Superfamily : 50685 [ Barwin-like endoglucanases ]
Class : All beta proteins
Fold : Double psi beta-barrel
# of Members : 8
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1n10a2  (1003 )                                                      
d2enga-  (   1 )                                                      
d2g5da1  (  40 )    pdrpagipdpagttvagg---------------gAvYtVvphlsMphWaa
d2pi8a-  (   3 )                      skptdrGqqykdgkftqpfslvn--qPdAvga
d2pnwa1  (   5 )                                      fsidevsfrdLpgWgq
d3czba-  (  58 )                                       mpAalsfagLagWae
d4jp6a-  (   2 )                                                      
d5xbxa1  (   1 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1n10a2  (1003 )                                                      
d2enga-  (   1 )                                                      
d2g5da1  (  75 )    Q-dFakSLqSFrlGÇanLknrq------------gWqdVÇaqAfqt-pih
d2pi8a-  (  33 )    PiNagdFaeQInhIrnssprlyg-----------nqsnvYnaVqeWl---
d2pnwa1  (  21 )    d-dPrkLfpAMatILshLrnakpyrtGalgItAaeLvsLLelAergqvns
d3czba-  (  73 )    E-dHlaALnAFraGÇgvsk-------------dpaaarVçglAkatkdld
d4jp6a-  (   2 )                                                      
d5xbxa1  (   1 )                                                      
                                                                      

                             110       120       130       140       150 
d1n10a2  (1003 )                                                      
d2enga-  (   1 )                                                      
d2g5da1  ( 111 )    sfqAkrFFeryFtPWqVag-ngslagtVtGyyEpvLkGdgrrterArfpI
d2pi8a-  (  69 )    ragGdTrnrqfgidAwQeGadnyGNVqFtGyyTpviqArhtrqgefqypi
d2pnwa1  (  70 )    peqArqfFetnSVPFrIsp-----sGfVtAfYEpeLeVsatpddvwrypI
d3czba-  ( 109 )    vsgAkafIeanFrVea---VdgGgdglLtAyfaPqyeArmsrnaeFsapL
d4jp6a-  (   2 )                                                      
d5xbxa1  (   1 )                                                      
                                                                      

                             160       170       180       190       200 
d1n10a2  (1003 )                                                      
d2enga-  (   1 )                                                      
d2g5da1  ( 160 )    YGiPddFIsvplplvrIrqtgknsGthtAdlsrFpitarTtaIkGrfegs
d2pi8a-  ( 121 )    yrPp--------------------------krgrl---------------
d2pnwa1  ( 119 )    YrrPpeLvdIdn---------dnrpd-gFdp-------sya--fGkadee
d3czba-  ( 156 )    rglpadLvvldlGpfe--------------palvg-----kkitGhvegs
d4jp6a-  (   2 )                                                      
d5xbxa1  (   1 )                                                      
                                                                      

                             210       220       230       240       250 
d1n10a2  (1003 )                        pkvppgp---------nitatygd----kw
d2enga-  (   1 )                                                      
d2g5da1  ( 225 )    rFlpYhtRnqInggaLdgkApilGyAeDpVelFfMHiqgsGRLktpsg-k
d2pi8a-  ( 131 )    -----ssRaeIyagaLsd-kyIlAySnsl-dnfi-DvqgsgyIdfgdgsp
d2pnwa1  ( 150 )    gisyFpdRraIdegcLrgrgLeIAwArskvdlFfVHvqgaArLvfpdg-a
d3czba-  ( 187 )    tfvpypdRaeieatpsd----plAwM-rpEeLFfLQiqgsGvLvLpdg-r
d4jp6a-  (   2 )                                                    sa
d5xbxa1  (   1 )                        aqlÇqpd---------ahgVrrfn----gr
                                                                      

                             260       270       280       290       300 
d1n10a2  (1020 )    ldAkStwyg----------------------ggaÇ--gykdvd-------
d2enga-  (   1 )    adgrStryWdÇçKpsÇGwak---------kApvnqpVfsÇnanfqritdf
d2g5da1  ( 274 )    yirIgyAdkNehpyvsIGryMadkgylklgqtsmqgIkayMrqnp-qrla
d2pi8a-  ( 175 )    lnFFsyagkNghayrsIgkVLidrgev------sqairhwgethseaevr
d2pnwa1  ( 199 )    ikrITyaAkAGHvfspIgrlLldrgeldpktismqtirqwLadhp-deVd
d3czba-  ( 232 )    rvrAvfagtNgkpfvgiaiaMrdkglla------dairtwLaehrgpeAd
d4jp6a-  (   4 )    snVrAtyhfYnAqqngwdLr---------kvsAyÇatwdAdkp-------
d5xbxa1  (  18 )    pÇASTtryvdghkgaÇGÇGq---------k-----------------gsd
                    bbbbbbbb                                          

                             310       320       330       340       350 
d1n10a2  (1049 )    ---------------------------kppfs-gmTGcGNtp-IfksgrG
d2enga-  (  42 )    daksGçepgGvAYsÇadQtPwavn-----ddfALGFAaTs-iagsneagw
d2g5da1  ( 323 )    eVlGqNpsYiFFrel---dgpvgaLgTpL--mgeYAGAIDr-----hyIT
d2pi8a-  ( 225 )    eLleqNpSfvFfkpqs-fapVkgasaVpL--vgrASvASdr-----siIp
d2pnwa1  ( 248 )    gvLwhNrSYiFFrea----gPiaaAkVpL--vagrALAVdr-----liHT
d3czba-  ( 282 )    aiMrlNprYVFFrtvpDdgePagaAgvaL--ppgrAIAVdp-----gyHa
d4jp6a-  (  38 )    ---------------------------yswrskygWTAFçGpvgphgraA
d5xbxa1  (  42 )    tPfpwNl-qkhVTAPSerYFDdggsnlwçGknÇGkÇVrLt-PTgGfvpg-
                                                       bbb            

                             360       370       380       390       400 
d1n10a2  (1070 )    çgSÇfeIkÇtk-peAÇsg---epvvVhItddneepiapyHFdLsghAFGa
d2enga-  (  86 )    ÇÇAÇYeLtFts-gpVa-g---kkMVVQSTstnhFdLnIPgGgvgifdGÇt
d2g5da1  ( 368 )    LGAPLFVaTa---hPvt-rkaLNrLIMAQdtgs-----------------
d2pi8a-  ( 267 )    pGtTLIaEvPlLdnnGkfngqyeLrLVALdvgg-----------------
d2pnwa1  ( 294 )    fGLPFFIhAptLthldd-gkpFarLMLALdtgs-----------------
d3czba-  ( 326 )    yGgFYWLdAa--------fpvyrrAVTALdtgg-----------------
d4jp6a-  (  61 )    ÇgkÇLrVtNtk-----tr---aettVRIVdqç---sng-GLdLDwsvFkk
d5xbxa1  (  89 )    ----kGgaPpn------h---npvvFMVTnAçpin---------------
                       bbbbbb             bbbbbbbb                    

                             410       420       430       440       450 
d1n10a2  (1116 )    MAkk------------------------------------gdeqkLrsag
d2enga-  ( 137 )    pQfggLpgqrygGIssrneÇdrFpdaLkp--------GÇyWRfdWFknAd
d2g5da1  ( 397 )    -----------aIk------------gAVrVdYFWgyg-deagelAgkQ-
d2pi8a-  ( 301 )    -----------aik------------g-qhFAIYQgig-peAGhrAgwY-
d2pnwa1  ( 326 )    -----------aIv------------gpArGdIFTgsg-feaGelAgtV-
d3czba-  ( 358 )    -----------aik------------geVrAdLYmgsg-avagveAgrV-
d4jp6a-  (  99 )    LDtd------------------------------------g---sGylrg
d5xbxa1  ( 111 )    ---g---neewÇGIsgkpgtnhvNshgYEVHFdLQ--dqvgqVeal-hWd
                                                             aaaaa    

                             460       470       480 
d1n10a2  (1130 )    eLeLqFrrvkçkypeg                
d2enga-  ( 179 )    nPsFsfrqVqÇpaeLvarTgÇrRndDgnfpav
d2g5da1  ( 422 )    kttGyVWQLLpNgmkPeyrp            
d2pi8a-  ( 325 )    nhyGrVWvlktap                   
d2pnwa1  ( 351 )    rneAdFYILLPriAAeryr             
d3czba-  ( 383 )    rhtLrLYrLtpnp                   
d4jp6a-  ( 110 )    hLiVnYqfvnçg---n                
d5xbxa1  ( 152 )    nPEVTweevpçpgdLqanyq-qÇeÇhns    
                     bbbbbbbb
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Pollen allergen PHL P 1 N-terminal domainPollen allergen PHL P 1 N-terminal domainTimothy grass (Phleum pratense) [TaxId: 15957]view
Endoglucanase V (Eng V)Eng V-likeFungus (Humicola insolens) [TaxId: 34413]view
Membrane-bound lytic murein transglycosylase A, MLTAMLTA-likeNeisseria gonorrhoeae [TaxId: 485]view
Membrane-bound lytic murein transglycosylase A, MLTAMLTA-likeEscherichia coli [TaxId: 562]view
Membrane-bound lytic murein transglycosylase A, MLTAMLTA-likeAgrobacterium tumefaciens [TaxId: 358]view
automated matchesautomated matchesCaulobacter crescentus [TaxId: 190650]view
automated matchesBarwinPapaya (Carica papaya) [TaxId: 3649]view
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No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P K V P P G P - - - - - - - - - N I T A T Y G D - - - - K W L D A K S T W Y G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G A C - - G Y K D V D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K P P F S - G M T G C G N T P - I F K S G R G C G S C F E I K C T K - P E A C S G - - - E P V V V H I T D D N E E P I A P Y H F D L S G H A F G A M A K K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G D E Q K L R S A G E L E L Q F R R V K C K Y P E G - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A D G R S T R Y W D C C K P S C G W A K - - - - - - - - - K A P V N Q P V F S C N A N F Q R I T D F D A K S G C E P G G V A Y S C A D Q T P W A V N - - - - - D D F A L G F A A T S - I A G S N E A G W C C A C Y E L T F T S - G P V A - G - - - K K M V V Q S T S T N H F D L N I P G G G V G I F D G C T P Q F G G L P G Q R Y G G I S S R N E C D R F P D A L K P - - - - - - - - G C Y W R F D W F K N A D N P S F S F R Q V Q C P A E L V A R T G C R R N D D G N F P A V
P D R P A G I P D P A G T T V A G G - - - - - - - - - - - - - - - G A V Y T V V P H L S M P H W A A Q - D F A K S L Q S F R L G C A N L K N R Q - - - - - - - - - - - - G W Q D V C A Q A F Q T - P I H S F Q A K R F F E R Y F T P W Q V A G - N G S L A G T V T G Y Y E P V L K G D G R R T E R A R F P I Y G I P D D F I S V P L P L V R I R Q T G K N S G T H T A D L S R F P I T A R T T A I K G R F E G S R F L P Y H T R N Q I N G G A L D G K A P I L G Y A E D P V E L F F M H I Q G S G R L K T P S G - K Y I R I G Y A D K N E H P Y V S I G R Y M A D K G Y L K L G Q T S M Q G I K A Y M R Q N P - Q R L A E V L G Q N P S Y I F F R E L - - - D G P V G A L G T P L - - M G E Y A G A I D R - - - - - H Y I T L G A P L F V A T A - - - H P V T - R K A L N R L I M A Q D T G S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A I K - - - - - - - - - - - - G A V R V D Y F W G Y G - D E A G E L A G K Q - K T T G Y V W Q L L P N G M K P E Y R P - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - S K P T D R G Q Q Y K D G K F T Q P F S L V N - - Q P D A V G A P I N A G D F A E Q I N H I R N S S P R L Y G - - - - - - - - - - - N Q S N V Y N A V Q E W L - - - R A G G D T R N R Q F G I D A W Q E G A D N Y G N V Q F T G Y Y T P V I Q A R H T R Q G E F Q Y P I Y R P P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K R G R L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S S R A E I Y A G A L S D - K Y I L A Y S N S L - D N F I - D V Q G S G Y I D F G D G S P L N F F S Y A G K N G H A Y R S I G K V L I D R G E V - - - - - - S Q A I R H W G E T H S E A E V R E L L E Q N P S F V F F K P Q S - F A P V K G A S A V P L - - V G R A S V A S D R - - - - - S I I P P G T T L I A E V P L L D N N G K F N G Q Y E L R L V A L D V G G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A I K - - - - - - - - - - - - G - Q H F A I Y Q G I G - P E A G H R A G W Y - N H Y G R V W V L K T A P - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - F S I D E V S F R D L P G W G Q D - D P R K L F P A M A T I L S H L R N A K P Y R T G A L G I T A A E L V S L L E L A E R G Q V N S P E Q A R Q F F E T N S V P F R I S P - - - - - S G F V T A F Y E P E L E V S A T P D D V W R Y P I Y R R P P E L V D I D N - - - - - - - - - D N R P D - G F D P - - - - - - - S Y A - - F G K A D E E G I S Y F P D R R A I D E G C L R G R G L E I A W A R S K V D L F F V H V Q G A A R L V F P D G - A I K R I T Y A A K A G H V F S P I G R L L L D R G E L D P K T I S M Q T I R Q W L A D H P - D E V D G V L W H N R S Y I F F R E A - - - - G P I A A A K V P L - - V A G R A L A V D R - - - - - L I H T F G L P F F I H A P T L T H L D D - G K P F A R L M L A L D T G S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A I V - - - - - - - - - - - - G P A R G D I F T G S G - F E A G E L A G T V - R N E A D F Y I L L P R I A A E R Y R - - - - - - - - - - - - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in