Reading input alignment file to find conserved blocks of secondary structure The input structure based alignment from Comparer _____________________________________________ >P1;d1h2sa- ------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC---CCCCHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCC---CCEECCC-------------CCCEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-----------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-----------------------------C-CHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHCCCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC---------- >P1;d1xioa- ------------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC---CCCHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-------------------------CCCC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC-------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-----------------------------CHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHCCCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-------------- >P1;d2jafa- ------------------------------CCC--CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC--CCHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCC---CCCEEEECCCCCCCCC---CEEEEC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-----------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC--C--------------------------CHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHHHCC------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC----CHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCC--------- >P1;d2rh1a1 ---------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCH-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC-CHHHHHHHHCCC-CCC----CC--CCHHHH-HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC------CC-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-CCC----CCCHHHHHHHHHHHHH-HHHCHHHHHHH-CHHHHHHHHHHCCC------ >P1;d3ddla- -------------------------CCC--CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-CEEEC-CCCEEECC-----CCCCC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC--------------------------CCCHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHCCHHHHCCCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC-----CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC--------- >P1;d3emla1 ---------------------------------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHC--CCCEEC-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-CHHHCCCCCC----CCCCCCCCCEECC----HHHHCCHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-CCCCC--CCCHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCC- >P1;d4hyja- --------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCC---CCCHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHC-CCCCCC------------HHH---C--CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCC--------------CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------------------CCCCHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHCCCCCCCCC--------------------CCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHC--------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC------------------ >P1;d4jq6a- -------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH------------C---------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC---------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC----------------------------CCC---HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCC--------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------------CCC >P1;d5c1ma- ---------------------CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC-CHHHHHHHHHCCCCCCH-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HEEEEEEC--------CEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC----CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHCCCCHHHHHHC------------ >P1;d5dysa- CCCEEECCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCH-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCC-CCCEEEECCCC-------EEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-CC---CCCCCHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH--CCCCC- >P1;d5jsia- -------------------------------------CCCC-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-CCC---C-CCHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-C-------------------CCCC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------------------------HHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHCC-----CCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHC---------CCCHHHHHHHHHHHH-CCHHHHHHHHHHHHHCC-------------- >P1;d6eida- --------------------------CCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-------CCCHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHCCCCCCEECC------------CCCEEC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC---------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC--C----------------------------CHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-HHHHHHHHHC----------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHCC-HHHHHHHHHHHHHCCHHHHC--------- >P1;d6lm1a1 -----------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC--CCCCCHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCC---CCCEE---------------CCEEC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-----------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-----------------------------C-CHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHCCCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC---------- >P1;d6n4br- -------------------------------------------CCCCCCCHHHHCCCCCCCC--------CCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCC------------------CC------CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC----------CCCCCCCCCCCCCCCCCC-----------------------------CCCCCCCCCCCCHHHHHHHH-CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-------CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCC----------------CCCCCCCCCCC-CC-HHHHHHHCCCCCHHHHCC----------- >P1;d6rnka- ------------------------CHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHCCCCCC-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HCC--HHHCCCCCCCCCCC-CHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC-------- >P1;d6s6ca- --------------------------CCCCCCC--CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHC---CCEEEEEEC------C---EEEEEE--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-----------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-----------------------------CHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC----------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC--HHHHCCCCCCC------- >P1;d6tk6a- ---------------------CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-CCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHC-CEEEE-CCEEEECCC---CCCCCC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC-------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC--------------------------HH-HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHC-CHHHHHCCCC----------------CCC-CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-------------- >P1;d6xl3a- --------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCC---CCCEEEC-------------CEEEC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-----------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-----------------------------C-CHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHC----------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC-----CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHCCC---------- >P1;d7crja- ---------------------CCHHHHC--CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-HEEEE-CCEEEECC-----CCCCC--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC--------------------------HH-HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC----------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC >P1;d7l1vr- -------------------------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCH-------HHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC--CCCCC-CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH--CEEEEEECCCC--CCCCEEEEEECCCC---CHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC---------CCHHHHHHHC-CHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHC-CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC---------- PSA >P1;d1h2sa- ------------------------------------a5913720460065057028305830590---9ab35621700360044008-10330064---7524716-------------b2200--31005011500130030000005-----------07a841920372044105043500225-----------------------------9-a71382275148-117602730553028304834----------------a3135003501520272045137003500005372-----73650044018103300160053019217724637a7---------- >P1;d1xioa- ------------------------------------596215103701630680163067107843---9035500710150053016-1046006-------------------------a251--53005003301020010000000053-------a146a1085028104610404140151a-----------------------------78721364265136-106501600352037204705----------------87018002700630172044126001202205472-----844500530041045001300550023006257-------------- >P1;d2jafa- ------------------------------a91--95a6036006302740571184057106905--8a205601600150051026-10620071---810641600a905128---650100--30005212701010020001004-----------089a21970270052105152300324--9--------------------------43860364276147-408502610575028206919------------------0460056027303720541271024000060655----62041034006102500040042005202732930171--------- >P1;d2rh1a1 ---------------------------------aa64893376177227702620510250075396036021200300040024006200231132315740336-------492123------11011210100001001200411350020785280527495056427612550363035103646030a-588058018573-303----33--147912-5720561026008506620650362067146------39-593057041114008202810331150243108-76a----6377753472214003-00140081043-36305500461496------ >P1;d3ddla- -------------------------b22--4054b3056037104703830771364048036500---6603500610050062015-00640152067-00556-b931434b-----79057--73025013501120020001003048-------953a61166019103510622620361a744--------------------------59641063373155-0166017003540ab019515----------------a60260046027205600431360067308-----a653921173023105001500060052014003100653a4b--------- >P1;d3emla1 ---------------------------------a7c66614850571165037405203401821880471113003100500231055004222512--704327-------169004------200120001000020021005022200434982aa61439607962772285056101-2036840608----a7ab0ca951404----336000150006400351037107606920660382085a46------882684167060114019302801332051018325-47a5b--4258731360224004-1012006104822630440056056435679- >P1;d4hyja- --------------------------------6595055027106303760471174047339603---6733600520050062015-00550-800806------------6a6---2--95831420080155012200200030193--------------90470370055105333500320494------------------------9442860261157129-117501610256046036--------------------960700460152047202312720370066--------6b4160126006002600260033006003------------------ >P1;d4jq6a- -------------------------------------98007107700640581274047247602---9613600310050033017-102602531485------------8---------710173004004501120040071165---------------9485117103510602320019----------------------------636---4663253127-016402611475--------------------------------a70350036003212500360137------ba663740041006002300161056035502845------------96b >P1;d5c1ma- ---------------------7533264ab9578923750352067118603830740160076505387031000220050004004-0043213114682032a-------584035------11032111101000000100302212204597189234483065217616750171064049--20315868--------a330000518a45865264135312440143027304710750255366673b----9b7179187446317501620470133105132532--76a28467a21332151102013-00040050003419704749------------ >P1;d5dysa- 9302829612004348774052007340420165730661053065015504420520350184288045333201300040013005400420360054020153-------492047------001412001000000000004021143073-59c28027a30682375048205400410388-40100000000-------1021011162982707601622353014502730560084027324770595793a924970784272163016003501622171165045-55---c46161540350154012-001200410014585048115205--5a788- >P1;d5jsia- -------------------------------------9803-10480195056016505801-707---7-43600510061032036-10450081266-a-------------------a175--22006013501121010000003d---------a608603650271056118115601528453----------------------------940450276237-1145008205802-----e29----------------c944810550152028405312720322277---------b59521140041126-0260032006004311b-------------- >P1;d6eida- --------------------------a4a52988419aa237504620760284047027407926-------904600342052036-00440367017710223a------------426001--4100301350211002000101256c---------93830670180052305341300326--c----------------------------872553264168-4285036204-4007624760----------------3e039105702820360053135005402128463-----40130024005001310-4034300601530744786a--------- >P1;d6lm1a1 -----------------------------------1795045005402520560283047216517--96503400410360064016-00430055---61048---------------79210--40004002501130040002006-----------057850790273046105033400548-----------------------------5-840463174138-108701620574036005726----------------95028103601630181044126004403207771-----7504102300710330004004200623661035008---------- >P1;d6n4br- -------------------------------------------94bc878429921745617--------25232601510060651243595447239------------------b9------b26441120202170033003142243376a----------636279165483837017-----------------------------a7746556734931950583-13046006203730766167478c-------9485763482075016207700741164157----------------d5985218315-12-211610064657845775----------- >P1;d6rnka- ------------------------2a9356417613573027205703760186056006005701ab24000000220050015006-00521261244771524-------494036------03221100000001000300201012133591759604482067207602640461055018305-------715--08757203200245-6267126205701650055017405624630251388--------------6773260053026104710430062014104-214b5943321060041103003-000400500220648066317867-------- >P1;d6s6ca- --------------------------6073438--5a04003102400740370164047406b2a--46203300600150013007-10520141---96153062c------c---352200--42006004601210020000003-----------177a10750382035004032400316-----------------------------76930454264115-006400730154038308916----------------96017106600710391042116001402104481-----820500340051013002400530062--5006560432a------- >P1;d6tk6a- ---------------------70000410560038005401710560153057127506824-806---8702400500250051026-10530051038-00757-763231189---494061--33005014401210010003009039-------4845502740470043115024300640286--------------------------49-20573174137-2074017005-0072036c26----------------880-420680162047006313701410154b94712414002300430060031001500320450041137-------------- >P1;d6xl3a- --------------------------------------5267204401620570075038229707--78306401510350052019-00530057---7118723-------------93611--31016215601220030002006-----------07a712850392047106024300216-----------------------------3-850474284137-107503720453026201742----------------68148104400740171054125112402107552-----932210230050025002800420080-065057399---------- >P1;d7crja- ---------------------6100242--5065a2055027107502930381275076127200---6604500500260042007-10650163045-00554-9631324a-----76030--2500721370112003000100209a-------9528501470251044106114300330274--------------------------39-30583275157-417601710142057139504----------------490362026017201600511350140015-----4561700130041015002000050042005001200133626405712a68 >P1;d7l1vr- -------------------------------------79246407713650373055026017617904537140130006002300520042215425443053a-------5a5035------21252200200002000200322216304585--93375-4086226703750483042137--00225557237--b99524304072aa---77156105622631047026404700450375148---------a759854740-4137007302710531152313320-77537a78845571040432002-0004005100256781533871---------- Translating the sequences ------------------------------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C---****HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH**---*C*****-------------*****--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-----------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----------------------------*-*HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHH**HHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH*****---------- ------------------------------------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH*-------------------------****--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH****-------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----------------------------***HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HH***-------------- ------------------------------***--***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*--****HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH**---*C**************---******--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-----------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***--*--------------------------***HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****------------------*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*********----*HHHHHHHHHHHHH*H*HHHHHHHH***HH*H******--------- ---------------------------------*****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*******HHHHHHHHHHHHHHHH**HHHHH******C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*********-************-***----**--**HHHH-HHHHH*H*HHHHHHHH*HHHHHH********------**-******HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-***----***HHHHHHHHHHHHH-HHH*HHHHHH*-*HHHH*********------ -------------------------***--********HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH*****-C****-********-----*****--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*****-------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******--------------------------***HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH***HHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH****-----******HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH******--------- ---------------------------------*****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*******HHHHHHHHHHHHHHHH*HHHHHH***--*C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-**********----*************----******HHHHH***HH*H*HHHHHHHH*HHHHHH********------*********HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-*****--***HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH***HHHH**************- --------------------------------******HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH****C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH*-******------------***---*--*****HHHHHHHHHHHHHHH*HHHHHH**--------------*****HHHHHHHHHHHHHHH******------------------------*****HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHH*********--------------------****HHHHHHHHHH*HHHHHHHHHHH****--------***HHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH****------------------ -------------------------------------*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH******------------*---------****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*---------------*HHHHHHHHHHHHHHHHHHH**----------------------------***---HHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH**--------------------------------**HHHHHHHHHHHHHHHHHH****------****HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH------------*** ---------------------*****************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*******HHHHHHHHHHHHHHH*-*HHHHH******C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**--********--------***************HHHHHHHHHHH*H*HHHHHHHH*HHHHHH*********----**********HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**--**********HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH****HHHH***------------ **************************************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*******HHHHHHHHHHHHHHHH**HHHHH******C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******-*******HHHHHHHHHHHHHHHHHHH*HH***-***********-------**************HHHHHHHHHH***HHHHHHHH*HHHHHH***********************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-**---*****HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH****HHHH*******--*****- -------------------------------------****-*HHHHHHHHHHHHHHHHHH*-*C*---*-**HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH*****-C-------------------****--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**---------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******----------------------------*HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH***-----***----------------***HHHHHHHHHHHHHH**HHHHHHHH****---------***HHHHHHHHHHH*-**HHHHHHH***HHH**-------------- --------------------------************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*****-------***HHHHHHHHHHHH-HHHHHH******C*****------------******--HHHHHHHHHHHHHHHHHHH*******---------****HHHHHHHHHHHHHHHHHHH***--*----------------------------*HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH-HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH***-HHHHHHH***HHH*******--------- -----------------------------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*--*****HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH**---*C***---------------*****--*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-----------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----------------------------*-*HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH*****---------- -------------------------------------------*******HHHH********--------***HHHHHHHHHH******HHHHH*****------------------**------***HHHHHH**HHHHHHHHH*HHH*******----------******************-----------------------------************HHHHHH*H-****HHHH*HHHHHH*********-------*******HHHHHHHHHHHHH****HHHH***----------------***********-**-HHHHHHH*****HH****----------- ------------------------**************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***********HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH******C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*****-------***--**************-***HHHHHHHHHHH*H*HHHHHHHH*HHHHHH*****--------------****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-**********HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH*****HH*******-------- --------------------------*******--*****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*--****HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH**---*C*******------*---******--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-----------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----------------------------***HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH**--HHH********------- ---------------------*****************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**-*C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH*****-C****-*********---******--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******-------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******--------------------------**-HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHH*-*HHHHH****----------------***-**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH*-------------- --------------------------------------*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*--****HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH**---*C*****-------------*****--*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*-----------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----------------------------*-*HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********-----*HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH**-HHHH*****---------- ---------------------*******--********HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*---***HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH*****-*****-********-----*****--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH*****-------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******--------------------------**-HHHHHHHHHHH-H*HHHHHHHH*HHHHHH****----------------***HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***-----******HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH*************** -------------------------------------*HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C********HHHHHHHHHHHHHHH**HHHHH******C****-------******------**HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********--*****-*HHHHHHHHHHHHHHH**HH**--***********--**************---*HHHHHHHHHHH*H*HHHHHHHH*HHHHHH*****---------**********-*HHHHHHHHHHH*HHHHHHHHH***-**********HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHH*************---------- 