Superfamily : 51998 [ PFL-like glycyl radical enzymes ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : PFL-like glycyl radical enzymes
# of Members : 12
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1h16a-  (   1 )          selnekLatAWegFtkgdWqn-eVnVrdFiqknYtpyegdesfl
d1h77a-  (  26 )                                                      
d1l1la-  (   5 )                                                      
d1peqa2  ( 175 )                                                      
d1r9da-  (   2 )    iskgFs-tqterIniLkaqIlnA-kpcVeSeRAilITesfkqteg-----
d2f3oa-  (   4 )              drIekLk-kvsk--parLSVeRCrlYTesMkqteg-----
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                                      
d5fava1  (  53 )      gipd-gptprHvklkenFlkq-vpsitvqRAvAitkiakenpg-----
d6lona-  (  22 )            rgrrvykildrit---vPhvDieRAryFtesMrqteg-----
d6vxca-  (   2 )        ar-GtferTkkLreeSina-ephIsieRAvlMTeAykkyeg-----
d6xs4a-  (   1 )    mttLnlntlserIkaHkmaLVhivkppVCteRAqhYtemyqqhm------
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1h16a-  (  44 )    agateaTttLWdkVMegVklEnrthaPvdFdtavaStItsHdaGyInkql
d1h77a-  (  26 )                                                      
d1l1la-  (   5 )                                                      
d1peqa2  ( 175 )                                                      
d1r9da-  (  45 )    ----qpailrRAlALkhILe-------------------nIpItIrd--q
d2f3oa-  (  37 )    ----epmiirQAkALkhVLe-------------------nIpiqIld--s
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                                      
d5fava1  (  94 )    ----lpkpllRAktFryCCe-------------------tAplviqd--h
d6lona-  (  60 )    ----elltlrWAkAlknvAe-------------------kMtvyitp--d
d6vxca-  (  41 )    ---sveipvLRAlSFkhYIe-------------------nRtLsInd--g
d6xs4a-  (  45 )    ---dkpipVrRAlALahHLa-------------------qRtIwIkh--d
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1h16a-  (  94 )    EkIvGLqTeapLkRALIPfgGikmiegSCkayn------reldpmIkkiF
d1h77a-  (  26 )                                                      
d1l1la-  (   5 )                                                      
d1peqa2  ( 175 )                                                      
d1r9da-  (  70 )    ELIVGSlTkeprSSqVFPEFsNkwLqdEldrLnkrtGDaFqIseeSkekL
d2f3oa-  (  62 )    ELIVGTMLpnPpGAIIFPEGvglrIIneLdsLpnretNrLmvdeedakvL
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                                      
d5fava1  ( 119 )    ElivGSPngaPRAGAFSPEvAWrwlqdeldtigsRpqDpFyiseedkkvl
d6lona-  (  85 )    qllAGRvGqlgrYGilYPEiDGdFYievmd-lpnr-kSpFqidpaaaail
d6vxca-  (  67 )    ELIVGEKgdspnGAPTYPeIcCh-tmedLevMhnrdiInFsVseeArkiH
d6xs4a-  (  71 )    ElIVGNQAsevrAAPIFPEYTVswIekeiddLadrpgagFaVseenkrvL
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1h16a-  ( 138 )    te----yr--kTHNqGVfdvYtp-dIlrCrk------SGVLtg-LPDayg
d1h77a-  (  26 )                                                      
d1l1la-  (   5 )                          IsLsaefidrVkasvkphwgkLGwVtYK
d1peqa2  ( 175 )                                                      
d1r9da-  ( 120 )    k-dVFeyWngkTTselAtsyMte-eTreAv-n-----cdVFtVgnYyynG
d2f3oa-  ( 112 )    reeIapyWqrktIeafAfplMp--dIMqilyt-----gSVFvL-tEia-g
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                                      
d5fava1  ( 169 )    reevFpfWqnkSvdefCegqYreadlweMSge-----SfvSdCsYHAvnG
d6lona-  ( 135 )    meeiapyWegktYHehlnkvlpa-eirgvtYhdrGlSKfvvSE-tSSYRS
d6vxca-  ( 116 )    keeIipfWkkrqTrdkIinaMtp-eWlaAy-e-----AGMFTE-FMEQRA
d6xs4a-  ( 121 )    he-iCpwWrgqTVqdrCygmFtd-eqksLL-e-----TgIIkAegNMtSg
                                                                      

