Superfamily : 47954 [ Cyclin-like ]
Class : All alpha proteins
Fold : Cyclin-like
# of Members : 25
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1aisb1  (1108 )                                                      
d1aisb2  (1206 )                                                      
d1c9ba1  ( 110 )                                                     s
d1c9ba2  ( 208 )                                                      
d1f5qb1  (   8 )                gfldssllneedcrqmiyrserehdarmvgvnvdqHft
d1f5qb2  ( 147 )                                                      
d1g3nc1  (  16 )                      lcedrifynileieprfltsdsvfgtfQqsLt
d1g3nc2  ( 148 )                                                      
d1guxa-  ( 380 )                         ntiqqLMmiLnsasdqPsenLisyFnnCt
d1guxb-  ( 645 )                                           tslslfykk--
d1unld-  ( 146 )                                                      
d1w98b1  ( 228 )                                                      
d1w98b2  (  88 )              splpvLswanreevwkimlnkektylrdqhFle-qHplLq
d2eufa1  (   8 )            lnrakidsttmkdprvlnnlklrelllpkftslW--iQteVt
d2eufa2  ( 149 )                                                      
d2i53a1  (  14 )    sAnldhtkpcWywd-kkdla---hTpSqle-------------gldpatE
d2i53a2  ( 158 )                                                      
d3mi9b1  (   7 )         nnnkrWyft-reqle---nSpSrrf-------------gvdpdkE
d3mi9b2  ( 151 )                                                      
d4eojb1  ( 176 )              p-------dyhedihtylremevkckpkvgymk-kQpdIt
d4eojb2  ( 310 )                                                      
d4yoza1  ( 391 )                        tqsvsrLqsivaglknapsdqLiniFesCv
d4yoza2  ( 780 )                        n-------------rpkrtgslalfyrk--
d7b5oi1  (   1 )    myhnssqkrhWtfsseeqlarlradaNrkfrckavangpndpvflephee
d7b5oi2  ( 162 )                                                      
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1aisb1  (1108 )      nlafAlseLdrItaqL--kLp--------------rhVeeeAArLYre
d1aisb2  (1206 )        vkptdyVnkFAdel--gls--------------ekvRrrAieILde
d1c9ba1  ( 111 )    draMmnAfkeIttMAdri--nLp--------------rnIvdrTnnlFkq
d1c9ba2  ( 208 )       littgdfMsrFCsnL--cLp--------------kqVqmAAthIArk
d1f5qb1  (  46 )    sqyrkvLttwMfcvckdl--rQd--------------nnVfpLAvaLLDe
d1f5qb2  ( 147 )        clStdlIcyILhiM--hAp----------redylnIynlCrpkIfc
d1g3nc1  (  48 )    shmrkllGtwMfsVCqey--nLe--------------pnVvalAlnLLdr
d1g3nc2  ( 148 )       avlAtdvTsfLLlkL--Vgg----------sqhldfwhheVntlItk
d1guxa-  ( 409 )    vnPkesIlkrvkdIGyiFkekFAkav--gqg-cVeiGsqrYkLGVrLYyr
d1guxb-  ( 654 )    --vyrlAylrLntLCerlLseh---------------peLehIIWtLFqh
d1unld-  ( 146 )        astseLLrCLGefLcrr-----CyrLkhLs-----ptdPvlwLrsV
d1w98b1  ( 228 )       pltivswLnvYMqvAyln-----dlhevllpqYpqqiFiqIaeLLdL
d1w98b2  ( 127 )    pkmrailldwLmeVcevy--kLh--------------reTfylAqdFFdr
d2eufa1  (  49 )    vdnrtiLltwMhllcesf--eld--------------ksVfplSvsILdr
d2eufa2  ( 149 )       avlAtdfLipLCnaL--kIp----------edlwpqLyeaAsttIck
d2i53a1  (  47 )    aryrreGarFIfdVGtrl--gLh--------------ydTLaTGiiYFhr
d2i53a2  ( 158 )        ehpyqfLlkYakqL---kgd---------knkiqkLvqmAwtfVnd
d3mi9b1  (  35 )    lsyrqqAanlLqdMGqrL--nVs--------------qlTInTAivYMhr
d3mi9b2  ( 151 )        dhPhthVvkCTqlv---rAs-------------kdLaqtSyfMAtn
d4eojb1  ( 208 )    nsmraiLvdwLveVgeey--kLq--------------neTlhLAvnYIdr
d4eojb2  ( 310 )         tvnqfLtqYflhQq---------------panckVeSLAmFLGel
d4yoza1  ( 421 )    rnPvenImkiLkgiGetFcqhYtqstdeqpgshidfAvnrlklAeiLYYk
d4yoza2  ( 795 )    --vyhlASvrLrdLClkLd-Vs---------------neLrrkIWTCFef
d7b5oi1  (  54 )    mtlckyyekrLlefCsvFkpaMp--------------rsVvgTAcmYFkR
d7b5oi2  ( 162 )         nPyrpFegfLidLktrYpi---------LenPeiLrktAddfLnr
                          aaaaaaaaaaa                    aaaaaaaaaaaaa

                             110       120       130       140       150 
d1aisb1  (1140 )    Avrkg-lir---------------grsieSVMAACVyAACrll-k-----
d1aisb2  (1236 )    Aykrg-lts---------------gkspaGLVAAALyIASlle-g-----
d1c9ba1  ( 145 )    Vyeqk-sLk---------------grandAiASACLYIACrqe-g-----
d1c9ba2  ( 239 )    Aveld-lVp---------------grspisVAAAAIYMASqAs-a-----
d1f5qb1  (  80 )    LFLst-rid---------------renyqsTAAVALhIAGkvrAy-----
d1f5qb2  ( 181 )    Al-cdgrSa---------------mkrpvlITLACMhltMnqkydy----
d1g3nc1  (  82 )    LLlik-qVs---------------kehFqkTGSACLLVASklrSl-----
d1g3nc2  ( 183 )    Al-vdplTg---------------slpasiISAAGCAllVpanvIp----
d1guxa-  ( 456 )    VMesmLkse-------nfsklLndnifHmSLLACALEVVmaty--s----
d1guxb-  ( 687 )    TLqneyeLmr--------------drhlDQIMMCSMyGICkvk--n----
d1unld-  ( 182 )    drsLll------------qgwQdqgfItpanVVFLYMLCrdvI-----ss
d1w98b1  ( 270 )    Cvldv---------------dCl-efpyGiLAASALyhfs------s-se
d1w98b2  ( 161 )    YMatqenvv---------------ktlLqlIGISSLfIAAkleei-----
d2eufa1  (  83 )    YLckk-qGt---------------k-tLqkIGAACVLIGSkirTv-----
d2eufa2  ( 184 )    Al-iqpnIa---------------llspgLICAGGLLttIetntcp----
d2i53a1  (  81 )    FYMfh-SFk---------------qfprYvTGACCLfLAGkve-e-----
d2i53a2  ( 192 )    Sl-cttLsl---------------qwepeiIAVAVMyLAGrlc-------
d3mi9b1  (  69 )    FYMiq-SFt---------------qfpgnsVApAALfLAAkve-e-----
d3mi9b2  ( 181 )    SlhlTtFsl---------------qytppvVACVCIhLAckws-------
d4eojb1  ( 242 )    FLssm-svl---------------rgkLqLVGTAAMLLASkfeei-----
d4eojb2  ( 340 )    Slida--------------dpYl-kylpsviAGAAFHLAlytvtgqsWpe
d4yoza1  ( 471 )    ILetvMvqetrrlhgmdMSvlLeqdifHrSLMACCLEIVLfAy--s----
d4yoza2  ( 827 )    TLvhCpdLmk--------------drhlDQLLLCAFyIMAkvt--k----
d7b5oi1  (  90 )    FYLnn-SVm---------------eyhPriIMLTCAFLACkvd-e-----
d7b5oi2  ( 198 )    Ia-ltdAyl---------------lytpsqIALTAIlSSAsra-------
                    aa                         aaaaaaaaaaaaaaa        

                             160       170       180       190       200 
d1aisb1  (1168 )    -----vprtldeIAdiarvd--------------------------kkeI
d1aisb2  (1264 )    -----ekrtqreVAevArvt--------------------------evtV
d1c9ba1  ( 173 )    -----vprtfkeIcavSris--------------------------kkeI
d1c9ba2  ( 267 )    -----ekrtqkeIGdiAgva--------------------------dvtI
d1f5qb1  ( 109 )    -----mpIkatqLAylCg------------------------gattadkL
d1f5qb2  ( 211 )    -----YenridgvckslyIt--------------------------keeL
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d1g3nc2  ( 213 )    -----qg-vvpqLAsilgcd--------------------------vsvL
d1guxa-  ( 514 )    ---------fpwILnVLnLkAfdFykvIesFikaEgnLtr----eMikhL
d1guxb-  ( 717 )    -----idlkFkiIvtaYk----dLphAvqetFkrVlikeeeyd-sIivFY
d1unld-  ( 215 )    eVg----sdheLqAvLLTCLylSYsymGneis-Y--plkpFlvesckeaF
d1w98b1  ( 297 )    lMqkVSgyqwcdIenCvkwMvpfAmvIre---tg--ss-klkhfrgvade
d1w98b2  ( 191 )    -----yppklhqFayvTd------------------------gaCsgdeI
d2eufa1  ( 112 )    -----kpMtvskLty----------------------------lftnleL
d2eufa2  ( 217 )    -----wt-cyedLssilnfs--------------------------tntv
d2i53a1  ( 109 )    -----tpkkCkdIikTArslLn---------dv---qfgqF-gddpkeeV
d2i53a2  ( 219 )    -----------------kfeIqewTskpmyrrW---Weqfv-qdVpvdvL
d3mi9b1  (  97 )    -----qpkklehVIkvahtClhpqeslpdtrse---aylq-----qvqdl
d3mi9b2  ( 209 )    -----------------nweIp--vstdg-khw---weyVd-atVtlelL
d4eojb1  ( 271 )    -----yppevaeFvyiTd------------------------dtYtkkqV
d4eojb2  ( 375 )    sLirktgytlesLkpCLmdLhqtYlkapqhaqqs--irekYkn----sky
d4yoza1  ( 515 )    -----spRtFpwIIevLnLqpfyFykVIevVirSeegLsr----dMvkhL
d4yoza2  ( 857 )    -----eertFqeImksYr----nQpqAnshVYrsVll---erg-dLikFy
d7b5oi1  ( 118 )    -----fnVsspqFVgnLr------es-----pl---gqek-----AleqI
d7b5oi2  ( 225 )    -----------------gitMesYLs-----es---lmlke-nrtclsql
                             aaaaaaa                              aaaa

                             210       220       230       
d1aisb1  (1187 )    grSyrfIarnLn--------ltpkklf            
d1aisb2  (1283 )    rnrykeLvekLk--------Ikvpia             
d1c9ba1  ( 192 )    grCfklIlkaLe--------ts---vd            
d1c9ba2  ( 286 )    rqSYrlIyprAp--------dLFptdfkfdtpvdkLpql
d1f5qb1  ( 130 )    ltlEvksldtLs--------wvadr              
d1f5qb2  ( 230 )    hqCcdlVdiAivsfdenyf----------------kina
d1g3nc1  ( 132 )    idqekeLlekla--------wrte               
d1g3nc2  ( 236 )    qaAveqIltSvsdfdlri                     
d1guxa-  ( 551 )    erCehrImeslawlsdSplfdlikqsk            
d1guxb-  ( 757 )    nsvFmqrLktnIlqyast----------rpptlspiphi
d1unld-  ( 258 )    wdrClsVinlMsskMlqInad---phyftqVfsdLknes
d1w98b1  ( 341 )    dAHniqthrdsldLldk                      
d1w98b2  ( 212 )    ltMelmImkaLk--------wrls               
d2eufa1  ( 133 )    inqekdIleaLk--------wdte               
d2eufa2  ( 236 )    rtVKdqVseAfslydleil                    
d2i53a1  ( 141 )    mvleriLlqtIk---------fdlqv             
d2i53a2  ( 248 )    edIchqIldlysqgkqqmph                   
d3mi9b1  ( 134 )    vilesiIlqtLg---------felti             
d3mi9b2  ( 235 )    deLtheFlqilektpnrl-c                   
d4eojb1  ( 292 )    lrmehlVlkvLt--------fdlaAp             
d4eojb2  ( 419 )    hgVSllnppetLnl                         
d4yoza1  ( 556 )    nsIeeqIleslawshdSAlwealqvsankvptceevifp
d4yoza2  ( 935 )    ntiYvgrVksfAly-----------------plspFp  
d7b5oi1  ( 144 )    leyellLiqqLn---------fhliVh            
d7b5oi2  ( 249 )    ldiMksMrnlvkkye---pprseevavlkqklerchsae
                    aaaaaaaaaa
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
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Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N L A F A L S E L D R I T A Q L - - K L P - - - - - - - - - - - - - - R H V E E E A A R L Y R E A V R K G - L I R - - - - - - - - - - - - - - - G R S I E S V M A A C V Y A A C R L L - K - - - - - - - - - - V P R T L D E I A D I A R V D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K E I G R S Y R F I A R N L N - - - - - - - - L T P K K L F - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V K P T D Y V N K F A D E L - - G L S - - - - - - - - - - - - - - E K V R R R A I E I L D E A Y K R G - L T S - - - - - - - - - - - - - - - G K S P A G L V A A A L Y I A S L L E - G - - - - - - - - - - E K R T Q R E V A E V A R V T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E V T V R N R Y K E L V E K L K - - - - - - - - I K V P I A - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S D R A M M N A F K E I T T M A D R I - - N L P - - - - - - - - - - - - - - R N I V D R T N N L F K Q V Y E Q K - S L K - - - - - - - - - - - - - - - G R A N D A I A S A C L Y I A C R Q E - G - - - - - - - - - - V P R T F K E I C A V S R I S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K E I G R C F K L I L K A L E - - - - - - - - T S - - - V D - - - - - - - - - - - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in