Pfam Domains mapped on to the structure: 1P80
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1P80
Structural Details of PDB entry 1P80
Structural Details of PDB entry 1P80
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1P80
A,B
A:120-130,B:120-130
A:27-119,B:27-119
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 35 , 36 , 37 , 46 , 49 , 50 , 51 , 52 , 54 , 55 , 70 , 71 , 72 , 73 , 74 , 75 , 76 , 77 , 78 , 79 , 80 , 81 , 83 , 84 , 85 , 86 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 92 , 93 , 94 , 95 , 96 , 97 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 108 , 109 , 110 , 111 , 112 , 113 , 114 , 115 , 116 , 117 , 118 , 119 ,
B
27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 35 , 36 , 37 , 46 , 49 , 50 , 51 , 52 , 54 , 55 , 70 , 71 , 72 , 73 , 74 , 75 , 76 , 77 , 78 , 79 , 80 , 81 , 83 , 84 , 85 , 86 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 92 , 93 , 94 , 95 , 96 , 97 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 108 , 109 , 110 , 111 , 112 , 113 , 114 , 115 , 116 , 117 , 118 , 119 ,
C
126 , 193 , 194 , 195 , 210 , 212 , 213 , 215 , 226 , 394 , 404 , 406 , 409 , 412 , 413 , 414 , 417 , 418 , 421 , 426 , 429 , 436 , 438 , 439 , 440 , 441 , 442 , 444 , 447 , 451 , 452 , 453 , 454 , 455 , 456 , 457 , 462 , 463 , 464 , 465 , 467 , 468 , 469 , 470 , 471 , 472 , 473 , 475 , 480 , 481 , 482 , 489 , 490 , 491 , 492 , 493 , 494 , 495 , 496 , 497 , 498 , 535 , 536 ,
D
126 , 193 , 194 , 195 , 210 , 212 , 213 , 215 , 226 , 245 , 394 , 404 , 406 , 409 , 412 , 413 , 414 , 417 , 418 , 421 , 426 , 429 , 436 , 438 , 439 , 440 , 441 , 442 , 444 , 447 , 451 , 452 , 453 , 454 , 455 , 456 , 457 , 463 , 464 , 465 , 467 , 468 , 469 , 470 , 471 , 472 , 473 , 475 , 480 , 481 , 482 , 489 , 490 , 491 , 492 , 493 , 494 , 495 , 496 , 497 , 498 , 535 , 536 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
120 , 121 , 122 , 123 , 124 , 126 , 172 , 174 , 175 , 193 , 194 , 195 , 210 , 211 , 212 , 213 , 214 , 215 , 216 , 219 , 220 , 222 , 225 , 226 , 227 , 228 , 229 , 230 , 231 , 238 , 241 , 242 , 245 , 246 , 305 , 308 , 309 , 311 , 312 , 313 , 315 , 316 , 319 , 320 , 323 , 346 , 347 , 352 , 354 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 388 , 394 , 395 , 396 , 398 , 402 , 404 , 406 , 409 , 410 , 412 , 413 , 414 , 416 , 417 , 418 , 420 , 421 , 423 , 424 , 426 , 427 , 429 , 431 , 432 , 436 , 438 , 439 , 440 , 441 , 442 , 443 , 444 , 445 , 446 , 447 , 448 , 449 , 450 , 451 , 452 , 453 , 454 , 455 , 456 , 457 , 459 , 460 , 461 , 462 , 463 , 464 , 465 , 466 , 467 , 468 , 469 , 470 , 471 , 472 , 473 , 475 , 479 , 480 , 481 , 482 , 484 , 486 , 487 , 488 , 489 , 490 , 491 , 492 , 493 , 494 , 495 , 496 , 497 , 498 , 499 , 529 , 532 , 533 , 535 , 536 , 537 , 538 , 540 , 542 , 560 , 561 , 562 , 563 , 636 , 637 , 638 , 652 , 653 , 655 , 656 , 677 , 679 , 680 , 683 , 686 , 690 , 749 , 750 , 752 ,
B
120 , 121 , 122 , 123 , 124 , 126 , 172 , 174 , 175 , 193 , 194 , 195 , 210 , 211 , 212 , 213 , 214 , 215 , 216 , 219 , 220 , 222 , 225 , 226 , 227 , 228 , 229 , 230 , 231 , 238 , 241 , 242 , 245 , 246 , 305 , 308 , 309 , 311 , 312 , 313 , 315 , 316 , 319 , 320 , 323 , 346 , 347 , 352 , 354 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 388 , 394 , 395 , 396 , 398 , 402 , 404 , 406 , 409 , 410 , 412 , 413 , 414 , 416 , 417 , 418 , 420 , 421 , 423 , 424 , 426 , 429 , 431 , 432 , 436 , 438 , 439 , 440 , 441 , 442 , 443 , 444 , 445 , 446 , 447 , 448 , 449 , 450 , 451 , 452 , 453 , 454 , 455 , 456 , 457 , 459 , 460 , 461 , 462 , 463 , 464 , 465 , 466 , 467 , 468 , 469 , 470 , 471 , 472 , 473 , 475 , 479 , 480 , 481 , 482 , 484 , 486 , 487 , 488 , 489 , 490 , 491 , 492 , 493 , 494 , 495 , 496 , 497 , 498 , 499 , 529 , 532 , 533 , 535 , 536 , 537 , 538 , 540 , 542 , 560 , 561 , 562 , 563 , 636 , 637 , 638 , 652 , 653 , 655 , 656 , 677 , 679 , 680 , 682 , 683 , 686 , 690 , 749 , 750 , 752 , 753 ,
C
27 , 29 , 30 , 31 , 35 , 36 , 37 , 46 , 49 , 50 , 51 , 52 , 54 , 55 , 70 , 71 , 72 , 73 , 74 , 75 , 76 , 77 , 78 , 79 , 80 , 81 , 83 , 84 , 85 , 86 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 92 , 93 , 94 , 95 , 96 , 97 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 108 , 109 , 110 , 111 , 112 , 113 , 114 , 115 , 116 , 117 , 118 , 119 , 120 , 121 , 122 , 123 , 124 , 172 , 174 , 175 , 211 , 214 , 216 , 219 , 220 , 222 , 225 , 227 , 228 , 229 , 230 , 231 , 238 , 241 , 242 , 245 , 246 , 305 , 308 , 309 , 311 , 312 , 313 , 315 , 316 , 319 , 320 , 323 , 346 , 347 , 352 , 354 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 388 , 395 , 396 , 398 , 402 , 410 , 416 , 420 , 423 , 424 , 427 , 431 , 432 , 443 , 445 , 446 , 448 , 449 , 450 , 459 , 460 , 461 , 466 , 479 , 484 , 486 , 487 , 488 , 499 , 529 , 532 , 533 , 537 , 538 , 540 , 542 , 560 , 561 , 562 , 563 , 636 , 637 , 638 , 653 , 655 , 656 , 677 , 679 , 680 , 682 , 683 , 686 , 690 , 749 , 750 , 752 , 753 ,
D
27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 35 , 36 , 37 , 46 , 49 , 50 , 51 , 52 , 54 , 55 , 70 , 71 , 72 , 73 , 74 , 75 , 76 , 77 , 78 , 79 , 80 , 81 , 83 , 84 , 85 , 86 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 92 , 93 , 94 , 95 , 96 , 97 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 108 , 109 , 110 , 111 , 112 , 113 , 114 , 115 , 116 , 117 , 118 , 119 , 120 , 121 , 122 , 123 , 124 , 172 , 174 , 175 , 211 , 214 , 216 , 219 , 220 , 222 , 225 , 227 , 228 , 229 , 230 , 231 , 238 , 241 , 242 , 246 , 305 , 308 , 309 , 311 , 312 , 313 , 315 , 316 , 319 , 320 , 323 , 346 , 347 , 352 , 354 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 388 , 395 , 396 , 398 , 402 , 410 , 416 , 420 , 423 , 424 , 427 , 431 , 432 , 443 , 445 , 446 , 448 , 449 , 450 , 459 , 460 , 461 , 462 , 466 , 479 , 484 , 486 , 487 , 488 , 499 , 529 , 532 , 533 , 538 , 540 , 542 , 560 , 561 , 562 , 563 , 636 , 637 , 638 , 652 , 653 , 655 , 656 , 677 , 679 , 680 , 682 , 683 , 686 , 690 , 750 , 752 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: