Q A - - - - - K T G R P A V E T V F T V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L G S S V V N A L - - - - S T - S L D V R V Y K D - - G K V Y Y Q E Y R R G A V V D D L K V I E E - T - - D - - - R H G T T V H F I P D P E I F T E - - - - - - - T T V Y D F D K L A T R V R E L A F L N R G L H I S I E D R R E G Q E - - D K K E Y H Y E G - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - A D Y I E M K V P A Q P E Y V G I I R L T L S G V A S R M G Y T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y D E I E D L K I A V S E A C T N A V Q H A Y K E - - - - - - - - - D K N G E V S I R F G V F E - - - - - - - - - - - D R L E V I V A D E G G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L G L Y L M E T L M D - - - - - E V R V Q N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H S G V T V A M T K Y L N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in