Pfam Domains mapped on to the structure: 1MLV
No.
Chain ID
Pfam ID
Pfam Description
Linkout - Pfam
Linkout - CDD
1
A
PF00856
SET domain
PF00856
PF00856
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1MLV
Structural Details of PDB entry 1MLV
Structural Details of PDB entry 1MLV
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1MLV
A,C,B
A:459-464,C:459-464,B:459-464
A:465-486,C:465-487,B:465-488
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
123 , 124 , 172 , 175 , 176 , 180 , 313 , 314 , 315 , 316 , 342 , 395 , 399 , 403 , 407 , 465 , 466 , 468 , 469 , 470 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 ,
B
123 , 172 , 175 , 176 , 180 , 313 , 314 , 315 , 316 , 342 , 365 , 395 , 399 , 403 , 407 , 465 , 466 , 468 , 469 , 470 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 , 487 , 488 ,
C
123 , 172 , 175 , 176 , 180 , 313 , 314 , 315 , 316 , 342 , 365 , 399 , 403 , 407 , 465 , 466 , 468 , 469 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 , 487 ,
D
260 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
118 , 120 , 121 , 122 , 125 , 179 , 183 , 190 , 194 , 220 , 295 , 298 , 312 , 317 , 319 , 320 , 322 , 323 , 329 , 333 , 336 , 338 , 339 , 340 , 344 , 359 , 362 , 363 , 365 , 366 , 367 , 370 , 375 , 376 , 398 , 400 , 402 ,
B
70 , 72 , 88 , 91 , 93 , 94 , 95 , 124 , 125 , 179 , 183 , 216 , 220 , 229 , 231 , 256 , 257 , 258 , 259 , 260 , 261 , 262 , 263 , 264 , 265 , 267 , 268 , 295 , 312 , 317 , 322 , 323 , 324 , 344 , 362 , 363 , 366 , 367 , 375 , 398 , 400 ,
C
125 , 179 , 183 , 216 , 220 , 295 , 312 , 317 , 321 , 322 , 323 , 324 , 344 , 359 , 362 , 363 , 366 , 367 , 370 , 375 , 376 , 395 , 398 , 400 , 402 , 464 ,
D
70 , 72 , 88 , 91 , 93 , 94 , 95 , 123 , 124 , 125 , 172 , 175 , 176 , 179 , 180 , 183 , 216 , 220 , 229 , 231 , 256 , 257 , 258 , 259 , 261 , 262 , 263 , 264 , 265 , 267 , 268 , 295 , 312 , 313 , 314 , 315 , 316 , 317 , 322 , 323 , 324 , 342 , 344 , 362 , 363 , 365 , 366 , 367 , 375 , 395 , 398 , 399 , 400 , 403 , 407 , 465 , 466 , 468 , 469 , 470 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 , 487 , 488 ,
E
118 , 120 , 121 , 122 , 123 , 124 , 125 , 172 , 175 , 176 , 179 , 180 , 183 , 190 , 194 , 220 , 295 , 298 , 312 , 313 , 314 , 315 , 316 , 317 , 319 , 320 , 322 , 323 , 329 , 333 , 336 , 338 , 339 , 340 , 342 , 344 , 359 , 362 , 363 , 365 , 366 , 367 , 370 , 375 , 376 , 395 , 398 , 399 , 400 , 402 , 403 , 407 , 465 , 466 , 468 , 469 , 470 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 ,
F
123 , 125 , 172 , 175 , 176 , 179 , 180 , 183 , 216 , 220 , 295 , 312 , 313 , 314 , 315 , 316 , 317 , 321 , 322 , 323 , 324 , 342 , 344 , 359 , 362 , 363 , 365 , 366 , 367 , 370 , 375 , 376 , 395 , 398 , 399 , 400 , 402 , 403 , 407 , 464 , 465 , 466 , 468 , 469 , 472 , 473 , 474 , 475 , 476 , 477 , 478 , 479 , 480 , 481 , 482 , 483 , 485 , 486 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
C No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: