BASE   PART 1   PART 2   PART 3  
Superfamily : 53223 [ Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain
# of Members : 19
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1a4ia2  (   2 )                                                      
d1bgva2  (   1 )                                                      
d1c1da2  (   1 )                                                      
d1edza2  (   4 )                                                      
d1gtma2  (   3 )                                                      
d1hwxa3  (   1 )                                                      
d1llqa2  (   2 )    svahhedvyshnlppmdekemalyklyrpervtpkkrsaeLlkeprlnkg
d1luaa2  (   2 )                                                      
d1npya2  (   1 )                                                      
d1nyta2  (   1 )                                                      
d3ngxa1  (   2 )                                                      
d3tnla1  (   4 )                                                      
d3vpxa1  (   1 )                                                      
d4b4ua1  (   1 )                                                      
d4cjxa1  (   1 )                                                      
d5dzsa1  (   1 )                                                      
d5o2aa1  (   2 )                                                      
d7mf4a1  (  12 )                                        qgrailtdryinrg
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1a4ia2  (   2 )                                                      
d1bgva2  (   1 )                                skyVdrVia---eVekkyadep
d1c1da2  (   1 )                                                      
d1edza2  (   4 )                                                      
d1gtma2  (   3 )                                adpyeiVik---qleraaqy--
d1hwxa3  (   1 )                          adreddpnffkmVeg---ffdrgasi--
d1llqa2  (  52 )    mgFslyeRqylgLhgllppafmtqeqqayrvitkLreqpndlarYiqLdg
d1luaa2  (   2 )                                                      
d1npya2  (   1 )                                                      
d1nyta2  (   1 )                                                      
d3ngxa1  (   2 )                                                      
d3tnla1  (   4 )                                                      
d3vpxa1  (   1 )                                                      
d4b4ua1  (   1 )                                                      
d4cjxa1  (   1 )                                                      
d5dzsa1  (   1 )                                                      
d5o2aa1  (   2 )                                                      
d7mf4a1  (  26 )    taFtmeeRqklhIlgrlppvvetleeQvarVygqVkkyekpInrYqhLvs
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1a4ia2  (   2 )                         apaeilngkeisaqirar-----------
d1bgva2  (  20 )    eFvqTVeevLsslgpvVdahpeyee-valLermV--i--PerviefrVp-
d1c1da2  (   1 )                               sidsal-nwd--gemtvtrfda-
d1edza2  (   4 )                          pgrtilaskvaetfnte-----------
d1gtma2  (  20 )    ----m------------------eiseealeflk--r--pqrivevtIp-
d1hwxa3  (  24 )    ----vedklvedlktrqtqeqkrnrVrgilriik--p--CnhvlslsFp-
d1llqa2  ( 102 )    LqdrNekLFyrVVcdhvkeLmpIVytpTVglACqnfgyiyrkpkGlyIti
d1luaa2  (   2 )                                                      
d1npya2  (   1 )                                                      
d1nyta2  (   1 )                                                      
d3ngxa1  (   2 )                            kilrgeeiaekkaen-----------
d3tnla1  (   4 )                                                      
d3vpxa1  (   1 )                              meifkymehqd--YeqLvicqdk-
d4b4ua1  (   1 )                        m--alvldgralakqieen-----------
d4cjxa1  (   1 )                        mpeavvidgravakaiqke-----------
d5dzsa1  (   1 )                                                      
d5o2aa1  (   2 )                         a-akiidgktiaqqvrse-----------
d7mf4a1  (  76 )    vhstnTtlYyaTIlahleeMlpIIytpTVgeACmeyshlFfrerGvyFnr
                                                 aaaa                 

                             160       170       180       190       200 
d1a4ia2  (  20 )    ----lknqvtqlkeqvpgftprlAILQVGnr-------------------
d1bgva2  (  64 )    --Weddn--------gkvhvntGyRVQFngaigpykgGLrFap----sVn
d1c1da2  (  20 )    -----------------mtgAhFVIRLdstqlgpAAgGTrAaqysnladA
d1edza2  (  21 )    ----iinnVeeykkthngqGpllVGFlANnd-------------------
d1gtma2  (  43 )    --Vemdd--------gsvkvftGFRVQHnwargpTkgGIrWhp----eEt
d1hwxa3  (  65 )    --irrdd--------gswevIeGyRAQHshqrtpCkGGIrYst----dVs
d1llqa2  ( 152 )    ndnsvskIyqiLsnWheedVraIVVTDGerIl------------glgdLG
d1luaa2  (   2 )                      skkllfQFDtd---------------------
d1npya2  (   1 )                  minkdTqlcMsLsgrps-------------------
d1nyta2  (   1 )                       metyAVFGnpia-------------------
d3ngxa1  (  17 )    ----lhgiiers-----glepslkLIQIgdn-------------------
d3tnla1  (   4 )              kiteritghTeliGLIAtpir-------------------
d3vpxa1  (  22 )    -----------------aSgLkAIIAIhdttlgpAlGGTrMwtYaseeeA
d4b4ua1  (  18 )    ----llvrvealkakt-grtpilATIlVGdd-------------------
d4cjxa1  (  20 )    ----lteevallerrykgrrpGlSTIICgkr-------------------
d5dzsa1  (   1 )                       mnffGlVGekLs-------------------
d5o2aa1  (  19 )    ----va-qvqariaagl-rapGlAvvlvgsn-------------------
d7mf4a1  ( 126 )    lykg--qFrniMrdagyqkVeVVVITDGSril------------glgdLG
                                         bbbbbb                       

                             210       220       230       240       250 
d1a4ia2  (  47 )    -ddSnlyInvklkaAeeig----ikAthikLpr-----------------
d1bgva2  ( 100 )    lSiMKflGFeqafkDslttlp--mgGAKGGSdF--dpn-------gks--
d1c1da2  (  53 )    LtdAGklAgamtlkmavsnlp--mGGGKSVIaLpaprh-------sId--
d1edza2  (  48 )    -paakmyAtwtqktsesmg----frYdlrvie------------------
d1gtma2  (  79 )    lstVkalAAwmtwkTavmdlp--ygGGkGGIiv--dpk-------kLs--
d1hwxa3  ( 101 )    vdeVkAlASlmTykcavvdvp--fGGAkAGVkI--npk-------nyt--
d1llqa2  ( 190 )    AYGiGIPvgkLAlyvAlggvqpkwcLpVLLdVGTnnmdllndpfYiGlrh
d1luaa2  (  13 )    ----atpsvfdvvvgydgg----adhItgyG-------------------
d1npya2  (  18 )    ---n-fgttfhnylydklg----lnfiYkaft------------------
d1nyta2  (  13 )    ---hskspfihqqfaqqln----iehpYgrvl------------------
d3ngxa1  (  39 )    -eaAsiyArakirrgkkig----iaVdleky-d-----------------
d3tnla1  (  25 )    ---hslsptmhneafaklg----ldyvYlAfe------------------
d3vpxa1  (  55 )    IedALrlArgmtykNaaagln--lgGGKTVIig--npk-------tdk--
d4b4ua1  (  44 )    -gaSatyvrmkgnaCrrVg----mdslkielpq-----------------
d4cjxa1  (  47 )    -kdsqtyVrlkrkaaaaCg----frnfsvelpa-----------------
d5dzsa1  (  13 )    ---hsvspqihkrvfeiln----ieSaYknfe------------------
d5o2aa1  (  45 )    -pasqiyvaskrkaCeevg----fvsrsydlpe-----------------
d7mf4a1  ( 162 )    snGIGISigkCslyvAgagidprlIVPVILDVGTnnerYlqdkdYlgmre
                        aaaaaaaaaaaaa        bbbbbb                   

                             260       270       280       290       300 
d1a4ia2  (  75 )    -tTteseVmkyItslne--------dstVhgFLVqlpLdSensInteeVi
d1bgva2  ( 137 )    ----dreVmrFCqaFMteLyr--hIgpdiDvPagdlgVg---arEigyMy
d1c1da2  (  92 )    ----pstwarILrIHAenIdk----lsgnYwTgpdvnTn---sadMdtLn
d1edza2  (  75 )    ---dkdfLeeaIiqAng--------ddsVngImVYfpVfgna--qDqyLq
d1gtma2  ( 116 )    ----drekerLArgYIraIyd--vIsPyeDiPapdvyTn---pqIMawMM
d1hwxa3  ( 138 )    ----deDLekITrrFTmeLAkkgfIgpgvDVPapnmsTg---erEMswIA
d1llqa2  ( 240 )    kRvrgkdYdtLLdnFMkACtkkYgq---kTlIQFE-DFa---npnafrLl
d1luaa2  (  36 )    -nVtpdnVgayVdgTIy---trggkekqsTaIfVGGgdmaaGerVfeaVk
d1npya2  (  42 )    --tq--diehaIkgVra---l------girgCaVsm-------pfketCm
d1nyta2  (  38 )    --ApindFintLnafFs---a------gGkgAnVtv-------pFkeeAf
d3ngxa1  (  66 )    -dismkdLlkrIddLak--------dpqinGIMIEnpLpk--gfdyyeIv
d3tnla1  (  50 )    --VgdkeLkdvVqgFra---m------nlrgWnVsm-------pNktnIh
