Superfamily : 310584 [ Outer membrane carboxylate (Occ) channels ]
Class : Membrane and cell surface proteins and peptides
Fold : Transmembrane beta-barrels
# of Members : 6
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d3sy7a1  (   1 )                    dafVsdQaeA-gfiedSsldlllrnyyfnrd---
d3syba-  (   8 )    papdnpSyaaevqsipsvapigQagAtglvegqsltlttrnFySren---
d3szva1  (   1 )                               dlvedShAslelrnfyfnrdfr-
d5dl5a1  (   1 )                        seQseAkgfvedanGsilfrtGyLtrdkk-
d5dl7a-  (   3 )                                 iadskaeltlrnFyFdrdykk
d5dl8a-  (   2 )                             npNqqtedewkftlknAyInrdfdn
                                                     bbbbbbbbbbbbbb   

                             60        70        80        90        100 
d3sy7a1  (  38 )    ------drvdwTqGfLttyeSgftqg-------tvGfGvdafgYlGlkld
d3syba-  (  79 )    --------nawvqGtvlkysSgytqg-------tvGfGfdvAaFneia--
d3szva1  (  31 )    ---------dwaqGfLlrleSgfseg-------tvGfGvdaigLlGfkld
d5dl5a1  (  30 )    --qgakdtsSvAqSaivsiesgftpg-------ivGfGvGvvgDgSfkig
d5dl7a-  (  24 )    dpypytAArDwAqGlifkgqsgyteg-------tvgfgvdvlaMaGfNlm
d5dl8a-  (  27 )    d--alkdtGSwSqAaslfykskMhdtplviadkpitigadaSvQyAvrls
                             bbbbbbbbbbb              bbbbbbbbbbbbbb  

                             110       120       130       140       150 
d3sy7a1  (  75 )    gtd----------------------dysra-ggAvKvrisktmlkwgeMq
d3syba-  ( 136 )    --g----------------------ewsklGvaNirlrasntefkagrFl
d3szva1  (  87 )    ------------------------ddyakl-gltaKarvsnsllkvgALh
d5dl5a1  (  71 )    ---enk-nAgnqMIPkhn-dgsAydhWaRG-ggSvKarfsnttvrygtqv
d5dl7a-  (  67 )    -gsrAddyarSgLLpVnt-dnsRddyYgki-GitgKakfrknelfvgdLv
d5dl8a-  (  75 )    -s---dkhvaDtVLpfnketqsQasdYlKy-gaTlklGydktllsvgELw
                                             bbbbb bbbbbbbb  bbbbbbbb 

                             160       170       180       190       200 
d3sy7a1  ( 120 )    PtApVFAaGgsrlfpQTAtgvQlqsSefeglDlEaGhFt-----------
d3syba-  ( 162 )    vnTPVFSyiDnrALpSSFtgfavtseeldnlSlqagsFk-VSPrtgsgde
d3szva1  ( 112 )    fkSpLVsAnd-tLLPELFrgalldvqeidgltlrgAhLdrNKlnsssdyq
d5dl5a1  ( 115 )    LdlpVLASNtgrMVpEYFtgtlltsheiknlevVagkFtkDQMSdqin--
d5dl7a-  ( 114 )    PqLPTIfSSpaRLFpQTYrgirfVsneipnlqlEgFyVdeVrqrdsirYt
d5dl8a-  ( 120 )    LdLPVTAvDasrQLlTSYwgtNlksqlsdqlyaEigrVekVSPRneedfk
                                    bbbbbbbbb     bbbbbbbbb bb        

                             210       220       230       240       250 
d3sy7a1  ( 159 )    eLyAtYA-g------etAsAdFiggryaitdnlsaslYgAeLedIYrQyY
d3syba-  ( 212 )    dMtTeyGtr------qVGdLnYlggNy-pldgleiSlYgShFqdVWnQyY
d3szva1  ( 162 )    vFsAnr----Ig---gsdaFdFaggdyrltpaltaslHqgrLkdIYrQtF
d5dl5a1  ( 163 )    ---tdADasg----rgLdrAiVwgakykfndnlnasyYGLdSknaLeRhY
d5dl7a-  ( 164 )    dVGTdniNhRFnkaatTdsFyTlggsyql-kdyrlraYhAeLkdIYqQqF
d5dl8a-  ( 170 )    kFsfta----ngitkeSdGLnYiDlryqftpslkgeyYfGnLedLYnKhY
                                       bbbbbbbbb    bbbbbbbbbb   bbbbb

                             260       270       280       290       300 
d3sy7a1  ( 215 )    lnsnytiplasdqslgfdfNiYrTndeg-------------------akA
d3syba-  ( 258 )    lgvthdiglengialrtafNgYhTgdtg------------------areA
d3szva1  ( 206 )    aglvhtldl----gslksdlrfAAseDg--------------------gf
d5dl5a1  ( 206 )    anvnfkqplandSsltydfSgYhTkFdanAhTysAtgtvapnYaadgiAg
d5dl7a-  ( 213 )    lgfngkqplndqlnflSdvrfFnSeetg------------------skkI
d5dl8a-  ( 216 )    vglehtwkq-ptfaltskfkyFnAkDdg--------------------nt
                    bbbbbbb      bbbbbbbbbbbbb                        

                             310       320       330       340       350 
d3sy7a1  ( 247 )    GdIsNtTwSlaaaytldAhtftlAyQkVhgdQPFDYIGFggAGgdsIfLa
d3syba-  ( 291 )    GyIdNdTwSlaftlghrAhalTlAyQqVdgnEYFDyVhETsA----IFLA
d3szva1  ( 236 )    reLdNrAfgalfslrlgahav-aGyQ-IsgddpYPyIa--gSd-P--yLV
d5dl5a1  ( 256 )    eeKtNnIwAisgtyatgphsvmlAyQqNtgnVGYDygqnADGf-qSiyLp
d5dl7a-  ( 245 )    geVdNrHiSglfGlnyqnhtvSlGyMqSfgstGLPfL----sg-teSpVV
d5dl8a-  ( 245 )    FdIdAeNiGlletvkvknhtfGlGyQqIigesaYPlPd--gfL-PEtyFI
                       bbbbbbbbbbbbb  bbbbbbbbbbb                     

                             360       370       380       390       400 
d3sy7a1  ( 301 )    NSVQySDFNGPgE-SwQarydlnlasyg-----vpgltfmvryInGkdId
d3syba-  ( 337 )    NsMl-AdYNSPnEkSaQiryeTdwsyyg-----vpglstGvWyV-GwdId
d3szva1  ( 281 )    NfIQigDFGnvdErSwQlrydydfgalg-----lpglsfmsryVsGdnVa
d5dl5a1  ( 305 )    NsyM-SdFIGNhEkSaQiqynvdfgklg----vlpglnwttAfVyGwdIk
d5dl7a-  ( 290 )    LdFMSSdYSNkdEkVySiryeydfknarigdvslnglrfmtryAkGedId
d5dl8a-  ( 292 )    nwnat-GFfkedEkSyHvmyGydfkd-y-----ipglnamvkyVyGhdFk
                                 bbbbbbbbbb             bbbbbbbbbbbbb 

                             410       420       430       440       450 
d3sy7a1  ( 346 )    GtMsd-----nNvgYknygYge-dGkHhEtNleakyvvqsgp-adlsfri
d3syba-  ( 381 )    GthYdGdrngaygNYaeVraQd-gekHhElGlMaaykvqngpikdStfkl
d3szva1  ( 326 )    rg----------------a--andGkewErNtdlgyvvqsgplknlgvkw
d5dl5a1  ( 350 )    vr----------------nvtd-dAqErEfFnqvkytvqsgfakdaslri
d5dl7a-  ( 340 )    Ll----------------qygdqrFkEdSlEfdlgykipegklkglgmra
d5dl8a-  ( 335 )    aa----------------n--gekNhEtEsnvilnyafqqpllkgfalqy
                                            bbbbbbbbbbbbb         bbbb

                             460       470       480 
d3sy7a1  ( 391 )    rqAwHrAn---adQgegdqnEfRlivdyplsil
d3syba-  ( 430 )    tymmH-As---qnQidgsvnelrlvstfpfnll
d3szva1  ( 358 )    rnAtvrSnfa-------dldEnrlilsyslalw
d5dl5a1  ( 383 )    rnSyYrAsdaYqgayigdTnEwRiFldipvklf
d5dl7a-  ( 374 )    rfShYrN-dMptnMtfhsAnEtRlnvdytfk-f
d5dl8a-  ( 367 )    irIdynVkhg------ndFgEdrlFvnytkk-f
                    bbbbbbb           bbbbbbbbbbbbb
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
OprD porin (OccD1)OccD-like (OprD-like)Pseudomonas aeruginosa [TaxId: 287]view
OpdP porin (OccD3)OccD-like (OprD-like)Pseudomonas aeruginosa [TaxId: 287]view
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No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480
- - - - - - - - - - - - - - - - D A F V S D Q A E A - G F I E D S S L D L L L R N Y Y F N R D - - - - - - - - - D R V D W T Q G F L T T Y E S G F T Q G - - - - - - - T V G F G V D A F G Y L G L K L D G T D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D Y S R A - G G A V K V R I S K T M L K W G E M Q P T A P V F A A G G S R L F P Q T A T G V Q L Q S S E F E G L D L E A G H F T - - - - - - - - - - - E L Y A T Y A - G - - - - - - E T A S A D F I G G R Y A I T D N L S A S L Y G A E L E D I Y R Q Y Y L N S N Y T I P L A S D Q S L G F D F N I Y R T N D E G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A K A G D I S N T T W S L A A A Y T L D A H T F T L A Y Q K V H G D Q P F D Y I G F G G A G G D S I F L A N S V Q Y S D F N G P G E - S W Q A R Y D L N L A S Y G - - - - - V P G L T F M V R Y I N G K D I D G T M S D - - - - - N N V G Y K N Y G Y G E - D G K H H E T N L E A K Y V V Q S G P - A D L S F R I R Q A W H R A N - - - A D Q G E G D Q N E F R L I V D Y P L S I L
P A P D N P S Y A A E V Q S I P S V A P I G Q A G A T G L V E G Q S L T L T T R N F Y S R E N - - - - - - - - - - - N A W V Q G T V L K Y S S G Y T Q G - - - - - - - T V G F G F D V A A F N E I A - - - - G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E W S K L G V A N I R L R A S N T E F K A G R F L V N T P V F S Y I D N R A L P S S F T G F A V T S E E L D N L S L Q A G S F K - V S P R T G S G D E D M T T E Y G T R - - - - - - Q V G D L N Y L G G N Y - P L D G L E I S L Y G S H F Q D V W N Q Y Y L G V T H D I G L E N G I A L R T A F N G Y H T G D T G - - - - - - - - - - - - - - - - - - A R E A G Y I D N D T W S L A F T L G H R A H A L T L A Y Q Q V D G N E Y F D Y V H E T S A - - - - I F L A N S M L - A D Y N S P N E K S A Q I R Y E T D W S Y Y G - - - - - V P G L S T G V W Y V - G W D I D G T H Y D G D R N G A Y G N Y A E V R A Q D - G E K H H E L G L M A A Y K V Q N G P I K D S T F K L T Y M M H - A S - - - Q N Q I D G S V N E L R L V S T F P F N L L
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D L V E D S H A S L E L R N F Y F N R D F R - - - - - - - - - - D W A Q G F L L R L E S G F S E G - - - - - - - T V G F G V D A I G L L G F K L D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - D D Y A K L - G L T A K A R V S N S L L K V G A L H F K S P L V S A N D - T L L P E L F R G A L L D V Q E I D G L T L R G A H L D R N K L N S S S D Y Q V F S A N R - - - - I G - - - G S D A F D F A G G D Y R L T P A L T A S L H Q G R L K D I Y R Q T F A G L V H T L D L - - - - G S L K S D L R F A A S E D G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G F R E L D N R A F G A L F S L R L G A H A V - A G Y Q - I S G D D P Y P Y I A - - G S D - P - - Y L V N F I Q I G D F G N V D E R S W Q L R Y D Y D F G A L G - - - - - L P G L S F M S R Y V S G D N V A R G - - - - - - - - - - - - - - - - A - - A N D G K E W E R N T D L G Y V V Q S G P L K N L G V K W R N A T V R S N F A - - - - - - - D L D E N R L I L S Y S L A L W
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - I A D S K A E L T L R N F Y F D R D Y K K D P Y P Y T A A R D W A Q G L I F K G Q S G Y T E G - - - - - - - T V G F G V D V L A M A G F N L M - G S R A D D Y A R S G L L P V N T - D N S R D D Y Y G K I - G I T G K A K F R K N E L F V G D L V P Q L P T I F S S P A R L F P Q T Y R G I R F V S N E I P N L Q L E G F Y V D E V R Q R D S I R Y T D V G T D N I N H R F N K A A T T D S F Y T L G G S Y Q L - K D Y R L R A Y H A E L K D I Y Q Q Q F L G F N G K Q P L N D Q L N F L S D V R F F N S E E T G - - - - - - - - - - - - - - - - - - S K K I G E V D N R H I S G L F G L N Y Q N H T V S L G Y M Q S F G S T G L P F L - - - - S G - T E S P V V L D F M S S D Y S N K D E K V Y S I R Y E Y D F K N A R I G D V S L N G L R F M T R Y A K G E D I D L L - - - - - - - - - - - - - - - - Q Y G D Q R F K E D S L E F D L G Y K I P E G K L K G L G M R A R F S H Y R N - D M P T N M T F H S A N E T R L N V D Y T F K - F
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Member Chain UniProtKB GO term
 
Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in