Superfamily : 54980 [ EF-G C-terminal domain-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : Ferredoxin-like
# of Members : 10
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1t95a3  ( 162 )    ilplkfeeeiaIkIp-pehtgrAisaLynf-----gg-Vtreewqr--dg
d1vi7a2  ( 138 )        p-lteytLqCe-yhqltgIealLgqC-----dGkiinsdyqa---f
d2bm1a4  ( 404 )      vpepvidvaIePktkadqekLsqALarlaeedptFrvsth----petg
d2cvea2  ( 125 )        vervglaFlVp-faEvgrVyalLear-----alkA-eetytp--eG
d2dy1a4  ( 378 )      lpdpnvpvALhpkgrtdearLgeALrkLleedpsLklerq----eetg
d2dy1a5  ( 570 )    vl-lepiyrLkVlAp-qervgdVlsdLqar-----rGrilgmeqe--gal
d3b82a3  ( 482 )    kfsvspvvqVaVevknandlpkLveGlkrLsksdpcVltyms----e-sg
d3b82a5  ( 726 )        epvflVeIqCp-eqavggIysVLnkk-----rGqvvseeqrpgtpl
d6id0c3  ( 582 )    fnt-tsvikIaVePvnpselpkMldGlrkVnksypsLtTkve----e-sg
d6id0c5  ( 829 )        EpyyfVeVqAp-adcvsaVytVLarr-----rGhvtqdapipgspl
                           bbbbbbb     aaaaaaaaaa        bbbb         

                             60        70        80        90        100 
d1t95a3  ( 204 )    SWiCvripsg--ygdldllgkVAkgeAltk                    
d1vi7a2  ( 174 )    VlLrVALpaakvaeFsakLadfsrgsLqLlaie                 
d2bm1a4  ( 448 )    qtiIsGmgelhLeiivdrLkref-kVdAnvgk                  
d2cvea2  ( 162 )    VrFaLlLpkperegFlraLldaTrgqVale                    
d2dy1a4  ( 422 )    elLLwGhgelhLatAkerLqdy--gVeVefsvpkv               
d2dy1a5  ( 611 )    svVhAeVPlaeVleYykaLpglTggaGaytlefshyaeVp----------
d3b82a3  ( 527 )    ehiVAGtgelhLeiClqdLehdhAgvpLkisppv                
d3b82a5  ( 766 )    ftVkAyLPvnesfgFtgeLrqaTggqAfpqmvfdhwstlgsdpldp----
d6id0c3  ( 626 )    ehVilGtgelyLdcVmhdlrkmySeidIkvadpv                
d6id0c5  ( 869 )    ytIkAfIPaidsfgFetdLrthTqgqAfSlsvfhhwqivpGdpldksivi
                     bbbbb        aaaaaaaa     bbb                    

                             110       120       130       
d1t95a3                                                    
d1vi7a2                                                    
d2bm1a4                                                    
d2cvea2                                                    
d2dy1a4                                                    
d2dy1a5  ( 651 )    --------phlaqrivqeraqe----------------g
d3b82a3                                                    
d3b82a5  ( 812 )    --------tskaGeivlaarkrhgmkeevpgwqeyydkl
d6id0c3                                                    
d6id0c5  ( 919 )    rplepQpaphlarefmiktrrrkgl              
                                                           

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Hypothetical protein AF0491, C-terminal domainHypothetical protein AF0491, C-terminal domainArchaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]view
Hypothetical protein YigZ, C-terminal domainYigZ C-terminal domain-likeEscherichia coli [TaxId: 562]view
Elongation factor G (EF-G)EF-G/eEF-2 domains III and VThermus thermophilus [TaxId: 274]view
Hypothetical protein TTHA1053, C-terminal domainYigZ C-terminal domain-likeThermus thermophilus [TaxId: 274]view
Elongation factor G (EF-G)EF-G/eEF-2 domains III and VThermus thermophilus, EF-G-2 [TaxId: 274]view
Elongation factor G (EF-G)EF-G/eEF-2 domains III and VThermus thermophilus, EF-G-2 [TaxId: 274]view
Elongation factor 2 (eEF-2), N-terminal domainEF-G/eEF-2 domains III and VBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Elongation factor 2 (eEF-2), C-terminal domainEF-G/eEF-2 domains III and VBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view

 

No outliers

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Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130
I L P L K F E E E I A I K I P - P E H T G R A I S A L Y N F - - - - - G G - V T R E E W Q R - - D G S W I C V R I P S G - - Y G D L D L L G K V A K G E A L T K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - P - L T E Y T L Q C E - Y H Q L T G I E A L L G Q C - - - - - D G K I I N S D Y Q A - - - F V L L R V A L P A A K V A E F S A K L A D F S R G S L Q L L A I E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - V P E P V I D V A I E P K T K A D Q E K L S Q A L A R L A E E D P T F R V S T H - - - - P E T G Q T I I S G M G E L H L E I I V D R L K R E F - K V D A N V G K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - V E R V G L A F L V P - F A E V G R V Y A L L E A R - - - - - A L K A - E E T Y T P - - E G V R F A L L L P K P E R E G F L R A L L D A T R G Q V A L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - L P D P N V P V A L H P K G R T D E A R L G E A L R K L L E E D P S L K L E R Q - - - - E E T G E L L L W G H G E L H L A T A K E R L Q D Y - - G V E V E F S V P K V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
V L - L E P I Y R L K V L A P - Q E R V G D V L S D L Q A R - - - - - R G R I L G M E Q E - - G A L S V V H A E V P L A E V L E Y Y K A L P G L T G G A G A Y T L E F S H Y A E V P - - - - - - - - - - - - - - - - - - P H L A Q R I V Q E R A Q E - - - - - - - - - - - - - - - - G
K F S V S P V V Q V A V E V K N A N D L P K L V E G L K R L S K S D P C V L T Y M S - - - - E - S G E H I V A G T G E L H L E I C L Q D L E H D H A G V P L K I S P P V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - E P V F L V E I Q C P - E Q A V G G I Y S V L N K K - - - - - R G Q V V S E E Q R P G T P L F T V K A Y L P V N E S F G F T G E L R Q A T G G Q A F P Q M V F D H W S T L G S D P L D P - - - - - - - - - - - - T S K A G E I V L A A R K R H G M K E E V P G W Q E Y Y D K L
F N T - T S V I K I A V E P V N P S E L P K M L D G L R K V N K S Y P S L T T K V E - - - - E - S G E H V I L G T G E L Y L D C V M H D L R K M Y S E I D I K V A D P V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - E P Y Y F V E V Q A P - A D C V S A V Y T V L A R R - - - - - R G H V T Q D A P I P G S P L Y T I K A F I P A I D S F G F E T D L R T H T Q G Q A F S L S V F H H W Q I V P G D P L D K S I V I R P L E P Q P A P H L A R E F M I K T R R R K G L - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

Member Chain UniProtKB GO term
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