Superfamily : 53448 [ Nucleotide-diphospho-sugar transferases ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : Nucleotide-diphospho-sugar transferases
# of Members : 7
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1fo8a-  ( 105 )                                                      
d1jvga-  (   2 )      nindlkltLskagQehLlrFwneLeeaqqveLyaeLqamnFeelnfff
d1s4na-  ( 104 )                                               kttmdyI
d1xhba2  (  95 )                                                      
d2bo4a1  (   2 )                                                      
d2icya2  (   5 )    tenlpqLksaVdglt---------------------eMseseksgFislV
d2yqca-  (   3 )    vksqqqIidsFkqanQdqLFqyydsLtidqqq-FidqLstiepa-li-tV
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1fo8a-  ( 105 )                                                      
d1jvga-  (  50 )    qkaieg--fdarMepVp-evlgSatrd-dqlqaWeseGLfqIS-qnkVAV
d1s4na-  ( 111 )    tpsFa-------gkPkACYVTlVrnkelkgLlsSIkyVEnkINkkfpYpW
d1xhba2  (  95 )                                                   nrs
d2bo4a1  (   2 )                                                      
d2icya2  (  34 )    srylaqhiewskIqtptdeiVvpyekMtpvsqd-vaeTknlLd---kLVV
d2yqca-  (  54 )    eqaiq---ssrnFtqLp-nqtastldlsdilqnwtelGlkAIG-ngeVAV
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1fo8a-  ( 105 )                     lavIPILViAçdr--stVrrCLdkLlhyrpsae
d1jvga-  ( 106 )    LLlaGgqG--LgvayPkGmydVgLpsrktLFqIQAerIlkLqqvAekyyg
d1s4na-  ( 157 )    VFLNdepFt----------------------eeFkeaVtkaVs-------
d1xhba2  (  98 )    lpdvrlegÇktkvypdnLptTSVVIvFhneawstLlrTVhsVInrSp-rh
d2bo4a1  (   2 )                        SLVVFpFkhehpevLlhNVrvAAa----Hp
d2icya2  (  83 )    LKLNGglgttmgctGPkSvieVr--dgltFLDLIViqIenlNnky-----
d2yqca-  ( 107 )    LLMAggqGtrLgssaPkGcfnIeLpsqksLFqIQAeKIlkIEqlAqqylk
                                                   aaaaaaaaaaaaa      

                             160       170       180       190       200 
d1fo8a-  ( 136 )    lFpIIVSQDçg---------heeTaqvIa-----sygsaVthirQpdlsn
d1jvga-  ( 156 )    n-kCiIPWY---IMTSgrT-mesTkefFtkhkyFglkkenViFFqQgmlP
d1s4na-  ( 178 )    sevkfgiLpkehwsypewInqtkAaeiradAat-----------------
d1xhba2  ( 147 )    MIeEIVLVdDaSer---dfLkrpLesyVk-----------klkVpVhVir
d2bo4a1  (  28 )    rVheVLCIGy--er---dqTYeaVeraap-----eIsratgTpVsVrlqe
d2icya2  ( 126 )    --gCkVPLV---LMNSfnT-hddThkivekytnsnVd---IhtfnQskYP
d2yqca-  ( 157 )    stkpiInWY---IMTSgpT-rnaTesfFi-nnyFgLnshQViFFnqgtlP
                          bbb           aaaaaaaaa              b      

                             210       220       230       240       250 
d1fo8a-  ( 172 )    iaVqp----dhrkf-----------qgyYkiArHYrw-ALgqIFhnfnyp
d1jvga-  ( 201 )    aMsfdg-kIi----LeeknkVsmapDgnGGLYrALaaqnIVedMeqrgIw
d1s4na-  ( 211 )    -----------------kyiyGgs--esyRhmCRYQSGfFWrHelLeeYd
d1xhba2  ( 183 )    me----------------------------qrsglir-ARlkGAavSrGq
d2bo4a1  (  68 )    rlGt----------------------lrpgkGDGMNT-ALryFleetqwe
d2icya2  ( 167 )    rVVadefvPwPskgktdke--GwYpPghGDVFpALmnsgkLdtFlsqgke
d2yqca-  ( 204 )    CFnlqGnkIL----lelknsICqspDgnGGLYkALkdngIlddLnskgIk
                                                  aaaaaaa  aaaaaaa    