                             210       220       230       240       250 
d1h16a-  ( 174 )    RgRIIGDYRR-VALY-GIdyLmkdKlaqftslqa--dlengvnleqtirl
d1h77a-  (  26 )                                           dsrvfptqrdl
d1l1la-  (  33 )    rtYArwlpe----kgrsEnWdeTVkrVVegNInlDprlqdspslelkqsL
d1peqa2  ( 175 )                                                      
d1r9da-  ( 162 )    VgHVSVdYgk-VLrv-GFngIineAkeqleknrsi-dpdfikkekFLnSV
d2f3oa-  ( 153 )    IShvAVNYpY-LLrr-GFrwFleeSerriraleesgvye-gekysFYqAA
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                                      
d5fava1  ( 214 )    GGDSnPGYdvilMkk-GMldiqreArekleqldyan-pedidkiyFYkSv
d6lona-  ( 185 )    AlqWvPdYek-AMkr-GFidiqneAkaklagldltnsvdiwekkpFleAM
d6vxca-  ( 158 )    PGHTVCg-dt-IYkk-GFldLkkdIearlkeLdflndldAynkkaDLeAM
d6xs4a-  ( 163 )    DahLAVnFpl-VLek-GLdgLrakVaerrsrInltv-lddlhGdqFLkAI
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                             260       270       280       290       300 
d1h16a-  ( 220 )    reeIaeQhrALgqMk---eMAakYg-------------------------
d1h77a-  (  37 )    magivskhiAknmVp---sfIMkahesGiIhVhdidySPAlpfTnCCLVd
d1l1la-  (  79 )    teEAerLYkLIyGLGATPsgrNLw----ISgtdyQrrtGDSLNnçWFVAI
d1peqa2  ( 175 )                                             lVsçFLLRI
d1r9da-  ( 209 )    iiSCeAAitYVnrYa---kkAkeiAdnts----dakrkaeLn-------e
d2f3oa-  ( 200 )    kiVSeAVinYGlrYS---klAeelAese-----dgerreeLl-------k
d2ha9a1  (   2 )                                                      
d2x1ya2  ( 222 )                                             fsscVLIEC
d5fava1  ( 262 )    ietAeGvMiYArrls---ayAaelAaret----dprrkaelq-------k
d6lona-  ( 233 )    iivCdAimiWA-rHa---qlArdtAaats----dpvrk-ell-------r
d6vxca-  ( 205 )    aiACdAMviLGkrYa---ekArqmAeeet----deakkkdll-------l
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                             310       320       330       340       350 
d1h16a-  ( 242 )    --------ydIs------gPAtnAqeAIQWTYFGYLAAVKsqnGA-AMSF
d1h77a-  (  84 )    Lk--gMLengFklgnaqietPksIgvATaiMAqITaqVashQYg--GTTF
d1l1la-  ( 125 )    rpqkYGdSkIvPsyLgkqekA---VSMPFSFLFDELmK---gG---gVGF
d1peqa2  ( 184 )    edn---------------------meSigravnSAlqLSkrgG---gVAF
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d5fava1  ( 298 )    is--evnarvPa------haPsnFweAiqAvWtvESllvvEEnqt-GMSi
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d6vxca-  ( 241 )    IA--eTCdvVPa------hkPetYhqAIQMYWFVHIGVTTELnIWdaFTP
d6xs4a-  ( 246 )    IA--enCdaIAh------epPktFwqALQLCYFIQLILQIEsnGh-SVSF
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                             360       370       380       390       400 
d1h16a-  ( 277 )    GRTStFLDVYIerDlk-----------ag-----------------kit-
d1h77a-  ( 130 )    AnVDkvLspYVkrTya-----------khiedAekwqiadalnyAqskT-
d1l1la-  ( 166 )    SVarsNisqIprVdFaIdLqLVVdetseSydaSvkvgAvGkelvqdadSi
