Superfamily : 52016 [ LeuD/IlvD-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : The 'swivelling' beta/beta/alpha domain
# of Members : 6
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1fgha1  ( 529 )    v---dvsptsqrlqlle-------pfdkwdgkdLedLqILIkVkgkCtTd
d1l5ja2  ( 161 )                                  alaekltVTVFkVtgeTnTd
d1v7la-  (   1 )                                     mittgkVWkfgddisTd
d2b3ya1  ( 631 )    dklffwnskstyiksppffenltldlqpp--ksivdAyVLLnLgdsvtTd
d2gp4a1  ( 419 )                                                      
d2hi6a1  (   2 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1fgha1  ( 569 )    hISaa-----------------------gpwlkfrghldnISnNLLi---
d1l5ja2  ( 181 )    dLSPa-pdawsrp-----------------------diplHAlaMLkn--
d1v7la-  (  18 )    eITPg-rynlt-k-----------------------dpkeLakiAFie--
d2b3ya1  ( 679 )    hISpagnIarnsPAAryLtnrgltpreFnsYgsRrgNdaVMarGTFan--
d2gp4a1  ( 419 )                                               glklLkg
d2hi6a1  (   2 )                                            kfaCrAitrg
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1fgha1  ( 593 )    ----gAiNsenrk-ansVrnavtqefgpVPdTAryYkqhg---irWVVIG
d1l5ja2  ( 205 )    ---are----------gIePdqpgv-vGPikqIealqqkg---fpLAY-V
d1v7la-  (  41 )    ---vrp------------------------dFarnVrp-----gDVVV-A
d2b3ya1  ( 727 )    ---irLlNrFLnkqapqTihlpsgeildVfdAAerYqqag---lpLIVLA
d2gp4a1  ( 426 )    nLgrAvIkvsaVqpqhrvVeA-pAVviddqnkLdalfksgaLdrdCVVvV
d2hi6a1  (  12 )    rAegeAlvtkeyisFlggidketGivkedceiKgesvag------rilvF
                                                    aaa          bbb  

                             160       170       180       190       200 
d1fgha1  ( 635 )    denY---GegssrehSAlEPRfL------------gGrAIITksFariHe
d1l5ja2  ( 237 )    GdvV---GtgssrkSATnSVLwfMGddiphvpnkrggglCLGgkIapiFf
d1v7la-  (  58 )    gknF---GigssreSAAlALkal------------gIaGVIAesFgriFy
d2b3ya1  ( 771 )    gkeY---GagssrdWAAkGPflL------------gIkAVLAesYeriHr
d2gp4a1  ( 475 )    KGQGpkAn-gpeLhkLtplLgsLQdk---------gfkVALTDgrsg---
d2hi6a1  (  56 )    pggk---GstvgSyvllnlrkn-----------gvAPkAiinkktetiia
                                  aaaaaaaa                bbbb    aaaa

                             210       220       230       240       250 
d1fgha1  ( 670 )    tnLKkqGLLPLtFadpadynk--IhpvDkLtIqgLkdFapgkpLtCiIkh
d1l5ja2  ( 284 )    ntMEdaGALPIeVdVs------nLnmgdvIDVyPy-------kgeVrnh-
d1v7la-  (  93 )    rnAiniGIpLLlgkTe------gLkdgdlVtVnWe-------tGeVrkg-
d2b3ya1  ( 806 )    snLVgmgVIPLeYlpgenadalgLtGqerYtIiIpenLkpqmkVqVkL--
d2gp4a1  ( 515 )    asgkVPaaihLtpEAidgGlIakVqdgdlIrVdAl-------tgeLsLlv
d2hi6a1  (  92 )    vGAamAeiplvevrdekFfea--vktgdrvvvnAd-------eGyvelie
                    aaaaa    bbb                bbbbb           bbbb  

                             260       270       280       290       300 
d1fgha1  ( 718 )    pn---gtqetIlLnHtF-netqIewfrAGSalnrmkelqqk         
d1l5ja2  ( 320 )    -e---tgellatFelk--tdvLidevragGripLiigrglttkarealgl
d1v7la-  ( 129 )    -d------eilmFepL--edflLeIVrEgGileyirrrgdlc--------
d2b3ya1  ( 854 )    dt---g--ktfqAvMrFdtdveltyflngGilnymirkmak         
d2gp4a1  ( 558 )    sdtelatrtat----eIdlrhsryggrelfgvlrs-----nlsspetgar
d2hi6a1                                                               
                                                  aaaaa               

                             
d1fgha1                      
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d1v7la-  ( 162 )    --------i
d2b3ya1                      
d2gp4a1  ( 600 )    stsaidely
d2hi6a1                      
                             

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Aconitase A, C-terminal domainLeuD-likeCow (Bos taurus) [TaxId: 9913]view
Aconitase B, second N-terminal domainLeuD-likeEscherichia coli [TaxId: 562]view
Isopropylmalate isomerase LeuDLeuD-likePyrococcus horikoshii [TaxId: 53953]view
ron-responsive element binding protein 1, C-terminal domainLeuD-likeHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
6-phosphogluconate dehydratase EDDIlvD/EDD C-terminal domain-likeShewanella oneidensis [TaxId: 70863]view
Hypothetical protein AF0055AF0055-likeArchaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300
V - - - D V S P T S Q R L Q L L E - - - - - - - P F D K W D G K D L E D L Q I L I K V K G K C T T D H I S A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G P W L K F R G H L D N I S N N L L I - - - - - - - G A I N S E N R K - A N S V R N A V T Q E F G P V P D T A R Y Y K Q H G - - - I R W V V I G D E N Y - - - G E G S S R E H S A L E P R F L - - - - - - - - - - - - G G R A I I T K S F A R I H E T N L K K Q G L L P L T F A D P A D Y N K - - I H P V D K L T I Q G L K D F A P G K P L T C I I K H P N - - - G T Q E T I L L N H T F - N E T Q I E W F R A G S A L N R M K E L Q Q K - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A L A E K L T V T V F K V T G E T N T D D L S P A - P D A W S R P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D I P L H A L A M L K N - - - - - A R E - - - - - - - - - - G I E P D Q P G V - V G P I K Q I E A L Q Q K G - - - F P L A Y - V G D V V - - - G T G S S R K S A T N S V L W F M G D D I P H V P N K R G G G L C L G G K I A P I F F N T M E D A G A L P I E V D V S - - - - - - N L N M G D V I D V Y P Y - - - - - - - K G E V R N H - - E - - - T G E L L A T F E L K - - T D V L I D E V R A G G R I P L I I G R G L T T K A R E A L G L P H S D V F R Q A
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M I T T G K V W K F G D D I S T D E I T P G - R Y N L T - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P K E L A K I A F I E - - - - - V R P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D F A R N V R P - - - - - G D V V V - A G K N F - - - G I G S S R E S A A L A L K A L - - - - - - - - - - - - G I A G V I A E S F G R I F Y R N A I N I G I P L L L G K T E - - - - - - G L K D G D L V T V N W E - - - - - - - T G E V R K G - - D - - - - - - E I L M F E P L - - E D F L L E I V R E G G I L E Y I R R R G D L C - - - - - - - - - - - - - - - - I
D K L F F W N S K S T Y I K S P P F F E N L T L D L Q P P - - K S I V D A Y V L L N L G D S V T T D H I S P A G N I A R N S P A A R Y L T N R G L T P R E F N S Y G S R R G N D A V M A R G T F A N - - - - - I R L L N R F L N K Q A P Q T I H L P S G E I L D V F D A A E R Y Q Q A G - - - L P L I V L A G K E Y - - - G A G S S R D W A A K G P F L L - - - - - - - - - - - - G I K A V L A E S Y E R I H R S N L V G M G V I P L E Y L P G E N A D A L G L T G Q E R Y T I I I P E N L K P Q M K V Q V K L - - D T - - - G - - K T F Q A V M R F D T D V E L T Y F L N G G I L N Y M I R K M A K - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G L K L L K G N L G R A V I K V S A V Q P Q H R V V E A - P A V V I D D Q N K L D A L F K S G A L D R D C V V V V K G Q G P K A N - G P E L H K L T P L L G S L Q D K - - - - - - - - - G F K V A L T D G R S G - - - A S G K V P A A I H L T P E A I D G G L I A K V Q D G D L I R V D A L - - - - - - - T G E L S L L V S D T E L A T R T A T - - - - E I D L R H S R Y G G R E L F G V L R S - - - - - N L S S P E T G A R S T S A I D E L Y
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K F A C R A I T R G R A E G E A L V T K E Y I S F L G G I D K E T G I V K E D C E I K G E S V A G - - - - - - R I L V F P G G K - - - G S T V G S Y V L L N L R K N - - - - - - - - - - - G V A P K A I I N K K T E T I I A V G A A M A E I P L V E V R D E K F F E A - - V K T G D R V V V N A D - - - - - - - E G Y V E L I E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

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