BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 55550 [ SH2 domain ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : SH2-like
# of Members : 33
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1ayaa-  (   4 )                                      rrWfhpni-tgveAen
d1bg1a3  ( 576 )                                ilalwnegYImGfi-skerEra
d1d4ta-  (   1 )                                   mdavaVyhgki-sretGek
d1i3za-  (   1 )                                   md-lpyyhgcl-tkreCea
d1lkka-  ( 122 )                                   lepepwffknl-srkdAer
d1mila1  (   4 )                                    lgepwfhgkl-srreAea
d1nrva-  ( 429 )                                  ihrtqhwFHgri-sreeShr
d1qada-  (   1 )                              edlpHhdektWnvgss-nrnkAen
d1uura3  ( 577 )                              rhistLwqegIIyGym-grqeVnd
d1xa6a2  (  21 )    ppiwksylyqLqqeAprPkriicPrevenrpkyygreFhGii-sreqAde
d2b3oa2  ( 109 )                                       rwyhghm-sggqAet
d2c9wa2  (  32 )                          qaalakAleLgqtgwywgsm-tvneA--
d2ciaa1  ( 284 )                                       ewyygnv-trhqAec
d2cs0a1  (   8 )            gqlaq------------------dgvpewfHgai-sredAen
d2dlza1  (   8 )                              sreidytaypWfAgnm-erqqtdn
d2dx0a-  ( 520 )          dtpptEl------------------hfgEkwFhkkvesrtsAek
d2eo6a1  (   8 )                       pfnstfadqeaellgkpWyAgac-drksAee
d2iuga1  (  10 )                                      aeWywgdi-sreeVne
d2izva2  ( 274 )                            lvpDllqInnnpCyWgvm-dkyaAea
d2kk6a1  (  12 )                                 kplaeqdWyhgai-prieAqe
d2oq1a1  (   5 )                                 dpAahlpfFYgsi-sraeAee
d2oq1a2  ( 135 )           legealeqaiisqapqvekliattaHerpwyHssl-treeAer
d2ysxa1  (   8 )                                    mvpcwnHgni-trskAee
d3eaza-  (  73 )                               agtklslmpWfHgki-treqAer
d3s9ka1  (   5 )                                  nletyewynksi-srdkAek
d3vrna3  ( 234 )                                     nhpGymafl-tydeVqe
d4eiha-  ( 167 )                                  slekhswYHgpv-srsaAey
d5jn0a-  (   6 )                                 dseersswywgrl-srqeAva
d5tnwa1  ( 663 )                                   heskeWYhasl-traqAeh
d5w3ra1  ( 520 )                                 qplsgypwfhgml-srlkAaq
d6icga1  (  60 )                                        wffgki-prakAee
d6pxba-  ( 178 )                                     tnqwyHgkl-drtiAee
d6waxa-  ( 340 )                             greedphegkiwFHgki-skqeAyn
                                                                aaaaaa

                             60        70        80        90        100 
d1ayaa-  (  19 )    lLlt----g--vdgSFLArpSk--snpgdfTLSVrrng------aVthik
d1bg1a3  ( 597 )    ILs------tkppGTFLLRfsessk-eggVTFTWVe-kdisgstqiqsve
d1d4ta-  (  19 )    lLlat---g--ldGSYLLRdSe--svpgvycLCVLyh------gyiytyr
d1i3za-  (  18 )    lLlkg---g--vdGNFLIRdSe--svpgAlCLCVsfk-------lvysyr
d1lkka-  ( 140 )    qllap---g-nthGSFliReSe--stagSfslSvrdf-dqnqgevvkHyk
d1mila1  (  22 )    lLq--------lnGdFLVRestt--tpgqyvLTGlqs------gqpkhll
d1nrva-  ( 448 )    iIkqq---g-lvdGlFLLRdsq--snpkAfvLTLChh------qkIknfq
d1qada-  (  24 )    lLrg------krdgTFLVres------gcyaCSVVVd------gevkHcv
d1uura3  ( 600 )    aLq------nqdpgTFIIRfsernp--gqfgIAyIg-vem--parikhy-
d1xa6a2  (  70 )    lLg-------gveGAYIlresq--rqpgcytLALrfg------nqtlnyr
d2b3oa2  ( 123 )    lLqak---g--epwTFLVresl--sqpgdfvLSVLSdqpks-plrVThik
d2c9wa2  (  61 )    kLk-ea-----pegtfLIRdSs--hsdYlLTiSvkts------agptnlr
d2ciaa1  ( 298 )    aLne----r-GvegDFLIRdse--sspsdfsVSLkAs------gkNkhfk
d2cs0a1  (  31 )    lles-q-----plGSFlirvsh--shv-GytlSYkaq------sscchfm
d2dlza1  (  31 )    llks------hasGtYliRerpaea--erfAiSikfn------devkhik
d2dx0a-  ( 546 )    lLqeyCaetgakdgtfLVReSe--tfpndytLSfwrs------grvqHÇr
d2eo6a1  (  38 )    Alhrs---n--kdGSFlirkssghdskqpYtlvAFfn------krvynip
d2iuga1  (  25 )    kLrd------tadGtFLVRdAstkmh-gdytLTLrkg------gnnklIk
d2izva2  ( 299 )    lLe-----g-kpeGTfLLRdSa--q-dylFSVSFrry------srslhar
d2kk6a1  (  32 )    llk--------kqGDFlvreshg--kpgeyvlSvySd------gqrrhfi
d2oq1a1  (  25 )    hLkla---g--adGLFLLRqCl--rslgGYvLSLvhd------vrfhHfp
d2oq1a2  ( 178 )    kLysg---a-qtdGkFLLRprk---eqgtyALSLIyg------ktVyhyl
d2ysxa1  (  25 )    llsrtg-----kdGSFlvrase--sisrAyalCvlyr------ncvytyr
d3eaza-  (  95 )    lLy-----p-petGlFLVrest--nypgdytLCVSSd------gkVehyr
d3s9ka1  (  24 )    lLldtg-----kegafMvrdsr--tpgt-ytvSvFtkaiis--enpcIkh
d3vrna3  ( 250 )    rLqac---rd-kpgSYIFRpsct--rlgqwaIgyVss-----dgsIlqti
d4eiha-  ( 186 )    lLs-----s-linGSFLVrese--sspgqlsISLrye------grVyhyr
d5jn0a-  (  26 )    lLqg------qrhGVfLVRdsstsp--gdyvLSVSEn------srVsHyi
d5tnwa1  ( 681 )    mlmr-----vprdGAFlvrkrn-ep--nSyAiSFrAe------gkikhcr
d5w3ra1  ( 540 )    lvltg---gtgshGvflvRqSe--trrgeyvltFnf---q-g--kakHlr
d6icga1  (  73 )    mLskqr-----hdGAFLIRess---apgdfSLSVkfg------ndVqhfk
d6pxba-  ( 194 )    rLrqa---g--ksGSYLIResd--rrpgsfvLSFLs---qmn--vVnhfr
d6waxa-  ( 364 )    lLmt----v-gqvSSFLVrpsd--ntpgdysLYFrTn------eniqrfk
                    aa             bbbbb         bbbbbbb         bbbbb

                             110       120       130       140       150 
d1ayaa-  (  56 )    Iqnt---g-d--yyDlyg------gkfatlaeLVqyYme-hhgqLk-ekn
d1bg1a3  ( 639 )    pyt---kqql--n---------n----msFAeiImgykImda--------
d1d4ta-  (  56 )    Vsqt---etg--swSaetapgvhkryfrkIknLisafqk-p-dq------
d1i3za-  (  55 )    Ifre---khg--yYrIetdahtprtifpnLqeLvskYgk-p-gq------
d1lkka-  ( 183 )    irnl---dng--Gfyisp-----ritFpglhelvrhYtn-a-sd------
d1mila1  (  56 )    LvdP--g------vrtk-------hrFesVshLIsyhmdnhlpIisa---
d1nrva-  ( 486 )    Ilpc-----t--ffsLd---dgn-tkFsdLiqLVdfYql-----------
d1qada-  (  59 )    Inkt--a--t--gyGFae----pynlysslkeLVlhYqh-t----sLvqh
d1uura3  ( 638 )    lvq---pndt--a-------aak----kTFPdFLsehs------------
d1xa6a2  ( 105 )    lfhd-------gkhfvg-----ekrfesihdlVtdgLitl----------
d2b3oa2  ( 169 )    Vmce---g-g--rytvgg-----letfdsltdLVehfkk-t--Gie-Eas
d2c9wa2  (  97 )    Ieyg--------kFrlDsiicv--lqfdsVvhLIdyyvqm----------
d2ciaa1  ( 335 )    Vqlv---d-n--vycig------qrrfhtmdeLVehYkk-a-pIft-seh
d2cs0a1  (  66 )    vklld-----dgtfmipge----kvahtsldalvtfHqqk----------
d2dlza1  (  67 )    vvek--d--n--wihite-----akkFdsllelveyYqc-h----slkeS
d2dx0a-  ( 588 )    IrStmen-g-vmkYyLTd-----nltfnsIyaLIqhYrea----------
d2eo6a1  (  77 )    vrFi--eatk--qYAlgkkknge-eyfgsvveivnshqh-nplvli-dsq
d2iuga1  (  62 )    Ifhr--d--g--kygFsd----p-LtfssvveLInhyrn-e----sLaqy
d2izva2  ( 335 )    Ieqw---n-h--nfSfdahdpcv-fhspdItgLlehYkd---------ps
d2kk6a1  (  66 )    iqyv--d--n--myrFeg------tGfsnipqlidhhyt-tkqvit-k--
d2oq1a1  (  63 )    Ierq---lng--tyaia---gg--kahcgPaeLCefYsr-----------
d2oq1a2  ( 215 )    Isqd---kag--kycip---eg--tkfdTLwqLVeyLkl-----------
d2ysxa1  (  62 )    ilpne-----ddkftvqasegvsmrfftkldqliefykke----------
d3eaza-  ( 131 )    Imyh---a-s--kLSId---e-e-vyfenLmqLVehYts-----------
d3s9ka1  (  64 )    yhiketnds-pkryyvae---k--yvfds-iplliqyHqy----------
d3vrna3  ( 289 )    pa----------------------nk--plsqvLlegqkdg---------
d4eiha-  ( 222 )    Intt---adg--kvyVt---a-e-srfstLaeLVhhHst-----------
d5jn0a-  (  62 )    Insr--------rlrIgd------qefdslpaLLefyki-h----yLd--
d5tnwa1  ( 717 )    vqqe--g--q--tvmlgn------sefdslvdlisyYek-h----plyr-
d5w3ra1  ( 579 )    lsln---aag--qCrvq------hlhfqsifdMlehFrv-h-pipl-sgg
d6icga1  ( 110 )    Vldga------gkyfLwv------vkfnslneLVdyHrst----------
d6pxba-  ( 232 )    Iiam---s-g--dyyig------grrfsslsdLIgyysh-v-ssll----
d6waxa-  ( 401 )    Ispt---pnn--qFmMg------gryynsIgdIIdhyrk-e-qIve----
                    bbb          bb              aaaaaaaa             

                             160       170       180       190       200 
d1ayaa-  (  93 )    ---gdvIeLkypln                                    
d1bg1a3  ( 663 )    -tnilvspLvylyp-----------dipkeeaFgkycr---aaplktkfi
d1d4ta-  (  93 )    ---givipLqypvek                                   
d1i3za-  (  92 )    ---gLvvhLsnpimr                                   
d1lkka-  ( 215 )    ---glctrlsrpCqt                                   
d1mila1  (  91 )    ---gseLcLqqpverkl                                 
d1nrva-  ( 519 )    nkgvLpckLkhhCir                                   
d1qada-  (  94 )    ndsL-nvtLayPVya                                   
d1uura3  ( 660 )    -------qFvnLLqwtkdtngaprfklhkdtALgsfapkrta--------
d1xa6a2  ( 133 )    yietkaa-----------------eyiskmttnpiyehigyatllr    
d2b3oa2  ( 204 )    ---gafVyLrqpyya                                   
d2c9wa2  ( 133 )    c                                                 
d2ciaa1  ( 370 )    ---geklyLvrALq                                    
d2cs0a1  (  97 )    pieprrelltqpCrqkd                                 
d2dlza1  ( 101 )    fkql-dttlkypy                                     
d2dx0a-  ( 621 )    --------hlrÇaefel---rltdp-------------------vp    
d2eo6a1  ( 120 )    nntkdstrlkyavkvs                                  
d2iuga1  (  96 )    npkl-dvkLlypvSkyqq                                
d2izva2  ( 369 )    aCmffepLLstplirtf                                 
d2kk6a1  ( 100 )    ---ksgvvllnpipkdkkwi                              
d2oq1a1  (  92 )    dpdgLpcnLrkpcnrpsglepq----------------pgvfdclrdavr
d2oq1a2  ( 244 )    kadgLiycLkeacpn                                   
