Superfamily : 53150 [ DNA repair protein MutS, domain II ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : Ribonuclease H-like motif
# of Members : 2
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
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d1wb9a3  ( 117 )    GtisdeallqerqdnlLAAIwqdskgFGYAtLdIssGrFrLsePadretM
                         333        bbbbbb    bbbbbb      bbbb    aaaa

                             60        70        80        90        100 
d1ewqa3  ( 167 )    YdELFrhrPaeVLLApeLlengafldeFrkrFpvlseAp---Fep--eg-
d1wb9a3  ( 167 )    aaeLqrtnPaeLLyAedF----aemsLIeg-rrglrrrplweFeidtArq
                    aaaaaaa   bbbb                                    

                             110       120       130       140       150 
d1ewqa3  ( 212 )    ----------------egplALrrArgALlayAqrtqggaLs-lqpfrfy
d1wb9a3  ( 212 )    qLnlqFgtrdLvgfgVenAprGLcAAGCLLqyAkdtqrttLphIrsItme
                                       aaaaaaaaaaaaaaaaaa          bb 

                             160       170 
d1ewqa3  ( 245 )    dPgafrlpeatLralevfepl
d1wb9a3  ( 262 )    reqdsiim             
                     333                 

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
DNA repair protein MutS, domain IIDNA repair protein MutS, domain IIThermus aquaticus [TaxId: 271]view
DNA repair protein MutS, domain IIDNA repair protein MutS, domain IIEscherichia coli [TaxId: 562]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170
- - L L Q E S L L P R - E A N Y L A A I A T G - D G W G L A F L D V S T G E F K G T V L K S K S A L Y D E L F R H R P A E V L L A P E L L E N G A F L D E F R K R F P V L S E A P - - - F E P - - E G - - - - - - - - - - - - - - - - - E G P L A L R R A R G A L L A Y A Q R T Q G G A L S - L Q P F R F Y D P G A F R L P E A T L R A L E V F E P L
G T I S D E A L L Q E R Q D N L L A A I W Q D S K G F G Y A T L D I S S G R F R L S E P A D R E T M A A E L Q R T N P A E L L Y A E D F - - - - A E M S L I E G - R R G L R R R P L W E F E I D T A R Q Q L N L Q F G T R D L V G F G V E N A P R G L C A A G C L L Q Y A K D T Q R T T L P H I R S I T M E R E Q D S I I M - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

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