Superfamily : 47741 [ CO dehydrogenase ISP C-domain like ]
Class : All alpha proteins
Fold : CO dehydrogenase ISP C-domain like
# of Members : 4
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
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d1n62a1  (  82 )    apdgtlsaLqeGFrmmhGlqcgyctpgMimrShrLLqenpsPteaeIrfg
d3eubs2  (  93 )    stktrlhpVqerIakshGsqcgfctpgIvmsMytllrnqpePtveeIeda
d5y6qa2  (  83 )    sasgelhpVqrCFvendAfqcgyctpgQimsAvaCikeghagsddeIrey
                           aaaaaaaa         aaaaaaaaaaaaa      aaaaaaa

                             60        70        80        90        100 
d1hlra6  ( 130 )    FqkhrnaCrcTgykpLVdAVmdAAaVingkkpetdLefkmpadgriwgsk
d1n62a1  ( 132 )    Ig--gnlCrcTgyqnIVkAIqyAaakingvpfee                
d3eubs2  ( 143 )    fq--gnlCrcTgyrPIlqgFrtf                           
d5y6qa2  ( 133 )    Ms--gnlCrcgAyphIidAIkqAaaemak                     
                                 aaaaaaaaaaaaaa                       

                             110  
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d5y6qa2                           
                                  

 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
automated matchesautomated matchesDesulfovibrio gigas [TaxId: 879]view
Carbon monoxide (CO) dehydrogenase iron-sulfur protein, C-domainCO dehydrogenase ISP C-domain likeOligotropha carboxidovorans, formerly Pseudomonas carboxydovorans [TaxId: 40137]view
automated matchesCO dehydrogenase ISP C-domain likeCow (Bos taurus) [TaxId: 9913]view
automated matchesautomated matchesMethylobacillus sp. [TaxId: 194289]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110
Q P - E N L H P L Q K A W V L H G G A Q C G F C S P G F I V S A K G L L D T N A D P S R E D V R D W F Q K H R N A C R C T G Y K P L V D A V M D A A A V I N G K K P E T D L E F K M P A D G R I W G S K Y P R P T A V A K V T G T L
A P D G T L S A L Q E G F R M M H G L Q C G Y C T P G M I M R S H R L L Q E N P S P T E A E I R F G I G - - G N L C R C T G Y Q N I V K A I Q Y A A A K I N G V P F E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
S T K T R L H P V Q E R I A K S H G S Q C G F C T P G I V M S M Y T L L R N Q P E P T V E E I E D A F Q - - G N L C R C T G Y R P I L Q G F R T F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
S A S G E L H P V Q R C F V E N D A F Q C G Y C T P G Q I M S A V A C I K E G H A G S D D E I R E Y M S - - G N L C R C G A Y P H I I D A I K Q A A A E M A K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

 

 

 

 

 

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