Pfam Domains mapped on to the structure: 1DGF
Conserved Domain Database Superfamily Annotations: 1DGF
Structural Details of PDB entry 1DGF
Structural Details of PDB entry 1DGF
PDBid
Chains
Hinge
Swapped Domain
1DGF
A,B
A:67-77,B:67-77
A:5-66,B:5-66
Swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
5 , 8 , 9 , 11 , 12 , 13 , 15 , 16 , 19 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 51 , 52 , 53 , 55 , 56 , 57 , 58 , 59 , 60 , 61 , 62 , 63 , 64 , 65 , 66 , 140 , 141 , 142 , 337 , 338 , 352 , 355 , 368 , 371 , 378 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 387 , 390 , 401 , 402 , 409 , 410 , 411 , 412 , 413 , 414 , 415 , 416 , 418 , 419 ,
B
5 , 8 , 9 , 11 , 12 , 13 , 15 , 16 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 51 , 52 , 53 , 55 , 56 , 57 , 58 , 59 , 60 , 61 , 62 , 63 , 64 , 65 , 66 , 140 , 141 , 142 , 337 , 338 , 352 , 355 , 368 , 371 , 378 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 387 , 390 , 401 , 402 , 409 , 410 , 411 , 412 , 413 , 414 , 415 , 418 , 419 ,
C
49 , 50 , 51 , 52 , 73 , 157 , 159 , 160 , 162 , 174 , 178 , 347 , 349 , 352 , 357 , 360 , 361 , 364 , 425 , 426 , 427 , 428 , 429 , 430 , 431 , 432 , 433 ,
D
49 , 50 , 51 , 52 , 73 , 157 , 159 , 160 , 162 , 174 , 178 , 347 , 349 , 352 , 357 , 360 , 361 , 364 , 425 , 426 , 427 , 428 , 429 , 430 , 431 , 432 , 433 ,
Non-swapped-domain interface residues and interactions:
Chains
Residues
A
67 , 68 , 69 , 70 , 71 , 73 , 119 , 120 , 121 , 122 , 157 , 158 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 166 , 167 , 169 , 170 , 171 , 172 , 173 , 174 , 175 , 176 , 177 , 178 , 180 , 181 , 184 , 185 , 188 , 189 , 251 , 254 , 255 , 259 , 262 , 263 , 266 , 289 , 295 , 296 , 297 , 322 , 323 , 324 , 325 , 326 , 327 , 328 , 331 , 339 , 341 , 345 , 347 , 349 , 353 , 356 , 357 , 360 , 361 , 363 , 364 , 366 , 367 , 369 , 373 , 374 , 386 , 388 , 389 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 , 396 , 397 , 399 , 400 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 420 , 422 , 423 , 424 , 425 , 426 , 427 , 428 , 429 , 430 , 431 , 432 , 433 , 469 , 471 , 473 , 501 ,
B
67 , 68 , 69 , 70 , 71 , 73 , 119 , 120 , 121 , 122 , 157 , 158 , 159 , 160 , 161 , 162 , 163 , 166 , 167 , 169 , 170 , 171 , 172 , 173 , 174 , 175 , 176 , 177 , 178 , 180 , 181 , 184 , 185 , 188 , 189 , 251 , 254 , 255 , 259 , 262 , 263 , 266 , 289 , 295 , 296 , 297 , 322 , 323 , 324 , 325 , 326 , 327 , 328 , 331 , 339 , 341 , 345 , 347 , 349 , 353 , 356 , 357 , 360 , 361 , 363 , 364 , 366 , 367 , 369 , 372 , 373 , 374 , 386 , 388 , 389 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 , 396 , 397 , 399 , 400 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 420 , 422 , 423 , 424 , 425 , 426 , 427 , 428 , 429 , 430 , 431 , 432 , 433 , 434 , 469 , 471 , 473 , 501 ,
C
5 , 8 , 9 , 11 , 12 , 13 , 15 , 16 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 53 , 55 , 56 , 57 , 58 , 59 , 60 , 61 , 62 , 63 , 64 , 65 , 66 , 67 , 68 , 69 , 70 , 71 , 77 , 119 , 120 , 121 , 122 , 140 , 141 , 142 , 158 , 161 , 163 , 166 , 167 , 169 , 170 , 171 , 172 , 173 , 175 , 176 , 177 , 180 , 181 , 184 , 185 , 188 , 189 , 251 , 254 , 255 , 259 , 262 , 263 , 266 , 289 , 295 , 296 , 297 , 322 , 323 , 324 , 325 , 326 , 327 , 331 , 337 , 338 , 339 , 341 , 345 , 353 , 355 , 356 , 363 , 366 , 367 , 368 , 369 , 371 , 373 , 374 , 378 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 , 396 , 397 , 399 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 , 410 , 411 , 412 , 413 , 414 , 415 , 418 , 419 , 420 , 422 , 423 , 424 , 469 , 471 , 473 , 501 ,
D
5 , 8 , 9 , 11 , 12 , 13 , 15 , 16 , 19 , 23 , 24 , 25 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 53 , 55 , 56 , 57 , 58 , 59 , 60 , 61 , 62 , 63 , 64 , 65 , 66 , 67 , 68 , 69 , 70 , 71 , 119 , 120 , 121 , 122 , 140 , 141 , 142 , 158 , 161 , 163 , 166 , 167 , 169 , 170 , 171 , 172 , 173 , 175 , 176 , 177 , 180 , 181 , 184 , 185 , 188 , 189 , 251 , 254 , 255 , 259 , 262 , 263 , 266 , 289 , 295 , 296 , 297 , 322 , 323 , 324 , 325 , 326 , 327 , 331 , 337 , 338 , 339 , 341 , 345 , 353 , 355 , 356 , 363 , 366 , 367 , 368 , 369 , 371 , 373 , 374 , 378 , 381 , 382 , 383 , 384 , 385 , 386 , 387 , 388 , 389 , 390 , 391 , 392 , 393 , 394 , 395 , 396 , 397 , 399 , 400 , 401 , 402 , 403 , 404 , 405 , 406 , 407 , 408 , 409 , 410 , 411 , 412 , 413 , 414 , 415 , 416 , 418 , 419 , 420 , 422 , 423 , 424 , 434 , 469 , 471 , 473 ,
Swapped domains are represented using trasperent spheres.
Non-swapped part is represented using light color and cartoon representation.
Hinge region is shown in yellow color.
Mutations in critical regions:
Chains
Hinge
Domain swapped interface
Non-swapped interface
Swapped Domain
A No mutation No mutation No mutation No mutation
B No mutation No mutation No mutation No mutation
HIDE output:
JMOL Visualization:
2D-plot:
JOY Structural annotation for hinge hinge and swapped domain:
JOY output: