Pfam Domains mapped on to the structure: 1KH3
No.
Chain ID
Pfam ID
Pfam Description
Linkout - Pfam
Linkout - CDD
1
A
PF00764
Arginosuccinate synthase
PF00764
PF00764
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1KH3
Structural Details of PDB entry 1KH3
Structural Details of PDB entry 1KH3
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1KH3
A,B
A:349-373,B:349-373
A:374-395,B:374-395
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
117 , 123 , 127 , 130 , 131 , 134 , 143 , 316 , 374 , 375 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 ,
B
117 , 123 , 127 , 130 , 131 , 134 , 143 , 316 , 374 , 375 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 ,
C
262 , 263 , 264 , 355 , 357 , 370 , 375 , 376 , 377 , 378 , 379 , 381 , 382 ,
D
262 , 263 , 264 , 355 , 357 , 370 , 371 , 374 , 375 , 376 , 377 , 378 , 379 , 381 , 382 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
81 , 82 , 83 , 116 , 118 , 122 , 126 , 142 , 189 , 191 , 192 , 194 , 206 , 207 , 213 , 215 , 217 , 253 , 255 , 257 , 259 , 260 , 261 , 262 , 263 , 264 , 265 , 266 , 267 , 280 , 283 , 287 , 288 , 290 , 291 , 292 , 293 , 294 , 295 , 296 , 297 , 299 , 300 , 301 , 303 , 304 , 307 , 311 , 313 , 317 , 318 , 320 , 321 , 322 , 324 , 325 , 328 , 338 , 340 , 342 , 343 , 344 , 345 , 347 , 348 , 349 , 350 , 351 , 352 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 370 , 371 , 373 ,
B
81 , 82 , 83 , 118 , 122 , 126 , 135 , 189 , 191 , 192 , 194 , 206 , 207 , 213 , 215 , 217 , 253 , 255 , 257 , 259 , 261 , 262 , 263 , 264 , 265 , 266 , 267 , 280 , 283 , 287 , 288 , 290 , 291 , 292 , 293 , 294 , 295 , 296 , 297 , 299 , 300 , 301 , 303 , 304 , 307 , 311 , 313 , 317 , 318 , 320 , 321 , 322 , 324 , 325 , 328 , 338 , 340 , 342 , 343 , 344 , 345 , 347 , 348 , 349 , 350 , 351 , 352 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 360 , 362 , 363 , 364 , 365 , 370 , 371 , 373 ,
C
81 , 82 , 83 , 116 , 117 , 118 , 122 , 123 , 126 , 127 , 130 , 131 , 134 , 135 , 142 , 143 , 149 , 189 , 191 , 192 , 194 , 206 , 207 , 213 , 215 , 217 , 253 , 255 , 257 , 259 , 260 , 261 , 265 , 266 , 267 , 280 , 283 , 287 , 288 , 290 , 291 , 292 , 293 , 294 , 295 , 296 , 297 , 299 , 300 , 301 , 303 , 304 , 307 , 311 , 313 , 316 , 317 , 318 , 320 , 321 , 322 , 324 , 325 , 328 , 338 , 340 , 342 , 343 , 344 , 345 , 347 , 348 , 349 , 350 , 351 , 352 , 356 , 358 , 359 , 360 , 362 , 363 , 364 , 365 , 371 , 373 , 374 , 380 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 ,
D
81 , 82 , 83 , 116 , 117 , 118 , 122 , 123 , 126 , 127 , 130 , 131 , 134 , 142 , 143 , 144 , 189 , 191 , 192 , 194 , 206 , 207 , 213 , 215 , 217 , 253 , 255 , 257 , 259 , 260 , 261 , 265 , 266 , 267 , 280 , 283 , 287 , 288 , 290 , 291 , 292 , 293 , 294 , 295 , 296 , 297 , 299 , 300 , 301 , 303 , 304 , 307 , 311 , 313 , 316 , 317 , 318 , 320 , 321 , 322 , 324 , 325 , 328 , 338 , 340 , 342 , 343 , 344 , 345 , 347 , 348 , 349 , 350 , 351 , 352 , 356 , 358 , 359 , 360 , 362 , 363 , 364 , 365 , 373 , 380 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: