Superfamily : 55261 [ GAD domain-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : DCoH-like
# of Members : 4
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1c0aa2  ( 288 )        NpMeltdVadlLksVefavFagpAndpkGrVAALrVpgGAsLt---
d1l0wa2  ( 295 )        fglelkeVgplFrqsgfrvFqea-----eSVkALaLpk--aLs---
d1zq1c2  ( 277 )    vkpdIkeefydVtdiFenTkSkiIarvik--ggkVLAIkLpkFrglIgre
d2p8ta2  (  83 )      mfsepigVsVd------------------gypGiAIVVknPp------
                             bb           aaaa       bbbbbbb          

                             60        70        80        90        100 
d1c0aa2  ( 331 )    ------rkqIdeYgnfVkiygakgLayIkVnerakgleG-InSpVakfLn
d1l0wa2  ( 331 )    ------rkeVaeLeevAkrhkAqgLawArVee------ggFsggvakfL-
d1zq1c2  ( 327 )    iqpgrr--lGteFadrAkky-VpgIfH-----IdeLpn--------ygIs
d2p8ta2  ( 107 )    ---efk---sielrdeAikfdAkgAmILtVkd------neIVfpedfrpL
                            aaaaaaaaaaa      bbbbb          bb        

                             110       120       130       140       150 
d1c0aa2  ( 374 )    aeiIedILdrT-aAqdgDMIFFgAdn-kkiVadAMgaLrlkVGkdlglt 
d1l0wa2  ( 368 )    epvreaLlqaT-eArpgdTLLFVAgp-rkvAatALgaVrlrAadlLglk 
d1zq1c2  ( 361 )    qeeVnkVierL-nLseedAFVLVAae-eekAknALreVIkrAreaiegv 
d2p8ta2  ( 145 )    kemypeVakkIvdyedgdAVIITwAetpakAlkSAihVAyiLkkeeitpe
                       aaaaaaa        bbbbbbb  aaaaaaaaaaaaaaaaaa     

                         
d1c0aa2                  
d1l0wa2                  
d1zq1c2                  
d2p8ta2  ( 195 )    ilevv
                         

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Prokaryotic AspRS, insert domainGAD domainEscherichia coli [TaxId: 562]view
Prokaryotic AspRS, insert domainGAD domainThermus thermophilus, AspRS-1 [TaxId: 274]view
Glutamyl-tRNA(gln) amidotransferase subunit E, GatE, insert domainGAD domainPyrococcus abyssi [TaxId: 29292]view
Hypothetical protein PH0730PH0730 C-terminal domain-likePyrococcus horikoshii [TaxId: 53953]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150
- - - - N P M E L T D V A D L L K S V E F A V F A G P A N D P K G R V A A L R V P G G A S L T - - - - - - - - - R K Q I D E Y G N F V K I Y G A K G L A Y I K V N E R A K G L E G - I N S P V A K F L N A E I I E D I L D R T - A A Q D G D M I F F G A D N - K K I V A D A M G A L R L K V G K D L G L T - - - - - -
- - - - F G L E L K E V G P L F R Q S G F R V F Q E A - - - - - E S V K A L A L P K - - A L S - - - - - - - - - R K E V A E L E E V A K R H K A Q G L A W A R V E E - - - - - - G G F S G G V A K F L - E P V R E A L L Q A T - E A R P G D T L L F V A G P - R K V A A T A L G A V R L R A A D L L G L K - - - - - -
V K P D I K E E F Y D V T D I F E N T K S K I I A R V I K - - G G K V L A I K L P K F R G L I G R E I Q P G R R - - L G T E F A D R A K K Y - V P G I F H - - - - - I D E L P N - - - - - - - - Y G I S Q E E V N K V I E R L - N L S E E D A F V L V A A E - E E K A K N A L R E V I K R A R E A I E G V - - - - - -
- - M F S E P I G V S V D - - - - - - - - - - - - - - - - - - G Y P G I A I V V K N P P - - - - - - - - - E F K - - - S I E L R D E A I K F D A K G A M I L T V K D - - - - - - N E I V F P E D F R P L K E M Y P E V A K K I V D Y E D G D A V I I T W A E T P A K A L K S A I H V A Y I L K K E E I T P E I L E V V

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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