Pfam Domains mapped on to the structure: 1L6W
No.
Chain ID
Pfam ID
Pfam Description
Linkout - Pfam
Linkout - CDD
1
A
PF00923
Transaldolase
PF00923
PF00923
Gene Ontology Annotations: 1L6W
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1L6W
Structural Details of PDB entry 1L6W
Structural Details of PDB entry 1L6W
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1L6W
F,A,J,E,B,H,C,D,I,G
F:195-196,A:196-198,J:195-196,E:196-198,B:196-198,H:195-196,C:196-198,D:196-198,I:195-196,G:195-196
F:197-220,A:199-220,J:197-220,E:199-220,B:199-220,H:197-220,C:199-220,D:199-220,I:197-220,G:197-220
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 138 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 219 , 220 ,
B
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 138 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 206 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
C
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 138 , 198 , 199 , 200 , 201 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 217 , 218 , 220 ,
D
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 138 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
E
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 62 , 71 , 74 , 110 , 112 , 138 , 198 , 199 , 200 , 201 , 202 , 203 , 204 , 206 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 219 , 220 ,
F
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 197 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 206 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
G
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 197 , 198 , 199 , 200 , 201 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
H
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 197 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 206 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 ,
I
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 110 , 112 , 197 , 198 , 199 , 200 , 201 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
J
29 , 30 , 33 , 36 , 61 , 71 , 110 , 112 , 197 , 198 , 199 , 200 , 202 , 203 , 204 , 207 , 208 , 210 , 211 , 214 , 215 , 218 , 220 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 139 , 140 , 141 , 148 , 151 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 , 197 ,
B
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 139 , 140 , 141 , 148 , 151 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 , 197 ,
C
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 139 , 140 , 141 , 148 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 181 , 193 , 194 , 195 , 197 ,
D
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 139 , 140 , 141 , 148 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 , 197 ,
E
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 75 , 78 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 139 , 140 , 141 , 148 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 , 197 ,
F
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 148 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 ,
G
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 148 , 151 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 ,
H
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 148 , 151 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 ,
I
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 71 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 148 , 151 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 181 , 193 , 194 , 195 ,
J
1 , 3 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 32 , 38 , 39 , 59 , 63 , 65 , 74 , 87 , 88 , 89 , 90 , 91 , 93 , 94 , 97 , 98 , 113 , 114 , 115 , 116 , 118 , 119 , 122 , 123 , 131 , 133 , 134 , 136 , 137 , 138 , 139 , 140 , 141 , 148 , 152 , 155 , 156 , 168 , 169 , 170 , 171 , 174 , 177 , 178 , 180 , 193 , 194 , 195 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
F No mutation No mutation No mutation No mutation
A No mutation No mutation No mutation No mutation
J No mutation No mutation No mutation No mutation
E No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
H No mutation No mutation No mutation No mutation
C No mutation No mutation No mutation No mutation
D No mutation No mutation No mutation No mutation
I No mutation No mutation No mutation No mutation
G No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: