BASE   PART 1   PART 2  
Superfamily : 102405 [ MCP/YpsA-like ]
Class : Alpha and beta proteins (a/b)
Fold : MCP/YpsA-like
# of Members : 11
Superposed Structure
solvent inaccessible: UPPER CASE X
solvent accesible: lower case x
alpha helix: red x
beta strand: blue x
3 - 10 helix: maroon x
hydrogen bond to main chain amide: bold x
hydrogen bond to mainchain carbonyl: underline x
disulphide bond: cedilla
positive phi: italic x
 
                             10        20        30        40        50  
d1rcua-  (   2 )                                                      
d1t35a-  (   2 )                                                      
d1weha-  (   2 )                                                      
d2nx2a1  (   2 )                                                      
d2q4oa-  (   9 )                          q---------------------------
d3bq9a2  ( 139 )                         rp---------------------------
d3imka1  (   3 )                                                      
d3quaa-  (  16 )                                                      
d3uqza2  (  72 )                                                      
d5wq3a-  (  42 )    wkhadpwrvlriqsefvaGfdaL---------------------------
d6bcoa1  (  12 )                          pkifrkkvcttfittekpTdAYGdLdFt
                                                                      

                             60        70        80        90        100 
d1rcua-  (   2 )                                            kkVVVVGysg
d1t35a-  (   2 )                                            kticvfagsn
d1weha-  (   2 )                                            rlLAVFvssr
d2nx2a1  (   2 )                                            kvLAITGYkp
d2q4oa-  (  10 )    ------------------------------------kSkFrrICVfcgss
d3bq9a2  ( 141 )    ------------------------------------qeePnMVVCWGghs
d3imka1  (   3 )                                                      
d3quaa-  (  16 )                                          rqwAVCVYCAsg
d3uqza2  (  72 )         psFsilddcYpwdLseIydaPvlLfykgnldLLkfpkVAVVGsra
d5wq3a-  (  65 )    ------------------------------------heMpkAVTVfGsar
d6bcoa1  (  83 )    ysgrkhsnFLrLSdrtdpatVyslVtr------sWgfraPnlVVSVlGgs
                                                             bbbbb    

                             110       120       130       140       150 
d1rcua-  (  12 )    pv------nkspVselrdiCleLGrtLAkkg-ylVfngGr-dGV-eLVSq
d1t35a-  (  12 )    pg---------gneaykrkaaeLGvy-Aeqg-igLVyggsrvGL-gtiAd
d1weha-  (  12 )    ls------ped---plyarWvrYGeVLAeeg-FgLAcgGY-qGG-eALAr
d2nx2a1  (  12 )    felgifkqddkaLyyIkkaIknrLiafLdegLewILISGq-lGVELWAAe
d2q4oa-  (  24 )    qg---------kkssyqdaAvdLGneLvsrn-IdLVygggsiGL-glVSq
d3bq9a2  ( 155 )    In------e-----ieykYTkdVGyhIGlrg-LnICTGCG-pgAmkGPMk
d3imka1  (   3 )                                epaItkIISGGq-tGAdraALd
d3quaa-  (  28 )    pt----------hpeLleLAaeVGssIAarg-wtLVSgGGnvSAMgaVAq
d3uqza2  ( 117 )    cs-----------kqgaksVekVIqgL--eneLVIVSGLa-kgIDtaAHA
d5wq3a-  (  79 )    ik------edh---pyYkaGveLGekLvaad-YAVVTGGg-pGLmeAPNk
d6bcoa1  ( 127 )    gg------pvlqtwLqdlLrrgLVraAqstg-AWIVTgGlhtgiGrHVGv
                                  aaaaaaaaaaaaaa     bbbb         aaaa

                             160       170       180       190       200 
d1rcua-  (  54 )    GVreag--------gtVvGILPd-----eeaGNp---yLsvavktgldf-
d1t35a-  (  52 )    aI-eng--------gtaiGV-psglfsgev-vhq---nLtelievngh--
d1weha-  (  51 )    GVkakg--------glVvGVTApaffperrgpNp---fVdlelpAatlp-
d2nx2a1  (  61 )    AAyd---lqeeypdLkVaVitPFyeqe---------knwk-------epn
d2q4oa-  (  64 )    aVhdgg--------rhVIGIipkt-------------lvgevravadh--
d3bq9a2  ( 192 )    gAtiGHakqrv-eggrylGLTepgiiaae-ppnp---iVnelvilpdie-
d3imka1  (  25 )    fAik---h-----hipyGGwVPkgRlAeggrVpetyqLqep-----tsdy
d3quaa-  (  67 )    aArakg--------ghTVGVIPkalvhrel-aDv---dAaelivtdtm--
d3uqza2  ( 154 )    Alqn---------ggkTIAVIGTG-ld---------vfyp-------kan
d5wq3a-  ( 118 )    gAsean-------glSVGLgielph-----hlnp---yVdlglnFryff-
d6bcoa1  ( 170 )    AVrdhqtastgsskVvAMGvApWGvVrnrdmLinpkgsfparYrwrgdpe
                    aaaa            bbbb                     b        

                             210       220       230       240       250 
d1rcua-  (  87 )    -qrSfvLLrnAdVVVSIGGe------igTaieIlgAYal-----------
d1t35a-  (  89 )    -erkaks-elAdgfIS-pgg------fgTyeelfevlcwaqig------i
d1weha-  (  89 )    -qrigrLldlGaGYLALpgg------vgTlaeLvlAwnllylr---rg--
d2nx2a1  (  92 )    keqYeaVlaqAdyeaSlth-rpyesplQfkqKnqfFIdkS----------
d2q4oa-  ( 101 )    -qrkaea-khSdAFIALPgg------ygTleeLleVitwaqlg------i
d3bq9a2  ( 236 )    -kRLeaFVrcAhGIVIFPgg------agTaeeLlyLLgiLmhp---dNqr
d3imka1  (  63 )    skrtekNVldSdGTLIISh-g----ilggsalTeffAeqy----------
d3quaa-  ( 103 )    -rRkreMehrSdAFIALPGg------igTleeFfeawtagylg------m
d3uqza2  ( 178 )    krlQdyIGndHLVLSeygp-geqplkfHfpaRnrIIaGLC----------
d5wq3a-  ( 154 )    -ArktMFlkySqAFVCLPGg------fgTldELfeVlcmvq-----tgkv
d6bcoa1  ( 220 )    dgvefpLDynYsAFFLVDdGtygrlggenrFrlrFEsyVaqqktgvggtg
                     aaaaaaa    bbbb          aaaaaaaaaaaaa           

                             260       270       280       290       300 
d1rcua-  ( 120 )    -gkpVILLr--gTggwTdrISqvLidgkyLdnrrive--IhqAw---tVe
d1t35a-  ( 126 )    hqkpIglYnVngyFep---kvkysiqegfsneshlkl--ihsss---rPd
d1weha-  ( 127 )    vGrpLAVd--pyWlgllkah-------geiapedvgl--LrvVa---dee
d2nx2a1  ( 131 )    --dGLLLLYdpekegsPkyMlgtAekrreq---dg---YpIyfIt-----
d2q4oa-  ( 138 )    hdkpVGLLnVdgyYnsllsfidkaveegfisptarei--IvsAp---tAk
d3bq9a2  ( 276 )    QsLpVILTGpasSrdyFealdefIga--tigdeArql--YkiiId--dpa
d3imka1  ( 100 )    --kpclhIdLdr--isiedAAtlInswTvs---hhIqvLNIaGpragkdp
d3quaa-  ( 141 )    hdkpLILLDpfghYdglLtwLrglvptgyvsqramds--Lvvvd---nv-
d3uqza2  ( 217 )    --rGVIVAeAk------rsgslitCerAee----g---rdvFAipgsild
d5wq3a-  ( 192 )    tnFpIVLIgtefWaglvdwIrhrlveegmidekdVdr--M-lvtd--dld
d6bcoa1  ( 270 )    idIpVLLLLIdG-dekmLkRIedAtqa--------qL--pcLLVagsggA
                        bbbb         aaaaaa                 bbb       

                             310       320       330       340       350 
d1rcua-  ( 162 )    eAVqiIeqi                                         
d1t35a-  ( 171 )    eLieqqny                                          
d1weha-  ( 163 )    dLrrFLrsl                                         
d2nx2a1  ( 168 )    --mddlrvtvee                                      
d2q4oa-  ( 183 )    eLVkkLee                                          
d3bq9a2  ( 320 )    aVAqhMhagmaaVkqyRrdsgDayyfNwtL                    
d3imka1  ( 143 )    eIyqaTdLLevFla                                    
d3quaa-  ( 186 )    aALeaCap                                          
d3uqza2  ( 254 )    glSdgChhliqega-------klVtsGqdVlaeFef              
d5wq3a-  ( 237 )    qAvkfIvdaha---------g--------l                    
d6bcoa1  ( 309 )    aDClvetleeardriRryfpkgdpevLqaqverImtrkeLltvYssedgs
                     aaaaaa                                           

                             360     
d1rcua-                              
d1t35a-                              
d1weha-                              
d2nx2a1                              
d2q4oa-                              
d3bq9a2                              
d3imka1                              
d3quaa-                              
d3uqza2                              
d5wq3a-                              
d6bcoa1  ( 372 )    eeFetIvlrAlvkacgs
 

 

Domain IDNameFamilySourceDomainSTRING-DB
Hypothetical protein TM1055MoCo carrier protein-likeThermotoga maritima [TaxId: 2336]view
Hypothetical protein YvdDMoCo carrier protein-likeBacillus subtilis [TaxId: 1423]view
Hypothetical protein TT1887 (TTHA0294)MoCo carrier protein-likeThermus thermophilus [TaxId: 274]view
Hypothetical protein YpsAYpsA-likeBacillus subtilis [TaxId: 1423]view
Hypothetical protein At2g37210/T2N18.3MoCo carrier protein-likeThale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]view
automated matchesautomated matchesIdiomarina baltica [TaxId: 314276]view
Putative molybdenum carrier protein (YP_461806.1)Circularly perumited SLOG domainSyntrophus aciditrophicus SB [TaxId: 56780]view
automated matchesautomated matchesMycobacterium smegmatis [TaxId: 246196]view
DNA processing protein A (DprA)SLOG domain from DNA-Processing proteinsPneumococcus (Streptococcus pneumoniae) [TaxId: 1313]view
automated matchesautomated matchesCorynebacterium glutamicum [TaxId: 1718]view
Calcium-activated non-selective cation channel TRPM4SMF/DprA-LOG (SLOG) domain from TPRM channelsMouse (Mus musculus) [TaxId: 10090]view

 

No outliers

FeatureDownload
Superfamily
Distance Matrix
Conserved Interactions
Cusp Results
Alistat - Alignment Statistics
SMotif - Conserved Structural Motifs
MeanRMS
PCSSE Details
Absolutely Conserved Residues
Highly Conserved Residues

 

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K K V V V V G Y S G P V - - - - - - N K S P V S E L R D I C L E L G R T L A K K G - Y L V F N G G R - D G V - E L V S Q G V R E A G - - - - - - - - G T V V G I L P D - - - - - E E A G N P - - - Y L S V A V K T G L D F - - Q R S F V L L R N A D V V V S I G G E - - - - - - I G T A I E I L G A Y A L - - - - - - - - - - - - G K P V I L L R - - G T G G W T D R I S Q V L I D G K Y L D N R R I V E - - I H Q A W - - - T V E E A V Q I I E Q I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K T I C V F A G S N P G - - - - - - - - - G N E A Y K R K A A E L G V Y - A E Q G - I G L V Y G G S R V G L - G T I A D A I - E N G - - - - - - - - G T A I G V - P S G L F S G E V - V H Q - - - N L T E L I E V N G H - - - E R K A K S - E L A D G F I S - P G G - - - - - - F G T Y E E L F E V L C W A Q I G - - - - - - I H Q K P I G L Y N V N G Y F E P - - - K V K Y S I Q E G F S N E S H L K L - - I H S S S - - - R P D E L I E Q Q N Y - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R L L A V F V S S R L S - - - - - - P E D - - - P L Y A R W V R Y G E V L A E E G - F G L A C G G Y - Q G G - E A L A R G V K A K G - - - - - - - - G L V V G V T A P A F F P E R R G P N P - - - F V D L E L P A A T L P - - Q R I G R L L D L G A G Y L A L P G G - - - - - - V G T L A E L V L A W N L L Y L R - - - R G - - V G R P L A V D - - P Y W L G L L K A H - - - - - - - G E I A P E D V G L - - L R V V A - - - D E E D L R R F L R S L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - K V L A I T G Y K P F E L G I F K Q D D K A L Y Y I K K A I K N R L I A F L D E G L E W I L I S G Q - L G V E L W A A E A A Y D - - - L Q E E Y P D L K V A V I T P F Y E Q E - - - - - - - - - K N W K - - - - - - - E P N K E Q Y E A V L A Q A D Y E A S L T H - R P Y E S P L Q F K Q K N Q F F I D K S - - - - - - - - - - - - D G L L L L Y D P E K E G S P K Y M L G T A E K R R E Q - - - D G - - - Y P I Y F I T - - - - - - - M D D L R V T V E E - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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W K H A D P W R V L R I Q S E F V A G F D A L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H E M P K A V T V F G S A R I K - - - - - - E D H - - - P Y Y K A G V E L G E K L V A A D - Y A V V T G G G - P G L M E A P N K G A S E A N - - - - - - - G L S V G L G I E L P H - - - - - H L N P - - - Y V D L G L N F R Y F F - - A R K T M F L K Y S Q A F V C L P G G - - - - - - F G T L D E L F E V L C M V Q - - - - - T G K V T N F P I V L I G T E F W A G L V D W I R H R L V E E G M I D E K D V D R - - M - L V T D - - D L D Q A V K F I V D A H A - - - - - - - - - G - - - - - - - - L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Contact: Prof. R. Sowdhamini - mini@ncbs.res.in