Reading input alignment file to find conserved blocks of secondary structure The input structure based alignment from Comparer _____________________________________________ >P1;d1rkta2 ------CHHHHHHHHHHHHHH--HCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHH-------CHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHH-CCHHHHHHHHH--------------------------------------CCH-HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHC---------CCCC------------- >P1;d1sgma2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--CCCCHHHCCCCCCHHHHHHHCCCC-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC-------------------------------------------CCHHHHHHHCCHHHHCC--------------------------- >P1;d1t33a2 -CCCHHHHHHHHHHHHHHHHH--HCCC------HHHHHHHHHHHHHH---HCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH------------CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCC-------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC----------------------- >P1;d1ui5a2 -----CCHHHHCC-CCCC-CH--HHHHC-H-HHHHHHHHHHC----------CCCCCCC-C-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCC--------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHC------------------------- >P1;d1vi0a2 ------CHHHHHHHHHHHHHH--HHHCCHH-HHHHHHCCCCC-CC--------HHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHC-CHHHHHHHHHHHCC---------------------------------------C-CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC---------C---------------- >P1;d1z0xa2 -----CCHHHHHHHC-CHHHH--HHHH----CCCHHHHHHC----------------CCCCCHHHHHHHHC--CHHHHC---C--CC----------C-CCHHHHHHHHHHHHC--CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHC-----CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC--------------------- >P1;d1zk8a2 ------CCCHHHHHHHHHHHH--HHHH--------CHHHHHHCCCC-----------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC-------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHC--------------------------- >P1;d2d6ya2 --------CCCHHHHHHHHHH--HHHH--------CCHHHHHHHHHCCCCCCCCC-CHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHH----------CCCCCCCCCHHHHHHHHHC-CCHHHHCC-CCHHHHCCH----------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHC---C----------------------- >P1;d2fbqa2 -----CCC-CCHHHHHHHHHH--HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCC-------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC--------------------- >P1;d2fd5a2 -----CCHHHHHHHHHHHHCC-HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH-------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-----------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC----------------------------------------C---HHHHHHHHHHHHCCC--------------------------- >P1;d2fq4a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHH-C-C-CCCHHHHHHHHHCC-------CHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-------------------------------------------CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC---------C---------------- >P1;d2g3ba2 ------CHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-------C-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC-----------CCCHHHHHHC-CHHHHHHHHHHHC--C----------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHHCC--------------------------- >P1;d2g7ga2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHC----CHHHHHHHHC----------------CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH---C--CC----------HHHC-CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC--------------CCCCCCC---CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-------------------- >P1;d2g7la2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHH----CHHHHHHHHH----------------CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC---C--CC----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH----------HCCCCC----CHHHHHC-CCCCCC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHC--CCCCCC----------------- >P1;d2g7sa2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHH-CCCCCCHHHHHHHHHHH-C-----CHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHCC-HHHHC-CCCCC--------------------------------------CC-----CCCHHHHHHCC-CCCCCC-------------------------- >P1;d2gena2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHHCHH-HHHHHHHHHHHHHH--------CCCHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC---------------------------------------CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC---------C---------------- >P1;d2gfna2 ---C--CHHHHHHHHHHCCCC--C-CHHHH-CCHHHHHHHHH----------C--CCHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHCCCC-CCCHHHCC--------------------------------CHHHHHHHHHHCC----------------------------- >P1;d2hkua2 -----CCHHHHHHHHHHHHHC--CCHH----HHHHHHHC--CCCC-------CHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHCHHHHCCCC-CCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------------------------CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHH---------HHHC------------- >P1;d2hyja2 -----CCCHHHHHHHHHHHHH--HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCC------CCCHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------------------------HCCC--CHHHHHHHHHHHHHHHC---------------------------- >P1;d2i10a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHCC--------CCC----CCC-CCCCCCCHHHHHHHH-HHHHC-CHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHH-CCHHHHHHHHHHC--------------------------------------CCC-----HHHHHHHHHHHHCCCC--------------------------- >P1;d2id3a2 --CCCCCHHHHHHHHHHHHHH--HHH-CHH-HHHHHHHHHHHHHH-------CHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-------------------------------------------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC---------CCCCCC----------- >P1;d2id6a2 --------CCCCCCCHHHHCC--CCCCCHH-HHHH-CCHHHCC--------CCCCHHHHHC-C-HHHHHHHC-CCCCC----CCCCC----------CCCCCCCCC-HHHHHHHHHHHHCCCCC------------------------------------CCCCCHHHHHHHC-CHHHHHC-C--------------------------- >P1;d2iu5a2 --------CCCHHHHHHHHHH--HHHHCHH-HHHH---HHHHC----------CCHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHC--CCCCC----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC------------------------------------CCH--HHHHHHHHHHHHHHHCCC--------------------------- >P1;d2jk3a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHHCHH-HHHHHHHHHHC--C-------CC-CHHHHH-HHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------C-CHHHHHHHHHHHHCC-HHHHH-------------------------------------------HHCC-CHHHHHHHHHHC---------------CCCC----------- >P1;d2np3a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHCCC---------------------------CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC---------------CCCCCCCHHHHHHHCCCCC--------------------------------------CCCCHHHC----CCCHHHHHHHHHHHHHC--------------------------- >P1;d2np5a2 ----CCCHHHHHHHCC-CCCCCCHHHHHHHH---C-CHHHHHHCC-------C-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC------C-----------CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH----------------------------------------HCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC--------------------- >P1;d2o7ta2 -----CCHHHHHHHHC-CCCC-------CC-HHHHHHHHCCC----------HHHCCCC-H-HHHHHH-CCHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHCCCCC-----------HHHCCCCCC--------------------------------CHHHHHHHHHHHC----------------------------- >P1;d2oi8a2 ---------CCHHHHHHHHHH--HHHH--------CHHHHHHHHCCCCCC----CCCCCC-----CCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC-------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHCCC----------------------------- >P1;d2xpwa2 CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH--HHHC----CCCHHHHHCC----------------CCC-CHHHHHHHHHHHHHHHHC---C--CC----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC---------CCCCCCCC---CHHHHHHHHHHHCCC--CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC----------------- >P1;d2yvea2 -----CCHHHHHHHHHHHHCC----CC--CH---HHHHHHHHHHH-------C-HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH---------------------CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC----------------------------------------CCCHHHHHHHHHHHHHCCCC-------------------------- >P1;d3br0a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHHCC--CHHHHHHHHHHHCC-------CC-CCCCHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------C-CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC-------------------------------------------CHHHHCCHHHHHHHHHHH-------------CC-------------- >P1;d3c07a2 -----CCHHHHHHHHHHHHHH--HHHH----HHHHHHHHHHHHCC-CCCCCCC---CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC---CCCCC----------HHHCCHHHH-CCCCC-CHHHHHHHCCCC-------------------------------------CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >P1;d3q0wa2 ---CCCCHHHHHHHHHHHHHH--HHHCCHH-HHHHHHHHCCC----------CHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC----------CCCHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHCCCCCCCHH----------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHCC------------------------- >P1;d4jyka2 -CC---CHHHHHHHHHHHHHH--HHHH--------CHHHHHHHCCCCC----CCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------CCCCC-CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCC-------------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHC--CC----------------------- PSA >P1;d1rkta2 ------400570265068137--9168078672376285383086-------579245545-86375318712840560375a2091----------557255004712-81360243007--------------------------------------589-a70617640673283048005---------0a47------------- >P1;d1sgma2 -----b612640265058105--10687a615503216517623973-------7753461574277315610630373a27---------------79605810540072016005603856-------------------------------------------53610462074037307--------------------------- >P1;d1t33a2 -a7748612760062056104--6204------78129717735706---9757a4177336774545147005200500------------9471747805740780173046205627830783927605-------------------------------98117603850264027405823a----------------------- >P1;d1ui5a2 -----62101302-6107-26--74664-6-95467136037----------9682988-5-4225542630263063018570149----------a38166306701662019717842630071383079028--------------------------------942a5048103502751------------------------- >P1;d1vi0a2 ------704750471036204--7029569-40452066534-a8--------87438625-7936a318602800560487a319b----------b35278226-02840172045005---------------------------------------a-0748046419800461368a7b---------9---------------- >P1;d1z0xa2 -----d923631163-38115--5056----6881157158----------------594757705743a5--520592---7--13----------6-91870342117401b--1986777556542796498255368467737569679678597-----b57475117404830581587882b--------------------- >P1;d1zk8a2 ------773810252047205--5038--------4596187557a-----------5883789659638502700421919---------------b88066107704810470035248973b8-------------------------------------97747740264067207a16--------------------------- >P1;d2d6ya2 --------2661533036216--6186--------567506744829739b7815-73973----7555674276155018----------4530188360460185036-01734436-82679483b----------------------------------aa067932562276068405---7----------------------- >P1;d2fbqa2 -----baa-360460055417--6347896868522156156275168794---a73976456452977581374066105-------------a0397115612371385118202707833763686876-------------------------------826346204810681079046a2959--------------------- >P1;d2fd5a2 -----5606630653069104-66003863b941610734a5067-------37685567266538730971054-----------------------88359405701830181046037356----------------------------------------9---a70271057137608--------------------------- >P1;d2fq4a2 -----9404720281027005--505-4-8-80360384187079-------4993064165712633256036204504839407a----------b071671056008301621363a-------------------------------------------680478305710471258a9a---------8---------------- >P1;d2g3ba2 ------506660274114302769a248916---62485472087-------6-8b358407762781077016206702867416-----------9272752058-06502a0146017--9----------------------------------------6151850365059406948--------------------------- >P1;d2g7ga2 -----6613650262048115--5227----73b4085536----------------674878a4576388348906a1---8--03----------7951-80174018301810642348577--------------93a4a78---75a6467388419277316670584076318914621773a-------------------- >P1;d2g7la2 -----7613930282067107--7026----6067045149----------------9559b7a167237303500530---a--17----------a500560055007300520183a678847726----------817897----5693477-994145--63765258203420571277--7188ab----------------- >P1;d2g7sa2 -----b100540381057138--2168-68921192053284278-1-----6a9418806-4347721640140064058595070----------b99156106718-30280-72056--------------------------------------88-----67910174036-068147-------------------------- >P1;d2gena2 -----9504620273016205--3047339-60476162589548--------8a619728-765977767546404a32869407b------------85a6178502640582053204---------------------------------------a51a56068147710450144044---------b---------------- >P1;d2gfna2 ---4--512650482045100--3-6a723-81663375286----------3--479716-4426804850581024018686068----------92706700750074027----202601759-9196066b--------------------------------6112700370069----------------------------- >P1;d2hkua2 -----7401430683046203--7516----80492165--9279-------588466823-853882265227600710719-094----------458466005600720170054047--------------------------------------396696345a502740265080579---------0476------------- >P1;d2hyja2 -----6401750572079306--40281959a007517238626b------67a9648716-651683365035005202858306a----------c06265008401415480081038--------------------------------------6836--51056047405800891---------------------------- >P1;d2i10a2 -----9504550375025308--7116--------627----485-ba9a92687547746-87458-2482172066038683069----------b170771064-0711480066046--------------------------------------915-----8a70574067206504--------------------------- >P1;d2id3a2 --3747402600340045007--306-477-40741475164078-------7aa326617-7536821681070064028383049----------90416300420274026003658-------------------------------------------590666103700780073047---------16237c----------- >P1;d2id6a2 --------5501431561480--6127429-6148-7637839--------d447469856-7-75936641-a2091----b14a3----------868129618-33752457116616838------------------------------------9056c71267045-078149a-2--------------------------- >P1;d2iu5a2 --------8230394027305--5028327-6136---20975----------87156603-630371074007004354--b0706----------994267015600660075046104634------------------------------------504--722871078047307714--------------------------- >P1;d2jk3a2 -----9704650681067125--7097457-60760251466--8-------2b-729936-4815842660471053048383021----------a-429702830144004-58548-------------------------------------------8567-b22870185028---------------75c9----------- >P1;d2np3a2 -----b820462058107724--634759---------------------------a69367966973466147713b508b---------------938217009302a000149--------------------------------------68593073----84400663085037416--------------------------- >P1;d2np5a2 ----db4258603771-75000688238727---7-266287189-------3-9835674666377347911740792------a-----------04807620260063048116603b46a----------------------------------------823485047207730900990a1b6--------------------- >P1;d2o7ta2 -----c7477706840-7418-------75-20664368337----------5a717b5-2-684677-5815730750174a1047----------9162970384037206438-----------a87477a93--------------------------------752a721690471----------------------------- >P1;d2oi8a2 ---------680352058118--4048--------44940376229868c----6957ba-----977666106206667b9a518506762424715020043031038401900351147629b-------------------------------------d66147304630870477----------------------------- >P1;d2xpwa2 508bc2602300364035207--7127----794304945c----------------694-57866b436423510363---9--07----------77505602340373018301922567635986---------977688a2---669546547777747--74990495057307913662719a8a6----------------- >P1;d2yvea2 -----b653630560068119----10--76---64257377156-------5-78638745855775227488389---------------------486244126006404702211465b7----------------------------------------71599515751650285029-------------------------- >P1;d3br0a2 -----a514650272036103--425747--62a55585466348-------4b-a33717-8856762730370065036792090----------b-718510560084044305839-------------------------------------------93a72350561067208a-------------17-------------- >P1;d3c07a2 -----8803730383066406--7166----70872363476145-4915505---20763698067215614701880---83911----------850651101-11270-90464016094a-------------------------------------b3540264075604930670560767a314714840464167241698 >P1;d3q0wa2 ---5b4845541269037316--6216738-91586293388----------389447716-7418721680163064107792026----------46606700470152117----201100194a92374a----------------------------------60253007402640178------------------------- >P1;d4jyka2 -b8---712720574046203--6034--------6177259532386----a05935a6269836751574184158129----------58502-82515700560283034201648615774924066-------------------------------98106600681178002904--26----------------------- Translating the sequences ------CHHHHHHHHHHHHHH--H**********H*HHHHH****-------******HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHH-**HHHHH*H**--------------------------------------***-****HHHHHHHHHHHHH****---------****------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--*************HHHHH******-------****HHH*HHHHHHHHHHHHHHHH****---------------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H****-------------------------------------------**HHHHHHH**HHH***--------------------------- -******HHHHHHHHHHHHHH--H***------*H*HHHHH******---********HHH*H*HHHHHHHHHHHHHH**------------********HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*************-------------------------------****HHHHHHHHHHHHH*******----------------------- -----*CHHHH**-****-*H--HHH**-*-***H*HHHHH*----------*******-*-*HHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHH***********************--------------------------------**HHHHHHHHHH*****------------------------- ------CHHHHHHHHHHHHHH--HHH****-***H*H*****-**--------*****HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHH*-*HHHHHHHHH*H**---------------------------------------*-*****HHHHHHHHHHHHH****---------*---------------- -----*CHHHHHHH*-*HHHH--HHH*----***H*HHHH*----------------*****HHHHHHHH*--*HHHH*---*--**----------*-**HHHHHHHHHHHH*--**H****************************************-----***HHHHHHHHHHHHH*********--------------------- ------C**HHHHHHHHHHHH--HHH*--------*HHHHH*****-----------*HHH*HHHHHHHHHHHHHHHH****---------------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*******-------------------------------------****HHHHHHHHHHHHH***--------------------------- --------***HHHHHHHHHH--HHH*--------**HHHH**************-**HHH----HHHHHHHHHHHHH***----------*********HHHHHHHHH*-**HHHH**-*********----------------------------------****HHHHHHHHHHHHH***---*----------------------- -----*C*-**HHHHHHHHHH--HHH********H*HHHHH**********---****HHH*HHHHHHHHHHHHHHHH***-------------******HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*************-------------------------------****HHHHHHHHHHHHH*********--------------------- -----*CHHHHHHHHHHHH**-*HHH**********HHHHH****-------******HHH*HHHHHHHHHH***-----------------------**HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*****----------------------------------------*---HHHHHHHHHHHH***--------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH-*-*-***H*HHHHH****-------******HHH*H*HHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH***-------------------------------------------****HHHHHHHHHHHHH****---------*---------------- ------CHHHHHHHHHHH*****HHH*****---H*HHHHH****-------*-****HHH*HHHHHHHHHHHHHHHH********-----------***HHHHHH*-*HHHHHHHH*H**--*----------------------------------------***HHHHHHHHHHHHH***--------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*----***H*HHHH*----------------*****HHHHHHHHHHHHHHHH*---*--**----------****-*HHHHHHHHHHHHHH*H******--------------*******---******************HHHHHHHHHHHHH**********-------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*----***H*HHHHH----------------*****HHHHHHHHHHHHHHH**---*--**----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH************----------******----*******-******--**HHHHHHHHHHHHH*****--******----------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*-******H*HHHHH****-*-----******HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHH**-HHHH*-*****--------------------------------------**-----***HHHHHH**-******-------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH****-***H*HHHHH****--------*****HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********------------*HHHHHHHHHHHHHHHHH*H**---------------------------------------*******HHHHHHHHHHHHH****---------*---------------- ---*--CHHHHHHHHHH****--*-*****-***H*HHHHH*----------*--***HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHH----H********-********--------------------------------*HHHHHHHHHH**----------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHH*--**H*----***H*HH*--****-------******HHH-HHHHHHHHHHHH*HHH*****-***----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H**--------------------------------------********HHHHHHHHHHHH*****---------****------------- -----*C*HHHHHHHHHHHHH--HHH********H*HHHHH****------*******HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H**--------------------------------------****--**HHHHHHHHHHHHH**---------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HH**--------***----***-************HHH-HHHH*-*HHHHHHHHH*********----------***HHHHHHH-**HHHHHHH*H**--------------------------------------***-----HHHHHHHHHHHH****--------------------------- --****CHHHHHHHHHHHHHH--HHH-***-***H*HHHHH****-------******HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH***-------------------------------------------****HHHHHHHHHHHHH****---------******----------- --------*******HHHH**--*******-***H-**HHH**--------*******HH*-*-HHHHHHH*-*****----*****----------*********-HHHHHHHHHH*H*****------------------------------------*******HHHHH*-*HHHHH*-*--------------------------- --------***HHHHHHHHHH--HHH****-***H---HHH**----------*****HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH**--*****----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*****------------------------------------***--**HHHHHHHHHHHHH***--------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH****-***H*HHHHH*--*-------**-***HHH-HH*HHHHHHHHHHHHH*********----------*-*HHHHHHHHHHHH**-HH*H*-------------------------------------------****-*HHHHHHHHHH*---------------****----------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH***---------------------------********HHHHHHHHHHHH******---------------*******HHHHHHH*****--------------------------------------********----***HHHHHHHHHHH***--------------------------- ----**CHHHHHHH**-******HHH*****---*-*HHHH****-------*-****HHH*HHHHHHHHHHHHHHH**------*-----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*****----------------------------------------***HHHHHHHHHHHH**********--------------------- -----*CHHHHHHHH*-****-------**-***H*HHH***----------*******-H-HHHHHH-**HHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHH*****-----------*********--------------------------------*HHHHHHHHHHH*----------------------------- ---------**HHHHHHHHHH--HHH*--------*HHHHH*********----******-----*****HHHHHH************************HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*******-------------------------------------****HHHHHHHHHHH***----------------------------- ******CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*----***H*HHH**----------------***-*HHHHHHHHHHHHHHHH*---*--**----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H**********---------********---***************--*HHHHHHHHHHHHH*************----------------- -----*CHHHHHHHHHHHH**----**--**---H*HHHHH****-------*-****HHH*HHHHHH******HHH---------------------**HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*****----------------------------------------***HHHHHHHHHHHHH****-------------------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH***--***H*HHHHH****-------**-****HH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------*-*HHHHHHHHHHHHHHHHH***-------------------------------------------****H**HHHHHHHHHH*-------------**-------------- -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*----***H*HHHHH****-*******---**HHH*HHHHHHHHHHHHHHH**---*****----------*****HHHH-*****-*HHH*H******-------------------------------------*****HHHHHHHHHHHHH****************************** ---***CHHHHHHHHHHHHHH--HHH****-***H*HHH***----------******HHH-HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHH----H***************----------------------------------HHHHHHHHHHHH*****------------------------- -**---CHHHHHHHHHHHHHH--HHH*--------*HHHHH*******----******HHH**HHHHHHHHHHHHHHH***----------*****-***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H*************-------------------------------****HHHHHHHHHHHHH***--**----------------------- 