Pfam Domains mapped on to the structure: 1W44
No.
Chain ID
Pfam ID
Pfam Description
Linkout - Pfam
Linkout - CDD
1
A
PF11602
ATPase P4 of dsRNA bacteriophage phi-12
PF11602
PF11602
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1W44
Structural Details of PDB entry 1W44
Structural Details of PDB entry 1W44
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1W44
A,C,B
A:88-124,C:88-124,B:88-124
A:1-87,C:1-87,B:1-87
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 ,
B
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 , 145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 175 , 291 , 293 ,
C
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 , 145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 175 , 291 , 293 ,
D
145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 175 , 291 , 293 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 135 , 137 , 138 , 141 , 145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 167 , 168 , 171 , 175 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 291 , 292 , 293 , 309 , 310 , 311 , 314 , 321 ,
B
95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 135 , 137 , 138 , 141 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 166 , 167 , 168 , 171 , 174 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 212 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 247 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 292 , 309 , 310 , 311 , 314 , 321 ,
C
95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 137 , 138 , 141 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 166 , 167 , 168 , 171 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 212 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 292 , 309 , 310 , 311 , 314 , 321 ,
D
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 , 95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 135 , 137 , 138 , 141 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 167 , 168 , 171 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 292 , 309 , 310 , 311 , 314 , 321 ,
E
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 , 95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 135 , 137 , 138 , 141 , 145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 166 , 167 , 168 , 171 , 174 , 175 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 212 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 247 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 291 , 292 , 293 , 309 , 310 , 311 , 314 , 321 ,
F
1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 14 , 15 , 18 , 52 , 64 , 75 , 78 , 79 , 80 , 81 , 95 , 96 , 103 , 107 , 108 , 109 , 132 , 133 , 137 , 138 , 141 , 145 , 152 , 153 , 154 , 155 , 157 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 164 , 165 , 166 , 167 , 168 , 171 , 175 , 178 , 179 , 183 , 192 , 193 , 209 , 212 , 216 , 217 , 219 , 220 , 223 , 224 , 234 , 236 , 237 , 238 , 239 , 242 , 244 , 248 , 251 , 252 , 253 , 255 , 272 , 274 , 275 , 276 , 277 , 278 , 291 , 292 , 293 , 309 , 310 , 311 , 314 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is reprented using light color and cartoon reprentation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
C No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: