Superfamily : 54534 [ FKBP-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a+b)
Fold : FKBP-like
# of Members : 13
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1grja2  (  80 )                                                      
d1w26a3  ( 132 )             vtdadvdgldtlrkq-----------qAtwkek-----dga
d2f23a2  (  78 )                                                      
d2f4ea-  (  34 )                    gnvppvdseaevlde--kVsKqiikeghg---sk
d2y78a1  (   1 )                        m---tvvt-tesg-lkyedlteGsg---ae
d3b7xa-  (  19 )             qslyerlsq------rmldisgdrgVLKdvireGag---dl
d3ey6a1  (  35 )                            ewldilgnglLrkktlvpGp-pgssr
d3ni6a-  (   3 )                        qetleqvhltedgGVvKtilrkGeggeena
d3pr9a-  (   1 )                                                     m
d4dipa1  (  19 )                          galip----epeVkievlqkpf-içhrk
d4jysa-  (  76 )                            dkpyvktesgIlykdlidG---egdp
d5gpga1  ( 109 )                                    pkytksvlkkGdk--tnf
d5xb0a-  (  92 )    gtdapteaalkaertfmagekakpgVkel--adgILmteltpgtg---pk
                                                         bb           

                             60        70        80        90        100 
d1grja2  (  80 )                                                      
d1w26a3  ( 158 )    VeaeDrVtIdftGsvd-----------------geefegGkAsdfvlagq
d2f23a2  (  78 )                                                      
d2f4ea-  (  64 )    PskyStCfLhYrAWTknsqhkFeDTwh-------------eqqpieLvlg
d2y78a1  (  23 )    AragqtvsvhytGwlt-dgqkFdSSkd-------------rndpfaFvlg
d3b7xa-  (  51 )    VapdasVlVkysGyLehmdrpfdsn---------------------lmLe
d3ey6a1  (  60 )    PvkgqvVtVhlqTsle-ngtrVqe----------------epe-lvftLg
d3ni6a-  (  33 )    PkkgneVtVhYvGklessgkvFdsSre-------------rnvpfkFhLg
d3pr9a-  (   2 )    VekgkmVkIsyDGyvd--gkLfdTtneelAkkegiynpamiYgpvaIfAg
d4dipa1  (  42 )    TkggDlMlVhyeGylekdgslFhsThhnn------------gqpiwFtLg
d4jysa-  (  99 )    IeegdiVyIhYqGkTtndfriihsTfnsi-------------ippkIrAg
d5gpga1  ( 125 )    PkkgdvVhCwytGtlq-dgtvFdtniq-------------nakplsfkVG
d5xb0a-  ( 137 )    PdanGrVeVryvGrlpd-gkifdqSt----------------qpqwfrLd
                         bbbbbbbbb        bb                     bb   

                             110       120       130       140       150 
d1grja2  (  80 )                                                      
d1w26a3  ( 192 )    ----gripgfedgIkghkageeftidVtFpe-------------------
d2f23a2  (  78 )                                                      
d2f4ea-  ( 101 )    kek-kelaGLAiGVasMksgErALVhV-gwelAygkeGnfs---------
d2y78a1  (  59 )    gg--mvikGWdeGvqgMkvgGvRrlti-ppqlGygarGag----------
d3b7xa-  (  89 )    ----dtlwGmelGLlsMrrgElArFLF-kpnyAygtlGcpp---------
d3ey6a1  (  92 )    dc--dviqAldlSVplMdvgEtAmVtA-dskyCygpqGrsp---------
d3ni6a-  (  70 )    qg--evikGWdiCVasMtknEkCsVrL-dskyGygeeGcg----------
d3pr9a-  (  50 )    e--gqvlpGLdeaIleMdvgeerevvL-ppekAfg-krdpskikliplse
d4dipa1  (  81 )    i--lealkGWdqGLkgMÇvgEkrkLiI-ppalGyg-eGk-----------
d4jysa-  ( 136 )    qydqkhirAIYeIVigMkkhTrRqCvV-pphlAyp-n-------------
d5gpga1  ( 168 )    vg--kvirGWdeALltMSkgEkArLeI-epewAygkkGqpd---------
d5xb0a-  ( 170 )    ----svisGWtsALqnMptgAkWrLVI-pSdqAygaeGagd---------
                           aaaaaa        bbbbbb  333                  

                             160       170       180       190       200 
d1grja2  (  80 )                                   mpnngrVifgAtVtVlnld
d1w26a3  ( 220 )    -----------------------------eyhae---nLkgkaAkFaInL
d2f23a2  (  78 )                                   gs-gevIglgsvVeLeDpl
d2f4ea-  ( 140 )    ----------------------------------fpnVppmadLlYEVeV
d2y78a1  (  96 )    ----------------------------------g-vippnatlvFevel
d3b7xa-  ( 126 )    ------------------------------------lIppnttVlFeIeL
d3ey6a1  ( 130 )    ------------------------------------yIpphaaLcLeVtL
d3ni6a-  ( 107 )    ----------------------------------e-sipgnsvLiFeIeL
d3pr9a-  (  96 )    FtkrgikPikgltitidgipgkIvsinsgrVlVdfNhelAgkeVkYrIkI
d4dipa1  ( 117 )    -----------------------------------gkippestLiFnIdL
d4jysa-  ( 171 )    ------------------------------------hfp-sqpLlYeIdV
d5gpga1  ( 206 )    ----------------------------------a-kIppnakLtfeVeL
d5xb0a-  ( 206 )    ------------------------------------lIdpftPLvFeIeL
                                                               bbbbbbb

                             210       220       230       240       250 
d1grja2  (  99 )    sdeeqtyrIVgddeadfkq--nlIsvnspiArgLigkeeddvVv------
d1w26a3  ( 238 )    kkVeerelpe                                        
d2f23a2  (  96 )    sgerlsVqVvspaeanvldtpmkIsdaspmGkaLlghrvgdvlsLdTpkg
d2f4ea-  ( 156 )    igFdetkeg                                         
d2y78a1  ( 111 )    ldv                                               
d3b7xa-  ( 140 )    ldfl                                              
d3ey6a1  ( 144 )    ktAvdgp                                           
d3ni6a-  ( 122 )    isfre                                             
d3pr9a-  ( 146 )    eevvd                                             
d4dipa1  ( 132 )    leIrnGp                                           
d4jysa-  ( 184 )    vkvvkksgktfiekveqkidq-----------------------------
d5gpga1  ( 221 )    vdid                                              
d5xb0a-  ( 220 )    iavsq                                             
                    bbb                                               

                             260 
d1grja2  ( 141 )    ivefeVikVeyl
d1w26a3                         
d2f23a2  ( 146 )    kreFrVvaIhg 
d2f4ea-                         
d2y78a1                         
d3b7xa-                         
d3ey6a1                         
d3ni6a-                         
d3pr9a-                         
d4dipa1                         
d4jysa-  ( 207 )    -----------i
d5gpga1                         
d5xb0a-                         
                                

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
GreA transcript cleavage factor, C-terminal domainGreA transcript cleavage factor, C-terminal domainEscherichia coli [TaxId: 562]view
Trigger factor PPIase domainFKBP immunophilin/proline isomeraseEscherichia coli [TaxId: 562]view
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FKBP25FKBP immunophilin/proline isomeraseHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
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Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M P N N G R V I F G A T V T V L N L D S D E E Q T Y R I V G D D E A D F K Q - - N L I S V N S P I A R G L I G K E E D D V V V - - - - - - I V E F E V I K V E Y L
- - - - - - - - - V T D A D V D G L D T L R K Q - - - - - - - - - - - Q A T W K E K - - - - - D G A V E A E D R V T I D F T G S V D - - - - - - - - - - - - - - - - - G E E F E G G K A S D F V L A G Q - - - - G R I P G F E D G I K G H K A G E E F T I D V T F P E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E Y H A E - - - N L K G K A A K F A I N L K K V E E R E L P E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S - G E V I G L G S V V E L E D P L S G E R L S V Q V V S P A E A N V L D T P M K I S D A S P M G K A L L G H R V G D V L S L D T P K G K R E F R V V A I H G -
- - - - - - - - - - - - - - - - G N V P P V D S E A E V L D E - - K V S K Q I I K E G H G - - - S K P S K Y S T C F L H Y R A W T K N S Q H K F E D T W H - - - - - - - - - - - - - E Q Q P I E L V L G K E K - K E L A G L A I G V A S M K S G E R A L V H V - G W E L A Y G K E G N F S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F P N V P P M A D L L Y E V E V I G F D E T K E G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M - - - T V V T - T E S G - L K Y E D L T E G S G - - - A E A R A G Q T V S V H Y T G W L T - D G Q K F D S S K D - - - - - - - - - - - - - R N D P F A F V L G G G - - M V I K G W D E G V Q G M K V G G V R R L T I - P P Q L G Y G A R G A G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - V I P P N A T L V F E V E L L D V - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - Q S L Y E R L S Q - - - - - - R M L D I S G D R G V L K D V I R E G A G - - - D L V A P D A S V L V K Y S G Y L E H M D R P F D S N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L M L E - - - - D T L W G M E L G L L S M R R G E L A R F L F - K P N Y A Y G T L G C P P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L I P P N T T V L F E I E L L D F L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E W L D I L G N G L L R K K T L V P G P - P G S S R P V K G Q V V T V H L Q T S L E - N G T R V Q E - - - - - - - - - - - - - - - - E P E - L V F T L G D C - - D V I Q A L D L S V P L M D V G E T A M V T A - D S K Y C Y G P Q G R S P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y I P P H A A L C L E V T L K T A V D G P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q E T L E Q V H L T E D G G V V K T I L R K G E G G E E N A P K K G N E V T V H Y V G K L E S S G K V F D S S R E - - - - - - - - - - - - - R N V P F K F H L G Q G - - E V I K G W D I C V A S M T K N E K C S V R L - D S K Y G Y G E E G C G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E - S I P G N S V L I F E I E L I S F R E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M V E K G K M V K I S Y D G Y V D - - G K L F D T T N E E L A K K E G I Y N P A M I Y G P V A I F A G E - - G Q V L P G L D E A I L E M D V G E E R E V V L - P P E K A F G - K R D P S K I K L I P L S E F T K R G I K P I K G L T I T I D G I P G K I V S I N S G R V L V D F N H E L A G K E V K Y R I K I E E V V D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G A L I P - - - - E P E V K I E V L Q K P F - I C H R K T K G G D L M L V H Y E G Y L E K D G S L F H S T H H N N - - - - - - - - - - - - G Q P I W F T L G I - - L E A L K G W D Q G L K G M C V G E K R K L I I - P P A L G Y G - E G K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G K I P P E S T L I F N I D L L E I R N G P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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