Superfamily : 47370 [ Bromodomain ]
Class : All alpha proteins
Fold : Bromodomain-like
# of Members : 31
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1e6ia-  ( 329 )                           rgphdaaIqn-ILteLqnh-------a
d1eqfa1  (1359 )    gttvhcdylnrphksihrrrtdpmVtLssiLes-II-ndMr------dlp
d2yyna-  (  16 )                         kltpidkrkCer-LLlfLych-------e
d3fkmx1  ( 333 )                           nkqwyllAnq-lIlsLsky-------e
d3g0ja-  ( 615 )                      ispsymtpmQqkLne-VYeaVknytd-r-grr
d3iu5a1  (  43 )                           tvdpiavChe-LyntIrdykdeq-grl
d3jb9a4  ( 698 )                        qrvdshqdlelraaVmndIldmipegirq-
d3k2ja1  ( 356 )                                    q-LydtVrscrn----qg
d3mqma1  (2433 )                       evaraarLaqiFke-iCdgIisykds-srqa
d3nxba-  ( 438 )                            d-dftaMyk-vLdvVkahk-------
d4nxja1  (   2 )                      ydeieelsknevLtn-LlnkLiafd-------
d4pkla1  (   9 )                            sfnkngClv-FVsrLwdlD-------
d4qnsa1  (1356 )                         hkevqlkdqIlg-vLdyLekq-------q
d4qspa1  ( 981 )                      qeedtFreLrifLrn-VThrLai-d-------
d5bt3a-  (1048 )                        ifkpeeLrqaLmp-TLeaLy------rqdp
d5c8ga-  (   6 )                  pnHvfhsdrlapeirdLYd-cLykLya------ees
d5ig6a1  ( 348 )                             eqlkhCng-ILkeLls----kkHaa
d5mwza-  ( 626 )                       memqltpFLiLLrk-TLeqLqekd-------
d5n17a1  ( 193 )         apkppqePdmnnlpenpIpqhQakfVln-TIkaVk-------rnr
d5r4oa-  (2793 )                 edamTvltpLtekdYegLkr-VLrsLqah-------k
d5s9ga-  (1316 )                          ydiqawkqCee-LLnlIfq-------ce
d5uiya-  (1430 )                         g-gvhelsafeq-LVveLvrh-------d
d5wmga1  (  44 )         nppppetsnpn-kp--krqtnqlqyllrvvlktlw-------khq
d6bqaa-  (  22 )                           stpiqqlLeh-fLrqLqrkD-------
d6cw0a-  (   7 )                                sryse-vllqLke-------lq
d6df4a-  (1501 )                        dddqvaFsfiLdn-IVtqkMm------avp
d6haza-  (1378 )                      pnp---pkltkqMna-iidtvinykdss-grq
d6mf9a-  (1839 )                    pitsyteALeFCieLqr-IInsTkt------lhh
d6uy1a1  (  20 )                             gifptvek-lvee-reqldevdshp
d6znva1  ( 178 )                           spalkeiLeq-LleaIvvatnp----g
                                              aaaaaaa aaaaaa          

                             60        70        80        90        100 
d1e6ia-  ( 348 )    AAwpflqpvnkee--vpdyydfIkepmDLstMeikLes-------nkYqk
d1eqfa1  (1401 )    nTypfhtpvnakv--vkdyykiItrpMDLqtLrenVrkr-------lYps
d2yyna-  (  37 )    mSlafqdpvplt---vpdYykiIknpMDLstIkkrLqed-----ysmYsk
d3fkmx1  ( 352 )    gGhifeklc-------pdyydviknp-sFscIktkLkk-------gqYay
d3g0ja-  ( 648 )    LSaiflrlpsrse--lpdYyltI-kpMdMekIrshMma-------nkYqd
d3iu5a1  (  68 )    lCelFirapkrrn--qpdYyevVsqpidLmkIqqklkm-------eeYdd
d3jb9a4  ( 727 )    ----------------gksktiLq--hLseAwrcwkanipwkvpglpapI
d3k2ja1  ( 371 )    lAepfyhlpskkk--ypdyyqqi-mpiSLqqIrtklkn-------qeYet
d3mqma1  (2462 )    lAapLlnlppn-----adYyis--dpldLitIekqIlt-------gyYkt
d3nxba-  ( 455 )    dSwpflepvdesy--ApnYy-iIkapmDIssMekkLng-------glYct
d4nxja1  (  29 )    --riflypvnvql--vpdylnvIe-pmDFttM-qklqn-------fkYks
d4pkla1  (  27 )    klgmFhhpvsaee--lpdyhtvIkrpvdLssIrdgIek-------gtyat
d4qnsa1  (1377 )    SAwpflkpvslse--apdyydiIkepTDIltMrrkArh-------gdYkt
d4qspa1  (1005 )    rFrvftkpvdpde--vpdyvtvIkqpmDLssViskIdl-------hkYlT
d5bt3a-  (1071 )    eSlpfrqpvdpqllgipdYfdiVkspmDLstIkrkLdtg-------qYqe
d5c8ga-  (  38 )    aSeyfrep-dalv-gawnyysvitepmSLrtVLdyIvqg-----g-rYsh
d5ig6a1  ( 368 )    yAwpfykpvdasalglhdyhdiIkhpmDLstVkrkmenr-------dYrd
d5mwza-  ( 649 )    tgnifsepvplse--vpdYldhik-pMDFftMkqnLea-------yrYln
d5n17a1  ( 230 )    eAvpflhpvdtvklnvpfYYnyIprpMDLstIerkInlk-------AYed
d5r4oa-  (2822 )    mAwpflepvdpnd--apdyygvI-epMdLatMeerVqr-------ryYek
d5s9ga-  (1337 )    dSepfrqpvdlle--ypdYrdiIdtpmDFatVretLeag-------nYes
d5uiya-  (1450 )    dSwPFlklvskiq--vpdyydiIkkpiALniIrekVnk-------ceYkl
d5wmga1  (  79 )    fAwpfqqpvdavklnlpaYykiiktpMDMgtikkrlenn-------yYwn
d6bqaa-  (  41 )    phgffafpvtdai--apgysmiIkhpmDFgtMkdkIva-------neYks
d6cw0a-  (  22 )    dSeaFlepvnw--lglddypdiVknpmDLktIgkkIkan-------fYt-
d6df4a-  (1524 )    dSwpfhhpvnkkf--vpdyykvIvnpmDLetIrknIskh-------kYqs
d6haza-  (1405 )    lSevfiqlpsrke--lpeYyelirkpvDFkkikerirn-------hkYrs
d6mf9a-  (1868 )    yShvfwnrvs--e--apnyynlVkrpmwLqlMinkCr---------eYks
d6uy1a1  (  44 )    rtsifeklpskrd--ypdyfkviekp-aidiilknCkn-------gtykt
d6znva1  ( 202 )    rlSlfq-lps-vq--ypdyyaiI--pIdL-tIa-rIqn-------gsYks
                      333             aaaa      aaaaaaaaa             

                             110       120       130       140       150 
d1e6ia-  ( 389 )    MedFIyDArlVFnncrmynge----------ntsyykyAnrLekfFnnkV
d1eqfa1  (1442 )    reeFrehLelIvknSatyn----gp------khsltqiSqsMldlCdekl
d2yyna-  (  79 )    pedFVadFrlIFqnCaefnep----------dsevanaGikLenyFeelL
d3fkmx1  ( 395 )    pseFvkdVqliFdncslynts----------nsvvAitGknIetyFnnqL
d3g0ja-  ( 689 )    idsMVedFvmMFnnactynep----------esliykDAlvLhkvLletr
d3iu5a1  ( 109 )    vnlLtadFqlLFnnaksyykp----------dspeykAAckLwdlYlrtr
d3jb9a4  ( 759 )    enMIlryvkskadwwtsvAhfnrerirrgatvdktvakkNlgrltrlwlk
d3k2ja1  ( 413 )    ldhLecdLnlMFenak-ynvp----------nsaiykrVl-LqqvMqakk
d3mqma1  (2503 )    veaFdadMlkVFnaey-ygks----------pvGdVcLra-Yynarheas
d3nxba-  ( 496 )    keeFvndMktMFrncrkyng----s-------seytkmSdnLercFhram
d4nxja1  (  68 )    FqeFekDVllIInncytyndp----------stiyykfAedIetyYkkln
d4pkla1  (  68 )    DvdVQndVarMItnaleyna----k------gstwyqeAmsFrktyldlA
d4qnsa1  (1418 )    kedFGieLkrMFdncrlynap----------ttiyfkyAneLqtlIwpky
d4qspa1  (1046 )    VkdYlrdIdlICsnaleynpdrdpg------drlirhrAcaLrdtAyaii
d5bt3a-  (1114 )    PwqYvddIwlMFnnawlyn----rk------tsrvykyCskLSevFeqei
d5c8ga-  (  82 )    v-qImndVelIwnCyng--------------ashlaadArrC-aiLhra 
d5ig6a1  ( 411 )    AqeFAadVrlMFsncykyn----pp------dhdvVamArkLqdvFefry
d5mwza-  ( 690 )    FddFeedFnlIVsncl-ynak----------dtifyraAvrLreqGgavL
d5n17a1  ( 273 )    vsqVvddFnlMVknckkfn----ge------aagiSkmAtnIqaqFeklm
d5r4oa-  (2863 )    LteFvadMtkIFdncryynps----------dspfyqcAevLesfFvqkl
d5s9ga-  (1378 )    PmeLCkdVrlIfsnskayt---psk------rsriYsmSlrLsafFeehI
d5uiya-  (1491 )    aseFiddIelMFsncfeynpr----------ntseAkAGtrLqafFhiqa
d5wmga1  ( 122 )    aqeCiqdFntMFtncyiyn----kp------gddivlmAealeklFlqki
d6bqaa-  (  82 )    vteFkadFklMCdnamtyn-rp---------dtvyyklAkkIlhaGfkmM
d6cw0a-  (  65 )    aeqFwadIdlIWhNcqlyn----he------ssevyqqSirMqdaAnnlr
d6df4a-  (1565 )    resFlddVnlIlanSvkyn----gp------esqytkTAqeIVnvCyqTL
d6haza-  (1446 )    lgdlekdvmllChnAqtfnle----------gsqiyeDSivlqsvFksAr
d6mf9a-  (1909 )    r-dFqdDLdlIvenckiyn----gv------nhplvsVAtlIhsnVv-kI
d6uy1a1  (  85 )    leevrqalqt-Fenarfynee----------gswvyvDAdklneftdewF
d6znva1  ( 245 )    ihaMakdIdlLA-naktynep----------gsqvf-dAnsIk-iFymkk
                    aaaaaaaaaaaaaaaaaa               aaaaaaaaaaaaaaaaa

