Pfam Domains mapped on to the structure: 1M85
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1M85
Structural Details of PDB entry 1M85
Structural Details of PDB entry 1M85
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1M85
A,B
A:400-409,B:400-409
A:410-479,B:410-479
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
410 , 411 , 412 , 451 , 479 ,
B
410 , 411 , 412 , 451 , 479 ,
C
19 , 21 , 22 , 25 ,
D
19 , 21 , 22 , 25 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 52 , 56 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 105 , 119 , 120 , 121 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 142 , 145 , 146 , 149 , 151 , 152 , 153 , 154 , 155 , 160 , 163 , 164 , 167 , 168 , 230 , 233 , 234 , 235 , 237 , 238 , 241 , 242 , 245 , 268 , 274 , 276 , 300 , 301 , 302 , 303 , 304 , 305 , 306 , 310 , 316 , 317 , 318 , 320 , 324 , 326 , 328 , 331 , 332 , 334 , 335 , 336 , 339 , 340 , 342 , 343 , 345 , 346 , 347 , 348 , 350 , 351 , 352 , 353 , 357 , 362 , 363 , 364 , 365 , 366 , 367 , 368 , 369 , 370 , 371 , 372 , 374 , 375 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 396 , 397 , 398 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 ,
B
4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 52 , 56 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 105 , 119 , 120 , 121 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 142 , 145 , 146 , 149 , 151 , 152 , 153 , 154 , 155 , 160 , 163 , 164 , 167 , 168 , 230 , 233 , 234 , 235 , 237 , 238 , 241 , 242 , 245 , 268 , 274 , 276 , 300 , 301 , 302 , 303 , 304 , 305 , 306 , 310 , 316 , 317 , 318 , 320 , 324 , 326 , 328 , 331 , 332 , 334 , 335 , 336 , 339 , 340 , 342 , 343 , 345 , 346 , 347 , 348 , 350 , 351 , 352 , 353 , 357 , 362 , 363 , 364 , 365 , 366 , 367 , 368 , 369 , 370 , 371 , 372 , 374 , 375 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 396 , 397 , 398 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 ,
C
4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 20 , 23 , 24 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 52 , 56 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 105 , 119 , 120 , 121 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 142 , 145 , 146 , 149 , 151 , 152 , 153 , 154 , 155 , 160 , 163 , 164 , 167 , 168 , 230 , 233 , 234 , 235 , 237 , 238 , 241 , 242 , 245 , 268 , 274 , 276 , 300 , 301 , 302 , 303 , 304 , 305 , 306 , 310 , 316 , 317 , 318 , 320 , 324 , 326 , 328 , 331 , 332 , 334 , 335 , 336 , 339 , 340 , 342 , 343 , 345 , 346 , 347 , 348 , 350 , 351 , 352 , 353 , 357 , 362 , 363 , 364 , 365 , 366 , 367 , 368 , 369 , 370 , 371 , 372 , 374 , 375 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 396 , 397 , 398 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 , 410 , 411 , 412 , 451 , 479 ,
D
4 , 5 , 6 , 7 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 20 , 23 , 24 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 52 , 56 , 98 , 99 , 100 , 101 , 102 , 105 , 119 , 120 , 121 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 142 , 145 , 146 , 149 , 151 , 152 , 153 , 154 , 155 , 160 , 163 , 164 , 167 , 168 , 230 , 233 , 234 , 235 , 237 , 238 , 241 , 242 , 245 , 268 , 274 , 276 , 300 , 301 , 302 , 303 , 304 , 305 , 306 , 310 , 316 , 317 , 318 , 320 , 324 , 326 , 328 , 331 , 332 , 334 , 335 , 336 , 339 , 340 , 342 , 343 , 345 , 346 , 347 , 348 , 350 , 351 , 352 , 353 , 357 , 362 , 363 , 364 , 365 , 366 , 367 , 368 , 369 , 370 , 371 , 372 , 374 , 375 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 396 , 397 , 398 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 , 410 , 411 , 412 , 451 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: