Superfamily : 47576 [ Calponin-homology domain, CH-domain ]
Class : All alpha proteins
Fold : CH domain-like
# of Members : 17
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1aoaa1  ( 121 )               yseeeKyafVnwInkaLendpdCrhvIpMnpntddLfkA
d1aoaa2  ( 267 )                 lspeelllrwAnfhLensgw----qkin----nfsad
d1bkra-  (   2 )                 ksakdalllwCqmkTa-------gyp-nVnIhnFtts
d1h67a1  (  28 )                 pqterqlrvwiEgatgrrig---------d--nfmdg
d1p5sa-  (  32 )        retlqAydYLcrVDeAkkWIeeClgtdlg---------pTstFEqs
d1pa7a-  (   1 )    mAvnVystsvtsdnlsrhdMlawInesL-----q---lnltk-----Ieq
d1rt8a-  ( 110 )               ineeerreFIkhInsvLagdpdVgsrVpIntetfeFFdq
d1ujoa1  (   8 )                 eeleerlveWivvqCgpdvgrPd----rg-rlgFqvw
d1wjoa1  (   8 )                   nddiivnwvnrtlseagks---tsiqsfk---dkt
d2d86a1  (   8 )                 mepWkqCAqWlihCkvlptnhrvtwd-saqvfdlAqt
d2dk9a1  (   1 )               gsagtqeellrwCqeqta-------gyp-gvhvsdlsss
d2e9ka1  (   8 )                 dirpsklltwCqqqte-------gyq-hvnvtdltts
d2jv9a1  (   6 )                    knmlleWCramtr-------nYe-hvdiqnfsss
d2l3ga1  (  11 )                 mnsAeqtvtWlitlg--vlespkkti-sdpegflqas
d2wa5a2  ( 138 )                kqtpkqrllgwIqnkIp-------y----lpItnFnqn
d6oa6a1  (  47 )              awekqqrktftawCnshlrkag-----tqie----nided
d6zshb-  ( 443 )                 pnasqsLlvwCkevTk-------nyr-gVkItnFtts
                                   aaaaaaaaaaaa                       

                             60        70        80        90        100 
d1aoaa1  ( 160 )    VgdGIVLCKMInlSvp------------dtIderaInkk-kltpfiiqeN
d1aoaa2  ( 296 )    IkdSkAYFhLLnqiApkgqkegepr---idInmsgfnet------ddlkR
d1bkra-  (  31 )    WrdGMAFNALIhkhrpdlI-dfdklkks-----------------nahyN
d1h67a1  (  54 )    lkdgvilCelinklqp------------gSvq--kvndpvqn--whklen
d1p5sa-  (  69 )    LrnGvvLAlLVqkfqpdklikIfysnel--------------qfr-hsdN
d1pa7a-  (  38 )    LcsGaaYCQFMdMLfp------------gSIalkkVkfq-AkleheyiqN
d1rt8a-  ( 149 )    CkdGLILSkLIndSvp------------dtIderVLnkq-pLdnfkCieN
d1ujoa1  (  40 )    lknGvilSklvnslype---------gskpv---kvpenppsmvfkqmeq
d1wjoa1  (  37 )    iSsSlAvvdlidAiqp------------gcinydlvksg-nlteddkhnn
d2d86a1  (  44 )    lrdGvllCqllnnlra------------hSinlkeinlrPqmsqflClkn
d2dk9a1  (  32 )    WadGlAlCAlvyrlqpgll-ePselqgl-----------------galeA
d2e9ka1  (  37 )    WrsglAlCAiihrfrpeli-nfdslned-----------------daven
d2jv9a1  (  32 )    WssGmAFCAlihkffpeAf-dyaeldpa-----------------krrhn
d2l3ga1  (  45 )    lkdGvvlCrllerllp------------gtie--kvype-prseseclsn
d2wa5a2  ( 165 )    WqdGkALGALVdsCapglCpdweswdpq-----------------kpvdN
d6oa6a1  (  78 )    FrdGlklMlllevisg------------erlp--kperg-k-mrvhkinN
d6zshb-  ( 472 )    WrnGLSFCAILhhfrpdlI-dYksLnpq-----------------dikeN
                        aaaaaaaaaa                                aaaa

                             110       120       130       140       150 
d1aoaa1  ( 197 )    LnlALnsAsai-gChvv-nigAedLrag---kphlVLgLLwqIIkiglfa
d1aoaa2  ( 337 )    AesMLqqAdkL-gcrq--fVtpadVvsG---npklNlaFVanLfn     
d1bkra-  (  63 )    LqnAFnlAeqhLgltk--lLdpedIsvd-hPdeksIitYVvtYyhyFskm
d1h67a1  (  88 )    ignFlraikhy-gvkphdiFeandlfent--nhtqvqstlialasqaktk
d1p5sa-  ( 104 )    InkFldfIhgi-glpeifHFeltdIyeGk--nLpkVIyCIHALSyfLsmq
d1pa7a-  (  75 )    FkiLqaGFkrm-gVdk--iIpvdkLVkg---kfqdNfeFVqwFkkFFdan
d1rt8a-  ( 190 )    NnVVinSAkAMggIsIt-nIgagdIleG---rehlILgLVwqIIrrgllg
d1ujoa1  (  78 )    vaqFlkaAedY-gviktdmFqtvdlYeGk--dmaavqrtlmalGslAvtk
d1wjoa1  (  74 )    AkyAvsMArri-gArv--yAlpedlvev---kpkmvmtvFaclmgrGmkr
d2d86a1  (  82 )    irtFltACcetFgMrkselFeafdlfdvr--dFgkvietlsrlSrtpiAl
d2dk9a1  (  64 )    tawAlkvAenelgitp--vvsaqavvaGs--dplgliaYlshFhsaFksm
d2e9ka1  (  69 )    nqlAFdvAerefgipp--vttGkeMasaqepdklsMvmYlskFyelfrgt
d2jv9a1  (  64 )    FtlAfstAekladcaq--llevddMvrlavPdskcvytYiqelyrslvqk
d2l3ga1  (  80 )    ireFlrGCgas-lrl--etFdandlyqgq--nfnkvlsSlvtlnkvtadi
d2wa5a2  ( 198 )    AreAMqqAddwlgVpq--vItPeeIihp-dvdehsVmtYLsqFpkakl  
d6oa6a1  ( 112 )    vnkAldfiask-gvklv-sigAeeivdG---nakmtlgMiwtiilrfaiq
d6zshb-  ( 504 )    NkkAYdgFas-igIsr--lLepsdMvllaiPdkltVmtYLyqIrahfsgq
                    aaaaaaaaaa           aaaaa      aaaaaaaaaaaaaaa   

                             160       170       180       190       200 
d1aoaa1  ( 242 )    diea                                              
d1aoaa2                                                               
d1bkra-                                                               
d1h67a1                                                               
d1p5sa-  ( 151 )    dlappliksdenlsftdedvsiIvrrlrqsnvilpnfkal          
d1pa7a-  ( 119 )    ydgkdydPvaar                                      
d1rt8a-  ( 236 )    kitldqflrlppekiLlrWFnyHLkaAnwprtVsnFskdVsdGeNYTVLL
d1ujoa1  ( 125 )    ndgnYrgdpnwFmk                                    
d1wjoa1  ( 118 )    v                                                 
d2d86a1  ( 130 )    atgirpfp                                          
d2dk9a1                                                               
d2e9ka1  ( 117 )    --------------plrpv                               
d2jv9a1  ( 112 )    --------------glvktkkk                            
d2l3ga1  ( 125 )    gl                                                
d2wa5a2                                                               
d6oa6a1  ( 157 )    did-----------------------------------------------
d6zshb-                                                               
                                                                      

                             210       220       230       240       250 
d1aoaa1                                                               
d1aoaa2                                                               
d1bkra-                                                               
d1h67a1                                                               
d1p5sa-                                                               
d1pa7a-                                                               
d1rt8a-  ( 302 )    nqLapelCsraPlqttdvlqrAeqVLqnAekLdCrkyLtptAMvagnpkL
d1ujoa1                                                               
d1wjoa1                                                               
d2d86a1                                                               
d2dk9a1                                                               
d2e9ka1                                                               
d2jv9a1                                                               
d2l3ga1                                                               
d2wa5a2                                                               
d6oa6a1  ( 160 )    --------------------------------------------------
d6zshb-                                                               
                                                                      

                             260       270       280       290       300 
d1aoaa1                                                               
d1aoaa2                                                               
d1bkra-                                                               
d1h67a1                                                               
d1p5sa-                                                               
d1pa7a-                                                               
d1rt8a-  ( 352 )    NLAFVAhLfnthpglepaegerEArVFtlwLnsldVtpsIhdFfnnLrdG
d1ujoa1                                                               
d1wjoa1                                                               
d2d86a1                                                               
d2dk9a1                                                               
d2e9ka1                                                               
d2jv9a1                                                               
d2l3ga1                                                               
d2wa5a2                                                               
d6oa6a1  ( 160 )    --------------------------------------------------
d6zshb-                                                               
                                                                      

                             310       320       330       340       350 
d1aoaa1                                                               
d1aoaa2                                                               
d1bkra-                                                               
d1h67a1                                                               
d1p5sa-                                                               
d1pa7a-                                                               
d1rt8a-  ( 415 )    lILLqAYdkitpntVnwkkVnkapasgdeMmrfkaveNCnyAVdlGknqg
d1ujoa1                                                               
d1wjoa1                                                               
d2d86a1                                                               
d2dk9a1                                                               
d2e9ka1                                                               
d2jv9a1                                                               
d2l3ga1                                                               
d2wa5a2                                                               
d6oa6a1  ( 160 )    --------------------------------------------------
d6zshb-                                                               
                                                                      