d3vpxa1  (  92 )    ----n---deMFraFGryIeg----lngrYiTaedvgTt---eadmdlIn
d4b4ua1  (  72 )    -eTtteqLlaeIekLna--------npdVhGILLqhpVp-a-qIderaCf
d4cjxa1  (  75 )    -nVtqeaLereVirLne--------eeaChsIvVqlpLp-p-hIdkvaAl
d5dzsa1  (  38 )    --iskedIskldgaIkl---l------giqgVnVtv-------pYkerIm
d5o2aa1  (  73 )    -ttseaellelidtlna--------dntidGilvhlplp-a-gidnvkvl
d7mf4a1  ( 212 )    krlgdeeFyeLLdeFMeAAsaeW-p---nAvIQFE-dFs---nnhCfdIm
                           aaaaaaaaaa             bbbb           aaaaa

                             310       320       330      
d1a4ia2  ( 116 )    naIapekdvdg                           
d1bgva2  ( 178 )    gqYrkivg---------gfyngVLtg            
d1c1da2  ( 131 )    dtTe------------------fVfgrslergga--gs
d1edza2  ( 112 )    qvVckekDveGlnhvYyqnlyhnvryldkenrlkSi-l
d1gtma2  ( 157 )    deYe-tisr------rktpAfgIItgkplsi       
d1hwxa3  ( 181 )    dtyastiGh------ydinAhaCVtgKpisqggi    
d1llqa2  ( 283 )    dkYqd---------------kytMfNdd          
d1luaa2  (  82 )    krFfgpfrVscmldSn                      
d1npya2  (  72 )    pfLd------eihpsAqaiesVntIvNdn-gfLrAynt
d1nyta2  (  70 )    arAd------elterAalagaVntLmrledgrLlGdnt
d3ngxa1  ( 105 )    rnIpyykdvda                           
d3tnla1  (  82 )    kyLd------klspaAelvgaVntVvNdd-gvLtGhit
d3vpxa1  ( 128 )    leTd------------------yV              
d4b4ua1  ( 111 )    daIslakdvdg                           
d4cjxa1  ( 114 )    skIkpekdadc                           
d5dzsa1  (  70 )    kyLd------fiSpeAkrigaVntIllre-nmLyGynt
d5o2aa1  ( 112 )    erihpdkdvdg                           
d7mf4a1  ( 254 )    erYqk---------------kyrCfndd
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolaseTetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolaseHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Glutamate dehydrogenaseAminoacid dehydrogenasesClostridium symbiosum [TaxId: 1512]view
Phenylalanine dehydrogenaseAminoacid dehydrogenasesRhodococcus sp., M4 [TaxId: 1831]view
Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolaseTetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolaseBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Glutamate dehydrogenaseAminoacid dehydrogenasesPyrococcus furiosus [TaxId: 2261]view
Glutamate dehydrogenaseAminoacid dehydrogenasesCow (Bos taurus) [TaxId: 9913]view
Mitochondrial NAD(P)-dependent malic enzymeMalic enzyme N-domainPig roundworm (Ascaris suum) [TaxId: 6253]view
Methylene-tetrahydromethanopterin dehydrogenaseMethylene-tetrahydromethanopterin dehydrogenaseMethylobacterium extorquens [TaxId: 408]view
Shikimate 5-dehydrogenase-like protein HI0607Shikimate dehydrogenase-likeHaemophilus influenzae [TaxId: 727]view
Shikimate 5-dehydrogenase AroEShikimate dehydrogenase-likeEscherichia coli [TaxId: 562]view
automated matchesautomated matchesThermoplasma acidophilum [TaxId: 2303]view
automated matchesautomated matchesListeria monocytogenes [TaxId: 169963]view
automated matchesautomated matchesSporosarcina psychrophila [TaxId: 1476]view
automated matchesautomated matchesAcinetobacter baumannii [TaxId: 575584]view
automated matchesautomated matchesTrypanosoma brucei [TaxId: 999953]view
automated matchesautomated matchesPeptoclostridium difficile [TaxId: 272563]view
automated matchesTetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolaseEscherichia coli [TaxId: 83333]view
automated matchesautomated matchesTrypanosoma cruzi [TaxId: 353153]view
Domain ID Name
d1vl6a21vl6 A:1-154
Created with Raphaëld1bgva2d1hwxa3d1gtma2d3vpxa1d1c1da2d7mf4a1d1llqa2d1nyta2d1npya2d5dzsa1d3tnla1d1luaa2d1edza2d3ngxa1d4cjxa1d4b4ua1d5o2aa1d1a4ia2
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Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S K Y V D R V I A - - - E V E K K Y A D E P E F V Q T V E E V L S S L G P V V D A H P E Y E E - V A L L E R M V - - I - - P E R V I E F R V P - - - W E D D N - - - - - - - - G K V H V N T G Y R V Q F N G A I G P Y K G G L R F A P - - - - S V N L S I M K F L G F E Q A F K D S L T T L P - - M G G A K G G S D F - - D P N - - - - - - - G K S - - - - - - D R E V M R F C Q A F M T E L Y R - - H I G P D I D V P A G D L G V G - - - A R E I G Y M Y G Q Y R K I V G - - - - - - - - - G F Y N G V L T G - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S I D S A L - N W D - - G E M T V T R F D A - - - - - - - - - - - - - - - - - - M T G A H F V I R L D S T Q L G P A A G G T R A A Q Y S N L A D A L T D A G K L A G A M T L K M A V S N L P - - M G G G K S V I A L P A P R H - - - - - - - S I D - - - - - - P S T W A R I L R I H A E N I D K - - - - L S G N Y W T G P D V N T N - - - S A D M D T L N D T T E - - - - - - - - - - - - - - - - - - F V F G R S L E R G G A - - G S
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A D P Y E I V I K - - - Q L E R A A Q Y - - - - - - M - - - - - - - - - - - - - - - - - - E I S E E A L E F L K - - R - - P Q R I V E V T I P - - - V E M D D - - - - - - - - G S V K V F T G F R V Q H N W A R G P T K G G I R W H P - - - - E E T L S T V K A L A A W M T W K T A V M D L P - - Y G G G K G G I I V - - D P K - - - - - - - K L S - - - - - - D R E K E R L A R G Y I R A I Y D - - V I S P Y E D I P A P D V Y T N - - - P Q I M A W M M D E Y E - T I S R - - - - - - R K T P A F G I I T G K P L S I - - - - - - -
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S V A H H E D V Y S H N L P P M D E K E M A L Y K L Y R P E R V T P K K R S A E L L K E P R L N K G M G F S L Y E R Q Y L G L H G L L P P A F M T Q E Q Q A Y R V I T K L R E Q P N D L A R Y I Q L D G L Q D R N E K L F Y R V V C D H V K E L M P I V Y T P T V G L A C Q N F G Y I Y R K P K G L Y I T I N D N S V S K I Y Q I L S N W H E E D V R A I V V T D G E R I L - - - - - - - - - - - - G L G D L G A Y G I G I P V G K L A L Y V A L G G V Q P K W C L P V L L D V G T N N M D L L N D P F Y I G L R H K R V R G K D Y D T L L D N F M K A C T K K Y G Q - - - K T L I Q F E - D F A - - - N P N A F R L L D K Y Q D - - - - - - - - - - - - - - - K Y T M F N D D - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M - - A L V L D G R A L A K Q I E E N - - - - - - - - - - - - - - - L L V R V E A L K A K T - G R T P I L A T I L V G D D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G A S A T Y V R M K G N A C R R V G - - - - M D S L K I E L P Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - E T T T E Q L L A E I E K L N A - - - - - - - - N P D V H G I L L Q H P V P - A - Q I D E R A C F D A I S L A K D V D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M N F F G L V G E K L S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H S V S P Q I H K R V F E I L N - - - - I E S A Y K N F E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I S K E D I S K L D G A I K L - - - L - - - - - - G I Q G V N V T V - - - - - - - P Y K E R I M K Y L D - - - - - - F I S P E A K R I G A V N T I L L R E - N M L Y G Y N T
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A - A K I I D G K T I A Q Q V R S E - - - - - - - - - - - - - - - V A - Q V Q A R I A A G L - R A P G L A V V L V G S N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A S Q I Y V A S K R K A C E E V G - - - - F V S R S Y D L P E - - - - - - - - - - - - - - - - - - T T S E A E L L E L I D T L N A - - - - - - - - D N T I D G I L V H L P L P - A - G I D N V K V L E R I H P D K D V D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q G R A I L T D R Y I N R G T A F T M E E R Q K L H I L G R L P P V V E T L E E Q V A R V Y G Q V K K Y E K P I N R Y Q H L V S V H S T N T T L Y Y A T I L A H L E E M L P I I Y T P T V G E A C M E Y S H L F F R E R G V Y F N R L Y K G - - Q F R N I M R D A G Y Q K V E V V V I T D G S R I L - - - - - - - - - - - - G L G D L G S N G I G I S I G K C S L Y V A G A G I D P R L I V P V I L D V G T N N E R Y L Q D K D Y L G M R E K R L G D E E F Y E L L D E F M E A A S A E W - P - - - N A V I Q F E - D F S - - - N N H C F D I M E R Y Q K - - - - - - - - - - - - - - - K Y R C F N D D - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

 
Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in