BASE   PART 1   PART 2   PART 3  
Superfamily : 53271 [ PRTase-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : PRTase-like
# of Members : 37
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1bd3a-  (  21 )                                                   qee
d1dqna-  (   2 )                                            iCsvtgkp--
d1ecfa1  ( 250 )                                                      
d1fsga1  (   1 )                        mAskpidYGkGkgriePmyipdnt-fyn--
d1g2qa-  (   1 )                 m-piasyaqeLklaLhqyp---nfpse----------
d1l1qa1  (   2 )                     tmsvadAhalIktip---dfptk----------
d1p41a2  (  75 )               MkqaeAeefVqtLgqsLa--n-per-ilp----------
d1u9ya1  (   1 )                                                      
d1u9ya2  ( 156 )                                                      
d1vcha1  (   2 )                              etypItVgg-vtrhvpliepl---
d1vdma1  (   1 )                                                      
d1wd5a-  (   2 )                                                      
d1xtta1  (   2 )                                                      
d2aeea1  (   1 )                  mtlasqIAtqLLdik-----A-VyLkpedpftw---
d2dy0a-  (   2 )                 t-AtaqqleyLknsIksiq---dypkp----------
d2e55a-  (   1 )                                                      
d2ehja1  (   2 )                                                      
d2geba1  (   1 )                                                      
d2h06a2  ( 161 )                                                      
d2jbha-  (   7 )                        e---apd------ygrGvvimddwpGyd--
d2ps1a-  (   2 )               imLedyqknFLelAiecq-----A-Lrfg---sfkL---
d2wnsa-  (   7 )                    algpLVtgLydVq-----A-Fkfg---dfvL---
d3lrta1  (   1 )                                                      
d3lrta2  ( 156 )                                                      
d4ohca-  (   2 )             tgydrqsIsdtTAkiLlevq-----A-VhFnae-pfif---
d4p82a1  (   2 )                                                      
d5eswa1  (   1 )                                                      
d5jsqa-  (   5 )                                                      
d5mp7a2  ( 169 )                                                      
d5vn4a1  (   1 )    mslvevlpnYfTLs-kdSpLRkkFekvYkwys-pafSphd----------
d5voga1  (   3 )                                                      
d5zgoa-  (   1 )                             mrtypveIag-vrreLpivqvg---
d6kp5a-  (   4 )                                                      
d6lbpa2  ( 322 )                                                      
d6nfea1  (   2 )                                                      
d6nfea2  ( 163 )                                                      
d6w1ia1  (   2 )                      ealkrkiee-------eGvvls----------
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1bd3a-  (  24 )    silqdIitrfpnVvlMkqtaqLraMMtiIrdk--etpkeeFvfyAdrLIr
d1dqna-  (  10 )    --vkdvlstffkdrn----dVlesevkk--F-hLLAT-feECkaLAaDTA
d1ecfa1  ( 250 )                  npcLFeYVyfarpd--sfidkIsVysARvnMGtkLG
d1fsga1  (  29 )    --Addf-------------lvpphCkpy--IdkILLp-gglVkdrVekLA
d1g2qa-  (  24 )    -----------gIlFedFlpIfr--------------npglfqkLIdAFk