d1peqa2  ( 210 )    LLSNLreagApikrie----------------------------------
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d2f3oa-  ( 276 )    GRIDqyLypfFkkDig-----------eg-----------------rin-
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d6lona-  ( 311 )    GRMDqylypyYkkDie-----------eg-----------------tlt-
d6vxca-  ( 283 )    GRLDqhLnpFyerDve-----------ng-----------------iLd-
d6xs4a-  ( 287 )    aRMDqyLypyYrrdve-----------ln----------------qsld-
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                             410       420       430       440       450 
d1h16a-  ( 298 )    ----eqeAQemVDHLVMKLRM--VRF-LrtpeydelFSGdPIWATESIGG
d1h77a-  ( 168 )    ----ekdVydAFqaYeyeVnt--lfss----------nGqtPfVTITFGt
d1l1la-  ( 217 )    yyrLpdtreGwVlANAlLIDLHF-----aqTNpdrkqkLILDLsdIrpyg
d1peqa2  ( 226 )    --nqssGVipvMkmLedAFsya------------------------qGaG
d1r9da-  ( 304 )    ----dkfAqeLIDCIWIKLND--INK-VRdeistkHFGGyPMYQNLIVGG
d2f3oa-  ( 297 )    ----relAfdILANLWIKTNE--IvP-AfDslleqyfSGqATNQAVTIGG
d2ha9a1  (  54 )    -----nlvavGdeIaaelgIpIvnkrVSVTPISlIGaaTdat--------
d2x1ya2  ( 276 )    -----tGCipfYkhFqtAVkscS-----qg-------------gvrggaA
d5fava1  ( 360 )    ----eyeAFdlAGCMlvKMSE--MMW-itsegaSkfFAGYqPFvnMCvGG
d6lona-  ( 332 )    ----seeAkellECMWvDMAq--FiDlYinptGneFqEgyAhWEAvtvGG
d6vxca-  ( 304 )    ----rdrAqeLLECLWVKFnN--QPAPPKvgiTlkESsTyTDFANINTGG
d6xs4a-  ( 309 )    ----rehVIeLLHSCWLKLlE--VNk-IRsgshskaSAGsPLYQNVTIGG
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d1h16a-  ( 341 )    mGld---grT-LVTkNSFRFLnTLyTM-----gpSPePNMTILWSe----
d1h77a-  ( 202 )    Gt-------dwTermIQkAILkNRikGlgrdgiTPifPKLVMFVee----
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d6vxca-  ( 348 )    inp---dgqd-GVneVSyIILdVMdeM------kLiqPSSNVQISk----
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d1h16a-  ( 378 )    --------------------------------kLplnFkkFAAkVSid-t
d1h77a-  ( 241 )    ----gvNlykd---------------------dpNydIKqlALeCASk-R
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d6lona-  ( 412 )    --------------------------------rtpdrFlyEiAltvqdgs
d6vxca-  ( 384 )    --------------------------------kTpqkFLkrACeISrkGW
d6xs4a-  ( 391 )    --------------------------------gMsndFLdACVqVIrCgF
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d1h16a-  ( 395 )    SSLQYEN----------DdLMrpdfn------------------------
d1h77a-  ( 265 )    MYPDIIS----------AknNkaITgSs----------------------
d1l1la-  ( 350 )    SnnsVaV---dsafs-gYqpIaagIrenGePgIVNldLSknygRivdgyq
d1peqa2  ( 340 )    Vrktyin---Ard---FFqtLAeIQfesgyPYIMFEdtVnraNPIa----
d1r9da-  ( 401 )    GLPAYYN----------DeVIipALvsrgLt-------------------
d2f3oa-  ( 394 )    NNLALFF----------DdaAvkALknaeVd-------------------
d2ha9a1  ( 142 )    kVcSSvNIGstksGiNtAvadGriIkeTAnl-------------------
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Highly Conserved Residues

 

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- - - - - - S E L N E K L A T A W E G F T K G D W Q N - E V N V R D F I Q K N Y T P Y E G D E S F L A G A T E A T T T L W D K V M E G V K L E N R T H A P V D F D T A V A S T I T S H D A G Y I N K Q L E K I V G L Q T E A P L K R A L I P F G G I K M I E G S C K A Y N - - - - - - R E L D P M I K K I F T E - - - - Y R - - K T H N Q G V F D V Y T P - D I L R C R K - - - - - - S G V L T G - L P D A Y G R G R I I G D Y R R - V A L Y - G I D Y L M K D K L A Q F T S L Q A - - D L E N G V N L E Q T I R L R E E I A E Q H R A L G Q M K - - - E M A A K Y G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y D I S - - - - - - G P A T N A Q E A I Q W T Y F G Y L A A V K S Q N G A - A M S F G R T S T F L D V Y I E R D L K - - - - - - - - - - - A G - - - - - - - - - - - - - - - - - K I T - - - - - E Q E A Q E M V D H L V M K L R M - - V R F - L R T P E Y D E L F S G D P I W A T E S I G G M G L D - - - G R T - L V T K N S F R F L N T L Y T M - - - - - G P S P E P N M T I L W S E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K L P L N F K K F A A K V S I D - T S S L Q Y E N - - - - - - - - - - D D L M R P D F N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N D D Y - A I A C C V S P M I V G - - - - - - - - - - - - - K Q M Q F - - F G A R A N L A K T M L Y A I N G G V D E K L K - M Q V G P K S E P I K - G D V L N Y D E V M E R M D H F M D W L A K Q Y I T - - - A L N I I H Y M H D K - - Y S - - - - - - Y E A S L M A L H D R - - - - - - - - - - - - - - - - - D V I R T M A C G I A G L S V A A D S L S A I K Y A - - K V K P I R D E - - - D G L - - - A I D F E I E G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E Y P Q F G N N D P R V D D L A V D L V E R F M - - - - - K K I Q K L H T Y R D - - - - - - A I P T Q S V L T I - T S N V V Y G K K T G - - - - N T P D G R R A G - - - - - A P F G P G A N P M H G R D Q - - - - - - - K G A V A S L T S V A K L P F A - - Y A K D G I S Y T F S I V P N A L G K D D E V R K T N L A G L M D G Y F H H E A S I E G G Q H L N V N V M N R E M L L D A M E - - - - - - - - - - - - - - N P E K Y P Q L T I R V S G Y A V R F N S L T K E Q Q Q D V I T R T F T Q S M
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D S R V F P T Q R D L M A G I V S K H I A K N M V P - - - S F I M K A H E S G I I H V H D I D Y S P A L P F T N C C L V D L K - - G M L E N G F K L G N A Q I E T P K S I G V A T A I M A Q I T A Q V A S H Q Y G - - G T T F A N V D K V L S P Y V K R T Y A - - - - - - - - - - - K H I E D A E K W Q I A D A L N Y A Q S K T - - - - - E K D V Y D A F Q A Y E Y E V N T - - L F S S - - - - - - - - - - N G Q T P F V T I T F G T G T - - - - - - - D W T E R M I Q K A I L K N R I K G L G R D G I T P I F P K L V M F V E E - - - - - - - - G V N L Y K D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D P N Y D I K Q L A L E C A S K - R M Y P D I I S - - - - - - - - - - A K N N K A I T G S S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V P V - S P M G C R S F L S V W - - - - - K D S T G N E I L D G R N N L G V V T L N L P R I A L D S - Y I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G T Q F N - - - - E Q K F V E L F N E R M D L C F E - - - A L M C R I S S L K G V K A T - - - - - - V A P I L Y Q E G A F G V R - - L K P D D D I I E L F K N G R S S V S L G Y I G I H E L N I L V G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R D I G R E I L T K M N - - - - - A H L K - - - - Q W T E R T - - G F A F S L Y S T P A E N L C Y R F C K L D T E K Y G S V K D V T D K G - - - - - - W Y T N S F H V S V E E N - - - - - - - - I T P F E K I S R E A P Y H F - - - I A T G G H I S Y V E L P D M K N - - - - - - N L K G L E A V W D Y A A Q H - - - L D Y F G V N M P V D K C F T C G S T H E M T P T E N G F V C S I C G E T D P K K M N T I R R T C A Y L G N P N - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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I S K G F S - T Q T E R I N I L K A Q I L N A - K P C V E S E R A I L I T E S F K Q T E G - - - - - - - - - Q P A I L R R A L A L K H I L E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N I P I T I R D - - Q E L I V G S L T K E P R S S Q V F P E F S N K W L Q D E L D R L N K R T G D A