Superfamily : 50784 [ Transcription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domain ]
Class : All beta proteins
Fold : Transcription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domain
# of Members : 3
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
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d1nh2d2  (  55 )    ntqskltvkgnldtygfcddvwtfivknCqvtveqsvisvdklrivacns
d1nvpd2  (  54 )    n---rvnfrgslntyrfcdnvwtfvlndVefrev--likvdkvkivac--
                          bbbbbbbbbbbb  bbbbbbbbbbbb     bbbbbbbbbbb  

                      
d1nh2c-               
d1nh2d2  ( 119 )    ks
d1nvpd2  (  99 )    -d
                      

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Large chain TOA1, C-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Small chain TOA2, C-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
Small chain TOA2, C-terminal domainTranscription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view

 

No outliers

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Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50
D Y L I E N L M L C L Y D K V T R T K A R W K C S L K D G V V T I N R N D Y T F Q K A Q V E A E W V - -
N T Q S K L T V K G N L D T Y G F C D D V W T F I V K N C Q V T V E Q S V I S V D K L R I V A C N S K S
N - - - R V N F R G S L N T Y R F C D N V W T F V L N D V E F R E V - - L I K V D K V K I V A C - - - D

 

 

 

 

 

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