BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 49562 [ C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) ]
Class : All beta proteins
Fold : C2 domain-like
# of Members : 28
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1d5ra1  ( 188 )                                  yrpvaLlFhkMmFetiPmfs
d1e7ua2  ( 351 )                           tvslwdcd--rkFrVkIrGIdIp--v-
d1qasa2  ( 626 )                                  wrperLrVrIisGqqL--p-
d1rh8a-  (4635 )       ashpitGeiqlqinydl-------------gnliihilqArnlvp--
d1rlwa-  (  16 )                                   sshkFtVvVlrAtkV--t-
d1tjxa1  ( 271 )          eklGdicFslrYvpt---------a--gkltvvileAknl--k-
d1wfja1  (   8 )                                   phgtlevvlvsAkGl--e-
d1wfma1  (   8 )       swnqapklhYcldYdcq-------------kaelfvtrleAvtsn--
d1yrka1  (   1 )       mapfLrIaFnsyeLgslqaede-------anqPfCAVkMkealster
d2bwqa-  ( 725 )         qflsGqLsIkLwFdkv---------g--hqLiVtIlgAkdL--p-
d2cjta1  (   1 )                                  m--slLcVGVkkAkFd--g-
d2cm5a-  ( 525 )    alyeeeeerGkIlVsLYstq-------------gGLiVGIirCvhL--a-
d2dmga1  (   8 )          splGqiqltirHssq---------r--nklivvvhaCrnl--i-
d2ep6a1  (  92 )                         d-------vkdvGilqvkvlkAadl--l-
d2fk9a1  (  -8 )                         s-sglvptmkfngyLrVrIgeAvgL--q-
d2nq3a1  (  13 )                              sltmk--sqLqItVisAkLk--e-
d2yrba1  ( 595 )                         detihlerge--nlFeihinkvtFs--s-
d2zkmx2  ( 678 )                                     tTLsItVisGqfL--S-
d3b7ya-  ( 102 )                         atcavevfGleSriVrVrViaGigL--a-
d3fbka-  (  32 )          qgAGqLrLsIdaq-----------d--rvLlLhIieGkgL--i-
d3fdwa-  ( 354 )         ifVtgrIaFsLYeq--------------qsLvVhVkeChqL--a-
d3rdla-  ( 156 )         tekrgrIyLkAevt-----------d--ekLhVtVrDAknL--i-
d3rlsa1  (   9 )                                iktlsvsrpIiyGNtAkkMg--
d4ns0a-  ( 382 )           tlgaLeFsLlydqd---------n--snLqCtIirAkgL--k-
d4weea1  ( 140 )          eklGklqYsldYdfq---------n--nqllvgiiqAael--p-
d6btya-  (1561 )             GaVkLsIsyr-----------n--gtLfImVmhIkdL--v-
d6nyta1  ( 687 )                                   wsAkisitvvcAqgl--q-
                                                      bbbbbbbbbb      

                             60        70        80        90        100 
d1d5ra1  ( 208 )    g----------------------gtCnPQFvVcql---------kvkiys
d1e7ua2  ( 373 )    ----------------lp---rtadltVfVEANIqygq-qvl----cqrr
d1qasa2  ( 644 )    -----v-----------------nivdPKViVeIhgvg-rDt----gsrq
d1rh8a-  (4667 )    ---rdnn----------------gysdPfvkvyllpg-------rgqvmv
d1rlwa-  (  32 )    -----kgafgdml----------dtPdPYVeLfIsttp-------dSrkr
d1tjxa1  ( 301 )    -----kmdv-------------gglSdPyvkihlMqng-krl----kkkk
d1wfja1  (  24 )    ---------------dad---FlnnmdPYvqltCr----------tqdqk
d1wfma1  (  40 )    ---hdg-----------------gcdCyvqGsvanrt-------gsveaq
d1yrka1  (  41 )    gktlvqkkptmypewkstfdAhiyegrvIqIvLmraa-------eepVSe
d2bwqa-  ( 756 )    -----sred-------------grpRnPyVkIyFl--p-drsdkn--krr
d2cjta1  (  16 )    ----------------a-----qekfnTyVTLkVq------n----vkst
d2cm5a-  ( 569 )    -----adan-------------g-ySdPfV-Lwlk--p--------akh-
d2dmga1  (  38 )    -----Afse-------------d-gsdPyvrMyll--p-dkrrs--grrk
d2ep6a1  ( 111 )    -----a---adfs----------gksdPfCllelg----------ndrlq
d2fk9a1  (  24 )    -----PtrwSlrhsLfkk---ghqlLdPyLtVsvdq---------vrvgq
d2nq3a1  (  32 )    ----------------n-----wfgpsPyVeVtVd------g----qskk
d2yrba1  ( 619 )    -----evlq-------as---gdkepvtfCtyafyd--------f-elqt
d2zkmx2  ( 692 )    -----e-----------------rsvrTYVeVeLfglp-gDp---krryr
d3b7ya-  ( 140 )    -----s--------------------dPyV-VtLydpm-ngv---ltsvq
d3fbka-  (  60 )    -----Skqp--------------gtCdPyVkIsLi--p-edsrlr--hqk
d3fdwa-  ( 385 )    -----yAde-------------a-rSnPyVkTyLl--p-dks--q-gkrk
d3rdla-  ( 185 )    -----pmdp-------------nglSdPYVkLkli--p-dpknes--kqk
d3rlsa1  (  29 )    -------------svkppnapaehthlWtIFVrG--pqnedIsyFIkkVv
d4ns0a-  ( 411 )    -----pmds-------------ngladPYVkLhLl--p-gasksn--klr
d4weea1  ( 170 )    -----aldm-------------ggtSdPYvkvfll--p-dkk----kkfe
d6btya-  (1586 )    ------Ted-------------gadPnPYVkTyLl--p-dnhktS--krk
d6nyta1  ( 703 )    -----a---kdkt----------gsSdPyvtvqvg----------ktkkr
                                               bbbbbbb              bb

                             110       120       130       140       150 
d1d5ra1  ( 227 )    sn--------sgptrredkfMyFeFpqplpVcg---------------dI
d1e7ua2  ( 399 )    Tspk----------pFte-eVlWnv-wleFsik-ikd----Lpkg--AlL
d1qasa2  ( 672 )    Tavi----------tnngfnPrWdm-efeFe-VTv-------pdl--AlV
d1rh8a-  (4691 )    vqnasaeykrrtkyvqkslnPeWnq-tviyksi-smeqlm------kKtl
d1rlwa-  (  60 )    Trhf----------nndi-nPvWne-tfeFi-Ldp-------n--qeNvL
d1tjxa1  ( 328 )    ttik----------kntl-nPyYne-sfsFe-v-pfeqiqk------vqv
d1wfja1  (  46 )    snvA----------egmgttPeWne-tfiFt-vse----------gttel
d1wfma1  (  63 )    talkkRq-----------lhttWee-Glvlp-l-aeeElp------tAtl
d1yrka1  (  84 )    v-tvgVsvLAerCkkn-ngkaefwl-dLq----------p------qAkV
d2bwqa-  ( 783 )    Tktv----------kktl-ePkWnq-tfiYspV-hrreFre------rmL
d2cjta1  (  35 )    Tiav----------r-gs-qPsWeq-dfmFeIn-rld----------lGL
d2cm5a-  ( 596 )    Tqik------------tl-nPeFne-effyd-i-khsdLa-------ksL
d2dmga1  (  64 )    thvs----------kktl-nPvfdq-sfdfs-v-slpevqr------rtl
d2ep6a1  ( 133 )    thtv----------yknl-nPeWnk-vftFp-ikd-------i---hdvl
d2fk9a1  (  57 )    Tstk----------qktn-kPtYne-efcan-Vt-----------dGghL
d2nq3a1  (  54 )    Tekc----------nntn-sPkWkq-pltViV--tPv----------skL
d2yrba1  ( 645 )    tpvv----------r-gl-hPeYnf-tsqylvh-vndlFlqyiqk--nti
d2zkmx2  ( 716 )    TklS---------pstnSinPvWkeepfvFekIlm-------pel--AsL
d3b7ya-  ( 161 )    Tti--------------slnP-Wne-eIlFr-Vhp-------q---qHrL
d3fbka-  (  86 )    Tqtv----------pdcr-dPaFhe-hffFp-V-q-eeDdq------krL
d3fdwa-  ( 413 )    Tsik----------rdtv-nPlYde-tlrYe-i-pe-lLa-------rtL
d3rdla-  ( 212 )    Tkti----------rstl-nPqWne-sftfk-L-k-psDkd------rrL
d3rlsa1  (  64 )    FkLhdtyp---------npvrsieappFeltetGw----------gefdI
d4ns0a-  ( 438 )    Tktl----------rntr-nPvWne-tlqyhgI-t--dmr-------ktL
d4weea1  ( 195 )    tkvh----------rktl-nPvFne-qftFk-v-pyselgg------ktl
d6btya-  (1612 )    Tkis----------rktr-nPtFne-mlvYsgy-sketLrq------reL
d6nyta1  ( 725 )    tkti----------ygnl-nPvWee-nfhFe-Chn-------s---sdri
                                         bbbb bbbbb                 bb

                             160       170       180       190       200 
d1d5ra1  ( 254 )    kVeFfHkqnkml----------kkdkMFhFwvnTffIpk-----------
d1e7ua2  ( 430 )    NLqIycg----------------aqllYyVNllLidh----------rfl
d1qasa2  ( 701 )    rFmVedyds-----------sskndfIGqstipWnsLk------------
d1rh8a-  (4733 )    Evtvwdydrfss-----------ndFlGevlidls-------stshldn-
d1rlwa-  (  88 )    eItLmDany------------vmdetLgtatftVssMkvg----------
d1tjxa1  ( 358 )    vvtvlDydk---------i--gkndAiGKvFvGynStgaelrHWsdMlan
d1wfja1  (  74 )    kAkiFdk-------dvgted----dAvGeAtiplepvFveg---------
d1wfma1  (  93 )    tltlrtcdrfsr-----------hsvaGelrlgld-------gtsvplg-
d1yrka1  ( 115 )    lMsVqyfle                                         
d2bwqa-  ( 814 )    eITLwDq----------------sefLGeilie-------LetAlld---
d2cjta1  (  61 )    tVeVwnkgl---------i---wdtmvGtvwipLrtIrq----------s
d2cm5a-  ( 626 )    dIsVwDyDi-----------gksndyIGgcLGisakg----lHWyeClnk
d2dmga1  (  94 )    DvAvknsgg---------flskdkgllGkvlva-------la-seela--
d2ep6a1  ( 160 )    evtvfdedg-----------dkppdflGkvaipllsir------------
d2fk9a1  (  83 )    eLaVfHeTplg-----------ydhfVAnctlqFqeLlrttga-------
d2nq3a1  (  80 )    hFrVwshqt---------lk--sdvllGtaaldIyetLksn------nmk
d2yrba1  ( 679 )    tlevhqays------------teyetiAaCqlkFh-------eile----
d2zkmx2  ( 748 )    rVAVmEeg---------------nkflGhriipInaln------------
d3b7ya-  ( 188 )    lFeVfden--------------tddFlGqVdvpLyplptenpl-------
d3fbka-  ( 115 )    lVTVwnras---------qsr-qSglIGC-SFg-------VksLlt----
d3fdwa-  ( 443 )    qFSVwhhgr-----------fgrntfLGeaeiqM--------swl---dk
d3rdla-  ( 241 )    sVeIwDwdr---------tt--rndfMGSLSFg-------VseLmk----
d3rlsa1  (  95 )    nIkVyFv-----eeAnek------vlnfyHrLrLhp--------------
d4ns0a-  ( 469 )    rISVCdedk-----------fghnefIGEtrfs-------Lk--Lan---
d4weea1  ( 225 )    vMAvydfdr---------f--skhdiiGeFkvp-------Mntvd-----
d6btya-  (1643 )    qLsVlSaes-----------lrenffLGgvtlp-------LkdfnLs---
d6nyta1  ( 752 )    kvrvwDedddiksrvkqrfkresddFlGqtiievrtls------------
                    bbbbbb                  bbbbbbbbb                 

                             210       220       230       240       250 
d1d5ra1  ( 314 )    -----eylvltltkndLdkAnkdk-----anryFspnFkVkLyFtktv  
d1e7ua2  ( 475 )    lrhge-yvlhMwqlsgkgfnadkltsatnpdke--nsMsIsIlLdnyc  
d1qasa2  ( 728 )    ---qgyrhVhLlskng----------------dqhpsAtLfVkIsiqd  
d1rh8a-  (4764 )    ----tprwYplkeqte---------------------------------s
d1rlwa-  ( 116 )    --ekkevpfiFn-----------------------qvTeMVLeMsLevas
d1tjxa1  ( 397 )    prrpiaqwHtlqv---eeevda------mla                   
d1wfja1  ( 104 )    --sipptaynvvkde-------------------eykGeiwvalsFkp  
d1wfma1  ( 124 )    ----aaqwgelkt                                     
d1yrka1                                                               
d2bwqa-  ( 845 )    ---dephwykLq                                      
d2cjta1  (  89 )    neegpGewltLdsgtk-----------------dptfhrIlLdaHFe   
d2cm5a-  ( 666 )    d--kierwhqLq                                      
d2dmga1  ( 125 )    --kGwtqwYdlte---d                                 
d2ep6a1  ( 187 )    --dgqpncyvlknkdl----------------eqafkgviyleMdliyn 
d2fk9a1  ( 115 )    -sdtfegwvdLe-----------------------pegkVfVvItLt   
d2nq3a1  ( 113 )    Leevv-vtlqLggdep-----------------tetigdLsIcLdgLqle
d2yrba1  ( 706 )    ksgrifctasliG---tkgdipnFgtveYwFrlrv               
d2zkmx2  ( 771 )    ---sgyhhlcLhsesn----------------mpltmpaLfIfLemkd  
d3b7ya-  ( 221 )    -erpytfdfvLhprsh-----------------ksVkgyLrLkMtYlp  
d3fbka-  ( 146 )    --keIsgwyyLLg---ehlGrtkhlkvarrr                   
d3fdwa-  ( 473 )    ---kldhclpLhg                                     
d3rdla-  ( 269 )    --mpasgwYkLLn---qeeGeyynvpipe                     
d3rlsa1  ( 143 )    aevssvyfdeIvFnePneeFfkilmsrpgnllp----------------s
d4ns0a-  ( 498 )    --qrknfnicLer---v                                 
d4weea1  ( 252 )    fghvteewrdlqs---a                                 
d6btya-  (1672 )    --ketvkwyqLta                                     
d6nyta1  ( 790 )    --gemdvwynldkrtd----------------ksavsgairlhisvei  
                          bbbb
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Pten tumor suppressor (Phoshphoinositide phosphatase), C-terminal domainPLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Phoshoinositide 3-kinase (PI3K)PLC-like (P variant)Pig (Sus scrofa) [TaxId: 9823]view
PI-specific phospholipase C isozyme D1 (PLC-D1), C-terminal domainPLC-like (P variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
PiccoloSynaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
Domain from cytosolic phospholipase A2PLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Synaptogamin ISynaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
C2 domain protein At1g63220Synaptotagmin-like (S variant)Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]view
Synaptotagmin XIIISynaptotagmin-like (S variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesPLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesSynaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
Unc-13 homolog APLC-like (P variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
automated matchesSynaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2, MCTP2PLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
E3 ubiquitin-protein ligase ItchyPLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
FantomPLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
Phospholipase C-beta-2PLC-like (P variant)Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
automated matchesautomated matchesHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
C2 domain from protein kinase c (alpha)Synaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
automated matchesYEATS domainBaker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]view
automated matchesautomated matchesNorway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
Synaptogamin ISynaptotagmin-like (S variant)Norway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
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automated matchesautomated matchesNorway rat (Rattus norvegicus) [TaxId: 10116]view
Domain ID Name
d5r68a-5r68 A:
FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T V S L W D C D - - R K F R V K I R G I D I P - - V - - - - - - - - - - - - - - - - - L P - - - R T A D L T V F V E A N I Q Y G Q - Q V L - - - - C Q R R T S P K - - - - - - - - - - P F T E - E V L W N V - W L E F S I K - I K D - - - - L P K G - - A L L N L Q I Y C G - - - - - - - - - - - - - - - - A Q L L Y Y V N L L L I D H - - - - - - - - - - R F L L R H G E - Y V L H M W Q L S G K G F N A D K L T S A T N P D K E - - N S M S I S I L L D N Y C - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in