d2ysxa1  (  97 )    n-mglvthlqypvplee---edtgd-------------------dp    
d3eaza-  ( 159 )    dadgLctrLikpkvme                                  
d3s9ka1  (  97 )    nggglv-------------------trlrypvc                 
d3vrna3  ( 306 )    -------fYlyPdgkthnpdlt                            
d4eiha-  ( 251 )    vadgLvttLhypApkc                                  
d5jn0a-  (  94 )    -----tttLiepVars                                  
d5tnwa1  ( 749 )    -----kmklrypine                                   
d5w3ra1  ( 616 )    ---sSdvvlvsyvpss                                  
d6icga1  ( 139 )    sVsrnqqIfLrdie                                    
d6pxba-  ( 264 )    ----kgekLlypvapp----------------------------------
d6waxa-  ( 434 )    -----gyyLkepVpmq                                  
                                                                      

                             210 
d1ayaa-                         
d1bg1a3  ( 712 )    cVtpf       
d1d4ta-                         
d1i3za-                         
d1lkka-                         
d1mila1                         
d1nrva-                         
d1qada-                         
d1uura3  ( 696 )    -pvpvggeplns
d1xa6a2                         
d2b3oa2                         
d2c9wa2                         
d2ciaa1                         
d2cs0a1                         
d2dlza1                         
d2dx0a-                         
d2eo6a1                         
d2iuga1                         
d2izva2                         
d2kk6a1                         
d2oq1a1  ( 127 )    d----yvrqtwk
d2oq1a2                         
d2ysxa1                         
d3eaza-                         
d3s9ka1                         
d3vrna3                         
d4eiha-                         
d5jn0a-                         
d5tnwa1                         
d5w3ra1                         
d6icga1                         
d6pxba-  ( 276 )    -------epved
d6waxa-
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A G T K L S L M P W F H G K I - T R E Q A E R L L Y - - - - - P - P E T G L F L V R E S T - - N Y P G D Y T L C V S S D - - - - - - G K V E H Y R I M Y H - - - A - S - - K L S I D - - - E - E - V Y F E N L M Q L V E H Y T S - - - - - - - - - - - D A D G L C T R L I K P K V M E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T N Q W Y H G K L - D R T I A E E R L R Q A - - - G - - K S G S Y L I R E S D - - R R P G S F V L S F L S - - - Q M N - - V V N H F R I I A M - - - S - G - - D Y Y I G - - - - - - G R R F S S L S D L I G Y Y S H - V - S S L L - - - - - - - - K G E K L L Y P V A P P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E P V E D
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G R E E D P H E G K I W F H G K I - S K Q E A Y N L L M T - - - - V - G Q V S S F L V R P S D - - N T P G D Y S L Y F R T N - - - - - - E N I Q R F K I S P T - - - P N N - - Q F M M G - - - - - - G R Y Y N S I G D I I D H Y R K - E - Q I V E - - - - - - - - - G Y Y L K E P V P M Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in