F Q I S E E S K E K L K - D V F E Y W N G K T T S E L A T S Y M T E - E T R E A V - N - - - - - C D V F T V G N Y Y Y N G V G H V S V D Y G K - V L R V - G F N G I I N E A K E Q L E K N R S I - D P D F I K K E K F L N S V I I S C E A A I T Y V N R Y A - - - K K A K E I A D N T S - - - - D A K R K A E L N - - - - - - - E I A - - K I C S K V S G - - - - - - E G A K S F Y E A C Q L F W F I H A I I N I E S N G H - S I S P A R F D Q Y M Y P Y Y E N D K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N I T - - - - - D K F A Q E L I D C I W I K L N D - - I N K - V R D E I S T K H F G G Y P M Y Q N L I V G G Q N S - - - E G K D - A T N K V S Y M A L E A A V H V - - - - - - K L P Q P S L S V R I W N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K T P D E F L L R A A E L T R E G L G L P A Y Y N - - - - - - - - - - D E V I I P A L V S R G L T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L E D A R D Y - G I I G C V E P Q K P G - - - - - - - - - - - - - K T E G W H - D S A F F N L A R I V E L T I N S G F D K - - N - K Q I G P K T Q N F E E - - M K S F D E F M K A Y K A Q M E Y F V K H M C C - - - A D N C I D I A H A E - - R A - - - - - - P L P F L S S M V D N C I G - - - - K G K S L Q D G G A E Y N F S - G P Q G V G V A N I G D S L V A V K K I V F D E N K I T P S E L K K T L N - - N D F K - - N - - - - - - - S E E I Q A L L K - - - - - - - - - - N - A P K F G N D I D E V D N L A R E G A L V Y C - - - - - R E V N K Y T N P R - - - - - - G G N F Q P G L Y P S - S I N V Y F G S L T G - - - - A T P D G R K S G - - - - - Q P L A D G V S P S R G C D V - - - - - - - S G P T A A C N S V S K L D H F - - I A S N G T L F N Q K F H P S A L K - - G D N G L M N L S S L I R S Y F D - - - - - Q K G F H V Q F N V I D K K I L L A A Q K - - - - - - - - - - - - - - N P E K Y Q D L I V R V A G Y S A Q F I S L D K S I Q N D I I A R T E H V - M
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M T T L N L N T L S E R I K A H K M A L V H I V K P P V C T E R A Q H Y T E M Y Q Q H M - - - - - - - - - D K P I P V R R A L A L A H H L A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q R T I W I K H - - D E L I V G N Q A S E V R A A P I F P E Y T V S W I E K E I D D L A D R P G A G F A V S E E N K R V L H E - I C P W W R G Q T V Q D R C Y G M F T D - E Q K S L L - E - - - - - T G I I K A E G N M T S G D A H L A V N F P L - V L E K - G L D G L R A K V A E R R S R I N L T V - L D D L H G D Q F L K A I D I V L E A V S L H I E R F A - - - A L A R E M A A T E S - - - - R V S R R D E L L - - - - - - - A I A - - E N C D A I A H - - - - - - E P P K T F W Q A L Q L C Y F I Q L I L Q I E S N G H - S V S F A R M D Q Y L Y P Y Y R R D V E - - - - - - - - - - - L N - - - - - - - - - - - - - - - - Q S L D - - - - - R E H V I E L L H S C W L K L L E - - V N K - I R S G S H S K A S A G S P L Y Q N V T I G G Q K L V N G E P M D - A V N P L S Y A I L E S C G R L - - - - - - R S T Q P N L S V R Y H A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G M S N D F L D A C V Q V I R C G F G M P A F N N - - - - - - - - - - D E I V I P E F I K L G V E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K E D A Y D Y - A A I G C I E T A V G G - - - - - - - - - - - - - K W G Y R C T G M S F I N F A R V M L A A L E G G R D A T S G - K V F L P Q E K A L S A G N F G N F D E V M T A W D T Q I R Y Y T R K S I E - - - I E Y V V D T M L E E - - N V - - - - - - H D I L C S A L V D D C I E - - - - R A K S I K Q G G A K Y D W V - S G L Q V G I A N L G N S L A A V K K L V F E Q G V I G Q Q Q L A A A L A - - D D F D - - G L T - - - - - H E Q L R Q R L I - - - - - - - - - - N G A P K Y G N D D D S V D M L L T R A Y Q T Y I - - - - - D E L K Q Y H N P R Y G R G P I G G N Y Y A G T S S I - S A N V P F G A A T M - - - - A T P D G R K A H - - - - - T P L A E G A S P A S G T D H - - - - - - - L G P T A V I G S V G K L P T E - - A I L G G V L L N Q K L N P S T L E - - N D S D R Q K L M V L L R T F F E V - - - - H K G W H I Q Y N I V S R E T L L D A K K - - - - - - - - - - - - - - H P D Q Y R D L V V R V A G Y S A F F T A L S P D A Q D D I I A R T E H T - L

 

 

 

 

 

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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in