                             160       170       180 
d1e6ia-  ( 429 )    keipeyshli                    
d1eqfa1  (1482 )    kekedkLarlekainp              
d2yyna-  ( 119 )    knlypekrFp                    
d3fkmx1  ( 435 )    ivgYnnfilkekinll              
d3g0ja-  ( 729 )    rdl                           
d3iu5a1  ( 149 )    nefvq                         
d3jb9a4  ( 809 )    aeqerqhnylkdgp                
d3k2ja1  ( 454 )    elad--de                      
d3mqma1  (2547 )    aqIdivge                      
d3nxba-  ( 536 )    m                             
d4nxja1  ( 110 )    -iqtkYmni                     
d4pkla1  ( 108 )    rqSgLvv                       
d4qnsa1  (1458 )    eai                           
d4qspa1  (1090 )    keeldedfeqlCeeIqesr           
d5bt3a-  (1154 )    dpvMqslg                      
d5c8ga-                                           
d5ig6a1  ( 451 )    akmp                          
d5mwza-  ( 730 )    rArrqaekm                     
d5n17a1  ( 313 )    vkvppk                        
d5r4oa-  (2903 )    kgfkasRs-h                    
d5s9ga-  (1419 )    ssvlsdyk--------------sAlrfhkr
d5uiya-  (1531 )    qklg----Lh                    
d5wmga1  ( 162 )    nelptee                       
d6bqaa-  ( 122 )    sk                            
d6cw0a-  ( 105 )    dml                           
d6df4a-  (1605 )    teydehLtqLekdictakeaaleeaelesl
d6haza-  (1486 )    qkiAk                         
d6mf9a-  (1949 )    deI--gI-eIeayLsl              
d6uy1a1  ( 125 )    keh-s                         
d6znva1  ( 285 )    aeiehh------------e           
                    a
 

 

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PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R G P H D A A I Q N - I L T E L Q N H - - - - - - - A A A W P F L Q P V N K E E - - V P D Y Y D F I K E P M D L S T M E I K L E S - - - - - - - N K Y Q K M E D F I Y D A R L V F N N C R M Y N G E - - - - - - - - - - N T S Y Y K Y A N R L E K F F N N K V K E I P E Y S H L I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
G T T V H C D Y L N R P H K S I H R R R T D P M V T L S S I L E S - I I - N D M R - - - - - - D L P N T Y P F H T P V N A K V - - V K D Y Y K I I T R P M D L Q T L R E N V R K R - - - - - - - L Y P S R E E F R E H L E L I V K N S A T Y N - - - - G P - - - - - - K H S L T Q I S Q S M L D L C D E K L K E K E D K L A R L E K A I N P - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K L T P I D K R K C E R - L L L F L Y C H - - - - - - - E M S L A F Q D P V P L T - - - V P D Y Y K I I K N P M D L S T I K K R L Q E D - - - - - Y S M Y S K P E D F V A D F R L I F Q N C A E F N E P - - - - - - - - - - D S E V A N A G I K L E N Y F E E L L K N L Y P E K R F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N K Q W Y L L A N Q - L I L S L S K Y - - - - - - - E G G H I F E K L C - - - - - - - P D Y Y D V I K N P - S F S C I K T K L K K - - - - - - - G Q Y A Y P S E F V K D V Q L I F D N C S L Y N T S - - - - - - - - - - N S V V A I T G K N I E T Y F N N Q L I V G Y N N F I L K E K I N L L - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - I S P S Y M T P M Q Q K L N E - V Y E A V K N Y T D - R - G R R L S A I F L R L P S R S E - - L P D Y Y L T I - K P M D M E K I R S H M M A - - - - - - - N K Y Q D I D S M V E D F V M M F N N A C T Y N E P - - - - - - - - - - E S L I Y K D A L V L H K V L L E T R R D L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T V D P I A V C H E - L Y N T I R D Y K D E Q - G R L L C E L F I R A P K R R N - - Q P D Y Y E V V S Q P I D L M K I Q Q K L K M - - - - - - - E E Y D D V N L L T A D F Q L L F N N A K S Y Y K P - - - - - - - - - - D S P E Y K A A C K L W D L Y L R T R N E F V Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in