Pfam Domains mapped on to the structure: 1F8M
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1F8M
Structural Details of PDB entry 1F8M
Structural Details of PDB entry 1F8M
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1F8M
A,D,C,B
A:346-348,D:346-348,C:346-348,B:346-348
A:349-384,D:349-384,C:349-384,B:349-384
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
75 , 76 , 79 , 80 , 83 , 84 , 85 , 320 , 329 , 330 , 333 , 349 , 351 , 352 , 353 , 354 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 360 , 361 , 362 , 363 , 365 , 366 , 369 , 370 , 371 , 373 , 374 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 383 , 388 , 390 ,
B
75 , 76 , 79 , 80 , 83 , 84 , 85 , 320 , 329 , 330 , 333 , 349 , 351 , 352 , 353 , 354 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 360 , 361 , 362 , 363 , 365 , 366 , 369 , 370 , 371 , 373 , 374 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 383 , 388 , 390 ,
C
75 , 76 , 79 , 80 , 83 , 84 , 85 , 320 , 329 , 330 , 333 , 349 , 351 , 352 , 353 , 354 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 360 , 361 , 362 , 363 , 365 , 366 , 369 , 370 , 371 , 373 , 374 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 383 , 388 , 390 ,
D
75 , 76 , 79 , 80 , 83 , 84 , 85 , 320 , 329 , 330 , 333 , 349 , 351 , 352 , 353 , 354 , 355 , 356 , 357 , 358 , 359 , 360 , 361 , 362 , 363 , 365 , 366 , 369 , 370 , 371 , 373 , 374 , 376 , 377 , 378 , 379 , 380 , 381 , 383 , 390 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
1 , 2 , 4 , 5 , 29 , 30 , 34 , 36 , 37 , 38 , 40 , 41 , 42 , 44 , 45 , 47 , 48 , 50 , 51 , 54 , 55 , 65 , 67 , 69 , 73 , 93 , 97 , 98 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 109 , 110 , 111 , 113 , 114 , 115 , 122 , 123 , 126 , 129 , 130 , 132 , 133 , 136 , 137 , 144 , 145 , 147 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 165 , 166 , 169 , 187 , 188 , 190 , 193 , 194 , 195 , 196 , 207 , 210 , 211 , 214 , 236 , 239 , 240 , 241 , 253 , 254 , 255 , 256 , 257 , 259 , 287 , 316 , 317 , 318 , 319 , 321 , 322 , 323 , 346 , 386 , 393 , 394 , 396 , 397 , 399 , 401 , 402 , 404 , 405 , 406 , 408 , 409 , 410 , 412 , 413 , 414 , 415 , 416 , 417 , 419 , 420 , 421 , 422 , 425 , 426 , 427 ,
B
1 , 2 , 4 , 5 , 29 , 30 , 34 , 36 , 37 , 38 , 40 , 41 , 42 , 44 , 45 , 47 , 48 , 50 , 51 , 54 , 55 , 58 , 65 , 67 , 69 , 73 , 93 , 97 , 98 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 109 , 110 , 111 , 113 , 114 , 115 , 122 , 123 , 126 , 127 , 129 , 130 , 132 , 133 , 136 , 137 , 145 , 147 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 165 , 166 , 169 , 185 , 187 , 188 , 190 , 193 , 194 , 195 , 196 , 207 , 210 , 211 , 214 , 236 , 239 , 240 , 241 , 253 , 254 , 255 , 256 , 257 , 259 , 260 , 287 , 316 , 317 , 318 , 319 , 321 , 322 , 323 , 346 , 386 , 393 , 394 , 396 , 397 , 399 , 401 , 402 , 404 , 405 , 406 , 408 , 409 , 410 , 412 , 414 , 415 , 416 , 417 , 419 , 420 , 421 , 422 , 425 , 426 , 427 ,
C
1 , 2 , 4 , 5 , 29 , 30 , 34 , 36 , 37 , 38 , 40 , 41 , 42 , 44 , 45 , 47 , 48 , 50 , 51 , 54 , 55 , 58 , 65 , 67 , 69 , 73 , 93 , 97 , 98 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 109 , 110 , 111 , 113 , 114 , 115 , 122 , 123 , 126 , 129 , 130 , 132 , 133 , 136 , 137 , 144 , 145 , 147 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 165 , 166 , 169 , 170 , 185 , 187 , 188 , 190 , 193 , 194 , 195 , 196 , 207 , 210 , 211 , 214 , 236 , 239 , 240 , 241 , 253 , 254 , 255 , 256 , 257 , 259 , 260 , 287 , 314 , 316 , 317 , 318 , 319 , 321 , 322 , 323 , 346 , 386 , 393 , 394 , 396 , 397 , 399 , 401 , 402 , 404 , 405 , 406 , 408 , 409 , 410 , 412 , 413 , 414 , 415 , 416 , 417 , 419 , 420 , 421 , 422 , 425 , 426 , 427 ,
D
1 , 2 , 4 , 5 , 29 , 30 , 34 , 36 , 37 , 38 , 40 , 41 , 42 , 44 , 45 , 47 , 48 , 50 , 51 , 54 , 55 , 58 , 65 , 67 , 69 , 73 , 93 , 97 , 98 , 101 , 102 , 103 , 104 , 105 , 106 , 107 , 109 , 110 , 111 , 113 , 114 , 115 , 122 , 123 , 126 , 129 , 130 , 132 , 133 , 136 , 137 , 144 , 145 , 147 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 165 , 166 , 169 , 187 , 188 , 190 , 193 , 194 , 195 , 196 , 203 , 207 , 210 , 211 , 214 , 236 , 239 , 240 , 241 , 253 , 254 , 255 , 256 , 257 , 259 , 260 , 287 , 316 , 317 , 318 , 319 , 321 , 322 , 323 , 346 , 386 , 388 , 393 , 394 , 396 , 397 , 399 , 401 , 402 , 404 , 405 , 406 , 408 , 409 , 410 , 412 , 413 , 414 , 415 , 416 , 417 , 419 , 420 , 421 , 422 , 425 , 426 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
D No mutation No mutation No mutation No mutation
C No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: