BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 49401 [ Bacterial adhesins ]
Class : All beta proteins
Fold : Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
# of Members : 22
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1amxa-  ( 169 )                                      ts----svFYyKtGdm
d1n12a-  (   1 )                                      vpaÇtvsnttvdwq--
d1n67a1  ( 229 )                                     gtdItnqLtnvtVgIds
d1n67a2  ( 370 )                                 ekygkfy----nLSIKGtId-
d1p5ub-  (   1 )      adltasttrtatlveparitltykegapitimn---------------
d1pdkb-  (   9 )                                 lldrpÇhvsgslnkhvvf---
d1ut1a-  (   0 )                                    GsFtp---sgttgttkLt
d1zk5a-  (   1 )                                                      
d2axwa1  (   1 )                                             aelhlesrg
d2cnza-  (  22 )                                            dltvslipvs
d2okma-  (  35 )                                      rd----ypfFyKvGdl
d2uy6b1  (  10 )           kvtfnntvvdapÇsisqsa---------------dqsidfg--
d2xg5b-  (  25 )            aafhgevvrpaÇtlamda---------------wqiidmg--
d3jwne-  (   1 )    adstitirgyv----rdngÇsvaae------------------stnft--
d3rkpa2  ( 268 )                                            ePtIdKkIng
d4x5pa-  (   1 )                                                      
d4xo9a2  ( 159 )                                   ggçdvsa--rdvtvtlp--
d4z3ga1  (   0 )                  awnnivFYSlgdvn-syqggnvvit-----------
d5ihwa1  ( 278 )                                      nnvndlIkVtkqtIk-
d5ihwa2  ( 424 )                                 qdpmvhg----dSNIQSifT-
d5lp9a-  (   3 )               adtttvnGgtihFkge-vvnaAÇavdagSvdqtvqlg--
d6swhb-  (  11 )    g--nmqfqgvi----iaetÇrieagd-----------kqm---tvnmg--
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1amxa-  ( 181 )    lped------------------tthVrWfLnInn--e-ksyVsk----dI
d1n12a-  (  26 )    ---dVe--iqtLsq------nGnhekeftVnrçpynl----------g-t
d1n67a1  ( 246 )    g--ttVyphq------------agyVkLnYgFsVpn---sAvkg----Dt
d1n67a2  ( 386 )    ----qidkt-------------nntYrQTIyVNP--s-GdnVia----Pv
d1p5ub-  (  35 )    -------------gnId---t---ellvGtltLggYk-------------
d1pdkb-  (  29 )    ----tr--AsrdFwy-p---pGrSptesfvIrLenÇha----tavgki-V
d1ut1a-  (  15 )    VtekcqvrvgdltvAktrgqLtdaapIgpvtvqalgc-d---ar----qV
d1zk5a-  (   1 )                                       aV-sfigs-----te
d2axwa1  (  10 )    g-s--------gtqlr------dgakvAtGriiÇr-e-a---Ht----gF
d2cnza-  (  32 )    glk--------agkna------psakiakLvVnst---t---lk----eF
d2okma-  (  47 )    ag--------------------snqVrWfLNVNl--n-ksdVte----dI
d2uy6b1  (  37 )    ---qlssfLea---------ggvSkpmdldIeLvnçt------aFkgggt
d2xg5b-  (  52 )    ---Tpv-dLqn---------gfsGpe-rfsLrLrnÇeFnsggnlFsdsrI
d3jwne-  (  27 )    ---vdlmenaaKqfnni---GattpvvpfrIlLspÇgnav-s------aV
d3rkpa2  ( 278 )    klealpinp-------------ltnYnYdIkTlIped-IkeYkk----Yv
d4x5pa-  (   1 )                              FaÇktangtai-pigGgs----an
d4xo9a2  ( 174 )    ---------------dy---pgsvp-ipltvyÇak-----sq------nl
d4z3ga1  (  24 )    ------------qrpqF---itsWrpgiAtvtwnqçngpe-fAdgswaYy
d5ihwa1  ( 293 )    ----vgdGkdnv-----aaahdgkDIeYdTeFtIdn---kVkkg----Dt
d5ihwa2  ( 440 )    ----klded-------------kqtIeQQIYVNp--l-kksAtn----Tk
d5lp9a-  (  39 )    ---qvr--taslkq--a---gatssavgFniqlndÇdttvAt------kA
d6swhb-  (  39 )    ---qIs--snrFh-av----gedsapvpfvihLreÇstvvSe------rV
                                              bbbbbb                 b

                             110       120       130       140       150 
d1amxa-  ( 206 )    tIkD---qIq---------------ggqqLd--ls----tLnInVtg---
d1n12a-  (  56 )    kVtI---tAtnty--------n---nAilVqntSntssdGlLvylynSn-
d1n67a1  ( 275 )    FkIt---VpkeLnLng-vts--------------t----akvppImag--
d1n67a2  ( 412 )    LTgN---lkp---------n-----tdSNAlIdqq----nTsIkVykVd-
d1p5ub-  (  53 )    tgTtStsVnFtDaa-----gdp---myLTftSqdgnn-hqFtTkViGkd-
d1pdkb-  (  64 )    tLtF---kgteEa------alp---GhLkVtg--vNagr-LGIALlDTd-
d1ut1a-  (  57 )    ALkA---d------tdNfeq-----gkFFLisdnn----rdkLyVnIrpt
d1zk5a-  (  10 )    NdVg---psqgsysstnlpfvYtghnIGyqnanVWIsggfÇVGLdGkVdl
d2axwa1  (  36 )    hvwM---ne-rqvdgrae--------rYvvqSkdg----rhelrvrtg-g
d2cnza-  (  58 )    GVrG---isnnvvdstGT--------aWrVaGknt----gkeigVGLs-s
d2okma-  (  71 )    sIaD---Q-g---------------sGQqLn--ke----sFtFdIvn---
d2uy6b1  (  77 )    VLaF---tgpiVn------ghs---dELdTng-----gTgLAivVqga--
d2xg5b-  (  91 )    rVTF---dgvge--------tp---dkFnLs------gAgINLqIaDvr-
d3jwne-  (  64 )    kvgF---tgvad-s-----hna---nLLaLe-ntvsAAaGLGIQlLneq-
d3rkpa2  ( 310 )    VtAt---Ldn----------------rLvIqg---------kPiVkIdg-
d4x5pa-  (  20 )    vyvn---la-pvvnvgqnlvvdlstqifÇhndypet-itDyvtlqrGsAy
d4xo9a2  ( 194 )    GYyl---sgttada-----gn----SiFtntas-fspAqgvGvqltrn--
d4z3ga1  (  58 )    reyi---AWvvFpk--------------kvmtkng---yplfievhnkg-
d5ihwa1  ( 327 )    MtIn---YdknVipsd-ltd--------------k----ndpidItdp--
d5ihwa2  ( 466 )    VdIA---GSqVddyGn-ikl-----gngsTiIdq-----nTeIkVykVn-
d5lp9a-  (  73 )    AvAF---lgtaida-----trt---dvlalqssaagsAtnvGvqilDrt-
d6swhb-  (  73 )    gVaF---hGvaD-g-----knp---dVLsVg-egpgiAtnIGVALFdde-
                    bbbb                                     bbbbbb   

                             160       170       180       190       200 
d1amxa-  ( 229 )    --thsnyysgqsAitdFek------aFp--gSkItVdnt----------k
d1n12a-  (  91 )    --agnigtaItlg-------t---------pftPgkitgnn---------
d1n67a1  ( 301 )    ---------------------------dqvLAnGvid-s----------d
d1n67a2  ( 440 )    naad---LsesyfV-npenfedv-tnsV----nitfpn-----------p
d1p5ub-  (  93 )    --sdfdISPkVNg-------enlv-----gdvvLat--------------
d1pdkb-  (  98 )    --g---sslLkPg-------t---------sHngqgekg-----------
d1ut1a-  (  89 )    d-----------------------------nsaWttdn------------
d1zk5a-  (  63 )    p---vvgsld--------gqsIYGLteeVGLlIwMGdtnysrGtaMsgns
d2axwa1  (  69 )    d----------------------------gW-spvkge------------
d2cnza-  (  92 )    dSlr-------------------------rsdstekwn------------
d2okma-  (  94 )    -dketkyis----laeFeq------qg---YGkIdfv-t----------d
d2uy6b1  ( 109 )    ------gnvvFdg-------s---------egdatlg-------------
d2xg5b-  ( 123 )    ------gniArag-------k---------vMpaipl-------------
d3jwne-  ( 100 )    ------qnqipLn-------apss-----alswttLtp--g---------
d3rkpa2  ( 331 )    --------------------aev-nanv---VeVaie------------g
d4x5pa-  (  65 )    -----------------------ggvlsnFsgtvkYsg-----ssypFpt
d4xo9a2  ( 229 )    ------gtiipAn----------------ntvslgavg--t---------
d4z3ga1  (  87 )    --sWseentgdnd-------SyFF-----lkgykwdqrafdtanlçqkpg
d5ihwa1  ( 353 )    --------------------------sgevIAkGtfdka----------t
d5ihwa2  ( 501 )    -sdq--qLpqsNrIydfsqYedV-tsqF--dnkksfs------------n
d5lp9a-  ( 111 )    ------gnaltld---------Ga-----tfSaqttln--n---------
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                             210       220       230       240       250 
d1amxa-  ( 259 )    ntIdVtIp-qgyGS-ynsFsInYkTkIt--n---------eqqkeFvnnS
d1n12a-  ( 114 )    --------------adktisLHAkLGyk-gn----qnL---iagpfsata
d1n67a1  ( 313 )    gnViYtFtdyVntkddvkAtltMpAyId--p-----e-nVkktgnvtLaT
d1n67a2  ( 470 )    nQYkVeFn-tpddqIttPYiVvVnGhId--p-------nsk--gdLALrS
d1p5ub-  ( 117 )    ----------------gsqdFfVrSigsk---ggkLaa------gytdav
d1pdkb-  ( 120 )    ---------------sLeLpFgAyVvAt-peAlrtksV---vpgdyeata
d1ut1a-  (  98 )    Gvfykndvg----sw-ggiIgIyVdgqq--t-----nTp---pgnYtLtL
d1zk5a-  ( 102 )    wenVfsGwçVgnyvstQGLSVhVrPVil--nssaqysVq---k-tsIGsI
d2axwa1  (  78 )    ggkGvsrpg----qeeqvfFdvmAdg-n--q-----dia---pgeyrfsv
d2cnza-  ( 105 )    gvnwmTFnS-------ndtLdIVLtgpa--q-----nvt---aDtypitL
d2okma-  ( 119 )    ndFnLrFy-rdkAr-fTsFiVrYtStIt--e-------aGqhqatFeNsy
d2uy6b1  ( 128 )    ---------------envLhYtAvVkkss----avgaa---vtgafsAva
d2xg5b-  ( 138 )    ---------------teaLdYtlrIvrn--------gL---eagny-avl
d3jwne-  ( 121 )    --------------kpntlnfyArLmAtq------vpV---taghinata
d3rkpa2  ( 345 )    qkVtAtVkdftkMdgkkeFhLqIkSqVk--e-------gvpsgseIlntA
d4x5pa-  (  87 )    tsetprvvYnsr--tdkpWpvalyltPv--ssAggvAik---agsliAvl
d4xo9a2  ( 246 )    --------------savslgltAnyartg------gqv---tagnvqSii
d4z3ga1  ( 123 )    ett----------rlt--ekfddiiFkvalpa--dlpl---gdysvtipY
d5ihwa1  ( 367 )    kqItYtFtdyVdkyediksrLtLySyid--k-----k-tvpnetslnLtF
d5ihwa2  ( 533 )    nvAtLdFg-----dInsAyIIkVvSkYt--p-------tsdgeldIAQGT
d5lp9a-  ( 130 )    --------------gtntipFqArYyAig-------eA---tpgaAnAdA
d6swhb-  ( 128 )    ---------------stslhFiAkYrATg------rrV---tggiAnaqa
                                     bbbbbbbbbb                       

                             260       270       280       290       300 
d1amxa-  ( 296 )    qAwyqehgkeevngksfnhtVhn                           
d1n12a-  ( 143 )    tlvasys                                           
d1n67a1  ( 355 )    GIg----------sttanktVlVdy                         
d1n67a2  ( 508 )    TLYGynsniiWrSMSWDNevafnngsgsgdgidkpvvPeqPdepgeiepi
d1p5ub-  ( 143 )    tvtVsnq                                           
d1pdkb-  ( 151 )    tfeltyr                                           
d1ut1a-  ( 133 )    tgGyWak                                           
d1zk5a-  ( 148 )    rMrpy-ngssagsvqttVnFsL-npFtLnd                    
d2axwa1  ( 113 )    gGaÇvvpq------------------------------------------
d2cnza-  ( 138 )    dVvgyqp                                           
d2okma-  ( 158 )    dInYqln--qatn-ekntsqVkn                           
d2uy6b1  ( 157 )    nfnltyq                                           
d2xg5b-  ( 167 )    gfrvdye                                           
d3jwne-  ( 148 )    tftLeyq                                           
d3rkpa2  ( 386 )    kIhftnkndvigekeSkpVvViP                           
d4x5pa-  ( 130 )    ilrqtnnynsd-dfqFvWniyAnndvvvpt                    
d4xo9a2  ( 273 )    gvtfvyq                                           
d4z3ga1  ( 156 )    tSGiqrHFAsylgAr----fkipyn----vAktlpreneMlFlFknigg 
d5ihwa1  ( 409 )    aTA----------gketsqnvtvdy                         
d5ihwa2  ( 569 )    sMrTtdkygyynyAGysnfivts                           
d5lp9a-  ( 156 )    tFkvqYq                                           
d6swhb-  ( 154 )    wfsltyq                                           
                    bbbb                                              

                      
d1amxa-               
d1n12a-               
d1n67a1               
d1n67a2  ( 558 )    Pe
d1p5ub-               
d1pdkb-               
d1ut1a-               
d1zk5a-               
d2axwa1  ( 121 )    -e
d2cnza-               
d2okma-               
d2uy6b1               
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d4z3ga1               
d5ihwa1               
d5ihwa2               
d5lp9a-               
d6swhb-
 

 

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Collagen-binding domain of adhesinCollagen-binding domain of adhesinStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
PapE pilus subunitPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
Clumping factor AFibrinogen-binding domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
Clumping factor AFibrinogen-binding domainStaphylococcus aureus [TaxId: 1280]view
F1 capsule antigen Caf1Pilus subunitsYersinia pestis [TaxId: 632]view
PapK pilus subunitPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
DraA/Afimbrial adhesin Afa-IIIDr-family adhesinEscherichia coli [TaxId: 562]view
automated matchesF17c-type adhesinEscherichia coli [TaxId: 562]view
Invasin AfaDPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
automated matchesPilus subunitsSalmonella typhimurium [TaxId: 90371]view
automated matchesautomated matchesEnterococcus faecalis [TaxId: 1351]view
Pap fimbrial major pilin protein PapAPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
PAP fimbrial minor pilin protein PapHPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 562]view
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Mannose-specific adhesin FimH, N-terminal domainPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 83333]view
Mannose-specific adhesin FimH, C-terminal domainPilus subunitsEscherichia coli [TaxId: 83333]view
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No outliers

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SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G T D I T N Q L T N V T V G I D S G - - T T V Y P H Q - - - - - - - - - - - - A G Y V K L N Y G F S V P N - - - S A V K G - - - - D T F K I T - - - V P K E L N L N G - V T S - - - - - - - - - - - - - - T - - - - A K V P P I M A G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D Q V L A N G V I D - S - - - - - - - - - - D G N V I Y T F T D Y V N T K D D V K A T L T M P A Y I D - - P - - - - - E - N V K K T G N V T L A T G I G - - - - - - - - - - S T T A N K T V L V D Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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A D S T I T I R G Y V - - - - R D N G C S V A A E - - - - - - - - - - - - - - - - - - S T N F T - - - - - V D L M E N A A K Q F N N I - - - G A T T P V V P F R I L L S P C G N A V - S - - - - - - A V K V G F - - - T G V A D - S - - - - - H N A - - - N L L A L E - N T V S A A A G L G I Q L L N E Q - - - - - - - Q N Q I P L N - - - - - - - A P S S - - - - - A L S W T T L T P - - G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K P N T L N F Y A R L M A T Q - - - - - - V P V - - - T A G H I N A T A T F T L E Y Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G G C D V S A - - R D V T V T L P - - - - - - - - - - - - - - - - - D Y - - - P G S V P - I P L T V Y C A K - - - - - S Q - - - - - - N L G Y Y L - - - S G T T A D A - - - - - G N - - - - S I F T N T A S - F S P A Q G V G V Q L T R N - - - - - - - - G T I I P A N - - - - - - - - - - - - - - - - N T V S L G A V G - - T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S A V S L G L T A N Y A R T G - - - - - - G Q V - - - T A G N V Q S I I G V T F V Y Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - A W N N I V F Y S L G D V N - S Y Q G G N V V I T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q R P Q F - - - I T S W R P G I A T V T W N Q C N G P E - F A D G S W A Y Y R E Y I - - - A W V V F P K - - - - - - - - - - - - - - K V M T K N G - - - Y P L F I E V H N K G - - - S W S E E N T G D N D - - - - - - - S Y F F - - - - - L K G Y K W D Q R A F D T A N L C Q K P G E T T - - - - - - - - - - R L T - - E K F D D I I F K V A L P A - - D L P L - - - G D Y S V T I P Y T S G I Q R H F A S Y L G A R - - - - F K I P Y N - - - - V A K T L P R E N E M L F L F K N I G G - - -
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- - - - - - - - - - - A D T T T V N G G T I H F K G E - V V N A A C A V D A G S V D Q T V Q L G - - - - - Q V R - - T A S L K Q - - A - - - G A T S S A V G F N I Q L N D C D T T V A T - - - - - - K A A V A F - - - L G T A I D A - - - - - T R T - - - D V L A L Q S S A A G S A T N V G V Q I L D R T - - - - - - - G N A L T L D - - - - - - - - - G A - - - - - T F S A Q T T L N - - N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G T N T I P F Q A R Y Y A I G - - - - - - - E A - - - T P G A A N A D A T F K V Q Y Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
G - - N M Q F Q G V I - - - - I A E T C R I E A G D - - - - - - - - - - - K Q M - - - T V N M G - - - - - Q I S - - S N R F H - A V - - - - G E D S A P V P F V I H L R E C S T V V S E - - - - - - R V G V A F - - - H G V A D - G - - - - - K N P - - - D V L S V G - E G P G I A T N I G V A L F D D E - - - - - - - G N L V P I N - - - - - - - R P - - - - - - - - P A N W K R G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S T S L H F I A K Y R A T G - - - - - - R R V - - - T G G I A N A Q A W F S L T Y Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

 
Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in