81321.tem _________________________________ -------------------------*************HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH***C*******HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH******C****-------******-*******HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH********--****HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH******-----------------***----*****HHHHHHHHHHH*H*HHHHHHHH*HHHHHH*****------------******HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH**************HHHHHHHHHHHHH*HHHHHHHHHH***HHHH*******-------- Structural block scores 0 24 - 4.8 H 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 63.7 3.7 75.0 75.0 75.0 75.0 72.1 75.0 63.3 75.0 63.3 75.0 25 37 * 3.4 M 64.7 64.5 43.8 49.2 15.2 49.4 42.7 69.9 6.5 3.2 69.9 12.0 59.0 75.0 5.2 20.9 2.5 75.0 14.7 69.8 38 60 H 4.9 H 3.7 3.2 3.3 3.7 3.6 3.3 3.4 3.5 3.3 2.7 6.5 3.9 3.0 21.1 3.2 2.7 3.3 3.3 3.5 3.7 61 63 * 1.4 P 4.7 5.0 5.0 4.0 4.7 3.7 6.0 5.7 4.3 4.3 27.7 5.3 4.0 52.3 4.0 5.8 29.0 6.0 3.7 4.7 65 71 * 2.5 P 37.0 34.3 25.1 3.7 33.9 4.1 34.9 34.7 3.7 4.4 45.4 65.1 25.3 54.6 4.1 24.6 35.1 25.0 33.9 5.0 72 87 H 4.9 H 2.9 2.4 2.4 1.4 2.1 1.5 2.2 2.0 1.1 1.4 2.2 7.4 2.4 2.5 1.3 1.8 2.0 2.6 2.2 1.6 89 94 H 4.9 H 1.2 1.8 1.5 1.2 1.8 1.7 14.2 1.8 1.7 1.5 1.7 1.8 1.2 5.0 1.7 1.5 1.5 1.3 2.2 1.5 95 100 * 2.2 P 40.3 63.5 40.2 3.5 15.8 27.5 3.7 4.3 3.8 2.5 16.3 4.7 40.2 28.5 4.0 39.8 15.3 40.7 15.5 4.0 102 105 * 2.3 P 3.5 75.0 2.8 3.0 4.0 4.0 75.0 75.0 3.9 2.2 75.0 1.8 21.8 75.0 3.0 2.2 4.8 4.5 3.5 4.6 106 112 - 4.4 M 65.1 75.0 4.4 75.0 15.2 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 65.8 75.0 75.0 75.0 45.8 13.9 64.7 14.1 75.0 113 118 * 3.6 M 75.0 75.0 39.3 3.5 52.6 3.3 41.2 63.8 4.2 4.3 75.0 75.0 75.0 53.4 4.3 64.6 40.5 75.0 52.4 4.8 120 126 * 3.2 M 23.6 34.8 22.3 53.9 25.4 53.9 25.1 33.4 53.9 53.6 35.5 22.7 24.1 55.5 54.0 22.7 24.3 24.3 23.7 54.0 127 148 H 4.9 H 1.0 1.0 1.1 0.9 1.5 0.8 1.6 2.1 0.8 0.7 1.1 1.1 1.2 2.1 0.6 1.3 1.3 1.6 1.6 1.2 149 156 * 3.2 M 66.2 38.5 66.1 3.4 39.4 3.8 57.8 66.2 3.8 12.2 58.3 40.7 66.4 13.8 3.1 66.0 40.1 66.4 40.2 4.0 157 158 - 4.3 M 75.0 75.0 75.0 5.0 75.0 6.2 75.0 75.0 4.5 10.8 75.0 75.0 75.0 75.0 6.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 159 162 * 2.8 P 39.2 22.6 39.5 3.5 23.0 5.4 75.0 75.0 4.5 3.0 22.9 58.5 38.8 75.0 4.8 39.5 22.8 39.2 22.8 5.5 163 184 H 4.8 H 3.3 3.0 3.2 3.7 3.2 7.4 9.5 9.5 3.6 3.6 3.3 2.8 3.4 17.5 3.4 2.9 2.6 3.4 2.6 6.9 185 190 * 2.4 P 39.0 40.2 28.0 3.2 5.4 3.5 3.7 51.7 27.5 16.3 4.5 28.9 40.3 75.0 15.3 39.2 4.3 39.0 3.2 26.7 191 207 - 4.4 M 75.0 75.0 75.0 13.0 75.0 23.0 75.0 75.0 38.1 31.0 75.0 75.0 75.0 75.0 37.8 75.0 75.0 75.0 75.0 13.4 208 210 * 4.1 M 75.0 75.0 75.0 2.0 75.0 2.7 75.0 75.0 0.0 1.0 75.0 75.0 75.0 75.0 1.7 75.0 75.0 75.0 75.0 2.3 211 214 - 4.4 M 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 3.5 0.8 75.0 75.0 75.0 41.9 1.5 75.0 75.0 75.0 75.0 4.9 215 219 * 2.9 P 48.9 34.4 33.0 31.4 34.0 2.4 5.4 33.0 6.7 5.4 61.8 61.6 47.6 5.4 18.8 34.4 47.6 47.2 47.4 48.5 220 230 H 4.9 H 4.4 3.5 4.2 10.6 3.5 1.7 3.6 10.4 3.3 3.5 3.6 4.5 3.7 4.7 3.4 3.2 3.6 4.1 4.2 3.7 234 241 H 4.9 H 3.8 2.6 3.4 3.4 2.9 3.8 2.8 3.0 2.9 3.2 3.0 3.5 3.6 2.5 3.4 2.6 3.0 3.5 2.9 3.4 243 248 H 4.5 M 2.7 2.3 2.8 2.7 4.5 2.8 3.2 63.3 2.5 2.3 50.3 3.2 2.2 3.3 2.8 3.0 2.0 2.2 3.0 2.0 249 253 * 2.0 P 18.8 18.2 20.0 4.2 19.0 4.6 61.2 75.0 5.0 4.6 35.1 18.4 19.0 5.2 5.0 19.8 20.3 17.8 18.6 5.0 254 265 - 4.6 H 75.0 75.0 75.0 45.7 75.0 40.7 75.0 75.0 29.7 5.9 75.0 75.0 75.0 47.1 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 58.1 266 271 * 2.8 P 39.9 40.0 62.5 4.8 40.2 5.3 52.5 75.0 6.0 5.8 41.8 40.4 39.8 5.5 28.8 40.0 40.2 40.0 39.7 6.2 272 295 H 4.9 H 2.6 2.4 3.0 2.2 2.9 2.5 2.7 14.9 2.9 2.8 2.9 3.0 2.7 3.5 2.4 2.5 5.9 2.8 2.3 5.6 296 309 * 2.7 P 28.5 28.9 23.4 30.2 30.1 20.3 45.0 35.4 15.6 24.9 50.3 28.9 29.2 75.0 8.9 28.8 3.8 29.0 28.9 10.5 310 322 H 4.9 H 2.7 2.3 1.8 3.5 1.8 3.1 2.2 2.1 1.8 2.4 2.7 1.2 2.0 16.2 1.5 1.6 1.6 1.5 1.3 2.5 324 333 H 4.8 H 1.6 1.4 1.0 1.8 1.4 1.5 1.4 2.2 0.9 0.8 8.8 9.0 1.0 8.9 1.1 1.4 1.5 1.6 1.1 1.0 334 336 * 1.3 P 4.0 1.7 2.3 27.0 1.3 4.0 2.0 3.3 2.7 3.3 2.0 2.3 3.7 5.3 2.7 27.7 1.7 27.7 1.7 4.3 337 340 H 4.5 M 5.0 3.2 3.5 3.5 1.0 3.2 57.0 4.8 5.0 4.2 2.2 3.8 3.2 6.0 4.5 20.0 2.2 2.8 0.8 5.2 341 347 * 2.7 P 26.2 65.3 13.7 2.9 16.4 2.9 75.0 75.0 45.7 3.1 65.9 16.4 23.7 35.6 5.4 3.7 65.3 26.1 3.6 24.6 348 355 - 4.6 H 75.0 75.0 75.0 58.1 75.0 14.4 75.0 50.2 75.0 32.9 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 66.9 75.0 75.0 4.9 75.0 >>>>>>