                             260       270       280       290       300 
d1fo8a-  ( 206 )    AAVVVeddL-eVApDFFeYFqaTYplLkadpsLWÇVSAWNDNGkeqMVds
d1jvga-  ( 246 )    SIHVYcvDNILVkVADPrFIGFCiqk-----gAdCGAKVVeKtn--ptep
d1s4na-  ( 242 )    WYWRVepdIkLdInydVFkwMqen-----ekVYGFTVSihey------
d1xhba2  ( 204 )    VITFLdAhC-ECTagWLePLLarIkh---drr-TVVcPIiDvIsdd---t
d2bo4a1  (  95 )    rIHFYdAdItsFgpdWItkAEeaAdf----gy-gLVRHYFPrAstdaMIT
d2icya2  ( 215 )    YVFVAnsDNLgAiV-dltILkhLiqn-----kneYCMEVTpKtl--aDvk
d2yqca-  ( 250 )    hIHMYcVdNCLVkVADPiFIGFAiak-----kFdLATKVVKae-------
                    bbbbbb          aaaaaaaaa         bbbbbb          

                             310       320       330       340       350 
d1fo8a-  ( 255 )    ----------skpe-lLYRT----dFFPglGWLLlaelWaeLepk----W
d1jvga-  ( 289 )    vGVVCrv--d---gvyqVveyseis----------latAqkrssd-----
d1s4na-  ( 281 )    --------------------evTIptL--------wqtSmdFikknpeyl
d1xhba2  ( 246 )    feym-----agsdm-tYGGfnw----kLnfrwypVpqrEmdrRk------
d2bo4a1  ( 140 )    wMIT---RTGFALl-wphTeLSwIeqPlgGELLMrrevAamLyederVrr
d2icya2  ( 257 )    gGTLIsy--e---gkvqLleiaqVp----------dehvneFksi-----
d2yqca-  ( 293 )    vglIVLdqdn---qkPcVis----------------ela--ndpq-----
                                    bbb                 aaaaaa        

                             360       370       380       390       400 
d1fo8a-  ( 286 )    pkAf-wddwMrrpeQrkgrAÇVRPEISRTmtfg-----------------
d1jvga-  ( 319 )    -----------------grLlFnaGnIaNHFFTVpFLr-dVVnvyep--q
d1s4na-  ( 303 )    dennLmsFLSn---dngktYnlÇHFwSnFEIANLnLWrSpAYreYFdtLD
d1xhba2  ( 280 )    ---------gdrtl----pVrTPTMaggLFSIDrdYFqeIg---------
d2bo4a1  ( 186 )    rSDwGIDTLYTFVTvqqgvsIyECYIpeGkahrl----------------
d2icya2  ( 287 )    -------------------ekfkiFNTnNLWVnLkAIk-klvea--daLk
d2yqca-  ( 325 )    -----------------dslfLraAnIvNHYYsVefLn-kmIpkWissqy
                                           bb    bbbbaaaa             

                             410       420       430       440       450 
d1fo8a-  ( 331 )    --------------------------------------------------
d1jvga-  ( 349 )    LqhhvaqkkipyVdtqgqlikpdkpnGIkMe---KfVFdIFqfAk-----
d1s4na-  ( 350 )    hq------------------GGFFy--eRWgDaPVHSIAAALFLpkdkIh
d1xhba2  ( 308 )    ---------------tyDagMdiw-------GgenLEISFRIWQÇ-gGtL
d2bo4a1  ( 220 )    -----------------ygGLddl-------rtmLveCFaAIqsLqhevV
d2icya2  ( 315 )    MeIipnpkevd------------gvkVlQLe---TAAGAAIrfFd-----
d2yqca-  ( 360 )    LpfhiakkkIpSLnlnGefy-ptepnGIkLe---qfIfdVFpsVeln---
                                                                      

