Motif    Start   End  Length   Motif
Motif1    45     48     4      [Y][V][A][L]
Motif2    58     60     3      [G][R][AI]
Motif3    68     73     6      [VI][EA][CA][SC][F][PG]
Motif4    89     92     4      [I][Q][I][L]
Motif5    139    143    5      [TS][P][VA][IV][ML]
Motif6    151    155    5      [LI][L][G][YK][IA]
Motif7    162    165    4      [A][AT][VI][G]
Motif8    183    185    3      [V][L][FC]


Motif marked on the alignment

                                                      ****         ***
d2bjqa  : -----EFEDTWAYNTIGSPFP--DNPVRVKGQQ---------NMYVALWYKFGKPIHGRA
d2bjqa  : 
d2bjra  : KPIVRVTLNEWADFRCGDPWPTVGTPVRALGRSLDTLPGENPDQYVALWYQSGEPV-GRI


                 ******               ****                            
d2bjqa  : WNDN-GNVECSFPYNKVELTGARDLGGQIQILTATEQDPTEQFKKTGFWYEWRPYKDRVN
d2bjqa  : 
d2bjra  : WNDG-GKIAACFGWGGHEYRQ--KI-GSIQILYELP------EAIRGFDYDWKPFPEAAQ


                            *****       *****      ****               
d2bjqa  : DQ--LLQLVRCG----QSTPVIMKTKDGKDLLGYIDMSTEVAAVGVSGKSEQVAGGPIQD
d2bjqa  : 
d2bjra  : FGAKEWIPVHVDHHKGNISPAVLIVD-GKEILGKADIRNERATIGYGGTEKVLVGPAVHS


            ***                                                       
d2bjqa  : MLVLFRNVKAPPK--
d2bjqa  : 
d2bjra  : C-VLCRKAKPGCTID