d1l1qa1  (  22 )    -----------giafkdLsdIls--------------tpaAldaVrkeVt
d1p41a2  ( 100 )    -----------g-gyVyltdIL--------------gkpsvlskVGkLFa
d1u9ya1  (   1 )                                                      
d1u9ya2  ( 156 )                                                      
d1vcha1  (  22 )    ------p-g-rriPlVeFl---g--------------dpeFTraAAeaLr
d1vdma1  (   1 )                                  mdkvyLt-wwqVdrAIfaLA
d1wd5a-  (   2 )                                         rfrdrrhAGalLA
d1xtta1  (   2 )               plyvI-dkpiTlhILtqLrdk--ytdqinFrknLvrLGr
d2aeea1  (  28 )    ------asgikSPIyTdNrvTls--------------ypkTrdlIEngFv
d2dy0a-  (  25 )    -----------gilfrdVtsLle--------------dpkAyalSidlLv
d2e55a-  (   1 )               mivel-shplIkhkVntAriq--dtsaekLrkTLkeLGf
d2ehja1  (   2 )               kiveV-khplVkhklglMreq--distkrFreLAseVGs
d2geba1  (   1 )                         mpspmed--IeeilIt-eeqLkakvkeLG
d2h06a2  ( 161 )                                                      
d2jbha-  (  26 )    --lnlf-------------typqhYygD--LeyVLIp-hgiIvdrIerLA
d2ps1a-  (  29 )    ------ksgreSpYfFnLglFn---------------tgkllsnLAtAYA
d2wnsa-  (  29 )    ------ksglsSPIyIdLrgIvs--------------rprLlsqVAdiLf
d3lrta1  (   1 )                                                      
d3lrta2  ( 156 )                                                      
d4ohca-  (  35 )    -------sgwASPVyIdCrkLis--------------yprvrraLMeMAe
d4p82a1  (   2 )                                nqka--viLdeqaIrraLtrIA
d5eswa1  (   1 )      mtip-------------dkikaVyek--S-tclyt-sneVeaALdrMa
d5jsqa-  (   5 )                           ckydf--Atsvlft-eaeLhtrMrgVA
d5mp7a2  ( 169 )                                                      
d5vn4a1  (  39 )    -----------vprfAevgnIte--------------npeVmrgIrdfFv
d5voga1  (   3 )                                   qkiwyt-yddIhrvIkaLA
d5zgoa-  (  22 )    ------p-g-vAvAlLnLl---g--------------dteLTeaAAeaLa
d6kp5a-  (   4 )                                    kyvVt-wdmLqihArkLA
d6lbpa2  ( 322 )                   qcIfeHIyfslpn--sivfgrsVyeSrhvFGeiLA
d6nfea1  (   2 )                                                      
d6nfea2  ( 163 )                                                      
d6w1ia1  (  17 )    -----------d-qvlkvdsFlnh-----------qidpl-lqrigdeFA
                                                          aaaaaaaaaaaa

                             110       120       130       140       150 
d1bd3a-  (  72 )    lLIeeAlneLpfqkkevttpldvsyhgvsfys--kiCGVSIvraGeSMes
d1dqna-  (  50 )    rrMneyYkdv-----------------a-----epVTLVALltgAylYAs
d1ecfa1  ( 284 )    ekIarewe-----------------------dldIdVVIPIpetScdIAl
d1fsga1  (  61 )    ydIhrtYfge------------------------eLhIICIlkgSrgFFn
d1g2qa-  (  49 )    lhLeeafp-----------------------evkidyIVGLesrGflFGp
d1l1qa1  (  47 )    ahYk---------------------------dvpItkVVGIesrGfiLGg
d1p41a2  ( 124 )    sVFa---------------------------ereIdVVMTVAtkGipLAy
d1u9ya1  (   1 )                                       miVVsG-sqsqnlAf
d1u9ya2  ( 156 )                                      dpIVLAPdkgAlefAk
d1vcha1  (  47 )    plVpk----------------------------eAeILFTTetspipLTh
d1vdma1  (  20 )    ekLr---------------------------eykPdVIIGVArGGliPAv
d1wd5a-  (  15 )    eaLapl--gLe-----------------------aPVVLGlprgGVvVAD
d1xtta1  (  38 )    iLGyeIsntLdyeivevetplgvktkgvditDlnnIVIINIlraAvPLVe
d2aeea1  (  58 )    etIkahFp-------------------------eVeVIAGtataGipHGa
d2dy0a-  (  50 )    erYk---------------------------nagItkVVGTearGflFGa
d2e55a-  (  37 )    mLVyeAlkdilleekevrtwi-gnkrfnyln-eeeIVFVPIlraGlsFle
d2ehja1  (  38 )    lLTyeAtadletekvtiegwn-gpveidqik-gkkiTVVPIlraGlgMmd
d2geba1  (  27 )    emItrdYeg------------------------kdLVLIGvlkgAimFMs
d2h06a2  ( 161 )                                   ewrnCTIVSPdagGakrVt
d2jbha-  (  58 )    kdIMkdIGys------------------------dImVLcVlkgGykF-a
d2ps1a-  (  58 )    iAIiqsdl-------------------------kFdVIFGpAykGipLAa
d2wnsa-  (  59 )    qtAqnagi-------------------------sfdTVCGVPytAlpLAt
d3lrta1  (   1 )                                       mkIIAL-rsslklAa
d3lrta2  ( 156 )                                        yVVSPddgglarVa
d4ohca-  (  64 )    tTItrdIg-----------------------feqIdAVAGGetaGipFAa
d4p82a1  (  22 )    heMierNkgMn-----------------------nCILVGIktrGiyLAk
d5eswa1  (  32 )    ikIhetLqd------------------------knPVIIcvmvgGlvPlg
d5jsqa-  (  29 )    qrIaddYsnc-----------------nLkplenpLVIVSVlkGSfvFTa
d5mp7a2  ( 169 )                                   de-dmVVVSPdsgrvrvAe
d5vn4a1  (  64 )    drYknlq-------------------------qpIthILGFdsrGflLGp
d5voga1  (  21 )    ekIn--------------------------agvkYdAMIAIGggGfiPAr
d5zgoa-  (  47 )    krLpp----------------------------eVeVLVTPevkAvpLAh
d6kp5a-  (  21 )    qrLl---------------------------paqwkGIIAvsrgGlvPAg
d6lbpa2  ( 355 )    tesp----------------------------vdCdVVIAvPdsGvvAAl
d6nfea1  (   2 )                                     stmmIFtG-nAnp-lAl
d6nfea2  ( 163 )                                      niMIVSPdvgGvvrAr
d6w1ia1  (  44 )    srFa---------------------------d-gitkivtiessGiapAv
                    aa                                  bbbb     aaaaa

                             160       170       180       190       200 
d1bd3a-  ( 120 )    gLravcr-------------gvriGkIlIqrde-----tta----epkl-
d1dqna-  (  78 )    lLtvhLt------------FpytlhfVkvssykgt------------r--
d1ecfa1  ( 311 )    eIAril--------------gkpyrqGFvk-nryvgrt-------fimpg
d1fsga1  (  87 )    lLidyLatiqkysgressvppffehyVrLkSyqndn---------stg--
d1g2qa-  (  76 )    tLAlal--------------gvgfvpVrkag--kLpge-------Cfka-
d1l1qa1  (  70 )    iVAnsl--------------gvgfVaLrkag--klpgd-------vckc-
d1p41a2  ( 147 )    aAAsyl--------------nvpVviVrkd------gs-------tvsi-
d1u9ya1  (  15 )    kvAkll--------------ntklTrVeykrf-------pdneIyVrIv-
d1u9ya2  ( 172 )    taSkil--------------nAeydyLe-----------------iaPk-
d1vcha1  (  69 )    vLAeal--------------glpyVvArrrrrpyMe-d-------pIiqe
d1vdma1  (  43 )    rLshiLg-------------diplkvIDVkfyk--ger-------Gek--
d1wd5a-  (  40 )    eVArrl----g----------GeLDVVLvrkVGApg--npefaLgAVGeg
d1xtta1  (  88 )    GLlkaFp-------------kArqGvIGAsrvevdg--kevpkdMdVyi-
d2aeea1  (  83 )    iIAdkm--------------tlpfAyIrs--kpk----------------
d2dy0a-  (  73 )    pVAlgl--------------gvgfvpVrkpg--kLpre-------tise-
d2e55a-  (  85 )    GAlqvVp-------------nAkvGfLgIkrne-----etl----eShi-
d2ehja1  (  86 )    gVlenvp-------------sAriSvVGMyrne-----etl----epvp-
d2geba1  (  53 )    gLsraI---d---------lplsidfLavssyg-sstk-------ssG--
d2h06a2  ( 180 )    siAdrl--------------nVdfAlIhker------------drmvLv-