                             460       470       480       490       500 
d1fo8a-  ( 331 )    ------lkf-----ikLNqqfVpFtqldl-syLqqeaYdr-----dflar
d1jvga-  ( 391 )    --kFVVYeVlredEfspLknads-----qngkdNPttArhaLMslHhcwV
d1s4na-  ( 380 )    yFsdIGYhhp---pydNÇPldkevynsnnÇeÇdqgnDFtFqgySÇgkeYy
d1xhba2  ( 335 )    Ei-VTÇSHV-----Ghvfg---------qiinkNNrRLAeVWMdefknfF
d2bo4a1  ( 246 )    gq-paihrq-----ehphrvpvhIaervGYdveaTlhrLmqhwtprQvel
d2icya2  ( 345 )    --naiGVnVpr-sRFlpVka----------------------ssdlllVq
d2yqca-  ( 405 )    --kFGCLeVdrldEfSpL-nad------gakndTPttCrnhYleRSskWV
                          bb                          aaaaa      aaaaa

                             510       520       530       540       550 
d1fo8a-  ( 364 )    VygapqLqvekVrtndrkelgeVrVqYtgrdsFkafAkaLgVmddLksGV
d1jvga-  ( 434 )    lnAgGhFidengsrlpaiprsvpIqCEISp------------liSyageg
d1s4na-  ( 427 )    daqglvkpknwkkfre                                  
d1xhba2  ( 382 )    yiisp------------gVtkvdygdi----ssrlglrrkl---------
d2bo4a1  ( 290 )    LelFt----tpVregLrtCqrrpafnfMdemaWaaTYhvLLe------hF
d2icya2  ( 370 )    sd---------------------lytlv--------------dgfVtrn 
d2yqca-  ( 447 )    iqngGvIdn-------------qglVEVdS------------ktSYggeg
                    aa                                                

                             560       570       580       590       600 
d1fo8a-  ( 414 )    PrAGYrGIVTFlfrgRrVHLAPpqtwdgydpswt                
d1jvga-  ( 494 )    LesyVadkeFhapLiIdengvhel                          
d1s4na-                                                               
d1xhba2  ( 407 )    --------------------------qÇkpFswYleniYpds        
d2bo4a1  ( 330 )    qp-------------------gdpdWeELLFKLWTTRVLNYtmtVAlrgy
d2icya2                                                               
d2yqca-  ( 472 )    Lef-VngkhF-ngdiI                                  
                                                                      

                             610       620 
d1fo8a-                                  
d1jvga-                                  
d1s4na-                                  
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d2bo4a1  ( 361 )    dyAqqyLyrMLgrYryqAale
d2icya2                                  
d2yqca-                                  
                                         

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
N-acetylglucosaminyltransferase IN-acetylglucosaminyltransferase IRabbit (Oryctolagus cuniculus) [TaxId: 9986]view
UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylaseUDP-glucose pyrophosphorylaseHuman (Homo sapiens), AGX2 [TaxId: 9606]view
Glycolipid 2-alpha-mannosyltransferaseGlycolipid 2-alpha-mannosyltransferaseBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, N-terminal domainPolypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, N-terminal domainMouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]view
Mannosylglycerate synthase, MGSMGS-likeRhodothermus marinus [TaxId: 29549]view
UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (UDPGP 2)UDP-glucose pyrophosphorylaseThale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]view
automated matchesautomated matchesYeast (Candida albicans) [TaxId: 5476]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620
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T E N L P Q L K S A V D G L T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E M S E S E K S G F I S L V S R Y L A Q H I E W S K I Q T P T D E I V V P Y E K M T P V S Q D - V A E T K N L L D - - - K L V V L K L N G G L G T T M G C T G P K S V I E V R - - D G L T F L D L I V I Q I E N L N N K Y - - - - - - - G C K V P L V - - - L M N S F N T - H D D T H K I V E K Y T N S N V D - - - I H T F N Q S K Y P R V V A D E F V P W P S K G K T D K E - - G W Y P P G H G D V F P A L M N S G K L D T F L S Q G K E Y V F V A N S D N L G A I V - D L T I L K H L I Q N - - - - - K N E Y C M E V T P K T L - - A D V K G G T L I S Y - - E - - - G K V Q L L E I A Q V P - - - - - - - - - - D E H V N E F K S I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E K F K I F N T N N L W V N L K A I K - K L V E A - - D A L K M E I I P N P K E V D - - - - - - - - - - - - G V K V L Q L E - - - T A A G A A I R F F D - - - - - - - N A I G V N V P R - S R F L P V K A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S S D L L L V Q S D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L Y T L V - - - - - - - - - - - - - - D G F V T R N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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