48498.tem _________________________________ -----*CHHHHHHHHHHHHHH--HHH****-***H*HHHHH****-------******HHH*HHHHHHHHHHHHHHHH*********----------***HHHHHHHHHHHHHHHHH*H**********-------------------------------*******HHHHHHHHHHHHH*****------------------------- Structural block scores 0 4 - 4.7 H 75.0 75.0 20.7 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 60.8 75.0 75.0 75.0 32.8 75.0 75.0 75.0 75.0 62.7 75.0 75.0 7.4 75.0 75.0 75.0 48.3 48.9 7 20 H 4.6 H 3.6 3.2 2.9 12.8 3.1 8.4 3.3 8.5 9.0 3.5 2.7 3.0 3.1 3.5 3.2 2.7 2.7 2.9 3.7 3.4 2.2 8.4 8.6 3.6 3.4 9.0 9.9 14.1 2.5 3.8 2.9 3.5 4.0 3.1 21 22 - 4.8 H 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 40.5 75.0 6.5 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 3.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 23 25 H 4.5 M 5.3 2.3 2.7 5.7 3.0 3.3 2.7 5.0 4.3 2.0 3.3 7.2 3.0 3.0 3.0 2.3 28.0 4.3 2.0 3.0 3.0 3.0 2.3 5.3 4.3 6.0 75.0 2.7 3.3 50.3 3.7 4.7 3.0 3.0 26 29 * 2.7 P 5.8 7.9 57.2 22.8 7.2 57.8 58.2 57.8 7.5 5.0 40.5 5.5 58.0 57.8 24.2 5.5 5.6 57.8 5.8 57.8 23.2 5.5 5.0 5.8 24.0 5.0 40.5 58.2 58.0 39.2 23.2 57.8 6.0 57.2 31 33 * 2.5 P 4.0 3.3 52.3 6.0 2.7 7.3 75.0 75.0 6.3 4.7 3.7 75.0 7.2 4.0 1.3 3.3 5.0 4.0 3.5 75.0 3.7 3.7 3.3 4.3 75.0 75.0 2.7 75.0 6.7 75.0 6.2 5.0 5.0 75.0 36 40 H 4.6 H 5.2 4.0 5.2 2.6 4.0 5.2 5.8 4.8 3.6 4.9 4.8 5.6 5.4 4.6 3.6 4.4 5.0 32.4 4.2 46.8 4.6 6.2 32.2 3.6 75.0 4.8 4.6 4.0 6.9 4.8 5.6 4.6 5.0 4.4 41 44 * 2.5 P 4.2 5.0 5.5 58.0 24.4 75.0 6.0 5.8 5.0 4.5 5.8 4.2 75.0 75.0 5.2 6.5 57.8 6.8 6.4 23.0 4.8 40.5 40.5 41.0 75.0 6.2 58.0 4.2 75.0 4.8 5.2 4.0 58.2 4.8 45 51 - 4.5 M 75.0 55.0 35.3 75.0 75.0 75.0 65.8 6.9 15.7 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 64.4 75.0 75.0 75.0 65.1 18.2 75.0 66.2 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 27.6 75.0 75.0 75.0 14.1 75.0 45.3 52 57 * 2.2 P 5.3 28.7 5.8 7.0 17.5 63.3 63.3 16.5 29.9 5.7 5.2 18.1 63.5 64.0 6.4 18.2 28.8 6.2 7.4 6.2 6.5 5.7 17.0 17.8 52.8 17.2 7.0 29.5 63.5 17.3 17.8 38.7 5.8 5.4 58 60 H 4.3 M 4.7 3.7 4.3 29.3 4.3 6.7 6.3 6.3 5.7 5.0 3.7 4.0 6.3 6.3 4.7 5.7 4.7 4.3 4.7 5.7 4.7 6.3 3.0 6.0 6.0 5.7 27.3 32.3 29.3 6.3 5.0 5.3 4.7 6.2 62 77 H 4.8 H 4.6 3.9 3.5 3.3 4.7 13.7 4.6 18.1 5.0 17.7 3.4 4.2 6.2 3.9 3.3 5.9 3.8 4.4 3.6 9.1 4.0 13.8 2.8 4.0 5.7 5.1 9.6 17.9 4.7 10.2 4.6 4.6 4.0 5.1 78 86 * 2.6 P 4.2 44.2 58.3 3.9 6.0 43.1 43.9 51.0 50.7 75.0 5.1 12.1 43.0 43.7 4.3 5.6 4.8 11.8 4.7 4.8 4.1 36.7 20.4 3.2 44.4 59.7 3.8 7.0 43.8 75.0 4.0 27.4 3.8 51.3 87 96 - 4.8 H 75.0 75.0 40.3 75.0 75.0 75.0 75.0 32.1 53.9 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 3.9 75.0 75.0 75.0 75.0 75.0 39.5 97 99 * 1.4 P 5.7 7.3 6.3 7.2 6.5 30.0 9.2 5.7 5.7 30.3 6.2 6.0 7.0 5.2 9.8 52.7 6.0 5.7 6.2 6.5 4.3 7.3 7.3 29.8 6.7 4.0 5.3 2.3 6.3 29.0 31.2 4.3 5.3 5.0 100 116 H 4.7 H 7.4 2.6 3.5 3.6 7.6 11.9 3.2 7.5 3.3 3.5 2.9 7.8 7.3 2.3 12.1 4.4 15.9 2.9 3.3 7.5 2.4 8.2 3.2 7.8 7.3 3.1 8.3 2.3 2.7 2.9 3.2 11.4 15.6 2.8 119 128 * 3.2 M 60.7 47.2 5.4 3.4 60.5 5.4 27.6 13.3 5.7 39.9 68.5 54.2 33.4 6.5 61.1 60.4 11.4 61.1 61.1 61.0 68.3 40.1 39.2 68.3 75.0 41.0 61.9 26.6 5.7 40.9 68.4 33.0 3.5 5.3 129 159 - 4.7 H 72.7 75.0 68.1 59.0 75.0 8.5 75.0 75.0 68.4 75.0 75.0 75.0 35.3 39.6 72.8 75.0 59.3 72.7 72.8 72.9 75.0 75.0 75.0 75.0 61.5 75.0 59.6 75.0 33.0 75.0 75.0 75.0 63.8 68.1 160 166 * 3.2 M 16.5 65.0 34.9 75.0 14.9 46.2 36.0 36.0 34.9 65.6 34.7 44.6 4.3 24.1 55.6 5.4 75.0 6.1 24.7 54.4 35.0 5.8 24.0 35.9 45.4 44.7 75.0 35.9 26.0 44.7 36.4 24.8 75.0 34.7 167 179 H 4.8 H 3.9 3.3 3.8 9.7 4.0 3.8 4.0 4.8 3.6 9.7 3.8 4.0 4.7 3.8 9.2 3.7 8.3 4.2 3.6 4.8 3.5 9.8 4.2 10.0 3.5 4.3 10.4 4.1 4.8 4.8 3.5 4.0 8.5 3.5 180 184 * 2.5 P 17.6 32.0 3.8 3.0 22.4 5.8 33.5 31.8 5.9 32.8 22.6 34.2 4.4 4.8 19.0 17.4 61.8 19.2 47.0 31.8 17.8 47.5 32.4 75.0 32.2 3.6 60.2 61.4 5.0 18.2 62.1 3.6 4.0 32.6 185 209 - 4.7 H 63.9 75.0 69.5 75.0 72.4 64.2 75.0 72.3 64.0 75.0 72.3 75.0 61.1 58.8 75.0 72.5 75.0 63.7 75.0 75.0 58.3 75.0 75.0 64.3 75.0 64.2 75.0 75.0 53.2 75.0 69.3 4.8 75.0 69.3 >>>>>>