                             360       370       380       390       400 
d1aoaa1                                                               
d1aoaa2                                                               
d1bkra-                                                               
d1h67a1                                                               
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d1pa7a-                                                               
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d1rt8a-  ( 571 )    AiqNArLAISIARklgAvIFIlpeDIvavrprLVLhFIGsLmav
d1ujoa1                                                         
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Fimbrin (Plastin), actin-crosslinking domainCalponin-homology domain, CH-domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
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Ras GTPase-activating-like protein rng2Calponin-homology domain, CH-domainFission yeast (Schizosaccharomyces pombe) [TaxId: 4896]view
Microtubule-associated protein eb1, N-terminal microtubule binding domainCalponin-homology domain, CH-domainHuman (Homo sapiens) [TaxId: 9606]view
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Highly Conserved Residues

 

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- - - - - - - - - - - Y S E E E K Y A F V N W I N K A L E N D P D C R H V I P M N P N T D D L F K A V G D G I V L C K M I N L S V P - - - - - - - - - - - - D T I D E R A I N K K - K L T P F I I Q E N L N L A L N S A S A I - G C H V V - N I G A E D L R A G - - - K P H L V L G L L W Q I I K I G L F A D I E A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - L S P E E L L L R W A N F H L E N S G W - - - - Q K I N - - - - N F S A D I K D S K A Y F H L L N Q I A P K G Q K E G E P R - - - I D I N M S G F N E T - - - - - - D D L K R A E S M L Q Q A D K L - G C R Q - - F V T P A D V V S G - - - N P K L N L A F V A N L F N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - K S A K D A L L L W C Q M K T A - - - - - - - G Y P - N V N I H N F T T S W R D G M A F N A L I H K H R P D L I - D F D K L K K S - - - - - - - - - - - - - - - - - N A H Y N L Q N A F N L A E Q H L G L T K - - L L D P E D I S V D - H P D E K S I I T Y V V T Y Y H Y F S K M - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - P Q T E R Q L R V W I E G A T G R R I G - - - - - - - - - D - - N F M D G L K D G V I L C E L I N K L Q P - - - - - - - - - - - - G S V Q - - K V N D P V Q N - - W H K L E N I G N F L R A I K H Y - G V K P H D I F E A N D L F E N T - - N H T Q V Q S T L I A L A S Q A K T K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - R E T L Q A Y D Y L C R V D E A K K W I E E C L G T D L G - - - - - - - - - P T S T F E Q S L R N G V V L A L L V Q K F Q P D K L I K I F Y S N E L - - - - - - - - - - - - - - Q F R - H S D N I N K F L D F I H G I - G L P E I F H F E L T D I Y E G K - - N L P K V I Y C I H A L S Y F L S M Q D L A P P L I K S D E N L S F T D E D V S I I V R R L R Q S N V I L P N F K A L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
M A V N V Y S T S V T S D N L S R H D M L A W I N E S L - - - - - Q - - - L N L T K - - - - - I E Q L C S G A A Y C Q F M D M L F P - - - - - - - - - - - - G S I A L K K V K F Q - A K L E H E Y I Q N F K I L Q A G F K R M - G V D K - - I I P V D K L V K G - - - K F Q D N F E F V Q W F K K F F D A N Y D G K D Y D P V A A R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - I N E E E R R E F I K H I N S V L A G D P D V G S R V P I N T E T F E F F D Q C K D G L I L S K L I N D S V P - - - - - - - - - - - - D T I D E R V L N K Q - P L D N F K C I E N N N V V I N S A K A M G G I S I T - N I G A G D I L E G - - - R E H L I L G L V W Q I I R R G L L G K I T L D Q F L R L P P E K I L L R W F N Y H L K A A N W P R T V S N F S K D V S D G E N Y T V L L N Q L A P E L C S R A P L Q T T D V L Q R A E Q V L Q N A E K L D C R K Y L T P T A M V A G N P K L N L A F V A H L F N T H P G L E P A E G E R E A R V F T L W L N S L D V T P S I H D F F N N L R D G L I L L Q A Y D K I T P N T V N W K K V N K A P A S G D E M M R F K A V E N C N Y A V D L G K N Q G F S L V G I Q G A D I T D G S R T L T L A L V W Q M M R M N I T K T L H S T L S D S D M V A W A N S M A A K G G K G S Q I R S F R D P S I S T G V F V L D V L H G I K S E Y V D Y N L V T D G S T E E L A I Q N A R L A I S I A R K L G A V I F I L P E D I V A V R P R L V L H F I G S L M A V
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in