d2jbha-  (  84 )    dLvehLknisrnsdrfVs---mkvdfIrlkmqii----------------
d2ps1a-  (  83 )    iVcvkL-----aeiGgskfqnIqyAfnrkeakdh----------------
d2wnsa-  (  84 )    vICstn--------------qipmLirrketkdy----------------
d3lrta1  (  15 )    riAeel--------------ktepVmPderrf-------pdgeLyLrYd-
d3lrta2  ( 170 )    diSakl--------------gkkhFfIekkri-------dd-rtvemkvp
d4ohca-  (  91 )    wIAdrm--------------mvpmQyVrk--kpg----------------
d4p82a1  (  49 )    rLAerIeqiegn--------pVtvGeIdItlyrddl--skktsndeplv-
d5eswa1  (  58 )    nLlhrL---d---------FplevdyVhAtryr-g-dl-------tGg--
d5jsqa-  (  62 )    dMvriLgdfg---------Vptrvefl-----------------------
d5mp7a2  ( 187 )    kwadslg-------------gvplAfIhktr-------------snrVv-
d5vn4a1  (  89 )    mIAveL--------------nvpfvlIrkan--kiagv-------iikSe
d5voga1  (  46 )    mLrcfle--------------ipiyaVtTayyd--s-d-------gvt--
d5zgoa-  (  69 )    ALsrit--------------gkpyVvArktekpyMi-n-------pvsrq
d6kp5a-  (  45 )    iLareLg-------------iryvdtVcIs--------------------
d6lbpa2  ( 377 )    GYaaka--------------gvafqqGLir-shyvgrt-------fieps
d6nfea1  (  18 )    kisshl--------------qipigkAtVgtf-------sdgetmVeIl-
d6nfea2  ( 179 )    avAkrln-------------daelSiIdr-r-------------vmhIi-
d6w1ia1  (  68 )    -tGlkl--------------gvpvvfArkhksltltdn-------llta-
                    aaaaa                  bbbb                       

                             210       220       230       240       250 
d1bd3a-  ( 147 )    iyekLpa---------------------------------------dIre
d1dqna-  ( 102 )    ----------qesVvFdeedlkqLk-----------------------ek
d1ecfa1  ( 339 )    qql--ksvr--rkLnanraeFr--------------------------dk
d1fsga1  ( 126 )    ----------qLtvlsd--dlsiFr-----------------------dk
d1g2qa-  ( 102 )    tyekey---gsdlfeIqknaIp--a-----------------------gs
d1l1qa1  (  96 )    tfdmey-----gtIeVqkrqLg--p-----------------------hd
d1p41a2  ( 174 )    nyvsgssn-riqtMsLakrsMk--t-----------------------gs
d1u9ya1  (  43 )    -deIn--------------------------------------------d
d1u9ya2  ( 200 )    tldAk--------------------------------------------d
d1vcha1  (  97 )    Vqt--------evLwLdrrfAekLl-----------------------nq
d1vdma1  (  71 )    ----------pvitipIhg---dLk-----------------------dk
d1wd5a-  (  74 )    gelvlpyAlrya----dqsyLereAarqrdvlrkraerYrrvRpkaaRkg
d1xtta1  ( 122 )    yykkipd--------------------------------------Irakv
d2aeea1  ( 105 )    ----------gnqIeg-----rVlk-----------------------gq
d2dy0a-  (  99 )    tydley---gtdqLeIhvdaIk--p-----------------------gd
d2e55a-  ( 112 )    yysrLpe----------------------------------------Lkg
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Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q E E S I L Q D I I T R F P N V V L M K Q T A Q L R A M M T I I R D K - - E T P K E E F V F Y A D R L I R L L I E E A L N E L P F Q K K E V T T P L D V S Y H G V S F Y S - - K I C G V S I V R A G E S M E S G L R A V C R - - - - - - - - - - - - - G V R I G K I L I Q R D E - - - - - T T A - - - - E P K L - I Y E K L P A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D I R E R W V M L L D P M C A - - - - T A G S V C K A I E V L L R L - G V K E E R - I I F V N I L A A P Q G I E R V F K E Y P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K V R M V T A A V D I C L N S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R Y Y I V P - - - G I G D F G D R Y F G T M - - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N P C L F E Y V Y F A R P D - - S F I D K I S V Y S A R V N M G T K L G E K I A R E W E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D L D I D V V I P I P E T S C D I A L E I A R I L - - - - - - - - - - - - - - G K P Y R Q G F V K - N R Y V G R T - - - - - - - F I M P G Q Q L - - K S V R - - R K L N A N R A E F R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D K - N V L L V D D S I V - - - - R G T T S E Q I I E M A R E A G A K K - - - - V Y L A S A A P E I R F P N V Y G I D M P S A T E L I A H G R E V D E I R Q I I G A D - - G L I F Q D - - L - - N - - - D L I D A V R A E N P D I Q Q F E C S V F - N G V Y V T K - - - - - D V D Q G Y L D F L D T L R N D D A K A V Q R Q - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A S K P I D Y G K G K G R I E P M Y I P D N T - F Y N - - - - A D D F - - - - - - - - - - - - - L V P P H C K P Y - - I D K I L L P - G G L V K D R V E K L A Y D I H R T Y F G E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E L H I I C I L K G S R G F F N L L I D Y L A T I Q K Y S G R E S S V P P F F E H Y V R L K S Y Q N D N - - - - - - - - - S T G - - - - - - - - - - - - Q L T V L S D - - D L S I F R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D K - H V L I V E D I V D - - - - T G F T L T E F G E R L K A V G P K S - - - - M R I A T L V E K R T D R S - - - - N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S L K - - G D F V G F S I E D - V W I V G C C Y D F N - - - - - - - - E M F R D F - D H V A V L - - S - - - D A A R K K F E K - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - M - P I A S Y A Q E L K L A L H Q Y P - - - N F P S E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G I L F E D F L P I F R - - - - - - - - - - - - - - N P G L F Q K L I D A F K L H L E E A F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E V K I D Y I V G L E S R G F L F G P T L A L A L - - - - - - - - - - - - - - G V G F V P V R K A G - - K L P G E - - - - - - - C F K A - T Y E K E Y - - - G S D L F E I Q K N A I P - - A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S - N V I I V D D I I A - - - - T G G S A A A A G E L V E Q L E A N L - - - - L E Y N F V M E L D F L - - - - - - - - - K G R S K L - - - - - - - - - - - - - N A - - - P V F T L L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - M K Q A E A E E F V Q T L G Q S L A - - N - P E R - I L P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G - G Y V Y L T D I L - - - - - - - - - - - - - - G K P S V L S K V G K L F A S V F A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E R E I D V V M T V A T K G I P L A Y A A A S Y L - - - - - - - - - - - - - - N V P V V I V R K D - - - - - - G S - - - - - - - T V S I - N Y V S G S S N - R I Q T M S L A K R S M K - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G S - N V L I I D D F M K - - - - A G G T I N G M I N L L D E F N A N V - - - - A G I G V L V E A E - - - - - - - - - - - G V D E R L V - - - - - - - - - - - - - D - - - E Y M S L L T L - S T I - - - N M K E - - - - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S I E I Q N - - - - G N F L R F F K D N - - - - - - - - - - - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in